More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0235 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0235  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  100 
 
 
339 aa  691    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02551  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  91.74 
 
 
338 aa  634    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.495258  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02541  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  93.81 
 
 
338 aa  649    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.290207  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02651  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  78.21 
 
 
338 aa  532  1e-150  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23931  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  57.88 
 
 
348 aa  430  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0647769 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02551  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  60.24 
 
 
337 aa  424  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2051  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  56.36 
 
 
349 aa  404  1e-111  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1600  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  56.67 
 
 
339 aa  398  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0292  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  55.89 
 
 
349 aa  398  9.999999999999999e-111  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.456226  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03121  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  56.97 
 
 
339 aa  388  1e-107  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.789221  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3762  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  45.43 
 
 
323 aa  320  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.474591  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0670  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.97 
 
 
338 aa  317  3e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0693313  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2742  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.71 
 
 
343 aa  315  6e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2958  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.67 
 
 
328 aa  313  2.9999999999999996e-84  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.172983 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1472  aspartate carbamoyltransferase  46.99 
 
 
331 aa  313  2.9999999999999996e-84  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4368  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  48.04 
 
 
331 aa  312  6.999999999999999e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.080689 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3160  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  46.67 
 
 
328 aa  311  9e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1174  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  47.31 
 
 
333 aa  310  2e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0233311  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2090  aspartate carbamoyltransferase  43.79 
 
 
305 aa  261  8.999999999999999e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.219596 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2529  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  41.46 
 
 
310 aa  258  1e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1575  aspartate carbamoyltransferase  42.47 
 
 
311 aa  257  2e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2268  aspartate carbamoyltransferase  40.3 
 
 
315 aa  254  2.0000000000000002e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.120593  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2863  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  41.46 
 
 
318 aa  253  2.0000000000000002e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.694024  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1615  aspartate carbamoyltransferase  40.6 
 
 
313 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0602203  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2193  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  43.24 
 
 
316 aa  253  5.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.345265 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2240  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  41.95 
 
 
310 aa  252  7e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.862655 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1305  aspartate carbamoyltransferase  41.64 
 
 
306 aa  250  2e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00032948  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0464  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  41.44 
 
 
317 aa  250  3e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.958757  normal  0.0392835 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3105  aspartate carbamoyltransferase  40.98 
 
 
302 aa  249  6e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.178757  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1425  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  40.91 
 
 
325 aa  249  6e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4019  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  40.91 
 
 
312 aa  248  8e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00788568  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0879  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  41.16 
 
 
307 aa  248  9e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2330  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  43.77 
 
 
313 aa  248  1e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2242  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  43.77 
 
 
313 aa  248  1e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.300493  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1618  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  43.77 
 
 
313 aa  247  2e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2085  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  39.94 
 
 
310 aa  247  2e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.148257  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0370  aspartate carbamoyltransferase  39.22 
 
 
309 aa  246  3e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.101132  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1199  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  41.52 
 
 
331 aa  245  8e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000831641  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0723  aspartate carbamoyltransferase  40.42 
 
 
320 aa  245  9e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.515501  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0953  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  40.6 
 
 
312 aa  244  9.999999999999999e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0935774  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_982  aspartate carbamoyltransferase, catalytic chain  41.52 
 
 
331 aa  244  9.999999999999999e-64  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2003  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  42.09 
 
 
342 aa  244  9.999999999999999e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000182057 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0725  aspartate carbamoyltransferase  41.57 
 
 
312 aa  244  9.999999999999999e-64  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00253963  hitchhiker  0.0000000314766 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1896  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  39.94 
 
 
310 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2312  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  39.94 
 
 
310 aa  243  3e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2434  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  40.68 
 
 
318 aa  243  3e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.123525  normal  0.183819 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3992  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  38.72 
 
 
318 aa  243  3.9999999999999997e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4279  aspartate carbamoyltransferase  40.55 
 
 
312 aa  242  7e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.527169 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1009  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  41.21 
 
 
331 aa  241  1e-62  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1769  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  39.33 
 
 
311 aa  240  2e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0422268  normal  0.117103 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3361  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  39.26 
 
