More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BbuZS7_0112 on replicon NC_011728
Organism: Borrelia burgdorferi ZS7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011728  BbuZS7_0112  50S ribosomal protein L9  100 
 
 
173 aa  340  8e-93  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1675  50S ribosomal protein L9  38.01 
 
 
199 aa  117  7.999999999999999e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000107335  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1410  50S ribosomal protein L9  33.33 
 
 
171 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000225617  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0210  ribosomal protein L9  39.73 
 
 
172 aa  108  3e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000722973  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2257  50S ribosomal protein L9  40.94 
 
 
148 aa  108  4.0000000000000004e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000108464  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2388  50S ribosomal protein L9  40.54 
 
 
147 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2911  ribosomal protein L9  38.26 
 
 
147 aa  108  4.0000000000000004e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000198897  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1352  50S ribosomal protein L9  33.33 
 
 
167 aa  107  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2022  50S ribosomal protein L9  30 
 
 
168 aa  106  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.278988  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2509  50S ribosomal protein L9  35.14 
 
 
151 aa  105  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000781135  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1996  50S ribosomal protein L9  36.55 
 
 
148 aa  105  3e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1096  50S ribosomal protein L9  36.73 
 
 
160 aa  104  5e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.547655  normal  0.0167988 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0222  ribosomal protein L9  37.09 
 
 
151 aa  103  9e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0097  50S ribosomal protein L9  32.43 
 
 
151 aa  103  1e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.625219  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0163  50S ribosomal protein L9  34.9 
 
 
146 aa  103  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00237667  normal  0.639266 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0165  50S ribosomal protein L9  33.11 
 
 
148 aa  103  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000317895  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0161  50S ribosomal protein L9  33.11 
 
 
148 aa  102  2e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000723092  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4506  ribosomal protein L9  34.48 
 
 
149 aa  103  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.594005  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2028  50S ribosomal protein L9  32.03 
 
 
167 aa  102  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.728229  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1642  50S ribosomal protein L9  37.84 
 
 
164 aa  102  3e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0557513  normal  0.0367892 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0081  50S ribosomal protein L9  39.73 
 
 
148 aa  101  4e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.957353  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2780  50S ribosomal protein L9  34.44 
 
 
149 aa  102  4e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000928974  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3666  50S ribosomal protein L9  35.57 
 
 
149 aa  101  5e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.006093  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0761  50S ribosomal protein L9  37.5 
 
 
151 aa  101  5e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000425439  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07670  50S ribosomal protein L9  33.1 
 
 
148 aa  101  6e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.957501  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0150  50S ribosomal protein L9  33.11 
 
 
151 aa  100  7e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157053  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0760  50S ribosomal protein L9  34.9 
 
 
150 aa  99.8  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.242158  hitchhiker  0.000000266441 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1361  ribosomal protein L9  38.36 
 
 
150 aa  99.4  3e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4209  50S ribosomal protein L9  34.23 
 
 
150 aa  99  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.828057  hitchhiker  0.000279421 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5366  ribosomal protein L9  37.58 
 
 
151 aa  98.2  5e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0110  50S ribosomal protein L9  32.43 
 
 
151 aa  98.2  5e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000508651  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0586  50S ribosomal protein L9  30.87 
 
 
150 aa  98.2  5e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.482938  hitchhiker  3.77539e-17 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4737  ribosomal protein L9  32.65 
 
 
150 aa  98.2  6e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3927  50S ribosomal protein L9  35.57 
 
 
150 aa  97.8  7e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002335  LSU ribosomal protein L9p  30.92 
 
 
150 aa  97.4  8e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.178305  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03776  50S ribosomal protein L9  34.23 
 
 
150 aa  96.7  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0756  50S ribosomal protein L9  35.57 
 
 
150 aa  96.7  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000105777  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3281  50S ribosomal protein L9  32.89 
 
 
150 aa  96.7  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.134585  hitchhiker  0.000210385 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2841  50S ribosomal protein L9  34.01 
 
 
148 aa  96.3  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000145753  hitchhiker  0.000000000000102152 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2610  50S ribosomal protein L9  35.17 
 
 
147 aa  95.9  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.196058  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1030  50S ribosomal protein L9  35.47 
 
 
170 aa  96.3  2e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1112  ribosomal protein L9  35.17 
 
 
147 aa  96.7  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.573323  normal  0.866168 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3675  50S ribosomal protein L9  34.01 
 
 
147 aa  95.5  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0017578  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0117  50S ribosomal protein L9  31.76 
 
 
151 aa  95.5  3e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0025  ribosomal protein L9  38.36 
 
 
178 aa  95.5  3e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00173008  normal  0.984167 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0891  50S ribosomal protein L9P  32.43 
 
 
148 aa  95.5  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4535  50S ribosomal protein L9  34.46 
 
 
153 aa  95.1  4e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.323692 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00020  50S ribosomal protein L9  30.92 
 
 
150 aa  95.5  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0738  50S ribosomal protein L9  30.91 
 
