More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4737 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4737  ribosomal protein L9  100 
 
 		 150 aa  297  3e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4166  ribosomal protein L9  73.83 
 
 		 150 aa  223  6e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6031  50S ribosomal protein L9  70.86 
 
 		 151 aa  210  7e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.827335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0877  50S ribosomal protein L9  70.86 
 
 		 151 aa  209  9e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5743  50S ribosomal protein L9  67.33 
 
 		 152 aa  197  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.245852 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5367  50S ribosomal protein L9  67.33 
 
 		 152 aa  197  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5456  50S ribosomal protein L9  67.33 
 
 		 152 aa  197  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.166119  normal  0.0135281 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10055  50S ribosomal protein L9  66.67 
 
 		 152 aa  195  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.95125e-19  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5065  50S ribosomal protein L9  59.33 
 
 		 148 aa  177  4.999999999999999e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.972236  hitchhiker  0.000155251 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4553  50S ribosomal protein L9  59.33 
 
 		 148 aa  177  5.999999999999999e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.156994  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7042  ribosomal protein L9  60.81 
 
 		 151 aa  169  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5366  ribosomal protein L9  56.58 
 
 		 151 aa  164  2.9999999999999998e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4946  ribosomal protein L9  57.05 
 
 		 148 aa  159  1e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39420  LSU ribosomal protein L9P  53.69 
 
 		 152 aa  157  4e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0130  50S ribosomal protein L9  52.35 
 
 		 149 aa  155  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0311991 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4841  ribosomal protein L9  54.73 
 
 		 148 aa  154  5.0000000000000005e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3092  50S ribosomal protein L9  56.76 
 
 		 148 aa  153  7e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0370883  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3558  50S ribosomal protein L9  53.02 
 
 		 148 aa  153  7e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.882223 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0334  50S ribosomal protein L9  56.76 
 
 		 151 aa  152  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.801723 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9354  50S ribosomal protein L9P  54.36 
 
 		 148 aa  151  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.837132 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4519  50S ribosomal protein L9  55.78 
 
 		 148 aa  148  3e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.986951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4336  50S ribosomal protein L9  54.05 
 
 		 150 aa  147  6e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2130  50S ribosomal protein L9  54.05 
 
 		 149 aa  146  1.0000000000000001e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.929246  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3697  ribosomal protein L9  51.68 
 
 		 149 aa  144  3e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7309  50S ribosomal protein L9  53.69 
 
 		 148 aa  144  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.937449  normal  0.0304173 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5065  ribosomal protein L9  54.36 
 
 		 151 aa  141  3e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.366091  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3888  50S ribosomal protein L9  53.02 
 
 		 150 aa  139  9.999999999999999e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00361277 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26560  LSU ribosomal protein L9P  54.73 
 
 		 148 aa  138  3e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.199017 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4117  50S ribosomal protein L9  51.68 
 
 		 150 aa  135  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37780  LSU ribosomal protein L9P  48.65 
 
 		 149 aa  134  4e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.236654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4661  50S ribosomal protein L9P  50 
 
 		 148 aa  133  7.000000000000001e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4178  ribosomal protein L9  48.3 
 
 		 151 aa  129  1.0000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3352  ribosomal protein L9  49.66 
 
 		 151 aa  124  5e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.600621  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23230  LSU ribosomal protein L9P  51.35 
 
 		 153 aa  121  2e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2522  ribosomal protein L9  45.95 
 
 		 150 aa  120  5e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.559663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0132  50S ribosomal protein L9P  45.64 
 
 		 150 aa  117  7.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.191578  normal  0.450064 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0311  ribosomal protein L9  43.24 
 
 		 148 aa  116  9e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0979697 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2911  ribosomal protein L9  43.54 
 
 		 147 aa  115  3e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000198897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2388  50S ribosomal protein L9  44.97 
 
 		 147 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0654  ribosomal protein L9  45.64 
 
 		 146 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.233351  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31750  LSU ribosomal protein L9P  41.89 
 
 		 157 aa  110  6e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2535  ribosomal protein L9  37.58 
 
 		 148 aa  108  3e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000849852  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1216  50S ribosomal protein L9  41.22 
 
 		 148 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00020  50S ribosomal protein L9  42.28 
 
 		 150 aa  106  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2610  50S ribosomal protein L9  42 
 
 		 147 aa  105  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.196058  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0602  ribosomal protein L9  40.14 
 
 		 159 aa  105  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0097  50S ribosomal protein L9  42.28 
 
 		 151 aa  104  4e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.625219  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2102  50S ribosomal protein L9P  42.76 
 
 		 149 aa  104  5e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1692  50S ribosomal protein L9  40.54 
 
 		 149 aa  103  7e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3281  50S ribosomal protein L9  43.33 
 
 		 150 aa  102  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.134585  hitchhiker  0.000210385 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002335  LSU ribosomal protein L9p  42 
 
