More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_31750 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_31750  LSU ribosomal protein L9P  100 
 
 		 157 aa  317  6e-86  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4336  50S ribosomal protein L9  57.82 
 
 		 150 aa  176  1e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37780  LSU ribosomal protein L9P  53.74 
 
 		 149 aa  168  2e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.236654  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3697  ribosomal protein L9  51.02 
 
 		 149 aa  167  4e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3888  50S ribosomal protein L9  56.08 
 
 		 150 aa  167  5e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00361277 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4117  50S ribosomal protein L9  56.08 
 
 		 150 aa  166  1e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4661  50S ribosomal protein L9P  51.02 
 
 		 148 aa  161  4.0000000000000004e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4178  ribosomal protein L9  54.05 
 
 		 151 aa  158  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3352  ribosomal protein L9  50 
 
 		 151 aa  156  9e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.600621  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0334  50S ribosomal protein L9  51.68 
 
 		 151 aa  155  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.801723 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23230  LSU ribosomal protein L9P  52.7 
 
 		 153 aa  155  2e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3558  50S ribosomal protein L9  53.06 
 
 		 148 aa  155  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.882223 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4946  ribosomal protein L9  51.02 
 
 		 148 aa  155  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4841  ribosomal protein L9  47.62 
 
 		 148 aa  153  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3092  50S ribosomal protein L9  50.68 
 
 		 148 aa  149  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0370883  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2522  ribosomal protein L9  49.32 
 
 		 150 aa  149  1e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.559663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9354  50S ribosomal protein L9P  48.98 
 
 		 148 aa  148  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.837132 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26560  LSU ribosomal protein L9P  52.38 
 
 		 148 aa  145  1.0000000000000001e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.199017 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0130  50S ribosomal protein L9  44.59 
 
 		 149 aa  139  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0311991 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2130  50S ribosomal protein L9  44.9 
 
 		 149 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.929246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7309  50S ribosomal protein L9  46.26 
 
 		 148 aa  137  4.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.937449  normal  0.0304173 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4519  50S ribosomal protein L9  46.26 
 
 		 148 aa  134  4e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.986951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5065  ribosomal protein L9  46.26 
 
 		 151 aa  131  3.9999999999999996e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.366091  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4553  50S ribosomal protein L9  43.45 
 
 		 148 aa  130  6e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.156994  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5065  50S ribosomal protein L9  42.76 
 
 		 148 aa  130  9e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.972236  hitchhiker  0.000155251 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0877  50S ribosomal protein L9  45.64 
 
 		 151 aa  124  5e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0132  50S ribosomal protein L9P  41.78 
 
 		 150 aa  123  8.000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.191578  normal  0.450064 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7042  ribosomal protein L9  43.84 
 
 		 151 aa  122  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0311  ribosomal protein L9  42.18 
 
 		 148 aa  120  8e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0979697 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5367  50S ribosomal protein L9  44.97 
 
 		 152 aa  118  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5456  50S ribosomal protein L9  44.97 
 
 		 152 aa  118  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.166119  normal  0.0135281 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5743  50S ribosomal protein L9  44.97 
 
 		 152 aa  118  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.245852 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5366  ribosomal protein L9  40.94 
 
 		 151 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1216  50S ribosomal protein L9  40.82 
 
 		 148 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2535  ribosomal protein L9  40.82 
 
 		 148 aa  115  3e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000849852  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10055  50S ribosomal protein L9  40.94 
 
 		 152 aa  114  5e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.95125e-19  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6031  50S ribosomal protein L9  43.33 
 
 		 151 aa  114  6e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.827335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2911  ribosomal protein L9  39.86 
 
 		 147 aa  114  6.9999999999999995e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000198897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3757  50S ribosomal protein L9  40.28 
 
 		 148 aa  114  7.999999999999999e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11530  ribosomal protein L9  40.97 
 
 		 191 aa  110  6e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0446546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4737  ribosomal protein L9  41.89 
 
 		 150 aa  110  7.000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0448  50S ribosomal protein L9  35.86 
 
 		 148 aa  109  1.0000000000000001e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000315624  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4351  ribosomal protein L9  34.48 
 
 		 148 aa  108  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0881  50S ribosomal protein L9  37.41 
 
 		 148 aa  108  3e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00774862  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23320  ribosomal protein L9  42.42 
 
 		 147 aa  106  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.507738  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2388  50S ribosomal protein L9  38.1 
 
 		 147 aa  105  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2610  50S ribosomal protein L9  38.1 
 
 		 147 aa  105  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.196058  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0023  ribosomal protein L9  37.5 
 
 		 174 aa  105  3e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.725827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2022  50S ribosomal protein L9  39.04 
 
 		 168 aa  104  4e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.278988  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2332  ribosomal protein L9  32.68 
 
