More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2257 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2257  50S ribosomal protein L9  100 
 
 		 148 aa  290  5e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000108464  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0081  50S ribosomal protein L9  73.97 
 
 		 148 aa  222  1e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.957353  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2388  50S ribosomal protein L9  54.05 
 
 		 147 aa  148  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0654  ribosomal protein L9  47.95 
 
 		 146 aa  140  5e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.233351  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2535  ribosomal protein L9  48.95 
 
 		 148 aa  139  9.999999999999999e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000849852  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0132  50S ribosomal protein L9P  45.95 
 
 		 150 aa  138  1.9999999999999998e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.191578  normal  0.450064 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4931  50S ribosomal protein L9  50.34 
 
 		 148 aa  138  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.108353  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3412  50S ribosomal protein L9  51.35 
 
 		 149 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2925  ribosomal protein L9  46.62 
 
 		 147 aa  138  3e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0843322  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2972  50S ribosomal protein L9  55.17 
 
 		 148 aa  137  4.999999999999999e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2650  50S ribosomal protein L9  55.17 
 
 		 148 aa  137  4.999999999999999e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.502254  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3757  50S ribosomal protein L9  47.95 
 
 		 148 aa  134  5e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2212  50S ribosomal protein L9  48.53 
 
 		 150 aa  133  8e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0881  50S ribosomal protein L9  55.86 
 
 		 148 aa  130  9e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00774862  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0117  50S ribosomal protein L9  43.92 
 
 		 151 aa  128  3e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4351  ribosomal protein L9  42.07 
 
 		 148 aa  128  3e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0602  ribosomal protein L9  41.22 
 
 		 159 aa  127  4.0000000000000003e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0161  50S ribosomal protein L9  41.22 
 
 		 148 aa  125  2.0000000000000002e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000723092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3303  ribosomal protein L9  47.59 
 
 		 149 aa  124  3e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204917  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0761  50S ribosomal protein L9  47.59 
 
 		 151 aa  124  3e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000425439  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2509  50S ribosomal protein L9  41.89 
 
 		 151 aa  123  9e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000781135  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3541  50S ribosomal protein L9  48.65 
 
 		 149 aa  123  9e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2911  ribosomal protein L9  46.21 
 
 		 147 aa  122  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000198897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3675  50S ribosomal protein L9  44.14 
 
 		 147 aa  122  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0017578  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2841  50S ribosomal protein L9  44.14 
 
 		 148 aa  122  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000145753  hitchhiker  0.000000000000102152 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2006  ribosomal protein L9  50 
 
 		 152 aa  122  2e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0110  50S ribosomal protein L9  40.54 
 
 		 151 aa  122  2e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000508651  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2610  50S ribosomal protein L9  44.83 
 
 		 147 aa  122  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.196058  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0150  50S ribosomal protein L9  40.54 
 
 		 151 aa  121  3e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157053  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1814  ribosomal protein L9  41.89 
 
 		 149 aa  121  3e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9354  50S ribosomal protein L9P  41.38 
 
 		 148 aa  121  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.837132 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0740  ribosomal protein L9  44.14 
 
 		 150 aa  121  3e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0165  50S ribosomal protein L9  40.54 
 
 		 148 aa  120  5e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000317895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4553  50S ribosomal protein L9  38.78 
 
 		 148 aa  119  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.156994  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5065  50S ribosomal protein L9  38.1 
 
 		 148 aa  119  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.972236  hitchhiker  0.000155251 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4506  ribosomal protein L9  40.43 
 
 		 149 aa  118  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.594005  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0668  50S ribosomal protein L9  42.76 
 
 		 148 aa  118  3e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00124479  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3558  50S ribosomal protein L9  38.62 
 
 		 148 aa  118  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.882223 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7309  50S ribosomal protein L9  41.1 
 
 		 148 aa  118  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.937449  normal  0.0304173 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1096  50S ribosomal protein L9  43.92 
 
 		 160 aa  118  3e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.547655  normal  0.0167988 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0334  50S ribosomal protein L9  39.58 
 
 		 151 aa  118  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.801723 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2130  50S ribosomal protein L9  38.62 
 
 		 149 aa  117  3.9999999999999996e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.929246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2761  50S ribosomal protein L9  42.07 
 
 		 147 aa  117  7e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1359  ribosomal protein L9  45.27 
 
 		 151 aa  117  7e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0122536  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4535  50S ribosomal protein L9  39.86 
 
 		 153 aa  117  7e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.323692 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0011  50S ribosomal protein L9  42.18 
 
 		 150 aa  117  7e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.557694  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0097  50S ribosomal protein L9  38.51 
 
 		 151 aa  115  9.999999999999999e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.625219  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1479  50S ribosomal protein L9  41.38 
 
 		 147 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00653221 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0561  ribosomal protein L9  45.27 
 