 		 150 aa  102  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.178305  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0222  ribosomal protein L9  39.86 
 
 		 151 aa  102  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2257  50S ribosomal protein L9  38.1 
 
 		 148 aa  102  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000108464  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2780  50S ribosomal protein L9  40.94 
 
 		 149 aa  102  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000928974  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0760  50S ribosomal protein L9  42 
 
 		 150 aa  102  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.242158  hitchhiker  0.000000266441 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0081  50S ribosomal protein L9  36.05 
 
 		 148 aa  101  4e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.957353  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1205  ribosomal protein L9  40.14 
 
 		 151 aa  101  4e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0287  ribosomal protein L9  39.6 
 
 		 152 aa  100  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0120134  normal  0.0123082 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07670  50S ribosomal protein L9  41.33 
 
 		 148 aa  100  7e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.957501  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2559  50S ribosomal protein L9  42.28 
 
 		 152 aa  99.8  1e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03776  50S ribosomal protein L9  38.93 
 
 		 150 aa  99.8  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0586  50S ribosomal protein L9  43.92 
 
 		 150 aa  99.8  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.482938  hitchhiker  3.77539e-17 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2383  50S ribosomal protein L9  43.62 
 
 		 148 aa  99.8  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0668  50S ribosomal protein L9  39.46 
 
 		 148 aa  99  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00124479  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2542  50S ribosomal protein L9  38.51 
 
 		 152 aa  99.4  2e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3675  50S ribosomal protein L9  39.46 
 
 		 147 aa  99  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0017578  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1479  50S ribosomal protein L9  41.33 
 
 		 147 aa  98.2  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00653221 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09988  ribosomal protein L9  36.49 
 
 		 149 aa  98.2  3e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.536224  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0761  50S ribosomal protein L9  40.27 
 
 		 151 aa  97.8  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000425439  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1410  50S ribosomal protein L9  43.71 
 
 		 171 aa  97.4  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000225617  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3744  50S ribosomal protein L9  39.19 
 
 		 150 aa  97.4  6e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00940058  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28961  50S ribosomal protein L9  39.6 
 
 		 152 aa  97.4  6e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2022  50S ribosomal protein L9  44 
 
 		 168 aa  97.1  7e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.278988  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4209  50S ribosomal protein L9  41.33 
 
 		 150 aa  97.1  8e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.828057  hitchhiker  0.000279421 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0165  50S ribosomal protein L9  39.6 
 
 		 148 aa  96.3  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000317895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0150  50S ribosomal protein L9  38.93 
 
 		 151 aa  96.7  1e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157053  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1219  50S ribosomal protein L9P  40.27 
 
 		 148 aa  96.7  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.405746 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18001  50S ribosomal protein L9  36.91 
 
 		 152 aa  96.3  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0926  ribosomal protein L9  42.25 
 
 		 150 aa  96.7  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.50143  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0112  50S ribosomal protein L9  34.04 
 
 		 173 aa  95.5  2e-19  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2761  50S ribosomal protein L9  40 
 
 		 147 aa  95.9  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0025  ribosomal protein L9  41.89 
 
 		 178 aa  95.5  2e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00173008  normal  0.984167 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4931  50S ribosomal protein L9  38.26 
 
 		 148 aa  95.5  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.108353  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4506  ribosomal protein L9  38.51 
 
 		 149 aa  95.5  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.594005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0161  50S ribosomal protein L9  40.79 
 
 		 148 aa  95.5  2e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000723092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1775  50S ribosomal protein L9  40.94 
 
 		 149 aa  95.9  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000651865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0110  50S ribosomal protein L9  37.58 
 
 		 151 aa  95.5  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000508651  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2852  50S ribosomal protein L9  34.69 
 
 		 152 aa  94.7  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4542  50S ribosomal protein L9  36.73 
 
 		 152 aa  94.7  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.736351 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0851  50S ribosomal protein L9P  40 
 
 		 149 aa  95.1  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4812  50S ribosomal protein L9  39.6 
 
 		 149 aa  94.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0162172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1948  ribosomal protein L9  39.19 
 
 		 151 aa  94.7  4e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4754  50S ribosomal protein L9  39.6 
 
 		 149 aa  94.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0190714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3244  50S ribosomal protein L9  34.69 
 
 		 152 aa  94.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.65089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3348  50S ribosomal protein L9  41.33 
 
 		 150 aa  94.4  4e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000169987  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4790  50S ribosomal protein L9  39.6 
 
 		 149 aa  94.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.131212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0756  50S ribosomal protein L9  40.94 
 
 		 150 aa  94.7  4e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000105777  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2332  ribosomal protein L9  36.49 
 
 		 170 aa  94.4  5e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.640711  hitchhiker  0.00706783 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5718  50S ribosomal protein L9  39.6 
 
 		 149 aa  94  6e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.595872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4447  50S ribosomal protein L9  39.6 
 
 		 149 aa  94  6e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>