More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2505 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_2505  hydroxyacylglutathione hydrolase  100 
 
 
256 aa  513  1.0000000000000001e-145  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1750  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.91 
 
 
263 aa  194  1e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000000022513  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2055  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.68 
 
 
263 aa  193  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.413941  normal  0.0872893 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1321  hydroxyacylglutathione hydrolase  37.96 
 
 
254 aa  126  3e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.47741  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3270  hydroxyacylglutathione hydrolase  37.28 
 
 
256 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0093  hydroxyacylglutathione hydrolase  35.53 
 
 
255 aa  122  6e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.117082 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2381  hydroxyacylglutathione hydrolase  35.77 
 
 
256 aa  122  8e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.239292 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0508  hydroxyacylglutathione hydrolase  36.89 
 
 
255 aa  119  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.11609  normal  0.0226917 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0373  beta-lactamase-like protein  36.16 
 
 
255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.717136 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0343  metallo-beta-lactamase family protein  33.87 
 
 
256 aa  116  3e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1481  hydroxyacylglutathione hydrolase  35.63 
 
 
250 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00263805  normal  0.131466 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0069  hydroxyacylglutathione hydrolase  34.62 
 
 
255 aa  115  5e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0614  hydroxyacylglutathione hydrolase  36.4 
 
 
255 aa  115  6e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.362443  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1578  hydroxyacylglutathione hydrolase  34.21 
 
 
256 aa  114  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.156565 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7609  putative hydroxyacylglutathione hydrolase (glyoxalase II)  34.53 
 
 
255 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0185313  normal  0.217404 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0466  hydroxyacylglutathione hydrolase  36.76 
 
 
255 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.991116  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2798  hydroxyacylglutathione hydrolase  37.79 
 
 
272 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.233678 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01981  Hydroxyacylglutathione hydrolase  31.87 
 
 
263 aa  110  3e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0160657  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1866  hydroxyacylglutathione hydrolase  38.89 
 
 
255 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1984  hydroxyacylglutathione hydrolase  39.04 
 
 
255 aa  106  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.543925  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2651  hydroxyacylglutathione hydrolase  35.46 
 
 
258 aa  106  4e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0421465 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0917  hydroxyacylglutathione hydrolase  34.82 
 
 
258 aa  103  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0932864 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  36.41 
 
 
207 aa  103  4e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2063  hydroxyacylglutathione hydrolase  34 
 
 
255 aa  102  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.136922  hitchhiker  0.00967552 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1022  hydroxyacylglutathione hydrolase  32.77 
 
 
269 aa  103  4e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4036  glyoxalase II  31.43 
 
 
256 aa  101  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2445  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.4 
 
 
257 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0591  hydroxyacylglutathione hydrolase  37.65 
 
 
258 aa  100  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2438  hydroxyacylglutathione hydrolase  35.48 
 
 
259 aa  100  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1462  hydroxyacylglutathione hydrolase  33.33 
 
 
240 aa  100  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0144845  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1042  hydroxyacylglutathione hydrolase  33.86 
 
 
256 aa  99  6e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3665  hydroxyacylglutathione hydrolase  30 
 
 
257 aa  99  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.952724  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2788  hydroxyacylglutathione hydrolase  32.43 
 
 
268 aa  98.6  8e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000589518  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002770  hydroxyacylglutathione hydrolase  31.38 
 
 
252 aa  97.8  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.18088  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1403  hydroxyacylglutathione hydrolase  32.4 
 
 
258 aa  98.2  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0310666  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2291  hydroxyacylglutathione hydrolase  34.96 
 
 
257 aa  97.8  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.276958  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2401  putative metallo-beta-lactamase  31.69 
 
 
252 aa  97.4  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1432  hydroxyacylglutathione hydrolase  32.92 
 
 
259 aa  97.1  3e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.949505  normal  0.289854 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0448  hydroxyacylglutathione hydrolase  33.2 
 
 
255 aa  96.3  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.533461  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5360  hydroxyacylglutathione hydrolase  31.25 
 
 
263 aa  96.3  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0422  metallo-beta-lactamase family protein  29.27 
 
 
257 aa  95.9  6e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0543677  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1765  hydroxyacylglutathione hydrolase  29.27 
 
 
257 aa  95.9  6e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0430  hydroxyacylglutathione hydrolase  34.55 
 
 
256 aa  95.9  6e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.255177 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2530  hydroxyacylglutathione hydrolase  33.33 
 
 
257 aa  95.5  7e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.785477  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2116  hydroxyacylglutathione hydrolase  33.33 
 
 
257 aa  95.5  7e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1863  hydroxyacylglutathione hydrolase  32 
 
 
260 aa  94.7  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.255866  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1936  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  32 
 
 
257 aa  94.7  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1894  Hydroxyacylglutathione hydrolase  39.45 
 
 
255 aa  95.1  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.323846  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1828  putative hydroxyacylglutathione hydrolase GloB  31.16 
 