 
308 aa  240  2e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.528301  hitchhiker  0.000131858 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2355  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  43.23 
 
 
313 aa  241  2e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0449699  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1856  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  39.33 
 
 
311 aa  240  2e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4545  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  43.17 
 
 
308 aa  240  2.9999999999999997e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2266  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  40.9 
 
 
337 aa  239  2.9999999999999997e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1271  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  38.41 
 
 
311 aa  239  5e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102849  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1878  aspartate carbamoyltransferase  40.54 
 
 
314 aa  239  5.999999999999999e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.714727 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1706  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  39.88 
 
 
309 aa  238  1e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0451069 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3015  aspartate carbamoyltransferase  39.14 
 
 
313 aa  238  1e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00265688  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1846  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  40.18 
 
 
308 aa  237  2e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.258176  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09370  aspartate carbamoyltransferase  41.93 
 
 
313 aa  237  2e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.370258  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1092  aspartate carbamoyltransferase  39.82 
 
 
316 aa  237  2e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000013953  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3418  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  38.74 
 
 
317 aa  237  2e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10369  normal  0.633713 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2428  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  40.98 
 
 
324 aa  238  2e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1713  aspartate carbamoyltransferase  38.48 
 
 
320 aa  237  3e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.389289 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3150  aspartate carbamoyltransferase  39.04 
 
 
309 aa  236  4e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.987909  hitchhiker  0.000518906 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3093  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  40.12 
 
 
310 aa  235  7e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0733  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  38.55 
 
 
311 aa  235  8e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.6361  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1375  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  40.73 
 
 
305 aa  235  9e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2657  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  39.21 
 
 
306 aa  235  9e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2893  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  43.59 
 
 
320 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3570  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  43.59 
 
 
320 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.503342 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0103  aspartate carbamoyltransferase  39.94 
 
 
329 aa  234  1.0000000000000001e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1853  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  39.88 
 
 
308 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.822345  normal  0.502816 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11409  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  38.96 
 
 
319 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.098973  normal  0.197941 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1284  aspartate carbamoyltransferase  44.07 
 
 
312 aa  233  2.0000000000000002e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0189809  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1301  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  38.84 
 
 
323 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.276181  normal  0.0170425 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1581  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  42.63 
 
 
320 aa  233  3e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.917792 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2964  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  39.39 
 
 
318 aa  233  3e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.585187  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2401  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  39.14 
 
 
328 aa  233  3e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0442258  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0910  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  42.63 
 
 
320 aa  233  3e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.297016 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4614  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  42.63 
 
 
320 aa  233  3e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10323  probable aspartate carbamoyltransferase  40.49 
 
 
309 aa  233  5e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3202  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  38.11 
 
 
318 aa  232  5e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0897828  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2512  aspartate carbamoyltransferase  40.3 
 
 
314 aa  232  8.000000000000001e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.287204  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0327  aspartate carbamoyltransferase  40.18 
 
 
312 aa  232  8.000000000000001e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.765691  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1871  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  38.92 
 
 
318 aa  231  9e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3136  aspartate carbamoyltransferase  39.63 
 
 
306 aa  231  1e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.604866  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1681  aspartate carbamoyltransferase  39.27 
 
 
312 aa  231  1e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.23856  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2740  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  40.12 
 
 
323 aa  231  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1352  aspartate carbamoyltransferase  39.45 
 
 
311 aa  231  2e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0159083 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1842  aspartate carbamoyltransferase  40 
 
 
351 aa  230  3e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.553475  normal  0.269234 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12620  aspartate carbamoyltransferase  37.9 
 
 
327 aa  229  4e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0895444  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0708  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  40 
 
 
323 aa  229  4e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2805  Aspartate carbamoyltransferase  39.94 
 
 
310 aa  229  5e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1380  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  43.59 
 
 
320 aa  229  5e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.591528  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2282  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  38.74 
 
 
317 aa  229  5e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.47523  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1173  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  39.88 
 
 
310 aa  229  6e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3061  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  39.7 
 
 
341 aa  229  6e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.280506  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3005  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  38.62 
 
 
323 aa  229  6e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.290399 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>