More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_5456 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_5743  50S ribosomal protein L9  100 
 
 		 152 aa  301  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.245852 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5367  50S ribosomal protein L9  100 
 
 		 152 aa  301  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5456  50S ribosomal protein L9  100 
 
 		 152 aa  301  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.166119  normal  0.0135281 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6031  50S ribosomal protein L9  80.67 
 
 		 151 aa  249  8.000000000000001e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.827335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0877  50S ribosomal protein L9  80.67 
 
 		 151 aa  245  2e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10055  50S ribosomal protein L9  76.97 
 
 		 152 aa  235  1e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.95125e-19  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4737  ribosomal protein L9  67.33 
 
 		 150 aa  197  3.9999999999999996e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4166  ribosomal protein L9  66 
 
 		 150 aa  197  3.9999999999999996e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7042  ribosomal protein L9  62.84 
 
 		 151 aa  179  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3558  50S ribosomal protein L9  59.33 
 
 		 148 aa  166  1e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.882223 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39420  LSU ribosomal protein L9P  52.67 
 
 		 152 aa  164  5e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5366  ribosomal protein L9  53.64 
 
 		 151 aa  163  5.9999999999999996e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5065  50S ribosomal protein L9  55.7 
 
 		 148 aa  161  3e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.972236  hitchhiker  0.000155251 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4946  ribosomal protein L9  56.67 
 
 		 148 aa  161  3e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4553  50S ribosomal protein L9  55.33 
 
 		 148 aa  161  3e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.156994  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0334  50S ribosomal protein L9  55.7 
 
 		 151 aa  155  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.801723 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7309  50S ribosomal protein L9  54.67 
 
 		 148 aa  152  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.937449  normal  0.0304173 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9354  50S ribosomal protein L9P  53.33 
 
 		 148 aa  150  5e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.837132 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4841  ribosomal protein L9  53.33 
 
 		 148 aa  150  5.9999999999999996e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4519  50S ribosomal protein L9  56.76 
 
 		 148 aa  150  7e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.986951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3092  50S ribosomal protein L9  54.97 
 
 		 148 aa  150  8e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0370883  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2130  50S ribosomal protein L9  53.95 
 
 		 149 aa  148  2e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.929246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0130  50S ribosomal protein L9  49.67 
 
 		 149 aa  147  4e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0311991 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4661  50S ribosomal protein L9P  53.69 
 
 		 148 aa  144  6e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4336  50S ribosomal protein L9  51.01 
 
 		 150 aa  139  9e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26560  LSU ribosomal protein L9P  53.02 
 
 		 148 aa  134  5e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.199017 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3697  ribosomal protein L9  47.65 
 
 		 149 aa  132  9.999999999999999e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5065  ribosomal protein L9  51.68 
 
 		 151 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.366091  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4178  ribosomal protein L9  49.32 
 
 		 151 aa  132  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37780  LSU ribosomal protein L9P  48 
 
 		 149 aa  127  4.0000000000000003e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.236654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4117  50S ribosomal protein L9  50.34 
 
 		 150 aa  127  6e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23230  LSU ribosomal protein L9P  49.66 
 
 		 153 aa  125  2.0000000000000002e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3888  50S ribosomal protein L9  47.65 
 
 		 150 aa  125  3e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00361277 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31750  LSU ribosomal protein L9P  44.97 
 
 		 157 aa  118  3e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3352  ribosomal protein L9  47.65 
 
 		 151 aa  115  9.999999999999999e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.600621  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2522  ribosomal protein L9  45.33 
 
 		 150 aa  114  6e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.559663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0654  ribosomal protein L9  45.03 
 
 		 146 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.233351  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0132  50S ribosomal protein L9P  45.03 
 
 		 150 aa  112  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.191578  normal  0.450064 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2911  ribosomal protein L9  40.54 
 
 		 147 aa  105  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000198897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0311  ribosomal protein L9  43.33 
 
 		 148 aa  105  3e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0979697 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2388  50S ribosomal protein L9  43.71 
 
 		 147 aa  104  4e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2610  50S ribosomal protein L9  42 
 
 		 147 aa  104  5e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.196058  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2022  50S ribosomal protein L9  44.37 
 
 		 168 aa  102  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.278988  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0287  ribosomal protein L9  39.74 
 
 		 152 aa  101  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0120134  normal  0.0123082 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2257  50S ribosomal protein L9  37.34 
 
 		 148 aa  100  8e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000108464  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0761  50S ribosomal protein L9  42 
 
 		 151 aa  99.8  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000425439  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2535  ribosomal protein L9  36.18 
 
 		 148 aa  99  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000849852  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1692  50S ribosomal protein L9  38.06 
 
 		 149 aa  99.4  2e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09988  ribosomal protein L9  35.53 
 
 		 149 aa  97.8  4e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.536224  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0851  50S ribosomal protein L9P  41.94 
 
 		 149 aa  97.8  5e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1216  50S ribosomal protein L9  40.91 
 
