More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_2051 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_2051  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  100 
 
 
349 aa  703    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0292  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  85.67 
 
 
349 aa  569  1e-161  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.456226  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23931  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  78.96 
 
 
348 aa  565  1e-160  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0647769 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02551  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  64.39 
 
 
337 aa  484  1e-135  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1600  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  61.38 
 
 
339 aa  448  1e-125  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03121  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  60.78 
 
 
339 aa  430  1e-119  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.789221  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02551  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  55.86 
 
 
338 aa  421  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.495258  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0235  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  56.36 
 
 
339 aa  421  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02541  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  55.86 
 
 
338 aa  421  1e-117  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.290207  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02651  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  56.89 
 
 
338 aa  406  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0670  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  57.06 
 
 
338 aa  380  1e-104  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0693313  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3762  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  55.52 
 
 
323 aa  381  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.474591  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1174  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.67 
 
 
333 aa  370  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0233311  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2742  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.08 
 
 
343 aa  364  1e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2958  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.38 
 
 
328 aa  363  3e-99  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.172983 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1472  aspartate carbamoyltransferase  52.54 
 
 
331 aa  362  4e-99  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3160  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.38 
 
 
328 aa  362  6e-99  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4368  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.84 
 
 
331 aa  358  6e-98  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.080689 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_982  aspartate carbamoyltransferase, catalytic chain  45.97 
 
 
331 aa  280  3e-74  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1575  aspartate carbamoyltransferase  42.69 
 
 
311 aa  279  5e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1199  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  45.4 
 
 
331 aa  278  7e-74  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000831641  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1009  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  43.92 
 
 
331 aa  278  1e-73  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1615  aspartate carbamoyltransferase  42.65 
 
 
313 aa  271  1e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0602203  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1305  aspartate carbamoyltransferase  47.71 
 
 
306 aa  270  2e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00032948  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0723  aspartate carbamoyltransferase  45.59 
 
 
320 aa  270  2e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.515501  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4019  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  43.03 
 
 
312 aa  269  5e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00788568  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2428  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.88 
 
 
324 aa  268  1e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4279  aspartate carbamoyltransferase  47.89 
 
 
312 aa  267  2e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.527169 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2765  aspartate carbamoyltransferase  42.18 
 
 
313 aa  267  2e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.376966  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3992  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  44.85 
 
 
318 aa  266  5.999999999999999e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0370  aspartate carbamoyltransferase  45.92 
 
 
309 aa  265  8e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.101132  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3015  aspartate carbamoyltransferase  45.57 
 
 
313 aa  264  1e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00265688  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2090  aspartate carbamoyltransferase  42.6 
 
 
305 aa  263  3e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.219596 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2355  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  42.14 
 
 
313 aa  263  4e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0449699  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1301  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.48 
 
 
323 aa  262  6.999999999999999e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.276181  normal  0.0170425 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1856  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  41.72 
 
 
311 aa  261  8.999999999999999e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1681  aspartate carbamoyltransferase  42.94 
 
 
312 aa  260  2e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.23856  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1271  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  41.59 
 
 
311 aa  259  3e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102849  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0103  aspartate carbamoyltransferase  42.69 
 
 
329 aa  260  3e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1706  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.13 
 
 
309 aa  259  4e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0451069 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3202  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  45.12 
 
 
318 aa  259  5.0000000000000005e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0897828  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0879  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  43.16 
 
 
307 aa  259  6e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2401  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  45.21 
 
 
328 aa  258  1e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0442258  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1092  aspartate carbamoyltransferase  43.54 
 
 
316 aa  258  1e-67  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000013953  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2805  Aspartate carbamoyltransferase  45.51 
 
 
310 aa  257  2e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0953  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  41.14 
 
 
312 aa  256  4e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0935774  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0725  aspartate carbamoyltransferase  39.22 
 
 
312 aa  256  5e-67  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00253963  hitchhiker  0.0000000314766 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09370  aspartate carbamoyltransferase  44.11 
 
 
313 aa  256  5e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.370258  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2863  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  44.62 
 
 
318 aa  256  5e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.694024  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3361  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  45.43 
 
 
308 aa  256  6e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.528301  hitchhiker  0.000131858 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1713  aspartate carbamoyltransferase  44.55 
 
