More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4946 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_4946  ribosomal protein L9  100 
 
 		 148 aa  291  3e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3558  50S ribosomal protein L9  73.65 
 
 		 148 aa  224  4e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.882223 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4841  ribosomal protein L9  68.92 
 
 		 148 aa  215  2e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3092  50S ribosomal protein L9  68.28 
 
 		 148 aa  204  3e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0370883  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9354  50S ribosomal protein L9P  65.54 
 
 		 148 aa  201  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.837132 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4519  50S ribosomal protein L9  66.22 
 
 		 148 aa  196  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.986951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4553  50S ribosomal protein L9  64.83 
 
 		 148 aa  194  4.0000000000000005e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.156994  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5065  50S ribosomal protein L9  64.14 
 
 		 148 aa  193  6e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.972236  hitchhiker  0.000155251 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2130  50S ribosomal protein L9  65.54 
 
 		 149 aa  191  3e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.929246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0130  50S ribosomal protein L9  59.46 
 
 		 149 aa  189  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0311991 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4336  50S ribosomal protein L9  60.14 
 
 		 150 aa  187  5.999999999999999e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0334  50S ribosomal protein L9  62.59 
 
 		 151 aa  186  9e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.801723 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7309  50S ribosomal protein L9  62.84 
 
 		 148 aa  186  1e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.937449  normal  0.0304173 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37780  LSU ribosomal protein L9P  59.18 
 
 		 149 aa  181  3e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.236654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4661  50S ribosomal protein L9P  59.46 
 
 		 148 aa  181  4.0000000000000006e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3697  ribosomal protein L9  56.46 
 
 		 149 aa  174  3e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3352  ribosomal protein L9  59.18 
 
 		 151 aa  170  6.999999999999999e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.600621  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4178  ribosomal protein L9  59.72 
 
 		 151 aa  167  4e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7042  ribosomal protein L9  55.7 
 
 		 151 aa  166  8e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5065  ribosomal protein L9  58.33 
 
 		 151 aa  162  1.0000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.366091  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5367  50S ribosomal protein L9  56.67 
 
 		 152 aa  161  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5743  50S ribosomal protein L9  56.67 
 
 		 152 aa  161  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.245852 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5456  50S ribosomal protein L9  56.67 
 
 		 152 aa  161  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.166119  normal  0.0135281 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6031  50S ribosomal protein L9  58.28 
 
 		 151 aa  162  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.827335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4737  ribosomal protein L9  57.05 
 
 		 150 aa  159  1e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0877  50S ribosomal protein L9  56 
 
 		 151 aa  158  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26560  LSU ribosomal protein L9P  56.08 
 
 		 148 aa  155  1e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.199017 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31750  LSU ribosomal protein L9P  51.02 
 
 		 157 aa  155  2e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3888  50S ribosomal protein L9  52.74 
 
 		 150 aa  154  4e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00361277 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4117  50S ribosomal protein L9  50.68 
 
 		 150 aa  151  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10055  50S ribosomal protein L9  52.32 
 
 		 152 aa  150  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.95125e-19  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39420  LSU ribosomal protein L9P  51.33 
 
 		 152 aa  149  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5366  ribosomal protein L9  52.67 
 
 		 151 aa  149  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23230  LSU ribosomal protein L9P  54.42 
 
 		 153 aa  148  3e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4166  ribosomal protein L9  51.68 
 
 		 150 aa  144  5e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2522  ribosomal protein L9  49.32 
 
 		 150 aa  137  3.9999999999999997e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.559663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0132  50S ribosomal protein L9P  47.62 
 
 		 150 aa  133  9e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.191578  normal  0.450064 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2911  ribosomal protein L9  43.84 
 
 		 147 aa  132  1.9999999999999998e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000198897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0654  ribosomal protein L9  44.9 
 
 		 146 aa  127  4.0000000000000003e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.233351  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1692  50S ribosomal protein L9  43.15 
 
 		 149 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4931  50S ribosomal protein L9  41.89 
 
 		 148 aa  124  4.0000000000000003e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.108353  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0165  50S ribosomal protein L9  43.05 
 
 		 148 aa  123  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000317895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2610  50S ribosomal protein L9  42.57 
 
 		 147 aa  122  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.196058  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2925  ribosomal protein L9  43.54 
 
 		 147 aa  120  4e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0843322  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2388  50S ribosomal protein L9  42.18 
 
 		 147 aa  120  7e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1205  ribosomal protein L9  43.45 
 
 		 151 aa  120  8e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0097  50S ribosomal protein L9  42.86 
 
 		 151 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.625219  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0150  50S ribosomal protein L9  39.46 
 
