More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_2130 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_2130  50S ribosomal protein L9  100 
 
 
149 aa  291  3e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.929246  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0130  50S ribosomal protein L9  63.09 
 
 
149 aa  196  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0311991 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4946  ribosomal protein L9  65.54 
 
 
148 aa  191  3e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4336  50S ribosomal protein L9  62.42 
 
 
150 aa  191  3e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3558  50S ribosomal protein L9  65.54 
 
 
148 aa  191  4e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.882223 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4841  ribosomal protein L9  65.07 
 
 
148 aa  190  5e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5065  50S ribosomal protein L9  63.7 
 
 
148 aa  187  5.999999999999999e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.972236  hitchhiker  0.000155251 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4553  50S ribosomal protein L9  62.33 
 
 
148 aa  185  2e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.156994  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3697  ribosomal protein L9  60.54 
 
 
149 aa  185  2e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7309  50S ribosomal protein L9  61.49 
 
 
148 aa  182  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.937449  normal  0.0304173 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7042  ribosomal protein L9  61.22 
 
 
151 aa  181  4.0000000000000006e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9354  50S ribosomal protein L9P  60.14 
 
 
148 aa  180  7e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.837132 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4519  50S ribosomal protein L9  59.46 
 
 
148 aa  176  8e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.986951  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37780  LSU ribosomal protein L9P  58.5 
 
 
149 aa  174  4e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.236654  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0334  50S ribosomal protein L9  59.86 
 
 
151 aa  172  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.801723 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3092  50S ribosomal protein L9  60.96 
 
 
148 aa  171  2.9999999999999996e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0370883  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4661  50S ribosomal protein L9P  57.43 
 
 
148 aa  171  3.9999999999999995e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4178  ribosomal protein L9  60.81 
 
 
151 aa  167  4e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5065  ribosomal protein L9  58.22 
 
 
151 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.366091  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26560  LSU ribosomal protein L9P  56.08 
 
 
148 aa  155  1e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.199017 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2522  ribosomal protein L9  55.86 
 
 
150 aa  155  2e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.559663  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3352  ribosomal protein L9  58.5 
 
 
151 aa  155  2e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.600621  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5366  ribosomal protein L9  54.73 
 
 
151 aa  151  4e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39420  LSU ribosomal protein L9P  51.68 
 
 
152 aa  149  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5743  50S ribosomal protein L9  53.95 
 
 
152 aa  148  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.245852 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5367  50S ribosomal protein L9  53.95 
 
 
152 aa  148  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5456  50S ribosomal protein L9  53.95 
 
 
152 aa  148  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.166119  normal  0.0135281 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10055  50S ribosomal protein L9  51.97 
 
 
152 aa  147  4e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.95125e-19  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4737  ribosomal protein L9  54.05 
 
 
150 aa  146  1.0000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6031  50S ribosomal protein L9  53.02 
 
 
151 aa  144  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.827335  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4166  ribosomal protein L9  53.74 
 
 
150 aa  143  7.0000000000000006e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0877  50S ribosomal protein L9  51.68 
 
 
151 aa  143  9e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3888  50S ribosomal protein L9  50.34 
 
 
150 aa  142  1e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00361277 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4117  50S ribosomal protein L9  51.72 
 
 
150 aa  142  1e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31750  LSU ribosomal protein L9P  44.9 
 
 
157 aa  139  1.9999999999999998e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23230  LSU ribosomal protein L9P  51.02 
 
 
153 aa  135  2e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0132  50S ribosomal protein L9P  46.58 
 
 
150 aa  132  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.191578  normal  0.450064 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2212  50S ribosomal protein L9  50.37 
 
 
150 aa  127  7.000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0448  50S ribosomal protein L9  40.14 
 
 
148 aa  121  3e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000315624  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2925  ribosomal protein L9  42.76 
 
 
147 aa  121  3e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0843322  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2911  ribosomal protein L9  40.69 
 
 
147 aa  120  6e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000198897  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3757  50S ribosomal protein L9  40.82 
 
 
148 aa  118  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2257  50S ribosomal protein L9  38.62 
 
 
148 aa  117  3.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000108464  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4351  ribosomal protein L9  40.14 
 
 
148 aa  117  6e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0081  50S ribosomal protein L9  37.93 
 
 
148 aa  116  7.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.957353  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4931  50S ribosomal protein L9  42.76 
 
 
148 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.108353  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0311  ribosomal protein L9  42.07 
 
 
148 aa  116  9.999999999999999e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0979697 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2535  ribosomal protein L9  38.46 
 
 
148 aa  116  9.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000849852  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2610  50S ribosomal protein L9  43.24 
 
