More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0311 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0311  ribosomal protein L9  100 
 
 		 148 aa  288  2e-77  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0979697 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1216  50S ribosomal protein L9  80.41 
 
 		 148 aa  235  2e-61  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2522  ribosomal protein L9  50.67 
 
 		 150 aa  141  3e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.559663  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3697  ribosomal protein L9  51.37 
 
 		 149 aa  138  3e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0334  50S ribosomal protein L9  46 
 
 		 151 aa  130  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.801723 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37780  LSU ribosomal protein L9P  47.95 
 
 		 149 aa  130  9e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.236654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3352  ribosomal protein L9  48.67 
 
 		 151 aa  130  9e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.600621  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5065  50S ribosomal protein L9  44.14 
 
 		 148 aa  129  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.972236  hitchhiker  0.000155251 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4553  50S ribosomal protein L9  44.83 
 
 		 148 aa  129  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.156994  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3558  50S ribosomal protein L9  45.89 
 
 		 148 aa  126  8.000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.882223 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4166  ribosomal protein L9  46.98 
 
 		 150 aa  123  7e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4178  ribosomal protein L9  48.63 
 
 		 151 aa  122  1e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31750  LSU ribosomal protein L9P  42.18 
 
 		 157 aa  120  7e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26560  LSU ribosomal protein L9P  48.28 
 
 		 148 aa  119  9.999999999999999e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.199017 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4336  50S ribosomal protein L9  42.76 
 
 		 150 aa  118  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5065  ribosomal protein L9  44.3 
 
 		 151 aa  117  3.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.366091  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4946  ribosomal protein L9  41.78 
 
 		 148 aa  117  4.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4737  ribosomal protein L9  43.24 
 
 		 150 aa  116  9e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2130  50S ribosomal protein L9  42.07 
 
 		 149 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.929246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0877  50S ribosomal protein L9  44.97 
 
 		 151 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4841  ribosomal protein L9  39.04 
 
 		 148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23230  LSU ribosomal protein L9P  45.21 
 
 		 153 aa  111  3e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0130  50S ribosomal protein L9  39.73 
 
 		 149 aa  111  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0311991 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7042  ribosomal protein L9  45.21 
 
 		 151 aa  110  5e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6031  50S ribosomal protein L9  46.31 
 
 		 151 aa  110  6e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.827335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9354  50S ribosomal protein L9P  39.73 
 
 		 148 aa  109  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.837132 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3092  50S ribosomal protein L9  39.73 
 
 		 148 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0370883  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4117  50S ribosomal protein L9  40.41 
 
 		 150 aa  108  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4661  50S ribosomal protein L9P  40 
 
 		 148 aa  107  8.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5743  50S ribosomal protein L9  43.33 
 
 		 152 aa  105  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.245852 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5367  50S ribosomal protein L9  43.33 
 
 		 152 aa  105  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5456  50S ribosomal protein L9  43.33 
 
 		 152 aa  105  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.166119  normal  0.0135281 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3888  50S ribosomal protein L9  39.04 
 
 		 150 aa  104  4e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00361277 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4519  50S ribosomal protein L9  39.58 
 
 		 148 aa  104  4e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.986951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0132  50S ribosomal protein L9P  39.46 
 
 		 150 aa  102  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.191578  normal  0.450064 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10055  50S ribosomal protein L9  42 
 
 		 152 aa  102  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.95125e-19  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2028  50S ribosomal protein L9  39.04 
 
 		 167 aa  102  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.728229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39420  LSU ribosomal protein L9P  40.4 
 
 		 152 aa  101  3e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2911  ribosomal protein L9  38.03 
 
 		 147 aa  101  3e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000198897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7309  50S ribosomal protein L9  36.3 
 
 		 148 aa  100  6e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.937449  normal  0.0304173 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0761  50S ribosomal protein L9  42.67 
 
 		 151 aa  100  6e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000425439  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0654  ribosomal protein L9  38.62 
 
 		 146 aa  100  7e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.233351  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3675  50S ribosomal protein L9  38.46 
 
 		 147 aa  100  9e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0017578  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4351  ribosomal protein L9  35.37 
 
 		 148 aa  99.8  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2022  50S ribosomal protein L9  39.73 
 
 		 168 aa  99.4  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.278988  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4542  50S ribosomal protein L9  37.93 
 
 		 152 aa  98.6  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.736351 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1359  ribosomal protein L9  37.75 
 
 		 151 aa  98.2  3e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0122536  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0668  50S ribosomal protein L9  40.56 
 
 		 148 aa  97.1  7e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00124479  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1096  50S ribosomal protein L9  38.46 
 
 		 160 aa  97.1  8e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.547655  normal  0.0167988 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2852  50S ribosomal protein L9  35.86 
 
 		 152 aa  96.7  9e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3244  50S ribosomal protein L9  35.86 
 
 		 152 aa  96.7  9e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.65089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0602  ribosomal protein L9  37.67 
 
