More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1174 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_1174  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  100 
 
 
333 aa  686    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0233311  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1472  aspartate carbamoyltransferase  87.35 
 
 
331 aa  606  9.999999999999999e-173  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2958  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  79.27 
 
 
328 aa  541  1e-153  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.172983 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3160  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  78.96 
 
 
328 aa  538  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4368  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  77.41 
 
 
331 aa  530  1e-149  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.080689 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2742  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  76.13 
 
 
343 aa  516  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0670  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  73.8 
 
 
338 aa  505  9.999999999999999e-143  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0693313  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3762  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  71.95 
 
 
323 aa  493  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.474591  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02551  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.51 
 
 
337 aa  362  5.0000000000000005e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1600  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.68 
 
 
339 aa  362  7.0000000000000005e-99  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23931  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.12 
 
 
348 aa  361  8e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0647769 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0292  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.76 
 
 
349 aa  357  9.999999999999999e-98  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.456226  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2051  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  54.46 
 
 
349 aa  357  1.9999999999999998e-97  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03121  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.98 
 
 
339 aa  354  8.999999999999999e-97  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.789221  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02651  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.96 
 
 
338 aa  327  1.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02551  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.05 
 
 
338 aa  315  9e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.495258  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02541  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.18 
 
 
338 aa  313  1.9999999999999998e-84  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.290207  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0235  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.31 
 
 
339 aa  310  2e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1575  aspartate carbamoyltransferase  47.87 
 
 
311 aa  310  2e-83  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2765  aspartate carbamoyltransferase  48.62 
 
 
313 aa  309  4e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.376966  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1305  aspartate carbamoyltransferase  51.7 
 
 
306 aa  307  1.0000000000000001e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00032948  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0879  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.69 
 
 
307 aa  300  2e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2863  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.78 
 
 
318 aa  300  2e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.694024  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2512  aspartate carbamoyltransferase  48.93 
 
 
314 aa  300  3e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.287204  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0103  aspartate carbamoyltransferase  47.26 
 
 
329 aa  300  3e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4019  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.17 
 
 
312 aa  298  6e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00788568  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1615  aspartate carbamoyltransferase  48.01 
 
 
313 aa  298  1e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0602203  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2355  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.91 
 
 
313 aa  297  2e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0449699  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2434  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.95 
 
 
318 aa  296  3e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.123525  normal  0.183819 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1856  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.45 
 
 
311 aa  295  6e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1271  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.09 
 
 
311 aa  293  2e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102849  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3992  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.88 
 
 
318 aa  293  2e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0370  aspartate carbamoyltransferase  48.92 
 
 
309 aa  293  3e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.101132  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0725  aspartate carbamoyltransferase  47.4 
 
 
312 aa  292  5e-78  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00253963  hitchhiker  0.0000000314766 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0723  aspartate carbamoyltransferase  49.69 
 
 
320 aa  292  6e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.515501  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2529  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.72 
 
 
310 aa  292  6e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0953  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.43 
 
 
312 aa  290  3e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0935774  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0084  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.44 
 
 
307 aa  289  4e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0579282 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2193  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.78 
 
 
316 aa  288  7e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.345265 
 
 
-
 
NC_002936  DET1199  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.33 
 
 
331 aa  288  1e-76  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000831641  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2428  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.77 
 
 
324 aa  287  2e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2090  aspartate carbamoyltransferase  48.77 
 
 
305 aa  286  2.9999999999999996e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.219596 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_982  aspartate carbamoyltransferase, catalytic chain  48.02 
 
 
331 aa  286  4e-76  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1896  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.16 
 
 
310 aa  285  7e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2312  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.16 
 
 
310 aa  285  9e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2330  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.01 
 
 
313 aa  285  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2242  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.71 
 
 
313 aa  283  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.300493  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1769  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.73 
 
 
311 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0422268  normal  0.117103 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1618  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.71 
 
 
313 aa  283  3.0000000000000004e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2085  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.11 
 
 
310 aa  282  6.000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.148257  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1301  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.76 
 
 
323 aa  282  6.000000000000001e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.276181  normal  0.0170425 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3361  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.99 
 
 
308 aa  282  7.000000000000001e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.528301  hitchhiker  0.000131858 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1009  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.11 
 
