More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0425 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0425  Maf-like protein  100 
 
 		 202 aa  404  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0396  Maf-like protein  88.61 
 
 		 202 aa  333  1e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.539807 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0295  maf protein  73.27 
 
 		 202 aa  301  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0301  Maf family protein  85.15 
 
 		 202 aa  301  4.0000000000000003e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.389981  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0113  maf protein  60.4 
 
 		 202 aa  220  9.999999999999999e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.155594  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0103  Maf-like protein  59.9 
 
 		 202 aa  209  3e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0591246 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0160  putative maf-like protein  60.34 
 
 		 182 aa  187  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1828  Maf family protein  54.04 
 
 		 199 aa  180  1e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0357398 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1491  maf protein  51.24 
 
 		 204 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.038222 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2536  Maf family protein  55.28 
 
 		 205 aa  168  5e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3210  Maf-like protein  47.87 
 
 		 199 aa  163  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0852  Maf-like protein  50.78 
 
 		 199 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3936  Maf-like protein  48.4 
 
 		 199 aa  161  7e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.937595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3571  Maf family protein  51.76 
 
 		 212 aa  160  9e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.185022  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2068  Maf-like protein  50.52 
 
 		 199 aa  158  6e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.782682  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1988  Maf-like protein  50.52 
 
 		 199 aa  158  6e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1769  maf protein  50.54 
 
 		 204 aa  156  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.194696 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1491  maf protein  50.27 
 
 		 204 aa  155  3e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0002  septum formation inhibitor protein  46.84 
 
 		 199 aa  148  7e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4262  Maf-like protein  47.22 
 
 		 199 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.516858  normal  0.763632 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0116  Maf-like protein  42.19 
 
 		 195 aa  147  1.0000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0007  septum formation protein Maf  45.03 
 
 		 198 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000249801  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1928  Maf family protein  47.73 
 
 		 212 aa  146  2.0000000000000003e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.233629  normal  0.772496 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0197  maf protein  41.45 
 
 		 198 aa  145  3e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2841  maf protein  43.81 
 
 		 198 aa  145  4.0000000000000006e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.101765 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3479  Maf-like protein  43.46 
 
 		 202 aa  144  6e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4287  maf protein  49.73 
 
 		 203 aa  143  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.810301  normal  0.0181125 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5014  Maf family protein  45.83 
 
 		 202 aa  136  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.89619  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1274  Maf family protein  49.25 
 
 		 204 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1036  Maf family protein  47.51 
 
 		 210 aa  125  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.222741  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2019  hypothetical protein  34 
 
 		 200 aa  124  1e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2975  Maf family protein  40.31 
 
 		 196 aa  124  1e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2014  hypothetical protein  34 
 
 		 200 aa  123  2e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0428  maf protein  44 
 
 		 197 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2861  Maf-like protein  37.43 
 
 		 199 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.516793  normal  0.338924 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3614  Maf-like protein  42.56 
 
 		 202 aa  116  3e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0750548  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1255  maf protein  43.65 
 
 		 212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.905773 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2831  maf protein  40.45 
 
 		 197 aa  109  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0482245 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1954  maf protein  37.7 
 
 		 195 aa  106  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2670  Maf family protein  38.86 
 
 		 197 aa  105  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0103365  normal  0.348643 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2238  maf protein  35.96 
 
 		 201 aa  104  7e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.430207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1233  putative Maf/YceF/YhdE family protein  38.29 
 
 		 197 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3451  septum formation protein  38.64 
 
 		 198 aa  103  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2894  Maf family protein  37.71 
 
 		 197 aa  102  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0806025  normal  0.891076 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3627  maf protein  38.95 
 
 		 213 aa  102  5e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00981841  normal  0.308249 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4300  Maf-like protein  33.51 
 
 		 191 aa  100  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0561  maf protein  35.98 
 
 		 209 aa  100  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.27235  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1810  maf protein  37.89 
 
 		 197 aa  100  2e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0661  Maf-like protein  32.46 
 
 		 191 aa  98.6  6e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4352  Maf-like protein  32.46 
 