 		 151 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157053  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3675  50S ribosomal protein L9  41.22 
 
 		 147 aa  118  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0017578  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0851  50S ribosomal protein L9P  44.83 
 
 		 149 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0311  ribosomal protein L9  41.78 
 
 		 148 aa  117  4.9999999999999996e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0979697 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3121  ribosomal protein L9  41.78 
 
 		 193 aa  117  7e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2535  ribosomal protein L9  40.82 
 
 		 148 aa  117  7e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000849852  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2332  ribosomal protein L9  40.28 
 
 		 170 aa  116  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.640711  hitchhiker  0.00706783 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2257  50S ribosomal protein L9  38.62 
 
 		 148 aa  115  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000108464  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0448  50S ribosomal protein L9  40.14 
 
 		 148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000315624  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0081  50S ribosomal protein L9  35.86 
 
 		 148 aa  114  3e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.957353  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1516  50S ribosomal protein L9  40.41 
 
 		 191 aa  114  3.9999999999999997e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101233  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1479  50S ribosomal protein L9  40.54 
 
 		 147 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00653221 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0602  ribosomal protein L9  40.69 
 
 		 159 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0901  50S ribosomal protein L9  43.84 
 
 		 189 aa  114  5e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0476125 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2761  50S ribosomal protein L9  39.86 
 
 		 147 aa  114  5e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4351  ribosomal protein L9  36.55 
 
 		 148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3303  ribosomal protein L9  36.73 
 
 		 149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204917  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0117  50S ribosomal protein L9  38.78 
 
 		 151 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2188  50S ribosomal protein L9  44.9 
 
 		 209 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1350  50S ribosomal protein L9  46.26 
 
 		 189 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0676227  normal  0.268494 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2509  50S ribosomal protein L9  38.1 
 
 		 151 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000781135  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0491  ribosomal protein L9  36.3 
 
 		 179 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0881  50S ribosomal protein L9  39.19 
 
 		 148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00774862  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0110  50S ribosomal protein L9  40.14 
 
 		 151 aa  111  3e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000508651  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0161  50S ribosomal protein L9  40.4 
 
 		 148 aa  111  3e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000723092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3490  50S ribosomal protein L9  39.73 
 
 		 195 aa  111  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09988  ribosomal protein L9  41.1 
 
 		 149 aa  111  4.0000000000000004e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.536224  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1043  50S ribosomal protein L9  43.15 
 
 		 204 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0955164 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0761  50S ribosomal protein L9  38.78 
 
 		 151 aa  110  6e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000425439  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3757  50S ribosomal protein L9  37.24 
 
 		 148 aa  110  8.000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2510  50S ribosomal protein L9  41.1 
 
 		 194 aa  110  9e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.531472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5596  50S ribosomal protein L9  41.1 
 
 		 148 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000245736  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5262  50S ribosomal protein L9  38.36 
 
 		 148 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00409171  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23320  ribosomal protein L9  44.59 
 
 		 147 aa  109  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.507738  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5620  50S ribosomal protein L9  40.41 
 
 		 148 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000412151  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0452  50S ribosomal protein L9  39.46 
 
 		 189 aa  109  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.206752  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0458  50S ribosomal protein L9  39.46 
 
 		 189 aa  108  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0141  50S ribosomal protein L9  46.26 
 
 		 189 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2212  50S ribosomal protein L9  44.44 
 
 		 150 aa  109  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1774  50S ribosomal protein L9  46.26 
 
 		 189 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5657  50S ribosomal protein L9  40.41 
 
 		 148 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000227696  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0011  50S ribosomal protein L9  39.6 
 
 		 150 aa  108  3e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.557694  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5322  50S ribosomal protein L9  40.41 
 
 		 148 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5150  50S ribosomal protein L9  40.41 
 
 		 148 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000483517  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5166  50S ribosomal protein L9  40.41 
 
 		 148 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0461945  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5718  50S ribosomal protein L9  40.41 
 
 		 148 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000626689  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5579  50S ribosomal protein L9  40.41 
 
 		 148 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.17506e-22 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11530  ribosomal protein L9  38.3 
 
 		 191 aa  107  5e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0446546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0116  50S ribosomal protein L9  44.22 
 
 		 149 aa  107  5e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0668  50S ribosomal protein L9  38.51 
 
 		 148 aa  107  6e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00124479  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0025  ribosomal protein L9  40.54 
 
 		 178 aa  107  6e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00173008  normal  0.984167 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3040  50S ribosomal protein L9  42.86 
 
 		 188 aa  107  7.000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.186174 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0889  50S ribosomal protein L9  43.54 
 
 		 194 aa  107  7.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.301047  normal  0.514488 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>