More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0292 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0292  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  100 
 
 
349 aa  698    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.456226  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2051  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  85.67 
 
 
349 aa  569  1e-161  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23931  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  79.48 
 
 
348 aa  560  1.0000000000000001e-159  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0647769 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02551  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  64.09 
 
 
337 aa  471  1e-132  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1600  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  60.83 
 
 
339 aa  446  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03121  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  60.24 
 
 
339 aa  428  1e-119  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.789221  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02551  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  55.99 
 
 
338 aa  418  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.495258  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02541  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  56.29 
 
 
338 aa  419  1e-116  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.290207  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0235  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  55.89 
 
 
339 aa  416  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02651  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  57.01 
 
 
338 aa  410  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0670  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  55.85 
 
 
338 aa  379  1e-104  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0693313  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3762  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  55.99 
 
 
323 aa  376  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.474591  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1174  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.96 
 
 
333 aa  372  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0233311  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1472  aspartate carbamoyltransferase  52.4 
 
 
331 aa  365  1e-100  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2958  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.89 
 
 
328 aa  355  3.9999999999999996e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.172983 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2742  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.87 
 
 
343 aa  355  5e-97  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4368  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.94 
 
 
331 aa  355  6.999999999999999e-97  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.080689 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3160  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.6 
 
 
328 aa  353  2e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1575  aspartate carbamoyltransferase  42.99 
 
 
311 aa  284  2.0000000000000002e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1009  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  45.1 
 
 
331 aa  283  4.0000000000000003e-75  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_982  aspartate carbamoyltransferase, catalytic chain  45.97 
 
 
331 aa  281  2e-74  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1199  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  45.4 
 
 
331 aa  280  3e-74  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000831641  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1615  aspartate carbamoyltransferase  42.4 
 
 
313 aa  273  3e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0602203  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3015  aspartate carbamoyltransferase  46.48 
 
 
313 aa  269  4e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00265688  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4019  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  42.14 
 
 
312 aa  269  5.9999999999999995e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00788568  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2765  aspartate carbamoyltransferase  41 
 
 
313 aa  268  8e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.376966  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3992  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  45.43 
 
 
318 aa  268  1e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1305  aspartate carbamoyltransferase  46.5 
 
 
306 aa  268  1e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00032948  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0370  aspartate carbamoyltransferase  46.2 
 
 
309 aa  268  1e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.101132  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2428  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.04 
 
 
324 aa  267  2e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0723  aspartate carbamoyltransferase  46.29 
 
 
320 aa  267  2e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.515501  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1271  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  41.3 
 
 
311 aa  266  4e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102849  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1713  aspartate carbamoyltransferase  45.65 
 
 
320 aa  265  5.999999999999999e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.389289 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1856  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  41.12 
 
 
311 aa  265  7e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4279  aspartate carbamoyltransferase  47.29 
 
 
312 aa  265  1e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.527169 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0953  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  41.57 
 
 
312 aa  264  2e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0935774  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2805  Aspartate carbamoyltransferase  45.2 
 
 
310 aa  261  1e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2355  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  41.54 
 
 
313 aa  261  1e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0449699  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1352  aspartate carbamoyltransferase  46.11 
 
 
311 aa  261  1e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0159083 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2401  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  45.21 
 
 
328 aa  260  2e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0442258  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0879  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  42.2 
 
 
307 aa  259  4e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0514  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  39.94 
 
 
311 aa  259  4e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.457435  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3202  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  44.51 
 
 
318 aa  257  2e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0897828  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2090  aspartate carbamoyltransferase  41.99 
 
 
305 aa  258  2e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.219596 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1301  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  45.57 
 
 
323 aa  258  2e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.276181  normal  0.0170425 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1706  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  44.94 
 
 
309 aa  257  2e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0451069 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3136  aspartate carbamoyltransferase  45.73 
 
 
306 aa  257  3e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.604866  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1681  aspartate carbamoyltransferase  42.43 
 
 
312 aa  257  3e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.23856  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2529  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  40.95 
 
 
310 aa  257  3e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1896  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  40.3 
 
 
310 aa  256  4e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12620  aspartate carbamoyltransferase  46.15 
 
 
327 aa  256  4e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0895444  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2193  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  43.58 
 
