More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_5366 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_5366  ribosomal protein L9  100 
 
 		 151 aa  296  8e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7042  ribosomal protein L9  56.67 
 
 		 151 aa  176  8e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6031  50S ribosomal protein L9  57.89 
 
 		 151 aa  174  3e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.827335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5065  50S ribosomal protein L9  58.94 
 
 		 148 aa  171  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.972236  hitchhiker  0.000155251 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4553  50S ribosomal protein L9  58.28 
 
 		 148 aa  170  6.999999999999999e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.156994  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4166  ribosomal protein L9  56.29 
 
 		 150 aa  166  1e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4737  ribosomal protein L9  56.58 
 
 		 150 aa  164  2.9999999999999998e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0877  50S ribosomal protein L9  53.95 
 
 		 151 aa  164  4e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5367  50S ribosomal protein L9  53.64 
 
 		 152 aa  163  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5743  50S ribosomal protein L9  53.64 
 
 		 152 aa  163  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.245852 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5456  50S ribosomal protein L9  53.64 
 
 		 152 aa  163  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.166119  normal  0.0135281 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0130  50S ribosomal protein L9  55.33 
 
 		 149 aa  160  5.0000000000000005e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0311991 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39420  LSU ribosomal protein L9P  52.67 
 
 		 152 aa  156  1e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10055  50S ribosomal protein L9  52.32 
 
 		 152 aa  156  1e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.95125e-19  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9354  50S ribosomal protein L9P  53.33 
 
 		 148 aa  154  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.837132 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7309  50S ribosomal protein L9  50.67 
 
 		 148 aa  152  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.937449  normal  0.0304173 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2130  50S ribosomal protein L9  54.73 
 
 		 149 aa  151  4e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.929246  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4841  ribosomal protein L9  54.86 
 
 		 148 aa  150  5.9999999999999996e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3558  50S ribosomal protein L9  52.67 
 
 		 148 aa  150  8e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.882223 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4946  ribosomal protein L9  52.67 
 
 		 148 aa  149  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4519  50S ribosomal protein L9  51.68 
 
 		 148 aa  144  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.986951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3092  50S ribosomal protein L9  49.32 
 
 		 148 aa  137  3.9999999999999997e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0370883  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4336  50S ribosomal protein L9  49.32 
 
 		 150 aa  137  6e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0334  50S ribosomal protein L9  47.65 
 
 		 151 aa  135  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.801723 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3697  ribosomal protein L9  44.67 
 
 		 149 aa  132  9.999999999999999e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5065  ribosomal protein L9  49.33 
 
 		 151 aa  130  6e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.366091  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37780  LSU ribosomal protein L9P  44.3 
 
 		 149 aa  128  3e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.236654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4661  50S ribosomal protein L9P  46.62 
 
 		 148 aa  128  3e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26560  LSU ribosomal protein L9P  47.3 
 
 		 148 aa  126  1.0000000000000001e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.199017 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4178  ribosomal protein L9  49.66 
 
 		 151 aa  125  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4117  50S ribosomal protein L9  44 
 
 		 150 aa  119  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31750  LSU ribosomal protein L9P  40.94 
 
 		 157 aa  116  9.999999999999999e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3888  50S ribosomal protein L9  42 
 
 		 150 aa  114  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00361277 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3352  ribosomal protein L9  42.67 
 
 		 151 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.600621  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23230  LSU ribosomal protein L9P  41.61 
 
 		 153 aa  111  4.0000000000000004e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2522  ribosomal protein L9  42.95 
 
 		 150 aa  108  2.0000000000000002e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.559663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2911  ribosomal protein L9  41.61 
 
 		 147 aa  108  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000198897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0132  50S ribosomal protein L9P  43.33 
 
 		 150 aa  106  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.191578  normal  0.450064 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0566  50S ribosomal protein L9  39.86 
 
 		 189 aa  104  4e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0452  50S ribosomal protein L9  39.86 
 
 		 189 aa  103  9e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.206752  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2022  50S ribosomal protein L9  42.38 
 
 		 168 aa  103  9e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.278988  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0458  50S ribosomal protein L9  39.86 
 
 		 189 aa  103  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11530  ribosomal protein L9  41.89 
 
 		 191 aa  101  4e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0446546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0654  ribosomal protein L9  38.67 
 
 		 146 aa  100  5e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.233351  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0491  ribosomal protein L9  37.84 
 
 		 179 aa  98.2  3e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2006  ribosomal protein L9  38.16 
 
 		 152 aa  97.8  4e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1918  50S ribosomal protein L9  39.19 
 
 		 196 aa  97.1  7e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.403674  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2257  50S ribosomal protein L9  36.49 
 
 		 148 aa  97.1  7e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000108464  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0112  50S ribosomal protein L9  37.76 
 