 
252 aa  95.1  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2871  hydroxyacylglutathione hydrolase  31.06 
 
 
263 aa  94.4  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00247676  normal  0.571794 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1665  hydroxyacylglutathione hydrolase  32.7 
 
 
256 aa  94  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1979  Hydroxyacylglutathione hydrolase  38.99 
 
 
255 aa  94.4  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1621  hydroxyacylglutathione hydrolase  32.31 
 
 
264 aa  94.4  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.252215  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1702  hydroxyacylglutathione hydrolase  29.53 
 
 
257 aa  94.4  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0461199  normal  0.908663 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1663  hydroxyacylglutathione hydrolase  34.58 
 
 
242 aa  94.4  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.44689 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1515  putative hydroxyacylglutathione hydrolase protein  33.59 
 
 
284 aa  93.2  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4897  hydroxyacylglutathione hydrolase  33.04 
 
 
257 aa  93.6  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0923  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.77 
 
 
260 aa  93.6  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.319486  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03213  hydroxyacylglutathione hydrolase  29.72 
 
 
252 aa  93.6  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3080  beta-lactamase-like  30.45 
 
 
255 aa  93.6  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120215  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1572  hydroxyacylglutathione hydrolase  31.67 
 
 
266 aa  93.2  4e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2510  hydroxyacylglutathione hydrolase  33.33 
 
 
259 aa  92  7e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.484378  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0684  hydroxyacylglutathione hydrolase  34.97 
 
 
246 aa  91.7  9e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29620  hydroxyacylglutathione hydrolase  34.51 
 
 
258 aa  91.3  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0944915  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16683  glyoxalase  30.04 
 
 
262 aa  91.3  1e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3786  hydroxyacylglutathione hydrolase  29.48 
 
 
257 aa  91.3  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.554974 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  33.02 
 
 
208 aa  91.7  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06840  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G12840)  26.17 
 
 
254 aa  91.3  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.39505  normal  0.976226 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1038  hydroxyacylglutathione hydrolase  33.49 
 
 
259 aa  90.5  2e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.769751 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1595  Beta-lactamase-like  32.34 
 
 
265 aa  90.5  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2733  hydroxyacylglutathione hydrolase  32.93 
 
 
259 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.725936  normal  0.296553 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1253  hydroxyacylglutathione hydrolase  29.48 
 
 
263 aa  90.9  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.100506  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1895  hydroxyacylglutathione hydrolase  28.69 
 
 
257 aa  90.9  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00137094  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2552  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.71 
 
 
256 aa  90.1  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.964384  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1468  metallo-beta-lactamase family protein  30.98 
 
 
268 aa  90.1  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.176854  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0765  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.98 
 
 
268 aa  90.1  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1275  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.98 
 
 
268 aa  90.1  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.987461  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0594  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.98 
 
 
268 aa  90.1  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0558  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.98 
 
 
268 aa  90.1  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2691  putative hydroxyacylglutathione hydrolase  31.35 
 
 
256 aa  90.1  4e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.25235  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05621  putative hydroxyacylglutathione hydrolase  27.53 
 
 
253 aa  89.4  5e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4875  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.4 
 
 
257 aa  89  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1498  metallo-beta-lactamase family protein  30.59 
 
 
268 aa  88.6  8e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.950921  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1602  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.59 
 
 
268 aa  88.6  8e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1257  hydroxyacylglutathione hydrolase (glyoxalase II)  29.78 
 
 
254 aa  88.2  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02510  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  28.45 
 
 
274 aa  88.6  1e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.115534  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1884  hydroxyacylglutathione hydrolase  29.82 
 
 
258 aa  88.2  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000396006  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1975  hydroxyacylglutathione hydrolase  36.65 
 
 
259 aa  88.2  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1678  hydroxyacylglutathione hydrolase  33.49 
 
 
256 aa  88.6  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.820114 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1743  hydroxyacylglutathione hydrolase  34.39 
 
 
259 aa  88.2  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0994564 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2187  hydroxyacylglutathione hydrolase  32.33 
 
 
266 aa  87.4  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0843  hydroxyacylglutathione hydrolase  32.6 
 
 
223 aa  86.7  3e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.55491 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1258  hydroxyacylglutathione hydrolase (glyoxalase II)  30.22 
 
 
254 aa  87  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2064  hydroxyacylglutathione hydrolase  32.27 
 
 
257 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.455867  normal  0.0515167 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3714  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  31.97 
 
 
259 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.610808  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1164  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.43 
 
 
260 aa  86.7  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000229771  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  31.6 
 
 
213 aa  86.3  4e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1587  hydroxyacylglutathione hydrolase  33.18 
 
 
255 aa  86.3  5e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.325978  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1986  hydroxyacylglutathione hydrolase  31.75 
 
 
278 aa  85.9  6e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1536  hydroxyacylglutathione hydrolase  29.18 
 
 
263 aa  85.5  7e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0733967  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>