 
191 aa  95.1  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.823068  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4931  50S ribosomal protein L9  35.07 
 
 
148 aa  94.7  5e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000100703 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1339  50S ribosomal protein L9  36.49 
 
 
166 aa  94.4  6e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.361215  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0418  ribosomal protein L9  35.57 
 
 
150 aa  94.4  7e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.291311  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4665  50S ribosomal protein L9  34.33 
 
 
148 aa  94  8e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0656931 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5226  ribosomal protein L9  34.48 
 
 
150 aa  94  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1150  50S ribosomal protein L9  32 
 
 
165 aa  93.6  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0292661  hitchhiker  0.00494207 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1948  ribosomal protein L9  35.81 
 
 
151 aa  93.6  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0571  ribosomal protein L9  34 
 
 
150 aa  93.2  1e-18  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.409562  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3348  50S ribosomal protein L9  34.23 
 
 
150 aa  93.6  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000169987  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3558  50S ribosomal protein L9  34.44 
 
 
148 aa  93.2  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.882223 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1932  ribosomal protein L9  41.04 
 
 
149 aa  92.8  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3121  ribosomal protein L9  29.41 
 
 
193 aa  92.8  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1828  50S ribosomal protein L9  33.14 
 
 
168 aa  92.4  3e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2332  ribosomal protein L9  39.01 
 
 
170 aa  92  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.640711  hitchhiker  0.00706783 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0777  50S ribosomal protein L9  32.26 
 
 
149 aa  92  3e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000131124  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2827  ribosomal protein L9  38.52 
 
 
150 aa  92  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0648  50S ribosomal protein L9  34.27 
 
 
148 aa  92.4  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000594391 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1547  50S ribosomal protein L9  36.73 
 
 
149 aa  92  4e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0654  50S ribosomal protein L9  33.56 
 
 
150 aa  92  4e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1516  50S ribosomal protein L9  29.09 
 
 
191 aa  92  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101233  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2761  50S ribosomal protein L9  32.65 
 
 
147 aa  91.7  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2102  50S ribosomal protein L9P  32.89 
 
 
149 aa  91.3  6e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0449  50S ribosomal protein L9  33.55 
 
 
150 aa  91.3  6e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00474942 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04070  50S ribosomal protein L9  33.56 
 
 
149 aa  91.3  7e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3790  ribosomal protein L9  33.56 
 
 
149 aa  91.3  7e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00574678  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04032  hypothetical protein  33.56 
 
 
149 aa  91.3  7e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4447  50S ribosomal protein L9  33.56 
 
 
149 aa  91.3  7e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4166  ribosomal protein L9  36.17 
 
 
150 aa  90.9  7e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4673  50S ribosomal protein L9  33.56 
 
 
149 aa  91.3  7e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3810  50S ribosomal protein L9  33.56 
 
 
149 aa  91.3  7e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0581092 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0881  50S ribosomal protein L9  41.78 
 
 
148 aa  90.9  7e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00774862  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4812  50S ribosomal protein L9  36.3 
 
 
149 aa  91.3  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0162172  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4764  50S ribosomal protein L9  33.56 
 
 
149 aa  91.3  7e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9354  50S ribosomal protein L9P  32.45 
 
 
148 aa  90.9  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.837132 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4790  50S ribosomal protein L9  36.3 
 
 
149 aa  91.3  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.131212  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4736  50S ribosomal protein L9  33.56 
 
 
149 aa  91.3  7e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.257928  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5718  50S ribosomal protein L9  33.56 
 
 
149 aa  91.3  7e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.595872  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4754  50S ribosomal protein L9  36.3 
 
 
149 aa  91.3  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0190714  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3583  50S ribosomal protein L9  33.56 
 
 
150 aa  90.9  8e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.237319  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1668  50S ribosomal protein L9  33.33 
 
 
175 aa  90.9  9e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.197637  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1479  50S ribosomal protein L9  31.97 
 
 
147 aa  90.9  9e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00653221 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1436  50S ribosomal protein L9  33.56 
 
 
149 aa  90.9  9e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0116  50S ribosomal protein L9  33.11 
 
 
149 aa  90.9  9e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1918  50S ribosomal protein L9  30.91 
 
 
196 aa  90.5  9e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.403674  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0597  50S ribosomal protein L9  29.78 
 
 
179 aa  90.1  1e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0930  50S ribosomal protein L9  33.78 
 
 
154 aa  90.5  1e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.433843  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4672  50S ribosomal protein L9  35.56 
 
 
149 aa  90.1  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00136692  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0704  50S ribosomal protein L9  36.3 
 
 
150 aa  90.5  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000907287  hitchhiker  0.000477361 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0889  50S ribosomal protein L9  27.78 
 
 
194 aa  90.5  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.301047  normal  0.514488 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3781  50S ribosomal protein L9  32.89 
 
 
150 aa  90.1  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1084  50S ribosomal protein L9  33.78 
 
 
152 aa  90.5  1e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00450273  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>