More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3888 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_3888  50S ribosomal protein L9  100 
 
 		 150 aa  298  2e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00361277 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4117  50S ribosomal protein L9  92.67 
 
 		 150 aa  277  3e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23230  LSU ribosomal protein L9P  71.33 
 
 		 153 aa  199  9.999999999999999e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3697  ribosomal protein L9  58.78 
 
 		 149 aa  178  2e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4336  50S ribosomal protein L9  60.69 
 
 		 150 aa  174  5e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4841  ribosomal protein L9  56.16 
 
 		 148 aa  169  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9354  50S ribosomal protein L9P  56.85 
 
 		 148 aa  167  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.837132 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31750  LSU ribosomal protein L9P  56.08 
 
 		 157 aa  167  4e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37780  LSU ribosomal protein L9P  56.08 
 
 		 149 aa  164  5e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.236654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5065  50S ribosomal protein L9  53.74 
 
 		 148 aa  160  5.0000000000000005e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.972236  hitchhiker  0.000155251 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4178  ribosomal protein L9  54.48 
 
 		 151 aa  160  5.0000000000000005e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4553  50S ribosomal protein L9  54.42 
 
 		 148 aa  160  5.0000000000000005e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.156994  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3352  ribosomal protein L9  56.76 
 
 		 151 aa  156  7e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.600621  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0130  50S ribosomal protein L9  51.35 
 
 		 149 aa  156  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0311991 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4946  ribosomal protein L9  52.74 
 
 		 148 aa  154  4e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0334  50S ribosomal protein L9  54.11 
 
 		 151 aa  154  5.0000000000000005e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.801723 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3092  50S ribosomal protein L9  55.48 
 
 		 148 aa  153  6e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0370883  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3558  50S ribosomal protein L9  52.05 
 
 		 148 aa  153  9e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.882223 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5065  ribosomal protein L9  55.78 
 
 		 151 aa  150  5e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.366091  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26560  LSU ribosomal protein L9P  55.86 
 
 		 148 aa  147  3e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.199017 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4661  50S ribosomal protein L9P  51.03 
 
 		 148 aa  148  3e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2522  ribosomal protein L9  53.42 
 
 		 150 aa  145  1.0000000000000001e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.559663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4519  50S ribosomal protein L9  52.78 
 
 		 148 aa  145  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.986951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2130  50S ribosomal protein L9  50.34 
 
 		 149 aa  142  1e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.929246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4737  ribosomal protein L9  53.02 
 
 		 150 aa  139  9.999999999999999e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7309  50S ribosomal protein L9  48.63 
 
 		 148 aa  137  6e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.937449  normal  0.0304173 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0877  50S ribosomal protein L9  49.33 
 
 		 151 aa  133  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4166  ribosomal protein L9  50 
 
 		 150 aa  129  1.0000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10055  50S ribosomal protein L9  46.98 
 
 		 152 aa  126  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.95125e-19  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5743  50S ribosomal protein L9  47.65 
 
 		 152 aa  125  3e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.245852 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5367  50S ribosomal protein L9  47.65 
 
 		 152 aa  125  3e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5456  50S ribosomal protein L9  47.65 
 
 		 152 aa  125  3e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.166119  normal  0.0135281 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6031  50S ribosomal protein L9  46.67 
 
 		 151 aa  124  3e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.827335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7042  ribosomal protein L9  47.26 
 
 		 151 aa  124  4.0000000000000003e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39420  LSU ribosomal protein L9P  43.05 
 
 		 152 aa  122  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0132  50S ribosomal protein L9P  43.15 
 
 		 150 aa  120  6e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.191578  normal  0.450064 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5366  ribosomal protein L9  42 
 
 		 151 aa  114  3.9999999999999997e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2332  ribosomal protein L9  39.46 
 
 		 170 aa  110  5e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.640711  hitchhiker  0.00706783 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0097  50S ribosomal protein L9  39.04 
 
 		 151 aa  108  3e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.625219  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1216  50S ribosomal protein L9  39.73 
 
 		 148 aa  107  5e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0150  50S ribosomal protein L9  39.73 
 
 		 151 aa  107  6e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157053  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0110  50S ribosomal protein L9  37.67 
 
 		 151 aa  107  6e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000508651  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0654  ribosomal protein L9  43.15 
 
 		 146 aa  107  7.000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.233351  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2388  50S ribosomal protein L9  39.04 
 
 		 147 aa  106  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2509  50S ribosomal protein L9  38.36 
 
 		 151 aa  106  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000781135  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0165  50S ribosomal protein L9  39.04 
 
 		 148 aa  105  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000317895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0311  ribosomal protein L9  39.04 
 
 		 148 aa  104  4e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0979697 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2535  ribosomal protein L9  39.04 
 
 		 148 aa  103  7e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000849852  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1150  50S ribosomal protein L9  39.6 
 
 		 165 aa  103  8e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0292661  hitchhiker  0.00494207 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0448  50S ribosomal protein L9  36.11 
 
