More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0894 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0894  50S ribosomal protein L9  100 
 
 		 149 aa  293  8e-79  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000571684  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1422  50S ribosomal protein L9  57.43 
 
 		 151 aa  160  7e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0660955  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0064  50S ribosomal protein L9  53.02 
 
 		 149 aa  138  3e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.452229  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0064  50S ribosomal protein L9  53.02 
 
 		 149 aa  138  3e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0561  ribosomal protein L9  51.03 
 
 		 149 aa  138  3e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.204129  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2972  50S ribosomal protein L9  52.74 
 
 		 148 aa  129  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2650  50S ribosomal protein L9  52.74 
 
 		 148 aa  129  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.502254  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1814  ribosomal protein L9  44.83 
 
 		 149 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2257  50S ribosomal protein L9  47.97 
 
 		 148 aa  125  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000108464  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0851  50S ribosomal protein L9P  40.41 
 
 		 149 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3757  50S ribosomal protein L9  43.45 
 
 		 148 aa  123  8.000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0132  50S ribosomal protein L9P  44.74 
 
 		 150 aa  122  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.191578  normal  0.450064 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4351  ribosomal protein L9  43.15 
 
 		 148 aa  122  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0161  50S ribosomal protein L9  42.07 
 
 		 148 aa  121  2e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000723092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1150  50S ribosomal protein L9  41.61 
 
 		 165 aa  121  3e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0292661  hitchhiker  0.00494207 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0117  50S ribosomal protein L9  41.38 
 
 		 151 aa  120  9e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1359  ribosomal protein L9  47.55 
 
 		 151 aa  119  9.999999999999999e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0122536  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2535  ribosomal protein L9  47.3 
 
 		 148 aa  119  9.999999999999999e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000849852  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0602  ribosomal protein L9  42.07 
 
 		 159 aa  118  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2509  50S ribosomal protein L9  42.07 
 
 		 151 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000781135  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0881  50S ribosomal protein L9  51.03 
 
 		 148 aa  117  6e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00774862  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0150  50S ribosomal protein L9  40.69 
 
 		 151 aa  117  7e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157053  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1096  50S ribosomal protein L9  39.6 
 
 		 160 aa  115  3e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.547655  normal  0.0167988 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0110  50S ribosomal protein L9  40.69 
 
 		 151 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000508651  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3303  ribosomal protein L9  42.76 
 
 		 149 aa  114  5e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204917  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2388  50S ribosomal protein L9  43.92 
 
 		 147 aa  113  7.999999999999999e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2135  ribosomal protein L9  43.61 
 
 		 148 aa  113  8.999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000758155  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2911  ribosomal protein L9  47.59 
 
 		 147 aa  113  1.0000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000198897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0165  50S ribosomal protein L9  40 
 
 		 148 aa  112  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000317895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0081  50S ribosomal protein L9  40.69 
 
 		 148 aa  112  3e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.957353  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1000  50S ribosomal protein L9  45.95 
 
 		 147 aa  111  3e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1996  50S ribosomal protein L9  40.69 
 
 		 148 aa  110  7.000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0654  ribosomal protein L9  42.07 
 
 		 146 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.233351  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0097  50S ribosomal protein L9  37.93 
 
 		 151 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.625219  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5262  50S ribosomal protein L9  44.14 
 
 		 148 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00409171  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2925  ribosomal protein L9  45.21 
 
 		 147 aa  108  3e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0843322  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3412  50S ribosomal protein L9  43.45 
 
 		 149 aa  108  3e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4542  50S ribosomal protein L9  38.36 
 
 		 152 aa  107  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.736351 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2212  50S ribosomal protein L9  39.71 
 
 		 150 aa  107  7.000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3991  50S ribosomal protein L9  42.28 
 
 		 165 aa  106  8.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00054476 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4506  ribosomal protein L9  35.57 
 
 		 149 aa  105  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.594005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1410  50S ribosomal protein L9  36.49 
 
 		 171 aa  105  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000225617  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1975  50S ribosomal protein L9  44.97 
 
 		 149 aa  105  3e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1220  50S ribosomal protein L9  43.24 
 
 		 148 aa  103  5e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.592412  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4931  50S ribosomal protein L9  44.14 
 
 		 148 aa  103  6e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.108353  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3558  50S ribosomal protein L9  34.93 
 
 		 148 aa  103  9e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.882223 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5620  50S ribosomal protein L9  45.52 
 
 		 148 aa  102  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000412151  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5657  50S ribosomal protein L9  45.52 
 
 		 148 aa  102  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000227696  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1063  ribosomal protein L9  43.14 
 
 		 147 aa  102  1e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.342712  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3528  50S ribosomal protein L9  39.73 
 
 		 168 aa  102  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.156676  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4841  ribosomal protein L9  36.99 
 