 		 148 aa  96.7  1e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0011  50S ribosomal protein L9  38.93 
 
 		 150 aa  94.7  4e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.557694  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4506  ribosomal protein L9  37.75 
 
 		 149 aa  94.7  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.594005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00020  50S ribosomal protein L9  39.33 
 
 		 150 aa  94.7  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2559  50S ribosomal protein L9  40.79 
 
 		 152 aa  94.4  5e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2780  50S ribosomal protein L9  38.41 
 
 		 149 aa  94.4  5e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000928974  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0566  50S ribosomal protein L9  38.93 
 
 		 189 aa  94  7e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0081  50S ribosomal protein L9  36.36 
 
 		 148 aa  94  7e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.957353  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0760  50S ribosomal protein L9  42.11 
 
 		 150 aa  94  7e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.242158  hitchhiker  0.000000266441 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0602  ribosomal protein L9  35.29 
 
 		 159 aa  94  7e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0458  50S ribosomal protein L9  39.6 
 
 		 189 aa  92.8  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0452  50S ribosomal protein L9  39.6 
 
 		 189 aa  92.8  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.206752  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3281  50S ribosomal protein L9  42.76 
 
 		 150 aa  92.4  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.134585  hitchhiker  0.000210385 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2188  50S ribosomal protein L9  44.08 
 
 		 209 aa  91.7  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1410  50S ribosomal protein L9  40.4 
 
 		 171 aa  92  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000225617  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4931  50S ribosomal protein L9  38.41 
 
 		 148 aa  92  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.108353  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3528  50S ribosomal protein L9  36.6 
 
 		 168 aa  91.3  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.156676  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0222  ribosomal protein L9  38.56 
 
 		 151 aa  91.7  4e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0448  50S ribosomal protein L9  35.76 
 
 		 148 aa  91.7  4e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000315624  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0042  ribosomal protein L9  39.07 
 
 		 150 aa  91.3  5e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1479  50S ribosomal protein L9  38.51 
 
 		 147 aa  90.9  5e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00653221 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04070  50S ribosomal protein L9  39.74 
 
 		 149 aa  90.5  7e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3790  ribosomal protein L9  39.74 
 
 		 149 aa  90.5  7e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00574678  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4812  50S ribosomal protein L9  39.07 
 
 		 149 aa  90.5  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0162172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5718  50S ribosomal protein L9  39.74 
 
 		 149 aa  90.5  7e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.595872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4790  50S ribosomal protein L9  39.07 
 
 		 149 aa  90.5  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.131212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4447  50S ribosomal protein L9  39.74 
 
 		 149 aa  90.5  7e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4754  50S ribosomal protein L9  39.07 
 
 		 149 aa  90.5  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0190714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4764  50S ribosomal protein L9  39.74 
 
 		 149 aa  90.5  7e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04032  hypothetical protein  39.74 
 
 		 149 aa  90.5  7e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4673  50S ribosomal protein L9  39.74 
 
 		 149 aa  90.5  7e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4736  50S ribosomal protein L9  39.74 
 
 		 149 aa  90.5  7e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.257928  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002335  LSU ribosomal protein L9p  39.74 
 
 		 150 aa  90.5  7e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.178305  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3810  50S ribosomal protein L9  39.74 
 
 		 149 aa  90.5  7e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0581092 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2761  50S ribosomal protein L9  37.84 
 
 		 147 aa  90.5  8e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4672  50S ribosomal protein L9  39.07 
 
 		 149 aa  90.1  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00136692  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4662  50S ribosomal protein L9  39.07 
 
 		 149 aa  90.1  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0630658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1150  50S ribosomal protein L9  37.66 
 
 		 165 aa  89.7  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0292661  hitchhiker  0.00494207 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0097  50S ribosomal protein L9  38.82 
 
 		 151 aa  90.1  1e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.625219  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4542  50S ribosomal protein L9  34.23 
 
 		 152 aa  89.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.736351 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1352  50S ribosomal protein L9  41.03 
 
 		 167 aa  89.7  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1996  50S ribosomal protein L9  37.33 
 
 		 148 aa  89  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2852  50S ribosomal protein L9  32.67 
 
 		 152 aa  89  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4209  50S ribosomal protein L9  41.45 
 
 		 150 aa  89.4  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.828057  hitchhiker  0.000279421 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0165  50S ribosomal protein L9  34.87 
 
 		 148 aa  89  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000317895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3244  50S ribosomal protein L9  32.67 
 
 		 152 aa  89  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.65089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0901  50S ribosomal protein L9  39.6 
 
 		 189 aa  88.6  3e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0476125 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0561  ribosomal protein L9  35.29 
 
 		 149 aa  88.6  3e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.204129  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4351  ribosomal protein L9  32.24 
 
 		 148 aa  88.2  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2510  50S ribosomal protein L9  39.6 
 
 		 194 aa  87.8  5e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.531472  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>