27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_48640 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_48640  hypothetical protein  100 
 
 		 211 aa  417  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.952742  hitchhiker  0.0092637 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0344  hypothetical protein  29.08 
 
 		 267 aa  56.6  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2275  hydrolase protein  28.7 
 
 		 250 aa  53.9  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.318308  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4620  hypothetical protein  32.94 
 
 		 233 aa  50.1  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2994  putative secreted protein  24.55 
 
 		 257 aa  47.8  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4007  hypothetical protein  26.87 
 
 		 263 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.508442 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2628  hypothetical protein  26.43 
 
 		 263 aa  46.2  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0259  hypothetical protein  24.24 
 
 		 270 aa  45.8  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3511  hypothetical protein  26.87 
 
 		 263 aa  45.8  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2009  hydrolase, alpha/beta fold family protein  26.6 
 
 		 235 aa  45.1  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000348301  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2162  hypothetical protein  25.73 
 
 		 256 aa  45.1  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00663104  normal  0.456218 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1382  hypothetical protein  29.07 
 
 		 256 aa  44.3  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.484877 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0526  hypothetical protein  23.31 
 
 		 256 aa  44.7  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3448  hypothetical protein  43.18 
 
 		 263 aa  43.5  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0112  hypothetical protein  32.05 
 
 		 270 aa  43.1  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.237819  normal  0.370243 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2444  hypothetical protein  27.91 
 
 		 260 aa  43.5  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1873  hypothetical protein  25.94 
 
 		 256 aa  43.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.875545  normal  0.203455 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4636  alpha/beta hydrolase fold  26.09 
 
 		 234 aa  43.1  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3614  putative signal peptide protein  25 
 
 		 244 aa  43.1  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.143133  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4708  hypothetical protein  23.64 
 
 		 255 aa  42.7  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6793  secreted protein  26.58 
 
 		 268 aa  42.7  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5268  hypothetical protein  40.91 
 
 		 263 aa  42.7  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.744913  normal  0.596903 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2328  signal peptide protein  26.11 
 
 		 259 aa  42.7  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.267714 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0379  alpha/beta hydrolase fold protein  28.4 
 
 		 285 aa  42.4  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1479  hypothetical protein  26.01 
 
 		 259 aa  42.4  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1601  hypothetical protein  23.91 
 
 		 261 aa  41.6  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.488204  normal  0.0819094 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2042  alpha/beta hydrolase fold protein  25.28 
 
 		 279 aa  41.6  0.008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.10769  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>