 		 170 aa  104  4e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.640711  hitchhiker  0.00706783 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0011  50S ribosomal protein L9  36.99 
 
 		 150 aa  105  4e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.557694  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3675  50S ribosomal protein L9  38.19 
 
 		 147 aa  103  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0017578  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2925  ribosomal protein L9  36.05 
 
 		 147 aa  103  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0843322  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2006  ribosomal protein L9  34.67 
 
 		 152 aa  102  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0654  ribosomal protein L9  37.67 
 
 		 146 aa  102  2e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.233351  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1359  ribosomal protein L9  36.43 
 
 		 151 aa  102  2e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0122536  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2559  50S ribosomal protein L9  41.22 
 
 		 152 aa  102  2e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4542  50S ribosomal protein L9  38.62 
 
 		 152 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.736351 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1150  50S ribosomal protein L9  35.33 
 
 		 165 aa  101  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0292661  hitchhiker  0.00494207 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4931  50S ribosomal protein L9  40.14 
 
 		 148 aa  101  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.108353  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0025  ribosomal protein L9  37.5 
 
 		 178 aa  101  4e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00173008  normal  0.984167 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2257  50S ribosomal protein L9  34.72 
 
 		 148 aa  101  5e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000108464  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4166  ribosomal protein L9  39.19 
 
 		 150 aa  101  5e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0161  50S ribosomal protein L9  38.19 
 
 		 148 aa  100  6e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000723092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0761  50S ribosomal protein L9  37.01 
 
 		 151 aa  100  8e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000425439  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18001  50S ribosomal protein L9  34.69 
 
 		 152 aa  100  8e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39420  LSU ribosomal protein L9P  32.89 
 
 		 152 aa  100  9e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1205  ribosomal protein L9  35.62 
 
 		 151 aa  100  9e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0534  ribosomal protein L9  38.36 
 
 		 149 aa  99.8  1e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2841  50S ribosomal protein L9  35.37 
 
 		 148 aa  99.8  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000145753  hitchhiker  0.000000000000102152 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1479  50S ribosomal protein L9  38.1 
 
 		 147 aa  99  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00653221 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1692  50S ribosomal protein L9  33.1 
 
 		 149 aa  99.4  2e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27890  ribosomal protein L9  37.5 
 
 		 181 aa  99  2e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00233062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2193  50S ribosomal protein L9  36.05 
 
 		 152 aa  98.2  4e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1814  ribosomal protein L9  37.41 
 
 		 149 aa  97.4  6e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0668  50S ribosomal protein L9  35.81 
 
 		 148 aa  97.4  7e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00124479  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2761  50S ribosomal protein L9  37.41 
 
 		 147 aa  97.1  8e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0851  50S ribosomal protein L9P  36.91 
 
 		 149 aa  97.1  8e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5913  ribosomal protein L9  39.04 
 
 		 150 aa  95.9  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0081  50S ribosomal protein L9  32.64 
 
 		 148 aa  95.9  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.957353  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2212  50S ribosomal protein L9  39.1 
 
 		 150 aa  95.9  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0602  ribosomal protein L9  37.5 
 
 		 159 aa  95.9  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2458  50S ribosomal protein L9P  36.11 
 
 		 149 aa  94.7  4e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.174518 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0110  50S ribosomal protein L9  36.84 
 
 		 151 aa  94.4  5e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000508651  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1775  50S ribosomal protein L9  36.91 
 
 		 149 aa  94  7e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000651865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0397  hypothetical protein  33.56 
 
 		 149 aa  94  7e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2509  50S ribosomal protein L9  35.53 
 
 		 151 aa  94  7e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000781135  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0491  ribosomal protein L9  32.87 
 
 		 179 aa  94  7e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2542  50S ribosomal protein L9  34.93 
 
 		 152 aa  94  8e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1352  50S ribosomal protein L9  38.36 
 
 		 167 aa  94  8e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0150  50S ribosomal protein L9  35.1 
 
 		 151 aa  93.6  9e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157053  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0117  50S ribosomal protein L9  34.03 
 
 		 151 aa  92.8  1e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0097  50S ribosomal protein L9  38.69 
 
 		 151 aa  93.2  1e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.625219  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3991  50S ribosomal protein L9  37.24 
 
 		 165 aa  93.2  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00054476 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0901  50S ribosomal protein L9  36.11 
 
 		 189 aa  92.8  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0476125 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1272  50S ribosomal protein L9  33.33 
 
 		 152 aa  92.4  2e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0329  50S ribosomal protein L9  37.16 
 
 		 152 aa  92.4  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.355323  normal  0.434143 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3666  50S ribosomal protein L9  37.84 
 
 		 149 aa  92.8  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.006093  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2306  50S ribosomal protein L9  34.72 
 
 		 189 aa  92.4  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.891012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21431  50S ribosomal protein L9  34.01 
 
 		 152 aa  92.8  2e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>