More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0756 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0756  aspartate carbamoyltransferase  100 
 
 
310 aa  634    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.636087 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1878  aspartate carbamoyltransferase  80.72 
 
 
314 aa  518  1e-146  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.714727 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0503  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  61.11 
 
 
312 aa  375  1e-103  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0338301  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1575  aspartate carbamoyltransferase  53.31 
 
 
311 aa  316  3e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2863  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  52.49 
 
 
318 aa  311  9e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.694024  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0879  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  53 
 
 
307 aa  304  1.0000000000000001e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2434  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.84 
 
 
318 aa  298  6e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.123525  normal  0.183819 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1305  aspartate carbamoyltransferase  51.16 
 
 
306 aa  298  6e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00032948  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1009  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49 
 
 
331 aa  298  1e-79  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5487  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.33 
 
 
313 aa  296  3e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.07038 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2512  aspartate carbamoyltransferase  50.85 
 
 
314 aa  296  3e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.287204  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2657  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.85 
 
 
306 aa  295  5e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2355  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.83 
 
 
313 aa  292  5e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0449699  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1199  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48 
 
 
331 aa  291  7e-78  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000831641  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_982  aspartate carbamoyltransferase, catalytic chain  47.67 
 
 
331 aa  290  1e-77  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3015  aspartate carbamoyltransferase  49.33 
 
 
313 aa  289  3e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00265688  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1173  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.8 
 
 
310 aa  288  8e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0084  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.32 
 
 
307 aa  288  9e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0579282 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1284  aspartate carbamoyltransferase  48.67 
 
 
312 aa  288  1e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0189809  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3136  aspartate carbamoyltransferase  50.33 
 
 
306 aa  286  2e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.604866  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1352  aspartate carbamoyltransferase  49 
 
 
311 aa  287  2e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0159083 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4279  aspartate carbamoyltransferase  50.33 
 
 
312 aa  287  2e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.527169 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0514  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.17 
 
 
311 aa  286  4e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.457435  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2765  aspartate carbamoyltransferase  48.34 
 
 
313 aa  286  4e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.376966  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2242  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.32 
 
 
313 aa  285  5.999999999999999e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.300493  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2193  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.66 
 
 
316 aa  285  5.999999999999999e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.345265 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1271  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.34 
 
 
311 aa  284  1.0000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102849  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2330  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.99 
 
 
313 aa  284  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1618  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.99 
 
 
313 aa  284  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1846  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.18 
 
 
308 aa  283  2.0000000000000002e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.258176  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1301  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.83 
 
 
323 aa  283  3.0000000000000004e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.276181  normal  0.0170425 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0953  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.83 
 
 
312 aa  283  4.0000000000000003e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0935774  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1615  aspartate carbamoyltransferase  48.17 
 
 
313 aa  282  7.000000000000001e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0602203  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0344  aspartate carbamoyltransferase  48.14 
 
 
307 aa  280  2e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000132392  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4545  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.6 
 
 
308 aa  280  2e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2805  Aspartate carbamoyltransferase  48.46 
 
 
310 aa  280  3e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0723  aspartate carbamoyltransferase  50.17 
 
 
320 aa  280  3e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.515501  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0370  aspartate carbamoyltransferase  51.01 
 
 
309 aa  278  6e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.101132  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3105  aspartate carbamoyltransferase  49.5 
 
 
302 aa  278  6e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.178757  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2428  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.49 
 
 
324 aa  278  6e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15550  aspartate carbamoyltransferase  50.16 
 
 
310 aa  278  8e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.824951  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2090  aspartate carbamoyltransferase  49.15 
 
 
305 aa  278  9e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.219596 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11409  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.81 
 
 
319 aa  277  1e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.098973  normal  0.197941 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4019  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.67 
 
 
312 aa  277  2e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00788568  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3200  aspartate carbamoyltransferase  51.33 
 
 
314 aa  277  2e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3361  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.5 
 
 
308 aa  276  3e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.528301  hitchhiker  0.000131858 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3992  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.65 
 
 
318 aa  276  3e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1706  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.84 
 
 
309 aa  276  3e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0451069 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2034  aspartate carbamoyltransferase  49.52 
 