 
331 aa  281  1e-74  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3015  aspartate carbamoyltransferase  46.6 
 
 
313 aa  280  2e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00265688  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1681  aspartate carbamoyltransferase  45.87 
 
 
312 aa  280  3e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.23856  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5324  aspartate carbamoyltransferase  47.4 
 
 
326 aa  280  3e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3136  aspartate carbamoyltransferase  47.08 
 
 
306 aa  279  4e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.604866  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0514  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  45.03 
 
 
311 aa  278  7e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.457435  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2268  aspartate carbamoyltransferase  44.92 
 
 
315 aa  278  1e-73  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.120593  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1713  aspartate carbamoyltransferase  48.92 
 
 
320 aa  278  1e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.389289 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1706  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.38 
 
 
309 aa  276  5e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0451069 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1284  aspartate carbamoyltransferase  44.79 
 
 
312 aa  276  5e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0189809  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1846  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  45.99 
 
 
308 aa  274  1.0000000000000001e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.258176  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09370  aspartate carbamoyltransferase  45.48 
 
 
313 aa  274  1.0000000000000001e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.370258  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3105  aspartate carbamoyltransferase  47.2 
 
 
302 aa  273  3e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.178757  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5487  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  45.99 
 
 
313 aa  272  6e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.07038 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10323  probable aspartate carbamoyltransferase  45.17 
 
 
309 aa  272  7e-72  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0370  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  44.95 
 
 
307 aa  271  1e-71  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0685539  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1352  aspartate carbamoyltransferase  46.91 
 
 
311 aa  271  1e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0159083 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2657  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.25 
 
 
306 aa  270  2e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1581  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.08 
 
 
320 aa  270  2e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.917792 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3059  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.5 
 
 
327 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2666  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.5 
 
 
327 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11850  aspartate carbamoyltransferase  43.87 
 
 
314 aa  270  2.9999999999999997e-71  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0235672  normal  0.0348284 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2805  Aspartate carbamoyltransferase  45.74 
 
 
310 aa  269  4e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3761  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.3 
 
 
336 aa  269  4e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1517  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  45.48 
 
 
335 aa  269  4e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.726212 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0733  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.11 
 
 
311 aa  269  5e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.6361  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0612  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.17 
 
 
313 aa  269  5e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.295857  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3202  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  45.43 
 
 
318 aa  268  7e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0897828  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1674  aspartate carbamoyltransferase  44.17 
 
 
314 aa  268  7e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.574418  normal  0.0126587 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3150  aspartate carbamoyltransferase  47.06 
 
 
309 aa  268  8e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.987909  hitchhiker  0.000518906 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1092  aspartate carbamoyltransferase  46.93 
 
 
316 aa  268  8e-71  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000013953  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4279  aspartate carbamoyltransferase  45.65 
 
 
312 aa  268  1e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.527169 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3418  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.98 
 
 
317 aa  268  1e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10369  normal  0.633713 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5314  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  45.54 
 
 
334 aa  267  2e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.165994  normal  0.237409 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1853  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  45.23 
 
 
308 aa  267  2e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.822345  normal  0.502816 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07860  aspartate carbamoyltransferase  44.17 
 
 
314 aa  267  2e-70  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00316113  normal  0.512278 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0756  aspartate carbamoyltransferase  48.77 
 
 
310 aa  266  2.9999999999999995e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.636087 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3890  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.42 
 
 
319 aa  266  5e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2893  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.3 
 
 
320 aa  265  7e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1173  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  42.73 
 
 
310 aa  265  7e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2003  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.69 
 
 
342 aa  265  7e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000182057 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3570  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.3 
 
 
320 aa  265  7e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.503342 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2034  aspartate carbamoyltransferase  46.3 
 
 
332 aa  265  8e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0341419 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0344  aspartate carbamoyltransferase  44.69 
 
 
307 aa  265  8e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000132392  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1010  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.91 
 
 
334 aa  265  8.999999999999999e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.174033  normal  0.205744 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2333  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  45.09 
 
 
328 aa  264  1e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.993872  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1641  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  45.79 
 
 
321 aa  265  1e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.452041 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2582  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  45.85 
 
 
317 aa  264  2e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0906615 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>