 
147 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.196058  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2332  ribosomal protein L9  39.31 
 
 
170 aa  115  3e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.640711  hitchhiker  0.00706783 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3675  50S ribosomal protein L9  40.54 
 
 
147 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0017578  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3412  50S ribosomal protein L9  40.69 
 
 
149 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0851  50S ribosomal protein L9P  42.95 
 
 
149 aa  114  5e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11530  ribosomal protein L9  40.97 
 
 
191 aa  114  6e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0446546  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0023  ribosomal protein L9  42.76 
 
 
174 aa  114  6e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.725827  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4535  50S ribosomal protein L9  45.21 
 
 
153 aa  113  8.999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.323692 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09988  ribosomal protein L9  38.78 
 
 
149 aa  113  8.999999999999998e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.536224  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0025  ribosomal protein L9  42.76 
 
 
178 aa  112  1.0000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00173008  normal  0.984167 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1479  50S ribosomal protein L9  41.22 
 
 
147 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00653221 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2761  50S ribosomal protein L9  40.54 
 
 
147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0654  ribosomal protein L9  40.69 
 
 
146 aa  111  3e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.233351  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2388  50S ribosomal protein L9  39.46 
 
 
147 aa  111  3e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1205  ribosomal protein L9  40 
 
 
151 aa  111  3e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0541  50S ribosomal protein L9  36.36 
 
 
151 aa  111  4.0000000000000004e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0881  50S ribosomal protein L9  41.22 
 
 
148 aa  111  4.0000000000000004e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00774862  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0602  ribosomal protein L9  38.93 
 
 
159 aa  110  5e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0517  50S ribosomal protein L9  34.93 
 
 
151 aa  110  5e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0668  50S ribosomal protein L9  38.93 
 
 
148 aa  110  7.000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00124479  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3303  ribosomal protein L9  36.55 
 
 
149 aa  110  7.000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204917  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0161  50S ribosomal protein L9  39.73 
 
 
148 aa  109  1.0000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000723092  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0165  50S ribosomal protein L9  38.67 
 
 
148 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000317895  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0011  50S ribosomal protein L9  40.14 
 
 
150 aa  109  1.0000000000000001e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.557694  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3541  50S ribosomal protein L9  43.45 
 
 
149 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_482  ribosomal protein L9  35.66 
 
 
151 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5620  50S ribosomal protein L9  43.09 
 
 
148 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000412151  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0097  50S ribosomal protein L9  40.41 
 
 
151 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.625219  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1410  50S ribosomal protein L9  40.67 
 
 
171 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000225617  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0150  50S ribosomal protein L9  37.75 
 
 
151 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157053  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0761  50S ribosomal protein L9  42.07 
 
 
151 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000425439  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5657  50S ribosomal protein L9  43.09 
 
 
148 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000227696  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5596  50S ribosomal protein L9  43.09 
 
 
148 aa  108  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000245736  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5322  50S ribosomal protein L9  43.09 
 
 
148 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5150  50S ribosomal protein L9  43.09 
 
 
148 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000483517  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5166  50S ribosomal protein L9  43.09 
 
 
148 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0461945  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1692  50S ribosomal protein L9  37.09 
 
 
149 aa  107  4.0000000000000004e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5718  50S ribosomal protein L9  43.09 
 
 
148 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000626689  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5579  50S ribosomal protein L9  43.09 
 
 
148 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.17506e-22 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2509  50S ribosomal protein L9  37.67 
 
 
151 aa  107  4.0000000000000004e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000781135  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2022  50S ribosomal protein L9  44.52 
 
 
168 aa  107  6e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.278988  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5262  50S ribosomal protein L9  39.31 
 
 
148 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00409171  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4506  ribosomal protein L9  40.41 
 
 
149 aa  106  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.594005  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2841  50S ribosomal protein L9  37.16 
 
 
148 aa  105  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000145753  hitchhiker  0.000000000000102152 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3528  50S ribosomal protein L9  39.19 
 
 
168 aa  106  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.156676  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1814  ribosomal protein L9  39.86 
 
 
149 aa  106  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5339  50S ribosomal protein L9  41.46 
 
 
148 aa  105  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000103383  hitchhiker  0.00000000147927 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0116  50S ribosomal protein L9  44.83 
 
 
149 aa  105  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3480  50S ribosomal protein L9  42.47 
 
 
146 aa  104  3e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.34024  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0117  50S ribosomal protein L9  38.78 
 
 
151 aa  104  4e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1422  50S ribosomal protein L9  39.73 
 
 
151 aa  104  4e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0660955  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2510  50S ribosomal protein L9  38.62 
 
 
194 aa  104  5e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.531472  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>