 
332 aa  276  3e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0341419 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10323  probable aspartate carbamoyltransferase  46.26 
 
 
309 aa  276  4e-73  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2529  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.73 
 
 
310 aa  276  4e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1769  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  45.51 
 
 
311 aa  275  5e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0422268  normal  0.117103 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1472  aspartate carbamoyltransferase  50 
 
 
331 aa  275  6e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2336  aspartate carbamoyltransferase  50.49 
 
 
316 aa  275  7e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.52271  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1054  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.67 
 
 
313 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.38137  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0725  aspartate carbamoyltransferase  47.18 
 
 
312 aa  274  1.0000000000000001e-72  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00253963  hitchhiker  0.0000000314766 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3150  aspartate carbamoyltransferase  49.34 
 
 
309 aa  274  1.0000000000000001e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.987909  hitchhiker  0.000518906 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1853  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.85 
 
 
308 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.822345  normal  0.502816 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2401  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.86 
 
 
328 aa  273  2.0000000000000002e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0442258  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3202  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.84 
 
 
318 aa  273  3e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0897828  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1856  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.02 
 
 
311 aa  272  5.000000000000001e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1818  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.96 
 
 
304 aa  272  5.000000000000001e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.175577  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3747  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.16 
 
 
315 aa  272  5.000000000000001e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.67324  normal  0.0274086 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1896  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.39 
 
 
310 aa  272  7e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2312  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.39 
 
 
310 aa  271  1e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1353  aspartate carbamoyltransferase  46.89 
 
 
333 aa  271  1e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2085  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  45.25 
 
 
310 aa  270  2e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.148257  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3512  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.18 
 
 
315 aa  270  2e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4368  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50.62 
 
 
331 aa  270  2e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.080689 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3635  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.85 
 
 
315 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.177369 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3312  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.85 
 
 
315 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.847198 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1681  aspartate carbamoyltransferase  48.81 
 
 
312 aa  269  4e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.23856  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2660  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.19 
 
 
315 aa  269  4e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0370  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  45.12 
 
 
307 aa  269  5e-71  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0685539  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2964  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  50 
 
 
318 aa  269  5e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.585187  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09370  aspartate carbamoyltransferase  48.81 
 
 
313 aa  268  7e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.370258  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2585  aspartate carbamoyltransferase  49.19 
 
 
318 aa  268  7e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3761  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.89 
 
 
336 aa  268  8e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14730  aspartate carbamoyltransferase  48.7 
 
 
320 aa  267  2e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.41124  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1174  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.77 
 
 
333 aa  266  2e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0233311  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05260  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.04 
 
 
334 aa  266  2e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.873262  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3160  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.6 
 
 
328 aa  267  2e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0397  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.71 
 
 
335 aa  266  2e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1842  aspartate carbamoyltransferase  49.21 
 
 
351 aa  266  2.9999999999999995e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.553475  normal  0.269234 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2958  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.6 
 
 
328 aa  266  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.172983 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1092  aspartate carbamoyltransferase  47.64 
 
 
316 aa  266  4e-70  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000013953  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0612  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.14 
 
 
313 aa  266  5e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.295857  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0502  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.71 
 
 
334 aa  265  5.999999999999999e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1871  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.65 
 
 
318 aa  265  7e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4998  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.2 
 
 
334 aa  264  1e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0466  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.2 
 
 
334 aa  264  1e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4872  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.2 
 
 
334 aa  264  1e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.216485  normal  0.0344479 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5048  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.2 
 
 
334 aa  264  2e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.173326  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0464  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.16 
 
 
317 aa  264  2e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.958757  normal  0.0392835 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5040  aspartate carbamoyltransferase  47.54 
 
 
334 aa  263  3e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3418  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  49.01 
 
 
317 aa  263  3e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10369  normal  0.633713 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0542  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.04 
 
 
334 aa  263  3e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.686364  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0482  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.54 
 
 
334 aa  262  4e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1425  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.58 
 
 
325 aa  262  4.999999999999999e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03120  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.54 
 
 
336 aa  262  4.999999999999999e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0295366  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>