More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1828 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_1828  Maf family protein  100 
 
 
199 aa  390  1e-108  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0357398 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0295  maf protein  50.51 
 
 
202 aa  193  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0113  maf protein  53.54 
 
 
202 aa  186  2e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.155594  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1491  maf protein  54.04 
 
 
204 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.038222 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0160  putative maf-like protein  57.54 
 
 
182 aa  180  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0425  Maf-like protein  54.04 
 
 
202 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0396  Maf-like protein  52.02 
 
 
202 aa  175  5e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.539807 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0103  Maf-like protein  51.01 
 
 
202 aa  174  7e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0591246 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3210  Maf-like protein  48.17 
 
 
199 aa  171  3.9999999999999995e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0301  Maf family protein  54.04 
 
 
202 aa  171  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.389981  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3936  Maf-like protein  45.03 
 
 
199 aa  167  8e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.937595  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2068  Maf-like protein  49.44 
 
 
199 aa  165  4e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.782682  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1988  Maf-like protein  49.44 
 
 
199 aa  165  4e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0002  septum formation inhibitor protein  46.32 
 
 
199 aa  160  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1491  maf protein  51.37 
 
 
204 aa  159  3e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0852  Maf-like protein  47.42 
 
 
199 aa  157  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1769  maf protein  50.82 
 
 
204 aa  156  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.194696 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5014  Maf family protein  44.85 
 
 
202 aa  153  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.89619  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2536  Maf family protein  49.5 
 
 
205 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1274  Maf family protein  54.31 
 
 
204 aa  152  4e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1036  Maf family protein  56.35 
 
 
210 aa  151  5e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.222741  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3571  Maf family protein  48.06 
 
 
212 aa  151  7e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.185022  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4262  Maf-like protein  46.6 
 
 
199 aa  151  8e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.516858  normal  0.763632 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4287  maf protein  52.2 
 
 
203 aa  150  8.999999999999999e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.810301  normal  0.0181125 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0116  Maf-like protein  42.71 
 
 
195 aa  150  1e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3479  Maf-like protein  42.33 
 
 
202 aa  144  6e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0197  maf protein  41.75 
 
 
198 aa  140  1.9999999999999998e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0007  septum formation protein Maf  39.33 
 
 
198 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000249801  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1928  Maf family protein  47.21 
 
 
212 aa  137  1e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.233629  normal  0.772496 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2841  maf protein  42.56 
 
 
198 aa  136  3.0000000000000003e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.101765 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2975  Maf family protein  39.27 
 
 
196 aa  127  1.0000000000000001e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1255  maf protein  45.92 
 
 
212 aa  124  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.905773 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2861  Maf-like protein  38.34 
 
 
199 aa  119  3e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.516793  normal  0.338924 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3614  Maf-like protein  43.3 
 
 
202 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0750548  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0428  maf protein  45.13 
 
 
197 aa  112  4.0000000000000004e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2831  maf protein  42.56 
 
 
197 aa  111  7.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0482245 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2894  Maf family protein  42.86 
 
 
197 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0806025  normal  0.891076 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2670  Maf family protein  43.37 
 
 
197 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0103365  normal  0.348643 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1233  putative Maf/YceF/YhdE family protein  42.35 
 
 
197 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2019  hypothetical protein  31.35 
 
 
200 aa  105  4e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2014  hypothetical protein  31.35 
 
 
200 aa  105  4e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1954  maf protein  35.42 
 
 
195 aa  100  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3451  septum formation protein  36 
 
 
198 aa  99  4e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2545  Maf-like protein  34.02 
 
 
191 aa  98.6  5e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0895  Maf-like protein  31.96 
 
 
192 aa  95.9  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.415031  hitchhiker  0.000000000480722 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1259  Maf-like protein  32.47 
 
 
194 aa  94  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000739587  normal  0.283656 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1997  Maf-like protein  32.47 
 
 
194 aa  94.4  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000598296  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1288  Maf-like protein  32.47 
 
 
194 aa  94  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00740952  hitchhiker  0.00000000000368462 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1303  Maf-like protein  32.47 
 
 
194 aa  94  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.213914  hitchhiker  0.00000000413468 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2235  Maf-like protein  28.72 
 
 
193 aa  92.8  3e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.112907  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2238  Maf-like protein  31.84 
 