 		 149 aa  116  9.999999999999999e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.204129  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0163  50S ribosomal protein L9  39.86 
 
 		 146 aa  116  9.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00237667  normal  0.639266 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4946  ribosomal protein L9  38.62 
 
 		 148 aa  115  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3092  50S ribosomal protein L9  39.31 
 
 		 148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0370883  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3697  ribosomal protein L9  41.56 
 
 		 149 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0012  50S ribosomal protein L9  44 
 
 		 154 aa  115  3e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.181348  hitchhiker  0.0000209307 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5262  50S ribosomal protein L9  42.57 
 
 		 148 aa  114  5e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00409171  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4519  50S ribosomal protein L9  37.41 
 
 		 148 aa  114  6e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.986951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1205  ribosomal protein L9  40.14 
 
 		 151 aa  113  6.9999999999999995e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4841  ribosomal protein L9  36.99 
 
 		 148 aa  113  7.999999999999999e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0851  50S ribosomal protein L9P  37.06 
 
 		 149 aa  113  7.999999999999999e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5620  50S ribosomal protein L9  43.92 
 
 		 148 aa  113  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000412151  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5657  50S ribosomal protein L9  43.92 
 
 		 148 aa  113  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000227696  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1692  50S ribosomal protein L9  42.95 
 
 		 149 aa  112  1.0000000000000001e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1063  ribosomal protein L9  42.76 
 
 		 147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.342712  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0894  50S ribosomal protein L9  47.97 
 
 		 149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000571684  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7042  ribosomal protein L9  40.27 
 
 		 151 aa  111  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23320  ribosomal protein L9  47.59 
 
 		 147 aa  111  3e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.507738  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5596  50S ribosomal protein L9  43.92 
 
 		 148 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000245736  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5322  50S ribosomal protein L9  43.24 
 
 		 148 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5150  50S ribosomal protein L9  43.24 
 
 		 148 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000483517  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl083  50S ribosomal protein L9  40.41 
 
 		 147 aa  110  7.000000000000001e-24  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000770286  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5166  50S ribosomal protein L9  43.24 
 
 		 148 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0461945  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1410  50S ribosomal protein L9  37.84 
 
 		 171 aa  110  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000225617  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5718  50S ribosomal protein L9  43.24 
 
 		 148 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000626689  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5579  50S ribosomal protein L9  43.24 
 
 		 148 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.17506e-22 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5065  ribosomal protein L9  36.11 
 
 		 151 aa  110  8.000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.366091  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5339  50S ribosomal protein L9  42.57 
 
 		 148 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000103383  hitchhiker  0.00000000147927 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0448  50S ribosomal protein L9  38.51 
 
 		 148 aa  108  2.0000000000000002e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000315624  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6995  ribosomal protein L9  39.31 
 
 		 148 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.142438 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4336  50S ribosomal protein L9  37.93 
 
 		 150 aa  108  3e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1422  50S ribosomal protein L9  43.24 
 
 		 151 aa  108  3e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0660955  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0830  ribosomal protein L9  39.04 
 
 		 149 aa  108  4.0000000000000004e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.211438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11530  ribosomal protein L9  34.48 
 
 		 191 aa  107  5e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0446546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2102  50S ribosomal protein L9P  41.61 
 
 		 149 aa  107  8.000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0130  50S ribosomal protein L9  36.99 
 
 		 149 aa  106  8.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0311991 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3352  ribosomal protein L9  39.58 
 
 		 151 aa  106  9.000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.600621  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0397  hypothetical protein  40.14 
 
 		 149 aa  106  1e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0517  50S ribosomal protein L9  40.54 
 
 		 151 aa  105  1e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09988  ribosomal protein L9  41.78 
 
 		 149 aa  106  1e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.536224  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1150  50S ribosomal protein L9  36.49 
 
 		 165 aa  106  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0292661  hitchhiker  0.00494207 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0014  50S ribosomal protein L9P  39.6 
 
 		 151 aa  105  1e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0210  ribosomal protein L9  39.73 
 
 		 172 aa  105  2e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000722973  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0025  ribosomal protein L9  37.24 
 
 		 178 aa  105  2e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00173008  normal  0.984167 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2538  50S ribosomal protein L9  46.31 
 
 		 148 aa  105  2e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4009  50S ribosomal protein L9  44.59 
 
 		 148 aa  105  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.015297  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1775  50S ribosomal protein L9  40 
 
 		 149 aa  105  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000651865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0123  50S ribosomal protein L9  41.22 
 
 		 149 aa  104  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4178  ribosomal protein L9  36.11 
 
 		 151 aa  105  3e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0112  50S ribosomal protein L9  41.43 
 
 		 173 aa  104  3e-22  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2028  50S ribosomal protein L9  34.46 
 
 		 167 aa  104  3e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.728229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0134  50S ribosomal protein L9  41.22 
 
 		 149 aa  104  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>