More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1375 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1375  50S ribosomal protein L9  100 
 
 
148 aa  283  4e-76  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0636184  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0755  50S ribosomal protein L9  59.46 
 
 
147 aa  167  5e-41  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.123004  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0691  50S ribosomal protein L9  56.08 
 
 
147 aa  160  7e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.965634  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0766  50S ribosomal protein L9  55.41 
 
 
147 aa  159  9e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1335  50S ribosomal protein L9  55.41 
 
 
147 aa  159  1e-38  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.779246  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1063  ribosomal protein L9  56.08 
 
 
147 aa  154  4e-37  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.342712  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1029  ribosomal protein L9  54.73 
 
 
148 aa  152  1e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0075177  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1220  50S ribosomal protein L9  52.7 
 
 
148 aa  147  3e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.592412  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1975  50S ribosomal protein L9  53.02 
 
 
149 aa  144  3e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1000  50S ribosomal protein L9  54.05 
 
 
147 aa  140  5e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2388  50S ribosomal protein L9  40.54 
 
 
147 aa  106  9.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2257  50S ribosomal protein L9  41.89 
 
 
148 aa  104  4e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000108464  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4506  ribosomal protein L9  35.81 
 
 
149 aa  101  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.594005  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2925  ribosomal protein L9  38.51 
 
 
147 aa  100  9e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0843322  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3092  50S ribosomal protein L9  36.67 
 
 
148 aa  96.7  9e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0370883  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0081  50S ribosomal protein L9  38.51 
 
 
148 aa  96.7  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.957353  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0654  ribosomal protein L9  38.36 
 
 
146 aa  95.9  2e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.233351  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0602  ribosomal protein L9  37.16 
 
 
159 aa  95.9  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0165  50S ribosomal protein L9  33.78 
 
 
148 aa  94.7  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000317895  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0881  50S ribosomal protein L9  42.76 
 
 
148 aa  94  6e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00774862  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2535  ribosomal protein L9  36.49 
 
 
148 aa  92.8  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000849852  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0150  50S ribosomal protein L9  35.81 
 
 
151 aa  92.4  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157053  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4946  ribosomal protein L9  34.46 
 
 
148 aa  92  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0011  50S ribosomal protein L9  34.48 
 
 
150 aa  92  3e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.557694  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1410  50S ribosomal protein L9  35.14 
 
 
171 aa  91.7  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000225617  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4841  ribosomal protein L9  34.44 
 
 
148 aa  91.3  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1422  50S ribosomal protein L9  37.16 
 
 
151 aa  91.3  4e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0660955  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0132  50S ribosomal protein L9P  34.46 
 
 
150 aa  91.3  5e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.191578  normal  0.450064 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0012  50S ribosomal protein L9  35.86 
 
 
154 aa  90.9  5e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.181348  hitchhiker  0.0000209307 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3412  50S ribosomal protein L9  39.6 
 
 
149 aa  90.9  6e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1352  50S ribosomal protein L9  37.58 
 
 
167 aa  89.4  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2130  50S ribosomal protein L9  33.55 
 
 
149 aa  89.7  1e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.929246  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3558  50S ribosomal protein L9  33.97 
 
 
148 aa  88.6  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.882223 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0561  ribosomal protein L9  35.1 
 
 
149 aa  89.4  2e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.204129  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2002  50S ribosomal protein L9  38.51 
 
 
153 aa  89.4  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0148705  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0448  50S ribosomal protein L9  37.5 
 
 
148 aa  88.2  3e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000315624  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1150  50S ribosomal protein L9  35.76 
 
 
165 aa  88.6  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0292661  hitchhiker  0.00494207 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0161  50S ribosomal protein L9  32.43 
 
 
148 aa  88.6  3e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000723092  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4351  ribosomal protein L9  33.78 
 
 
148 aa  87.8  5e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2102  50S ribosomal protein L9P  39.22 
 
 
149 aa  87  7e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0117  50S ribosomal protein L9  34.46 
 
 
151 aa  87.4  7e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0740  ribosomal protein L9  34.48 
 
 
150 aa  87.4  7e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0014  50S ribosomal protein L9P  33.33 
 
 
151 aa  87  8e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3528  50S ribosomal protein L9  35.33 
 
 
168 aa  86.7  9e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.156676  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1814  ribosomal protein L9  39.13 
 
 
149 aa  86.7  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2509  50S ribosomal protein L9  33.78 
 
 
151 aa  86.7  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000781135  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4931  50S ribosomal protein L9  37.24 
 
 
148 aa  85.9  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.108353  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31750  LSU ribosomal protein L9P  33.11 
 
 
157 aa  85.1  3e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1692  50S ribosomal protein L9  35.48 
 
 
149 aa  85.1  3e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9354  50S ribosomal protein L9P  32.89 
 