 
207 aa  91.7  7e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  5.6461e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2180  Maf-like protein  31.96 
 
 
194 aa  91.3  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000292018  hitchhiker  0.00000000000623683 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2560  maf protein  31.84 
 
 
207 aa  90.5  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000855171  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2040  Maf-like protein  31.84 
 
 
207 aa  90.5  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000222937  hitchhiker  0.000140944 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1209  Maf-like protein  31.84 
 
 
207 aa  90.5  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  7.40436e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1607  maf protein  34.98 
 
 
202 aa  90.9  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.213904  normal  0.972679 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2514  Maf-like protein  31.84 
 
 
207 aa  90.5  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000168521  hitchhiker  0.0000778782 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1209  Maf-like protein  31.84 
 
 
207 aa  90.5  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000242527  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1909  Maf-like protein  33.16 
 
 
204 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000270228 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1465  Maf-like protein  31.34 
 
 
207 aa  90.1  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000094447  hitchhiker  0.0000000000261413 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3255  Maf-like protein  31.69 
 
 
194 aa  90.5  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.487755  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01083  Maf-like protein  32.47 
 
 
194 aa  89.7  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000492558  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3805  Maf-like protein  34.69 
 
 
192 aa  89.4  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.334652  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1520  Maf-like protein  35.9 
 
 
192 aa  89.4  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.692511 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0661  Maf-like protein  31.35 
 
 
191 aa  89.4  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01091  hypothetical protein  32.47 
 
 
194 aa  89.7  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000303437  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2238  maf protein  32.58 
 
 
201 aa  89  4e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.430207  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2953  maf protein  31.77 
 
 
195 aa  89  4e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1507  maf protein  28.12 
 
 
192 aa  89  4e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2566  maf protein  31.77 
 
 
195 aa  89  4e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4546  Maf-like protein  32.97 
 
 
203 aa  88.6  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4199  Maf-like protein  32.43 
 
 
191 aa  88.2  8e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.282568  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1581  maf protein  29.9 
 
 
195 aa  88.2  8e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000404809  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4573  Maf-like protein  31.89 
 
 
191 aa  88.2  8e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0732375  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4352  Maf-like protein  31.89 
 
 
191 aa  87.4  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4188  Maf-like protein  31.89 
 
 
191 aa  87.4  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4686  Maf-like protein  31.89 
 
 
191 aa  87.4  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.822481  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1602  Maf-like protein  32.14 
 
 
194 aa  87.4  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000219117  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4542  Maf-like protein  31.89 
 
 
191 aa  87.4  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2432  maf protein  35.75 
 
 
191 aa  86.7  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0363173  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2500  maf protein  30.26 
 
 
193 aa  87  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000202942  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1634  maf protein  32.51 
 
 
240 aa  86.7  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1485  Maf-like protein  34.02 
 
 
192 aa  85.9  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1272  maf protein  32.5 
 
 
228 aa  85.9  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4588  Maf-like protein  31.89 
 
 
191 aa  85.1  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.660835  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3686  Maf-like protein  29.85 
 
 
194 aa  85.1  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000112258  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1239  maf protein  38.07 
 
 
193 aa  85.5  5e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.761303  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2509  Maf-like protein  30.1 
 
 
194 aa  85.5  5e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000279275  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3684  Maf-like protein  32.6 
 
 
197 aa  85.1  6e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.201425  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1427  maf protein  36.17 
 
 
199 aa  85.1  6e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.129668  normal  0.430559 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0186  maf protein  31.52 
 
 
192 aa  85.1  7e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3627  maf protein  31.66 
 
 
213 aa  84.7  8e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00981841  normal  0.308249 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2036  maf protein  28.27 
 
 
199 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00784926  normal  0.0167616 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1810  maf protein  33.16 
 
 
197 aa  83.6  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1720  Maf-like protein  30.89 
 
 
199 aa  83.2  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2657  maf protein  32.82 
 
 
192 aa  83.2  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.346219 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1713  maf protein  32.99 
 
 
194 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000722988  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3730  Maf-like protein  34.62 
 
 
197 aa  82.4  0.000000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000662199  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3437  Maf-like protein  34.62 
 
 
197 aa  82  0.000000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00398739  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03058  hypothetical protein  34.62 
 
 
197 aa  82  0.000000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00132702  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>