 
316 aa  256  4e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.345265 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3005  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.08 
 
 
323 aa  256  5e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.290399 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2312  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  40.3 
 
 
310 aa  256  6e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2863  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  43.69 
 
 
318 aa  256  6e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.694024  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2336  aspartate carbamoyltransferase  45.99 
 
 
316 aa  255  1.0000000000000001e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.52271  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3105  aspartate carbamoyltransferase  44.65 
 
 
302 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.178757  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2034  aspartate carbamoyltransferase  46.22 
 
 
332 aa  254  1.0000000000000001e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0341419 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2003  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  43.4 
 
 
342 aa  253  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000182057 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0725  aspartate carbamoyltransferase  38.32 
 
 
312 aa  254  2.0000000000000002e-66  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00253963  hitchhiker  0.0000000314766 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1878  aspartate carbamoyltransferase  46.88 
 
 
314 aa  254  2.0000000000000002e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.714727 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3361  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  43.9 
 
 
308 aa  253  3e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.528301  hitchhiker  0.000131858 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0756  aspartate carbamoyltransferase  46.15 
 
 
310 aa  253  3e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.636087 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2266  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  42.94 
 
 
337 aa  253  3e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1092  aspartate carbamoyltransferase  43.98 
 
 
316 aa  252  6e-66  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000013953  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09370  aspartate carbamoyltransferase  43.28 
 
 
313 aa  251  1e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.370258  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2242  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  43.5 
 
 
313 aa  251  1e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.300493  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2268  aspartate carbamoyltransferase  41.57 
 
 
315 aa  251  2e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.120593  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2330  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  43.2 
 
 
313 aa  250  2e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3747  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  44.81 
 
 
315 aa  250  2e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.67324  normal  0.0274086 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1618  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  43.2 
 
 
313 aa  250  3e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2512  aspartate carbamoyltransferase  42.81 
 
 
314 aa  250  3e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.287204  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1375  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  41.09 
 
 
305 aa  250  3e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5324  aspartate carbamoyltransferase  43.88 
 
 
326 aa  250  3e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17960  aspartate carbamoyltransferase  43.82 
 
 
349 aa  249  5e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0103  aspartate carbamoyltransferase  41.04 
 
 
329 aa  249  5e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1325  aspartate carbamoyltransferase  45.66 
 
 
333 aa  249  6e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.358229 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1846  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  44.95 
 
 
308 aa  249  7e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.258176  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2964  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  43.49 
 
 
318 aa  248  9e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.585187  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1425  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  43.5 
 
 
325 aa  248  1e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2434  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  43.34 
 
 
318 aa  247  2e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.123525  normal  0.183819 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2085  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  39.33 
 
 
310 aa  247  2e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.148257  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2660  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  44.21 
 
 
315 aa  247  2e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1818  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  38.84 
 
 
304 aa  247  2e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.175577  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1871  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  44.25 
 
 
318 aa  246  3e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1842  aspartate carbamoyltransferase  44.77 
 
 
351 aa  246  6e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.553475  normal  0.269234 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1853  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  44.65 
 
 
308 aa  246  6e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.822345  normal  0.502816 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2585  aspartate carbamoyltransferase  43.99 
 
 
318 aa  245  9.999999999999999e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3418  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  44.04 
 
 
317 aa  244  9.999999999999999e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10369  normal  0.633713 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1769  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  39.82 
 
 
311 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0422268  normal  0.117103 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1708  aspartate carbamoyltransferase  44.13 
 
 
335 aa  244  9.999999999999999e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.116774  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4349  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  43.67 
 
 
316 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.881591 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0964  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  38.39 
 
 
308 aa  243  1.9999999999999999e-63  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0733  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  41.99 
 
 
311 aa  243  5e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.6361  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11409  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  42.65 
 
 
319 aa  243  5e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.098973  normal  0.197941 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2893  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  41.57 
 
 
320 aa  242  7.999999999999999e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3570  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  41.57 
 
 
320 aa  242  7.999999999999999e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.503342 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0612  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  40.24 
 
 
313 aa  242  9e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.295857  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3512  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  42.3 
 
 
315 aa  241  1e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14730  aspartate carbamoyltransferase  45.37 
 
 
320 aa  241  2e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.41124  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>