More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_0566 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009667  Oant_0566  50S ribosomal protein L9  100 
 
 		 189 aa  379  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0452  50S ribosomal protein L9  94.71 
 
 		 189 aa  365  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.206752  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0458  50S ribosomal protein L9  94.71 
 
 		 189 aa  363  1e-100  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0491  ribosomal protein L9  69.66 
 
 		 179 aa  262  2e-69  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1051  50S ribosomal protein L9  66.67 
 
 		 192 aa  260  6.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.289991 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1918  50S ribosomal protein L9  70.33 
 
 		 196 aa  260  8e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.403674  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1194  50S ribosomal protein L9  66.14 
 
 		 192 aa  260  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.762079  normal  0.0731596 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0738  50S ribosomal protein L9  68.72 
 
 		 191 aa  258  4e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.823068  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1516  50S ribosomal protein L9  68.16 
 
 		 191 aa  258  4e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101233  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4414  50S ribosomal protein L9  69.51 
 
 		 190 aa  239  2e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.248049 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5418  50S ribosomal protein L9  68.07 
 
 		 190 aa  238  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0206045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4307  50S ribosomal protein L9  68.9 
 
 		 190 aa  238  5e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0939755 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3939  50S ribosomal protein L9  68.9 
 
 		 190 aa  238  5e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.613806  normal  0.190537 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0901  50S ribosomal protein L9  66.46 
 
 		 189 aa  236  2e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0476125 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3121  ribosomal protein L9  66.05 
 
 		 193 aa  232  2.0000000000000002e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2306  50S ribosomal protein L9  65.85 
 
 		 189 aa  227  8e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.891012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1350  50S ribosomal protein L9  60.77 
 
 		 189 aa  225  3e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0676227  normal  0.268494 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0141  50S ribosomal protein L9  60.22 
 
 		 189 aa  224  7e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1774  50S ribosomal protein L9  60.22 
 
 		 189 aa  224  7e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2593  50S ribosomal protein L9  70.19 
 
 		 189 aa  223  1e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0267673 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3363  ribosomal protein L9  66.46 
 
 		 201 aa  222  2e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4634  50S ribosomal protein L9  70.44 
 
 		 189 aa  222  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.269406  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2188  50S ribosomal protein L9  61.88 
 
 		 209 aa  213  1.9999999999999998e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3040  50S ribosomal protein L9  54.17 
 
 		 188 aa  204  5e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.186174 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0889  50S ribosomal protein L9  58.75 
 
 		 194 aa  203  1e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.301047  normal  0.514488 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1620  50S ribosomal protein L9  55.25 
 
 		 211 aa  202  2e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0645747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3812  50S ribosomal protein L9  57.41 
 
 		 197 aa  199  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.740565  normal  0.136797 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1694  50S ribosomal protein L9  54.94 
 
 		 202 aa  196  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0817246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1043  50S ribosomal protein L9  57.5 
 
 		 204 aa  195  4.0000000000000005e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0955164 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3490  50S ribosomal protein L9  56.79 
 
 		 195 aa  194  9e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1510  ribosomal protein L9  54.71 
 
 		 186 aa  191  7e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1210  50S ribosomal protein L9  56.36 
 
 		 209 aa  188  4e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0873917  normal  0.750153 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2988  50S ribosomal protein L9  59.26 
 
 		 194 aa  186  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2415  50S ribosomal protein L9  52.47 
 
 		 202 aa  186  1e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.295062  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2461  50S ribosomal protein L9  58.64 
 
 		 196 aa  186  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.384902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2510  50S ribosomal protein L9  54.32 
 
 		 194 aa  184  7e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.531472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2293  50S ribosomal protein L9  58.02 
 
 		 198 aa  183  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.14836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1414  50S ribosomal protein L9  50.85 
 
 		 199 aa  181  4.0000000000000006e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0083  50S ribosomal protein L9  55.56 
 
 		 202 aa  180  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.584189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0411  50S ribosomal protein L9  63.01 
 
 		 195 aa  176  1e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.112533  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1902  50S ribosomal protein L9  54.66 
 
 		 210 aa  171  5.999999999999999e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.171336 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1403  50S ribosomal protein L9  46.21 
 
 		 150 aa  135  4e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.318005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2780  50S ribosomal protein L9  48.55 
 
 		 149 aa  134  6.0000000000000005e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000928974  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2458  50S ribosomal protein L9P  43.62 
 
 		 149 aa  134  7.000000000000001e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.174518 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3666  50S ribosomal protein L9  46.58 
 
 		 149 aa  133  9.999999999999999e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.006093  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1329  50S ribosomal protein L9P  51.03 
 
 		 148 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.556068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5226  ribosomal protein L9  46.9 
 
 		 150 aa  133  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1780  50S ribosomal protein L9  46.21 
 
 		 150 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5171  50S ribosomal protein L9  45.52 
 