 
320 aa  255  6e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.389289 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0514  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  40.18 
 
 
311 aa  255  7e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.457435  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5324  aspartate carbamoyltransferase  43.45 
 
 
326 aa  255  8e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1352  aspartate carbamoyltransferase  44.31 
 
 
311 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0159083 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3105  aspartate carbamoyltransferase  45.57 
 
 
302 aa  255  1.0000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.178757  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2512  aspartate carbamoyltransferase  43.58 
 
 
314 aa  254  1.0000000000000001e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.287204  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2193  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  42.69 
 
 
316 aa  253  3e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.345265 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0756  aspartate carbamoyltransferase  47.38 
 
 
310 aa  253  4.0000000000000004e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.636087 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17960  aspartate carbamoyltransferase  44.07 
 
 
349 aa  253  4.0000000000000004e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2003  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  43.99 
 
 
342 aa  252  5.000000000000001e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000182057 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2529  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  41.54 
 
 
310 aa  252  5.000000000000001e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2268  aspartate carbamoyltransferase  41.76 
 
 
315 aa  252  6e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.120593  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3747  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  45.59 
 
 
315 aa  251  2e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.67324  normal  0.0274086 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2266  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  43.24 
 
 
337 aa  249  3e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12620  aspartate carbamoyltransferase  45.86 
 
 
327 aa  249  4e-65  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0895444  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3005  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  45.97 
 
 
323 aa  249  4e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.290399 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2336  aspartate carbamoyltransferase  45.86 
 
 
316 aa  249  6e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.52271  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1896  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  40.48 
 
 
310 aa  248  1e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3136  aspartate carbamoyltransferase  44.82 
 
 
306 aa  248  1e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.604866  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2034  aspartate carbamoyltransferase  44.12 
 
 
332 aa  247  2e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0341419 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1173  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  41.64 
 
 
310 aa  247  2e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1878  aspartate carbamoyltransferase  46.46 
 
 
314 aa  248  2e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.714727 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2312  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  40.48 
 
 
310 aa  247  2e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2585  aspartate carbamoyltransferase  45.03 
 
 
318 aa  247  2e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1375  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  39.88 
 
 
305 aa  246  3e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2434  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  43.65 
 
 
318 aa  246  4e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.123525  normal  0.183819 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2660  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  44.71 
 
 
315 aa  246  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0733  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  43.9 
 
 
311 aa  246  4.9999999999999997e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.6361  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1325  aspartate carbamoyltransferase  45.09 
 
 
333 aa  246  6e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.358229 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1846  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  44.65 
 
 
308 aa  245  9e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.258176  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2242  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  41.57 
 
 
313 aa  245  9e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.300493  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2964  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  44.41 
 
 
318 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.585187  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1708  aspartate carbamoyltransferase  43.97 
 
 
335 aa  244  1.9999999999999999e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.116774  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2330  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  41.27 
 
 
313 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1618  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  41.27 
 
 
313 aa  243  3e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1769  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  40.43 
 
 
311 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0422268  normal  0.117103 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1853  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  45.26 
 
 
308 aa  243  5e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.822345  normal  0.502816 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2085  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  39.63 
 
 
310 aa  242  5e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.148257  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1842  aspartate carbamoyltransferase  44.57 
 
 
351 aa  242  7e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.553475  normal  0.269234 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1054  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  44.04 
 
 
313 aa  241  1e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.38137  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0246  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  42.6 
 
 
326 aa  241  1e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.906475  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10323  probable aspartate carbamoyltransferase  38.81 
 
 
309 aa  241  1e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2740  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  44.28 
 
 
323 aa  241  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11409  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  42.94 
 
 
319 aa  241  1e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.098973  normal  0.197941 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0084  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  39.7 
 
 
307 aa  241  1e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0579282 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15550  aspartate carbamoyltransferase  45.18 
 
 
310 aa  241  1e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.824951  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1818  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  37.31 
 
 
304 aa  241  2e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.175577  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0570  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  42.94 
 
 
323 aa  241  2e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.880032  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0678  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  43.24 
 
 
323 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3418  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  44.04 
 
 
317 aa  240  2.9999999999999997e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10369  normal  0.633713 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>