 		 159 aa  96.3  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1219  50S ribosomal protein L9P  39.46 
 
 		 148 aa  95.5  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.405746 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2841  50S ribosomal protein L9  38.3 
 
 		 148 aa  94.7  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000145753  hitchhiker  0.000000000000102152 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00020  50S ribosomal protein L9  43.05 
 
 		 150 aa  94.4  5e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0097  50S ribosomal protein L9  40.41 
 
 		 151 aa  94.4  5e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.625219  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1410  50S ribosomal protein L9  39.04 
 
 		 171 aa  94.4  5e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000225617  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2827  ribosomal protein L9  43.14 
 
 		 150 aa  94  6e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0161  50S ribosomal protein L9  41.1 
 
 		 148 aa  93.6  9e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000723092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0116  50S ribosomal protein L9  41.1 
 
 		 149 aa  93.2  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0150  50S ribosomal protein L9  38.36 
 
 		 151 aa  92.8  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157053  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5366  ribosomal protein L9  40.27 
 
 		 151 aa  92.8  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2509  50S ribosomal protein L9  39.04 
 
 		 151 aa  93.2  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000781135  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3281  50S ribosomal protein L9  41.72 
 
 		 150 aa  92  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.134585  hitchhiker  0.000210385 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2332  ribosomal protein L9  33.33 
 
 		 170 aa  92  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.640711  hitchhiker  0.00706783 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0534  ribosomal protein L9  36.99 
 
 		 149 aa  92.4  2e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1352  50S ribosomal protein L9  39.73 
 
 		 167 aa  91.7  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3666  50S ribosomal protein L9  41.33 
 
 		 149 aa  91.7  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.006093  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0117  50S ribosomal protein L9  41.1 
 
 		 151 aa  91.7  3e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1948  ribosomal protein L9  38.51 
 
 		 151 aa  91.7  3e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0123  50S ribosomal protein L9  40.41 
 
 		 149 aa  90.9  5e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4535  50S ribosomal protein L9  35.62 
 
 		 153 aa  90.9  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.323692 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0134  50S ribosomal protein L9  40.41 
 
 		 149 aa  90.9  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1205  ribosomal protein L9  40 
 
 		 151 aa  90.5  6e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2102  50S ribosomal protein L9P  38 
 
 		 149 aa  90.5  7e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0120  50S ribosomal protein L9  41.79 
 
 		 149 aa  90.1  8e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0927016  normal  0.199932 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002335  LSU ribosomal protein L9p  40 
 
 		 150 aa  89.7  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.178305  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2212  50S ribosomal protein L9  40.29 
 
 		 150 aa  89.7  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1479  50S ribosomal protein L9  37.06 
 
 		 147 aa  90.1  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00653221 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1692  50S ribosomal protein L9  34.25 
 
 		 149 aa  89.4  1e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2761  50S ribosomal protein L9  37.06 
 
 		 147 aa  90.1  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0586  50S ribosomal protein L9  41.22 
 
 		 150 aa  89.4  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.482938  hitchhiker  3.77539e-17 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0165  50S ribosomal protein L9  37.67 
 
 		 148 aa  90.1  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000317895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0081  50S ribosomal protein L9  35.37 
 
 		 148 aa  88.6  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.957353  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1150  50S ribosomal protein L9  36.67 
 
 		 165 aa  89.4  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0292661  hitchhiker  0.00494207 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0112  50S ribosomal protein L9  36.23 
 
 		 173 aa  88.6  3e-17  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0011  50S ribosomal protein L9  39.04 
 
 		 150 aa  88.6  3e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.557694  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2306  50S ribosomal protein L9  36.36 
 
 		 189 aa  88.2  3e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.891012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1828  50S ribosomal protein L9  40.28 
 
 		 168 aa  87.8  4e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2559  50S ribosomal protein L9  38.51 
 
 		 152 aa  87.8  5e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0210  ribosomal protein L9  35.66 
 
 		 172 aa  87.8  5e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000722973  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2610  50S ribosomal protein L9  36.55 
 
 		 147 aa  87.8  5e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.196058  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1775  50S ribosomal protein L9  37.41 
 
 		 149 aa  87.4  6e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000651865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2188  50S ribosomal protein L9  37.06 
 
 		 209 aa  87  7e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0597  50S ribosomal protein L9  36.99 
 
 		 179 aa  87  8e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2007  ribosomal protein L9  32.87 
 
 		 148 aa  87  8e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.474404 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4209  50S ribosomal protein L9  39.74 
 
 		 150 aa  87  8e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.828057  hitchhiker  0.000279421 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3927  50S ribosomal protein L9  40.65 
 
 		 150 aa  86.3  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0110  50S ribosomal protein L9  36.99 
 
 		 151 aa  86.3  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000508651  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18631  50S ribosomal protein L9  37.41 
 
 		 151 aa  86.3  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.58702  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>