More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_3303 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_3303  ribosomal protein L9  100 
 
 		 149 aa  294  4e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204917  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4351  ribosomal protein L9  52.41 
 
 		 148 aa  151  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3757  50S ribosomal protein L9  51.35 
 
 		 148 aa  150  7e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0132  50S ribosomal protein L9P  46.26 
 
 		 150 aa  147  7e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.191578  normal  0.450064 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2925  ribosomal protein L9  50.34 
 
 		 147 aa  143  1e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0843322  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0081  50S ribosomal protein L9  46.62 
 
 		 148 aa  140  4e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.957353  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2535  ribosomal protein L9  48.3 
 
 		 148 aa  139  1.9999999999999998e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000849852  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2257  50S ribosomal protein L9  47.59 
 
 		 148 aa  139  1.9999999999999998e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000108464  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2911  ribosomal protein L9  45.58 
 
 		 147 aa  137  6e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000198897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0654  ribosomal protein L9  44.14 
 
 		 146 aa  136  1e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.233351  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4931  50S ribosomal protein L9  48.28 
 
 		 148 aa  134  4e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.108353  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2212  50S ribosomal protein L9  45.19 
 
 		 150 aa  132  1.9999999999999998e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1814  ribosomal protein L9  46.26 
 
 		 149 aa  131  3e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2388  50S ribosomal protein L9  45.58 
 
 		 147 aa  130  6e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2841  50S ribosomal protein L9  45.64 
 
 		 148 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000145753  hitchhiker  0.000000000000102152 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3675  50S ribosomal protein L9  45.89 
 
 		 147 aa  124  6e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0017578  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0668  50S ribosomal protein L9  44.14 
 
 		 148 aa  123  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00124479  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0602  ribosomal protein L9  43.15 
 
 		 159 aa  123  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2610  50S ribosomal protein L9  45.58 
 
 		 147 aa  122  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.196058  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0851  50S ribosomal protein L9P  38.89 
 
 		 149 aa  122  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2761  50S ribosomal protein L9  47.59 
 
 		 147 aa  121  3e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0163  50S ribosomal protein L9  41.48 
 
 		 146 aa  121  4e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00237667  normal  0.639266 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1479  50S ribosomal protein L9  46.9 
 
 		 147 aa  120  5e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00653221 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2130  50S ribosomal protein L9  36.55 
 
 		 149 aa  120  7e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.929246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0761  50S ribosomal protein L9  45.58 
 
 		 151 aa  120  8e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000425439  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3121  ribosomal protein L9  39.04 
 
 		 193 aa  119  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2135  ribosomal protein L9  45.11 
 
 		 148 aa  119  9.999999999999999e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000758155  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1775  50S ribosomal protein L9  42.18 
 
 		 149 aa  118  1.9999999999999998e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000651865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4506  ribosomal protein L9  39.85 
 
 		 149 aa  118  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.594005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4535  50S ribosomal protein L9  40.41 
 
 		 153 aa  118  3e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.323692 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0448  50S ribosomal protein L9  41.38 
 
 		 148 aa  117  3.9999999999999996e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000315624  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4946  ribosomal protein L9  36.73 
 
 		 148 aa  117  4.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4841  ribosomal protein L9  37.24 
 
 		 148 aa  117  6e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0830  ribosomal protein L9  40.69 
 
 		 149 aa  117  7e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.211438  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3558  50S ribosomal protein L9  32.65 
 
 		 148 aa  117  7e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.882223 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1359  ribosomal protein L9  44.52 
 
 		 151 aa  116  9.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0122536  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9354  50S ribosomal protein L9P  36.05 
 
 		 148 aa  116  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.837132 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3412  50S ribosomal protein L9  44.83 
 
 		 149 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1350  50S ribosomal protein L9  39.04 
 
 		 189 aa  115  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0676227  normal  0.268494 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2972  50S ribosomal protein L9  46.62 
 
 		 148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2650  50S ribosomal protein L9  46.62 
 
 		 148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.502254  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4336  50S ribosomal protein L9  37.24 
 
 		 150 aa  115  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0150  50S ribosomal protein L9  41.38 
 
 		 151 aa  115  3e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157053  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2509  50S ribosomal protein L9  42.07 
 
 		 151 aa  115  3e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000781135  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0161  50S ribosomal protein L9  39.31 
 
 		 148 aa  113  6.9999999999999995e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000723092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0491  ribosomal protein L9  37.67 
 
 		 179 aa  113  7.999999999999999e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1205  ribosomal protein L9  40 
 
 		 151 aa  113  8.999999999999998e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0141  50S ribosomal protein L9  38.36 
 
 		 189 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0165  50S ribosomal protein L9  38.62 
 
 		 148 aa  112  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000317895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1774  50S ribosomal protein L9  38.36 
 
 		 189 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1692  50S ribosomal protein L9  39.04 
 
