More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2742 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2742  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  100 
 
 
343 aa  704    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2958  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  80.98 
 
 
328 aa  545  1e-154  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.172983 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3160  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  80.67 
 
 
328 aa  543  1e-153  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1174  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  76.13 
 
 
333 aa  516  1.0000000000000001e-145  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0233311  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1472  aspartate carbamoyltransferase  75.69 
 
 
331 aa  511  1e-143  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4368  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  74.85 
 
 
331 aa  499  1e-140  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.080689 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0670  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  70.55 
 
 
338 aa  473  1e-132  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0693313  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3762  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  69.54 
 
 
323 aa  473  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.474591  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23931  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.24 
 
 
348 aa  357  1.9999999999999998e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0647769 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1600  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.71 
 
 
339 aa  355  5.999999999999999e-97  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03121  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.01 
 
 
339 aa  348  9e-95  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.789221  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2051  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53.94 
 
 
349 aa  345  7e-94  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02551  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  51.96 
 
 
337 aa  343  2e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0292  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.73 
 
 
349 aa  337  1.9999999999999998e-91  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.456226  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02551  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.59 
 
 
338 aa  318  7.999999999999999e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.495258  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0235  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.71 
 
 
339 aa  315  6e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02541  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.97 
 
 
338 aa  314  9.999999999999999e-85  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.290207  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02651  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.2 
 
 
338 aa  313  1.9999999999999998e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2765  aspartate carbamoyltransferase  50.79 
 
 
313 aa  307  2.0000000000000002e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.376966  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1575  aspartate carbamoyltransferase  48.75 
 
 
311 aa  305  9.000000000000001e-82  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2512  aspartate carbamoyltransferase  48.91 
 
 
314 aa  295  7e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.287204  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0723  aspartate carbamoyltransferase  51.41 
 
 
320 aa  291  2e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.515501  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1305  aspartate carbamoyltransferase  50.32 
 
 
306 aa  290  2e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00032948  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1615  aspartate carbamoyltransferase  49.39 
 
 
313 aa  289  4e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0602203  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0103  aspartate carbamoyltransferase  48.29 
 
 
329 aa  289  6e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0879  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.96 
 
 
307 aa  288  7e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2529  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.62 
 
 
310 aa  288  1e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0953  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.23 
 
 
312 aa  287  2e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0935774  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1856  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.38 
 
 
311 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0725  aspartate carbamoyltransferase  45.82 
 
 
312 aa  283  2.0000000000000002e-75  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00253963  hitchhiker  0.0000000314766 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0370  aspartate carbamoyltransferase  48.1 
 
 
309 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.101132  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3992  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.69 
 
 
318 aa  282  5.000000000000001e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1271  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.92 
 
 
311 aa  281  1e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102849  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2355  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.84 
 
 
313 aa  281  1e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0449699  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2085  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.37 
 
 
310 aa  280  2e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.148257  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0084  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.63 
 
 
307 aa  280  2e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0579282 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1896  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.11 
 
 
310 aa  280  2e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2312  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.56 
 
 
310 aa  278  1e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1769  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.68 
 
 
311 aa  278  1e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0422268  normal  0.117103 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4019  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.56 
 
 
312 aa  278  1e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00788568  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1352  aspartate carbamoyltransferase  47.48 
 
 
311 aa  278  1e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0159083 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5487  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.34 
 
 
313 aa  277  2e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.07038 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1846  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.15 
 
 
308 aa  276  3e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.258176  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3361  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.91 
 
 
308 aa  276  3e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.528301  hitchhiker  0.000131858 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2428  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.29 
 
 
324 aa  276  3e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2863  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.32 
 
 
318 aa  273  2.0000000000000002e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.694024  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1853  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.15 
 
 
308 aa  273  2.0000000000000002e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.822345  normal  0.502816 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3015  aspartate carbamoyltransferase  45.91 
 
 
313 aa  273  3e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00265688  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1199  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.15 
 
 
331 aa  272  7e-72  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000831641  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2090  aspartate carbamoyltransferase  47.53 
 
 
305 aa  272  8.000000000000001e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.219596 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2330  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.65 
 