 		 173 aa  97.1  8e-20  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0597  50S ribosomal protein L9  40.67 
 
 		 179 aa  96.3  1e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2388  50S ribosomal protein L9  38.67 
 
 		 147 aa  96.7  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1216  50S ribosomal protein L9  41.18 
 
 		 148 aa  96.7  1e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1410  50S ribosomal protein L9  41.33 
 
 		 171 aa  95.5  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000225617  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3480  50S ribosomal protein L9  40.67 
 
 		 146 aa  95.1  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.34024  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4542  50S ribosomal protein L9  38.51 
 
 		 152 aa  95.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.736351 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4506  ribosomal protein L9  40.28 
 
 		 149 aa  95.1  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.594005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4931  50S ribosomal protein L9  38.41 
 
 		 148 aa  94.4  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.108353  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1205  ribosomal protein L9  41.1 
 
 		 151 aa  94.4  5e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0097  50S ribosomal protein L9  41.06 
 
 		 151 aa  94  6e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.625219  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0287  ribosomal protein L9  40.67 
 
 		 152 aa  94  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0120134  normal  0.0123082 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2852  50S ribosomal protein L9  37.16 
 
 		 152 aa  94  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3244  50S ribosomal protein L9  37.16 
 
 		 152 aa  94  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.65089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0602  ribosomal protein L9  37.16 
 
 		 159 aa  93.2  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0165  50S ribosomal protein L9  41.06 
 
 		 148 aa  93.2  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000317895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0397  hypothetical protein  37.09 
 
 		 149 aa  93.2  1e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0311  ribosomal protein L9  40.27 
 
 		 148 aa  92.8  1e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0979697 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2535  ribosomal protein L9  36 
 
 		 148 aa  93.2  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000849852  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2188  50S ribosomal protein L9  39.19 
 
 		 209 aa  93.2  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0901  50S ribosomal protein L9  41.22 
 
 		 189 aa  92.4  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0476125 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2332  ribosomal protein L9  38.46 
 
 		 170 aa  91.7  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.640711  hitchhiker  0.00706783 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27890  ribosomal protein L9  40.97 
 
 		 181 aa  91.7  3e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00233062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2510  50S ribosomal protein L9  38.51 
 
 		 194 aa  91.3  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.531472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0851  50S ribosomal protein L9P  39.73 
 
 		 149 aa  91.3  4e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2610  50S ribosomal protein L9  40.4 
 
 		 147 aa  90.9  6e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.196058  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0081  50S ribosomal protein L9  33.78 
 
 		 148 aa  90.9  6e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.957353  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0881  50S ribosomal protein L9  37.09 
 
 		 148 aa  90.5  7e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00774862  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0161  50S ribosomal protein L9  40 
 
 		 148 aa  89.7  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000723092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2559  50S ribosomal protein L9  38.67 
 
 		 152 aa  90.1  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1150  50S ribosomal protein L9  40.28 
 
 		 165 aa  88.6  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0292661  hitchhiker  0.00494207 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09988  ribosomal protein L9  35.46 
 
 		 149 aa  89.4  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.536224  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3121  ribosomal protein L9  37.58 
 
 		 193 aa  89.4  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0761  50S ribosomal protein L9  40 
 
 		 151 aa  89  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000425439  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2028  50S ribosomal protein L9  39.07 
 
 		 167 aa  89  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.728229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2925  ribosomal protein L9  38.67 
 
 		 147 aa  89  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0843322  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04070  50S ribosomal protein L9  39.74 
 
 		 149 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3790  ribosomal protein L9  39.74 
 
 		 149 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00574678  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04032  hypothetical protein  39.74 
 
 		 149 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4307  50S ribosomal protein L9  39.86 
 
 		 190 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0939755 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1996  50S ribosomal protein L9  41.06 
 
 		 148 aa  88.6  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4414  50S ribosomal protein L9  39.86 
 
 		 190 aa  88.2  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.248049 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1352  50S ribosomal protein L9  40.67 
 
 		 167 aa  88.6  3e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4764  50S ribosomal protein L9  39.74 
 
 		 149 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3939  50S ribosomal protein L9  39.86 
 
 		 190 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.613806  normal  0.190537 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3810  50S ribosomal protein L9  39.74 
 
 		 149 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0581092 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4673  50S ribosomal protein L9  39.74 
 
 		 149 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5718  50S ribosomal protein L9  39.74 
 
 		 149 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.595872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4447  50S ribosomal protein L9  39.74 
 
 		 149 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4736  50S ribosomal protein L9  39.74 
 
 		 149 aa  88.6  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.257928  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0150  50S ribosomal protein L9  36 
 
 		 151 aa  87.8  4e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157053  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0740  ribosomal protein L9  32.45 
 
 		 150 aa  87.4  5e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>