 		 191 aa  97.8  9e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4686  Maf-like protein  32.46 
 
 		 191 aa  97.8  9e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.822481  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4199  Maf-like protein  32.46 
 
 		 191 aa  97.1  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.282568  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4546  Maf-like protein  31.94 
 
 		 203 aa  96.7  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0394  maf protein  38.62 
 
 		 201 aa  97.1  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.689886  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4188  Maf-like protein  32.46 
 
 		 191 aa  97.1  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4542  Maf-like protein  32.46 
 
 		 191 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4573  Maf-like protein  30.73 
 
 		 191 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0732375  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4588  Maf-like protein  31.94 
 
 		 191 aa  95.9  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.660835  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1507  maf protein  31.63 
 
 		 192 aa  95.9  4e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2545  Maf-like protein  31.77 
 
 		 191 aa  95.1  6e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0841  Maf-like protein  37.16 
 
 		 198 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.52716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1179  maf protein  35.35 
 
 		 199 aa  93.2  3e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2782  maf protein, putative  33.84 
 
 		 203 aa  92.4  4e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1917  maf protein  33.33 
 
 		 198 aa  92.4  4e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.768264  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2136  maf protein  31.63 
 
 		 191 aa  92.4  4e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000418564  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2550  maf protein  34.38 
 
 		 191 aa  92.4  4e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1267  Maf-like protein  35.48 
 
 		 187 aa  92.4  4e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.209514 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3353  maf protein  35.9 
 
 		 198 aa  92.4  4e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000252643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2564  maf protein  33.16 
 
 		 195 aa  92  5e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000069447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0895  Maf-like protein  30.96 
 
 		 192 aa  91.7  6e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.415031  hitchhiker  0.000000000480722 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2235  Maf-like protein  29.65 
 
 		 193 aa  90.5  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.112907  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1508  maf protein  35.42 
 
 		 197 aa  90.9  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.912061  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1450  maf protein  38.22 
 
 		 194 aa  90.5  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0936  Maf-like protein  36.07 
 
 		 203 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1909  Maf-like protein  30.93 
 
 		 204 aa  89.4  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000270228 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1520  Maf-like protein  31.41 
 
 		 192 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.692511 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2011  Maf-like protein  34.18 
 
 		 193 aa  89.4  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2657  maf protein  35.75 
 
 		 192 aa  89  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.346219 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1177  maf protein  31.63 
 
 		 207 aa  89.4  4e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2953  maf protein  34.25 
 
 		 195 aa  88.6  6e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2566  maf protein  34.25 
 
 		 195 aa  88.6  6e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0240  maf protein  32.64 
 
 		 193 aa  88.6  6e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3171  Maf-like protein  32.98 
 
 		 191 aa  88.2  8e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1353  maf protein  37.7 
 
 		 194 aa  87.8  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2768  Maf-like protein  37.57 
 
 		 210 aa  87.8  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0898  Maf-like protein  36.22 
 
 		 191 aa  87.4  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0462  Maf-like protein  32.49 
 
 		 199 aa  87.4  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.804005  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1513  maf protein  34.38 
 
 		 192 aa  87.4  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.914638  normal  0.807051 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12680  Maf-like protein  37.7 
 
 		 196 aa  87.4  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2434  Maf-like protein  34.92 
 
 		 199 aa  87.4  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.774356  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2509  Maf-like protein  31.12 
 
 		 194 aa  87.8  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000279275  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1427  maf protein  37.89 
 
 		 199 aa  87.4  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.129668  normal  0.430559 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3284  maf protein  36.55 
 
 		 199 aa  86.7  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0866  maf protein  34.39 
 
 		 189 aa  87  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2637  maf protein  36.55 
 
 		 199 aa  86.7  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3684  Maf-like protein  36.7 
 
 		 197 aa  86.7  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.201425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3255  Maf-like protein  31.12 
 
 		 194 aa  86.7  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.487755  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1385  maf protein  35.42 
 
 		 193 aa  87  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1405  maf protein  32.63 
 
 		 193 aa  86.3  3e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000139135  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3686  Maf-like protein  32.29 
 
 		 194 aa  85.9  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000112258  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>