 
313 aa  271  1e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_982  aspartate carbamoyltransferase, catalytic chain  46.15 
 
 
331 aa  271  1e-71  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1009  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.73 
 
 
331 aa  271  1e-71  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2193  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.02 
 
 
316 aa  271  1e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.345265 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3105  aspartate carbamoyltransferase  46.71 
 
 
302 aa  271  1e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.178757  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2242  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.34 
 
 
313 aa  270  2e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.300493  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1618  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.65 
 
 
313 aa  270  2e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1706  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.37 
 
 
309 aa  270  2e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0451069 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3136  aspartate carbamoyltransferase  47.34 
 
 
306 aa  270  4e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.604866  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1284  aspartate carbamoyltransferase  46.56 
 
 
312 aa  269  4e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0189809  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3890  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.08 
 
 
319 aa  269  5e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2657  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.86 
 
 
306 aa  268  1e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2268  aspartate carbamoyltransferase  43.83 
 
 
315 aa  267  2e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.120593  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1092  aspartate carbamoyltransferase  45.76 
 
 
316 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000013953  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1517  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  44.11 
 
 
335 aa  266  2.9999999999999995e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.726212 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2805  Aspartate carbamoyltransferase  46.18 
 
 
310 aa  266  2.9999999999999995e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4614  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.18 
 
 
320 aa  266  4e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09370  aspartate carbamoyltransferase  44.83 
 
 
313 aa  266  5e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.370258  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1581  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.52 
 
 
320 aa  266  5e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.917792 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0344  aspartate carbamoyltransferase  44.21 
 
 
307 aa  266  5e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000132392  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3570  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.51 
 
 
320 aa  265  5.999999999999999e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.503342 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2893  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.51 
 
 
320 aa  265  5.999999999999999e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2434  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.18 
 
 
318 aa  265  7e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.123525  normal  0.183819 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1054  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.69 
 
 
313 aa  265  8.999999999999999e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.38137  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1713  aspartate carbamoyltransferase  44 
 
 
320 aa  265  8.999999999999999e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.389289 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4279  aspartate carbamoyltransferase  45.74 
 
 
312 aa  265  1e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.527169 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1301  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.52 
 
 
323 aa  264  1e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.276181  normal  0.0170425 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1681  aspartate carbamoyltransferase  45.94 
 
 
312 aa  264  2e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.23856  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1878  aspartate carbamoyltransferase  51.75 
 
 
314 aa  263  3e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.714727 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0370  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  44.65 
 
 
307 aa  263  4e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0685539  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0612  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.78 
 
 
313 aa  263  4e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.295857  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3150  aspartate carbamoyltransferase  47.32 
 
 
309 aa  263  4e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.987909  hitchhiker  0.000518906 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0936  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  45.14 
 
 
313 aa  263  4.999999999999999e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0143291  normal  0.350081 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2582  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  45.81 
 
 
317 aa  262  6e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0906615 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10323  probable aspartate carbamoyltransferase  43.4 
 
 
309 aa  262  6e-69  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17960  aspartate carbamoyltransferase  46.75 
 
 
349 aa  262  6.999999999999999e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1641  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  45.15 
 
 
321 aa  261  1e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.452041 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0756  aspartate carbamoyltransferase  49.84 
 
 
310 aa  261  1e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.636087 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3200  aspartate carbamoyltransferase  47.8 
 
 
314 aa  261  1e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0514  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  44.83 
 
 
311 aa  261  1e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.457435  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0910  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.85 
 
 
320 aa  261  1e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.297016 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1708  aspartate carbamoyltransferase  46.75 
 
 
335 aa  259  3e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.116774  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3761  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.84 
 
 
336 aa  259  4e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2003  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.98 
 
 
342 aa  259  4e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000182057 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3345  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  45.6 
 
 
320 aa  259  4e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.164434  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0246  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.11 
 
 
326 aa  259  5.0000000000000005e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.906475  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3418  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.86 
 
 
317 aa  259  5.0000000000000005e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10369  normal  0.633713 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1173  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  44.48 
 
 
310 aa  259  7e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3202  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  44.55 
 
 
318 aa  258  8e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0897828  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2324  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  45.29 
 
 
346 aa  258  9e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0736648 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>