 		 150 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1808  50S ribosomal protein L9  46.21 
 
 		 150 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.432428  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1894  50S ribosomal protein L9  45.52 
 
 		 150 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000492255  hitchhiker  0.000000062237 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002335  LSU ribosomal protein L9p  46.58 
 
 		 150 aa  132  3.9999999999999996e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.178305  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6208  50S ribosomal protein L9  45.52 
 
 		 150 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1871  50S ribosomal protein L9  45.52 
 
 		 150 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.539407  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3034  50S ribosomal protein L9  45.52 
 
 		 150 aa  130  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000136909  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04070  50S ribosomal protein L9  46.58 
 
 		 149 aa  128  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3790  ribosomal protein L9  46.58 
 
 		 149 aa  128  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00574678  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04032  hypothetical protein  46.58 
 
 		 149 aa  128  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5718  50S ribosomal protein L9  46.58 
 
 		 149 aa  128  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.595872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4764  50S ribosomal protein L9  46.58 
 
 		 149 aa  128  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4447  50S ribosomal protein L9  46.58 
 
 		 149 aa  128  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4736  50S ribosomal protein L9  46.58 
 
 		 149 aa  128  5.0000000000000004e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.257928  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3810  50S ribosomal protein L9  46.58 
 
 		 149 aa  128  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0581092 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4673  50S ribosomal protein L9  46.58 
 
 		 149 aa  128  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00020  50S ribosomal protein L9  45.21 
 
 		 150 aa  127  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4662  50S ribosomal protein L9  44.52 
 
 		 149 aa  126  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0630658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4672  50S ribosomal protein L9  44.52 
 
 		 149 aa  126  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00136692  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2196  50S ribosomal protein L9  44.14 
 
 		 150 aa  125  3e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0214296  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2827  ribosomal protein L9  44.14 
 
 		 150 aa  125  3e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2249  50S ribosomal protein L9  46.21 
 
 		 150 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.128176  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2911  ribosomal protein L9  39.31 
 
 		 147 aa  125  4.0000000000000003e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000198897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4790  50S ribosomal protein L9  43.84 
 
 		 149 aa  124  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.131212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4812  50S ribosomal protein L9  43.84 
 
 		 149 aa  124  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0162172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4754  50S ribosomal protein L9  43.84 
 
 		 149 aa  124  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0190714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2102  50S ribosomal protein L9P  42.76 
 
 		 149 aa  124  8.000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0760  50S ribosomal protein L9  45.95 
 
 		 150 aa  124  9e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.242158  hitchhiker  0.000000266441 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0984  50S ribosomal protein L9  46.32 
 
 		 150 aa  124  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1219  50S ribosomal protein L9P  46.9 
 
 		 148 aa  123  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.405746 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3281  50S ribosomal protein L9  45.89 
 
 		 150 aa  123  1e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.134585  hitchhiker  0.000210385 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1529  50S ribosomal protein L9P  47.01 
 
 		 150 aa  124  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00288476  normal  0.135454 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0777  50S ribosomal protein L9  44.52 
 
 		 149 aa  124  1e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000131124  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2566  50S ribosomal protein L9  47.59 
 
 		 150 aa  122  2e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3213  50S ribosomal protein L9  47.59 
 
 		 150 aa  122  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1246  50S ribosomal protein L9  48.25 
 
 		 150 aa  122  4e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00525572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1185  50S ribosomal protein L9  48.25 
 
 		 150 aa  122  4e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.152259  normal  0.105379 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4209  50S ribosomal protein L9  45.27 
 
 		 150 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.828057  hitchhiker  0.000279421 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07670  50S ribosomal protein L9  43.26 
 
 		 148 aa  119  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.957501  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3348  50S ribosomal protein L9  43.92 
 
 		 150 aa  118  6e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000169987  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1948  ribosomal protein L9  44.14 
 
 		 151 aa  118  7e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4665  50S ribosomal protein L9  44.12 
 
 		 148 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0656931 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2383  50S ribosomal protein L9  47.59 
 
 		 148 aa  117  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1310  50S ribosomal protein L9  47.01 
 
 		 150 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0418  ribosomal protein L9  43.92 
 
 		 150 aa  116  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.291311  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1361  ribosomal protein L9  43.71 
 
 		 150 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3927  50S ribosomal protein L9  47.3 
 
 		 150 aa  115  3e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0449  50S ribosomal protein L9  43.15 
 
 		 150 aa  116  3e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00474942 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4931  50S ribosomal protein L9  43.38 
 
 		 148 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000100703 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1231  50S ribosomal protein L9  47.79 
 
 		 150 aa  115  3e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.662893  normal  0.0262623 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03776  50S ribosomal protein L9  43.15 
 
 		 150 aa  115  3.9999999999999997e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1821  50S ribosomal protein L9  45.52 
 
 		 150 aa  115  5e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.215704  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>