 		 148 aa  102  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5322  50S ribosomal protein L9  45.52 
 
 		 148 aa  102  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5150  50S ribosomal protein L9  45.52 
 
 		 148 aa  102  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000483517  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5166  50S ribosomal protein L9  45.52 
 
 		 148 aa  102  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0461945  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5579  50S ribosomal protein L9  45.52 
 
 		 148 aa  102  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.17506e-22 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5718  50S ribosomal protein L9  45.52 
 
 		 148 aa  102  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000626689  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18001  50S ribosomal protein L9  38.26 
 
 		 152 aa  102  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5339  50S ribosomal protein L9  45.52 
 
 		 148 aa  102  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000103383  hitchhiker  0.00000000147927 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2028  50S ribosomal protein L9  36.24 
 
 		 167 aa  102  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.728229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5596  50S ribosomal protein L9  45.52 
 
 		 148 aa  101  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000245736  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4661  50S ribosomal protein L9P  36.3 
 
 		 148 aa  101  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4946  ribosomal protein L9  37.24 
 
 		 148 aa  100  6e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23320  ribosomal protein L9  47.26 
 
 		 147 aa  100  6e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.507738  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2193  50S ribosomal protein L9  38.1 
 
 		 152 aa  100  6e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1765  50S ribosomal protein L9  36.99 
 
 		 151 aa  100  7e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5913  ribosomal protein L9  37.41 
 
 		 150 aa  100  7e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6995  ribosomal protein L9  39.35 
 
 		 148 aa  100  8e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.142438 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1350  50S ribosomal protein L9  39.86 
 
 		 189 aa  100  8e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0676227  normal  0.268494 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3244  50S ribosomal protein L9  36.49 
 
 		 152 aa  100  8e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.65089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2852  50S ribosomal protein L9  36.49 
 
 		 152 aa  100  9e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2022  50S ribosomal protein L9  35.57 
 
 		 168 aa  100  9e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.278988  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2559  50S ribosomal protein L9  38.51 
 
 		 152 aa  99.4  1e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0755  50S ribosomal protein L9  43.24 
 
 		 147 aa  99.8  1e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.123004  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0116  50S ribosomal protein L9  38.62 
 
 		 149 aa  98.6  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18631  50S ribosomal protein L9  36.49 
 
 		 151 aa  99  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4178  ribosomal protein L9  36.55 
 
 		 151 aa  99  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0541  50S ribosomal protein L9  37.58 
 
 		 151 aa  98.2  3e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0134  50S ribosomal protein L9  38.62 
 
 		 149 aa  98.2  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0123  50S ribosomal protein L9  38.62 
 
 		 149 aa  98.2  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2130  50S ribosomal protein L9  36.3 
 
 		 149 aa  98.2  3e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.929246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18821  50S ribosomal protein L9  36.49 
 
 		 151 aa  97.4  5e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0277205  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1029  ribosomal protein L9  37.16 
 
 		 148 aa  97.1  7e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0075177  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3363  ribosomal protein L9  35.57 
 
 		 201 aa  96.3  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1352  50S ribosomal protein L9  34.23 
 
 		 167 aa  96.7  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18631  50S ribosomal protein L9  35.62 
 
 		 151 aa  96.7  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.58702  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2542  50S ribosomal protein L9  36.91 
 
 		 152 aa  96.7  1e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0011  50S ribosomal protein L9  38.93 
 
 		 150 aa  96.3  1e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.557694  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_482  ribosomal protein L9  36.91 
 
 		 151 aa  96.3  1e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37780  LSU ribosomal protein L9P  36.55 
 
 		 149 aa  96.3  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.236654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4009  50S ribosomal protein L9  43.45 
 
 		 148 aa  96.3  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.015297  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4519  50S ribosomal protein L9  33.1 
 
 		 148 aa  95.9  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.986951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3541  50S ribosomal protein L9  42.76 
 
 		 149 aa  95.5  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0141  50S ribosomal protein L9  39.86 
 
 		 189 aa  95.1  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7309  50S ribosomal protein L9  33.79 
 
 		 148 aa  95.1  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.937449  normal  0.0304173 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0517  50S ribosomal protein L9  36.91 
 
 		 151 aa  94.7  3e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1774  50S ribosomal protein L9  39.86 
 
 		 189 aa  95.1  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1375  50S ribosomal protein L9  38.41 
 
 		 148 aa  94.4  4e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0636184  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0691  50S ribosomal protein L9  39.86 
 
 		 147 aa  94.7  4e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.965634  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0766  50S ribosomal protein L9  38.62 
 
 		 147 aa  94.4  5e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1335  50S ribosomal protein L9  38.62 
 
 		 147 aa  94.4  5e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.779246  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>