 		 148 aa  103  1e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000315624  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23320  ribosomal protein L9  40.77 
 
 		 147 aa  102  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.507738  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2559  50S ribosomal protein L9  43.24 
 
 		 152 aa  102  2e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2257  50S ribosomal protein L9  38.19 
 
 		 148 aa  101  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000108464  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2911  ribosomal protein L9  37.84 
 
 		 147 aa  101  4e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000198897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1410  50S ribosomal protein L9  40.54 
 
 		 171 aa  101  4e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000225617  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09988  ribosomal protein L9  37.67 
 
 		 149 aa  100  7e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.536224  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0025  ribosomal protein L9  39.58 
 
 		 178 aa  100  7e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00173008  normal  0.984167 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0161  50S ribosomal protein L9  37.67 
 
 		 148 aa  99.8  1e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000723092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0117  50S ribosomal protein L9  38.36 
 
 		 151 aa  99.8  1e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0602  ribosomal protein L9  38.19 
 
 		 159 aa  99.8  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1692  50S ribosomal protein L9  35.62 
 
 		 149 aa  99.4  1e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2510  50S ribosomal protein L9  40.28 
 
 		 194 aa  100  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.531472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0081  50S ribosomal protein L9  37.5 
 
 		 148 aa  99.4  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.957353  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2610  50S ribosomal protein L9  38.36 
 
 		 147 aa  98.2  4e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.196058  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18001  50S ribosomal protein L9  40.82 
 
 		 152 aa  97.4  5e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3757  50S ribosomal protein L9  39.58 
 
 		 148 aa  97.1  7e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3121  ribosomal protein L9  37.76 
 
 		 193 aa  96.7  9e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0668  50S ribosomal protein L9  39.19 
 
 		 148 aa  95.9  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00124479  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0023  ribosomal protein L9  37.14 
 
 		 174 aa  95.5  2e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.725827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4351  ribosomal protein L9  35.86 
 
 		 148 aa  95.1  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2841  50S ribosomal protein L9  38.03 
 
 		 148 aa  95.1  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000145753  hitchhiker  0.000000000000102152 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4931  50S ribosomal protein L9  39.04 
 
 		 148 aa  95.1  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.108353  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1272  50S ribosomal protein L9  41.45 
 
 		 152 aa  94.4  4e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2542  50S ribosomal protein L9  42.18 
 
 		 152 aa  94.4  4e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1814  ribosomal protein L9  41.13 
 
 		 149 aa  94.7  4e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3303  ribosomal protein L9  35.62 
 
 		 149 aa  94.4  5e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204917  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4506  ribosomal protein L9  37.84 
 
 		 149 aa  94.4  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.594005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0491  ribosomal protein L9  37.06 
 
 		 179 aa  94.4  5e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0329  50S ribosomal protein L9  38.1 
 
 		 152 aa  94  6e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.355323  normal  0.434143 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3675  50S ribosomal protein L9  36.81 
 
 		 147 aa  94  6e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0017578  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21431  50S ribosomal protein L9  41.45 
 
 		 152 aa  94  6e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0761  50S ribosomal protein L9  37.67 
 
 		 151 aa  93.6  7e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000425439  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0123  50S ribosomal protein L9  42.47 
 
 		 149 aa  92.8  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1219  50S ribosomal protein L9P  40.14 
 
 		 148 aa  93.2  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.405746 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00020  50S ribosomal protein L9  39.33 
 
 		 150 aa  93.2  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1765  50S ribosomal protein L9  39.07 
 
 		 151 aa  93.2  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2780  50S ribosomal protein L9  38.67 
 
 		 149 aa  92.8  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000928974  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0134  50S ribosomal protein L9  42.47 
 
 		 149 aa  92.8  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07670  50S ribosomal protein L9  40.4 
 
 		 148 aa  92.8  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.957501  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4535  50S ribosomal protein L9  37.41 
 
 		 153 aa  92.4  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.323692 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0881  50S ribosomal protein L9  38.36 
 
 		 148 aa  92.4  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00774862  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1479  50S ribosomal protein L9  36.11 
 
 		 147 aa  92.8  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00653221 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1063  ribosomal protein L9  37.93 
 
 		 147 aa  91.7  3e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.342712  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3480  50S ribosomal protein L9  38.1 
 
 		 146 aa  91.3  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.34024  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1205  ribosomal protein L9  34.72 
 
 		 151 aa  91.3  4e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2102  50S ribosomal protein L9P  40.94 
 
 		 149 aa  91.7  4e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2897  50S ribosomal protein L9  38.31 
 
 		 152 aa  91.3  4e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000174347  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2761  50S ribosomal protein L9  35.42 
 
 		 147 aa  90.9  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2827  ribosomal protein L9  42.57 
 
 		 150 aa  90.9  6e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3666  50S ribosomal protein L9  40.14 
 
 		 149 aa  90.5  6e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.006093  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>