More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_27100 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_27100  transcriptional regulator  100 
 
 		 85 aa  174  3e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.631262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4874  transcriptional regulator, GntR family  55.22 
 
 		 92 aa  78.6  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4876  transcriptional regulator, GntR family  48.65 
 
 		 100 aa  71.6  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6080  GntR family transcriptional regulator  56 
 
 		 238 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.348599 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0783  GntR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 248 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3182  transcriptional regulator, GntR family  42.67 
 
 		 248 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.659988  hitchhiker  0.001615 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0534  GntR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 244 aa  62  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.237769  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2878  GntR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 244 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3168  GntR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 244 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0478  GntR family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 244 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0696996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0551  GntR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 244 aa  62  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0720  GntR family regulatory protein  42.67 
 
 		 244 aa  62  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.035737  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0446  GntR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 244 aa  62  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4156  GntR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 244 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0138  GntR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 244 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.417671  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1450  GntR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 244 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0560  transcriptional regulator, GntR family  45.45 
 
 		 244 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.645686  normal  0.27798 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1007  GntR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 267 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.497463  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2450  GntR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 258 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000263261 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2580  GntR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 258 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.496201  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0763  GntR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 248 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237996 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2556  GntR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 248 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000796144 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2532  GntR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 248 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00685301  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1920  GntR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 248 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0292  GntR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 244 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0552  GntR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 248 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0339408 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2669  GntR domain-containing protein  52 
 
 		 237 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2257  GntR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 248 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1100  GntR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 248 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.100378  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5864  GntR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 248 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.564885  normal  0.734875 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0946  GntR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 248 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.406281  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0552  GntR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 248 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.689242  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0754  GntR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 248 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.304598  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2130  GntR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 248 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0949  GntR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 248 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3370  GntR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 247 aa  59.7  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2802  GntR domain-containing protein  52 
 
 		 237 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6155  GntR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 244 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.272713  normal  0.391554 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2836  GntR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 244 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2825  GntR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 244 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.214074  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5449  GntR family transcriptional regulator  52 
 
 		 247 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.179216  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0209  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  48.44 
 
 		 474 aa  58.5  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0214  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  48.44 
 
 		 478 aa  58.5  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2212  GntR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 244 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.189171  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1361  putative transcriptional regulator  43.94 
 
 		 277 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141756  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2885  GntR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 244 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.790974  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2743  GntR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 244 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.927097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5185  GntR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 496 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0411857 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5903  GntR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 288 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.210517  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1440  transcriptional regulator  45.45 
 
 		 482 aa  57.8  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5379  GntR domain-containing protein  48 
 
 		 234 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.791423  normal  0.648453 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1119  GntR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 257 aa  57.4  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.196429 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3876  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  43.94 
 
 		 476 aa  57.4  0.00000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3799  GntR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 251 aa  57  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.392461  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4206  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  48.44 
 
 		 249 aa  57  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15830  GntR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 247 aa  57  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.800651  normal  0.0246518 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2941  GntR family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 259 aa  56.2  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.994772  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5900  GntR family transcriptional regulator  46 
 
 		 232 aa  56.6  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.540308 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4331  regulatory protein GntR, HTH  41.54 
 
 		 83 aa  55.8  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.157834  normal  0.0446909 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4773  regulatory protein GntR HTH  41.54 
 
 		 86 aa  55.5  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0230746  decreased coverage  0.0000199602 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2915  GntR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 249 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5275  GntR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 496 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.187277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3253  putative transcriptional regulator  44.44 
 
 		 474 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0471959  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4063  GntR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 256 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4447  GntR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 238 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1365  GntR domain-containing protein  41.38 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38250  putative transcriptional regulator  44.44 
 
 		 474 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293552 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0431  GntR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 241 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1390  GntR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 241 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0949  GntR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 241 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1096  GntR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 277 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113015  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1800  GntR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 241 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00723826  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2096  GntR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 471 aa  54.7  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.698776  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0214  GntR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 241 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.892015  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1885  GntR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 241 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5531  GntR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 473 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.433178 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1076  GntR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0019673 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1179  GntR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 244 aa  54.3  0.0000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33520  transcriptional regulator  45 
 
 		 263 aa  54.3  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.422261  normal  0.208572 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4179  regulatory protein GntR HTH  45.31 
 
 		 243 aa  54.3  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8675  putative transcriptional regulator, GntR family  40.54 
 
 		 157 aa  54.3  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5327  transcriptional regulator  43.75 
 
 		 496 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.898471  normal  0.06298 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2064  GntR domain protein  42.42 
 
 		 247 aa  53.9  0.0000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5787  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  43.08 
 
 		 483 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0349  transcriptional regulatory protein  44.44 
 
 		 277 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0240  GntR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 473 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5190  GntR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 240 aa  52.8  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.702411  normal  0.0588532 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3668  transcriptional regulator  44.44 
 
 		 509 aa  53.1  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22591  normal  0.0459269 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4012  transcriptional regulator, GntR family  44.44 
 
 		 240 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.696075  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4125  transcriptional regulator, GntR family  44.44 
 
 		 240 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0374  GntR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 243 aa  53.1  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0543  trehalose operon repressor  36.51 
 
 		 235 aa  53.5  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.405615  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0195  transcriptional regulator  44.44 
 
 		 476 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.344664  hitchhiker  0.000191089 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0369  transcriptional regulator  34.92 
 
 		 243 aa  53.1  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0527  trehalose operon transcriptional repressor  36.51 
 
 		 235 aa  53.5  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0096  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I  43.75 
 
 		 473 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6904  transcriptional regulator  40 
 
 		 483 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3689  GntR domain-containing protein  37.88 
 
 		 247 aa  52.4  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.349225 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4145  GntR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 247 aa  52.4  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0283  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 233 aa  52.4  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.696412  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>