 		 149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0097  50S ribosomal protein L9  39.31 
 
 		 151 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.625219  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0881  50S ribosomal protein L9  46.94 
 
 		 148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00774862  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1150  50S ribosomal protein L9  39.19 
 
 		 165 aa  111  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0292661  hitchhiker  0.00494207 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5913  ribosomal protein L9  39.1 
 
 		 150 aa  111  4.0000000000000004e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0117  50S ribosomal protein L9  40.69 
 
 		 151 aa  110  4.0000000000000004e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3352  ribosomal protein L9  40.13 
 
 		 151 aa  111  4.0000000000000004e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.600621  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7309  50S ribosomal protein L9  34.69 
 
 		 148 aa  111  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.937449  normal  0.0304173 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0110  50S ribosomal protein L9  40.54 
 
 		 151 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000508651  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3528  50S ribosomal protein L9  43.54 
 
 		 168 aa  111  4.0000000000000004e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.156676  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5065  ribosomal protein L9  34.97 
 
 		 151 aa  110  5e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.366091  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2188  50S ribosomal protein L9  37.67 
 
 		 209 aa  110  5e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1410  50S ribosomal protein L9  38.78 
 
 		 171 aa  110  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000225617  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0411  50S ribosomal protein L9  40 
 
 		 195 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.112533  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1043  50S ribosomal protein L9  35.62 
 
 		 204 aa  110  9e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0955164 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1219  50S ribosomal protein L9P  39.86 
 
 		 148 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.405746 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0566  50S ribosomal protein L9  34.93 
 
 		 189 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4519  50S ribosomal protein L9  33.1 
 
 		 148 aa  108  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.986951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37780  LSU ribosomal protein L9P  34.72 
 
 		 149 aa  108  3e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.236654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1096  50S ribosomal protein L9  40.27 
 
 		 160 aa  108  3e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.547655  normal  0.0167988 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4307  50S ribosomal protein L9  35.62 
 
 		 190 aa  108  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0939755 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5418  50S ribosomal protein L9  36.3 
 
 		 190 aa  108  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0206045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3939  50S ribosomal protein L9  35.62 
 
 		 190 aa  108  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.613806  normal  0.190537 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0889  50S ribosomal protein L9  34.93 
 
 		 194 aa  108  3e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.301047  normal  0.514488 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3541  50S ribosomal protein L9  43.45 
 
 		 149 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4553  50S ribosomal protein L9  34.48 
 
 		 148 aa  107  4.0000000000000004e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.156994  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4414  50S ribosomal protein L9  34.93 
 
 		 190 aa  107  5e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.248049 
 
 
-
 
NC_002936  DET0541  50S ribosomal protein L9  37.76 
 
 		 151 aa  107  6e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2559  50S ribosomal protein L9  38.67 
 
 		 152 aa  107  6e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5065  50S ribosomal protein L9  33.79 
 
 		 148 aa  107  6e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.972236  hitchhiker  0.000155251 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0901  50S ribosomal protein L9  37.67 
 
 		 189 aa  107  6e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0476125 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0397  hypothetical protein  39.31 
 
 		 149 aa  107  7.000000000000001e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3092  50S ribosomal protein L9  33.78 
 
 		 148 aa  107  7.000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0370883  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4178  ribosomal protein L9  34.72 
 
 		 151 aa  107  7.000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0334  50S ribosomal protein L9  32.88 
 
 		 151 aa  107  7.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.801723 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0517  50S ribosomal protein L9  39.46 
 
 		 151 aa  106  1e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1246  50S ribosomal protein L9  39.73 
 
 		 150 aa  106  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00525572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1422  50S ribosomal protein L9  42.76 
 
 		 151 aa  106  1e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0660955  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1185  50S ribosomal protein L9  39.73 
 
 		 150 aa  106  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.152259  normal  0.105379 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0894  50S ribosomal protein L9  42.76 
 
 		 149 aa  106  1e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000571684  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2332  ribosomal protein L9  39.04 
 
 		 170 aa  106  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.640711  hitchhiker  0.00706783 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4661  50S ribosomal protein L9P  37.31 
 
 		 148 aa  106  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3697  ribosomal protein L9  34.72 
 
 		 149 aa  105  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0534  ribosomal protein L9  37.41 
 
 		 149 aa  105  2e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_482  ribosomal protein L9  37.06 
 
 		 151 aa  105  2e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3185  ribosomal protein L9  37.93 
 
 		 148 aa  105  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.564436  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0452  50S ribosomal protein L9  34.25 
 
 		 189 aa  105  3e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.206752  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6995  ribosomal protein L9  37.41 
 
 		 148 aa  105  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.142438 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0458  50S ribosomal protein L9  34.25 
 
 		 189 aa  105  3e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2306  50S ribosomal protein L9  35.62 
 
 		 189 aa  105  3e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.891012  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>