 
148 aa  85.1  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.837132 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2212  50S ribosomal protein L9  34.56 
 
 
150 aa  84.3  4e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0023  ribosomal protein L9  32.24 
 
 
174 aa  84.3  5e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.725827  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4336  50S ribosomal protein L9  34.9 
 
 
150 aa  84.3  5e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2972  50S ribosomal protein L9  39.22 
 
 
148 aa  84  6e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2650  50S ribosomal protein L9  39.22 
 
 
148 aa  84  6e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.502254  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6995  ribosomal protein L9  35.29 
 
 
148 aa  84  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.142438 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1096  50S ribosomal protein L9  33.57 
 
 
160 aa  83.6  9e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.547655  normal  0.0167988 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09988  ribosomal protein L9  36.24 
 
 
149 aa  83.2  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.536224  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2911  ribosomal protein L9  39.6 
 
 
147 aa  82.4  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000198897  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0894  50S ribosomal protein L9  35.81 
 
 
149 aa  82  0.000000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000571684  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1976  50S ribosomal protein L9  37.75 
 
 
152 aa  82  0.000000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3541  50S ribosomal protein L9  40.27 
 
 
149 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0397  hypothetical protein  34.19 
 
 
149 aa  82.4  0.000000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0110  50S ribosomal protein L9  33.11 
 
 
151 aa  81.6  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000508651  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0789  50S ribosomal protein L9  37.41 
 
 
150 aa  81.3  0.000000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3757  50S ribosomal protein L9  36.99 
 
 
148 aa  81.3  0.000000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3666  50S ribosomal protein L9  35.95 
 
 
149 aa  80.9  0.000000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.006093  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4661  50S ribosomal protein L9P  30.87 
 
 
148 aa  80.9  0.000000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2135  ribosomal protein L9  35.07 
 
 
148 aa  80.5  0.000000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000758155  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2610  50S ribosomal protein L9  34.48 
 
 
147 aa  80.5  0.000000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.196058  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1359  ribosomal protein L9  32.17 
 
 
151 aa  80.5  0.000000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0122536  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11530  ribosomal protein L9  34.65 
 
 
191 aa  80.5  0.000000000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0446546  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1403  50S ribosomal protein L9  36.42 
 
 
150 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.318005  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4117  50S ribosomal protein L9  35.14 
 
 
150 aa  79.7  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3888  50S ribosomal protein L9  35.14 
 
 
150 aa  79.7  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00361277 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2022  50S ribosomal protein L9  31.08 
 
 
168 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.278988  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5171  50S ribosomal protein L9  34.64 
 
 
150 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2332  ribosomal protein L9  34.93 
 
 
170 aa  79  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.640711  hitchhiker  0.00706783 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1894  50S ribosomal protein L9  34.64 
 
 
150 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000492255  hitchhiker  0.000000062237 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6208  50S ribosomal protein L9  34.64 
 
 
150 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1871  50S ribosomal protein L9  34.64 
 
 
150 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.539407  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5262  50S ribosomal protein L9  33.1 
 
 
148 aa  79  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00409171  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2538  50S ribosomal protein L9  34.93 
 
 
148 aa  78.2  0.00000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0130  50S ribosomal protein L9  30.2 
 
 
149 aa  78.6  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0311991 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3480  50S ribosomal protein L9  38.71 
 
 
146 aa  78.6  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.34024  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3697  ribosomal protein L9  32.21 
 
 
149 aa  78.6  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7042  ribosomal protein L9  35.53 
 
 
151 aa  78.6  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl083  50S ribosomal protein L9  34.46 
 
 
147 aa  78.2  0.00000000000004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000770286  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0097  50S ribosomal protein L9  32.43 
 
 
151 aa  78.2  0.00000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.625219  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0851  50S ribosomal protein L9P  28.77 
 
 
149 aa  77.8  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3991  50S ribosomal protein L9  30.41 
 
 
165 aa  77.4  0.00000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00054476 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0042  ribosomal protein L9  32.88 
 
 
150 aa  77  0.00000000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18631  50S ribosomal protein L9  36.13 
 
 
151 aa  77  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.58702  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1780  50S ribosomal protein L9  33.33 
 
 
150 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1808  50S ribosomal protein L9  33.33 
 
 
150 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.432428  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7309  50S ribosomal protein L9  28.48 
 
 
148 aa  76.3  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.937449  normal  0.0304173 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1966  50S ribosomal protein L9  34.69 
 
 
150 aa  76.6  0.0000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2006  ribosomal protein L9  34.01 
 
 
152 aa  76.3  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0064  50S ribosomal protein L9  31.72 
 
 
149 aa  75.9  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.452229  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0517  50S ribosomal protein L9  31.58 
 
 
151 aa  75.9  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>