72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_23670 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_23670  hypothetical protein  100 
 
 		 225 aa  448  1e-125  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.172627 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2009  hydrolase, alpha/beta fold family protein  55.8 
 
 		 235 aa  249  2e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000348301  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2999  alpha/beta hydrolase fold protein  50 
 
 		 229 aa  200  9.999999999999999e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.049692 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3816  hypothetical protein  47.79 
 
 		 231 aa  190  2e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4669  hypothetical protein  46.49 
 
 		 221 aa  182  5.0000000000000004e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0416711  normal  0.0226392 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8879  hypothetical protein  41.78 
 
 		 232 aa  164  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4024  hypothetical protein  45.04 
 
 		 131 aa  94.7  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.783966  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3359  hydrolase, alpha/beta fold family protein  36.56 
 
 		 234 aa  93.2  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0379028 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2246  hypothetical protein  29.74 
 
 		 241 aa  65.1  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0661824  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2722  hypothetical protein  26.64 
 
 		 289 aa  63.2  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.538859  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1902  EstC  26.27 
 
 		 235 aa  62  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00691738  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1760  alpha/beta hydrolase fold  26.12 
 
 		 235 aa  62.4  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000242559  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4620  hypothetical protein  28.44 
 
 		 233 aa  61.2  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3448  hypothetical protein  29.28 
 
 		 263 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2476  esterase EstC, putative  30.52 
 
 		 261 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.706044 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5268  hypothetical protein  28.38 
 
 		 263 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.744913  normal  0.596903 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6228  secreted protein  29.39 
 
 		 232 aa  57  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2250  hypothetical protein  26.92 
 
 		 242 aa  55.8  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.32812  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2042  alpha/beta hydrolase fold protein  28.02 
 
 		 279 aa  53.5  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.10769  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1801  hypothetical protein  27.53 
 
 		 238 aa  54.3  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0314686 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7041  hypothetical protein  28.7 
 
 		 257 aa  53.9  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2994  putative secreted protein  26.32 
 
 		 257 aa  53.1  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1718  hypothetical protein  24.67 
 
 		 276 aa  53.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.205208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6978  putative secreted protein  25.33 
 
 		 276 aa  52.8  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.304279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4636  alpha/beta hydrolase fold  29.11 
 
 		 234 aa  52  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2328  signal peptide protein  26.24 
 
 		 259 aa  51.6  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.267714 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2397  hypothetical protein  28.24 
 
 		 238 aa  51.6  0.000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0924  hypothetical protein  28.33 
 
 		 242 aa  51.2  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.289399  normal  0.196921 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5405  alpha/beta hydrolase fold protein  25.64 
 
 		 274 aa  51.6  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0752119  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6062  hypothetical protein  24.89 
 
 		 262 aa  50.8  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1479  hypothetical protein  27.11 
 
 		 259 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4177  esterase EstC, putative  29.72 
 
 		 261 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.10139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3699  esterase EstC, putative  29.72 
 
 		 256 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3712  esterase EstC, putative  29.72 
 
 		 256 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1500  esterase/lipase/thioesterase domain-containing protein  26.54 
 
 		 231 aa  49.7  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0839932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3823  hypothetical protein  28.19 
 
 		 255 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.566879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3772  esterase EstC, putative  29.72 
 
 		 256 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.307611 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6320  putative secreted protein  25 
 
 		 276 aa  48.9  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.574941 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1452  hypothetical protein  26.36 
 
 		 259 aa  48.9  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.419886  normal  0.505883 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1509  putative secreted protein  24.89 
 
 		 276 aa  48.9  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3673  signal peptide protein  24.02 
 
 		 255 aa  48.9  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1008  alpha/beta hydrolase fold  26.47 
 
 		 240 aa  48.5  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.854645  normal  0.0281886 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3044  alpha/beta hydrolase fold protein  32.38 
 
 		 278 aa  48.5  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0386  putative secreted protein  25.66 
 
 		 257 aa  48.5  0.00009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0955  hypothetical protein  28.22 
 
 		 257 aa  48.5  0.00009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4708  hypothetical protein  26.99 
 
 		 255 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2859  hypothetical protein  34.45 
 
 		 222 aa  47.8  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2687  putative esterase  32.71 
 
 		 244 aa  47.8  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2393  alpha/beta hydrolase fold  27.16 
 
 		 240 aa  47.4  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.507497 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6933  hypothetical protein  33.88 
 
 		 241 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0641  hypothetical protein  26.25 
 
 		 261 aa  47  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0033841  normal  0.0977111 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2444  hypothetical protein  25.82 
 
 		 260 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1601  hypothetical protein  26.13 
 
 		 261 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.488204  normal  0.0819094 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4902  hypothetical protein  28.38 
 
 		 268 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48640  hypothetical protein  30.29 
 
 		 211 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.952742  hitchhiker  0.0092637 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1504  hypothetical protein  26.43 
 
 		 263 aa  45.8  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1772  lysophospholipase-like protein  20.27 
 
 		 222 aa  45.8  0.0005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5834  hypothetical protein  27.27 
 
 		 259 aa  45.8  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0216579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2823  hypothetical protein  26.22 
 
 		 267 aa  45.1  0.0009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.469785  normal  0.411077 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1996  putative hydrolase protein  38.1 
 
 		 257 aa  44.7  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.639101  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1873  hypothetical protein  27.83 
 
 		 256 aa  44.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.875545  normal  0.203455 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0228  hypothetical protein  24.02 
 
 		 257 aa  45.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2864  alpha/beta hydrolase  27.35 
 
 		 245 aa  44.3  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.134825  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2162  hypothetical protein  25 
 
 		 256 aa  44.7  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00663104  normal  0.456218 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3619  alpha/beta hydrolase fold protein  26.47 
 
 		 286 aa  43.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.938744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4408  hypothetical protein  26.32 
 
 		 221 aa  43.1  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2469  esterase/lipase/thioesterase domain-containing protein  25.55 
 
 		 230 aa  42.7  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0259  hypothetical protein  22.91 
 
 		 270 aa  42.4  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2190  hypothetical protein  26.2 
 
 		 278 aa  42  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6793  secreted protein  25.33 
 
 		 268 aa  42  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2532  hypothetical protein  25.97 
 
 		 249 aa  42.4  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2733  hypothetical protein  25.22 
 
 		 229 aa  41.6  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000713266 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>