More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3480 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3480  50S ribosomal protein L9  100 
 
 		 146 aa  290  3e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.34024  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1668  50S ribosomal protein L9  66.89 
 
 		 175 aa  197  3e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.197637  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09988  ribosomal protein L9  58.78 
 
 		 149 aa  178  2e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.536224  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0597  50S ribosomal protein L9  55.1 
 
 		 179 aa  162  1.0000000000000001e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0741  ribosomal protein L9  57.14 
 
 		 147 aa  158  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0681469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1112  ribosomal protein L9  50.34 
 
 		 147 aa  144  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.573323  normal  0.866168 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2593  50S ribosomal protein L9  50.34 
 
 		 147 aa  140  5e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0397  hypothetical protein  49.32 
 
 		 149 aa  137  3.9999999999999997e-32  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2007  ribosomal protein L9  45.52 
 
 		 148 aa  127  5.0000000000000004e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.474404 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2841  50S ribosomal protein L9  42.14 
 
 		 148 aa  114  6e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000145753  hitchhiker  0.000000000000102152 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0150  50S ribosomal protein L9  46.26 
 
 		 151 aa  111  3e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157053  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1410  50S ribosomal protein L9  42.57 
 
 		 171 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000225617  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6995  ribosomal protein L9  45.95 
 
 		 148 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.142438 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3675  50S ribosomal protein L9  41.18 
 
 		 147 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0017578  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0602  ribosomal protein L9  40.14 
 
 		 159 aa  108  3e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0117  50S ribosomal protein L9  44.9 
 
 		 151 aa  106  8.000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0668  50S ribosomal protein L9  40 
 
 		 148 aa  106  9.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00124479  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1479  50S ribosomal protein L9  39.29 
 
 		 147 aa  105  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00653221 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2761  50S ribosomal protein L9  39.29 
 
 		 147 aa  105  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2022  50S ribosomal protein L9  39.19 
 
 		 168 aa  105  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.278988  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2610  50S ribosomal protein L9  43.38 
 
 		 147 aa  104  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.196058  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2130  50S ribosomal protein L9  42.47 
 
 		 149 aa  104  3e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.929246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3092  50S ribosomal protein L9  40.82 
 
 		 148 aa  104  4e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0370883  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7042  ribosomal protein L9  40.14 
 
 		 151 aa  104  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0097  50S ribosomal protein L9  43.54 
 
 		 151 aa  103  6e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.625219  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2509  50S ribosomal protein L9  42.86 
 
 		 151 aa  103  8e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000781135  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4535  50S ribosomal protein L9  38.78 
 
 		 153 aa  103  9e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.323692 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0110  50S ribosomal protein L9  41.5 
 
 		 151 aa  102  1e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000508651  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0761  50S ribosomal protein L9  39.73 
 
 		 151 aa  102  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000425439  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0130  50S ribosomal protein L9  40.27 
 
 		 149 aa  102  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0311991 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0163  50S ribosomal protein L9  38.78 
 
 		 146 aa  100  6e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00237667  normal  0.639266 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0161  50S ribosomal protein L9  40.14 
 
 		 148 aa  100  9e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000723092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9354  50S ribosomal protein L9P  39.46 
 
 		 148 aa  99.8  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.837132 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0654  ribosomal protein L9  41.1 
 
 		 146 aa  99.8  1e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.233351  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1352  50S ribosomal protein L9  38.78 
 
 		 167 aa  100  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5226  ribosomal protein L9  42.76 
 
 		 150 aa  99  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1096  50S ribosomal protein L9  37.5 
 
 		 160 aa  98.6  3e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.547655  normal  0.0167988 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23230  LSU ribosomal protein L9P  40.82 
 
 		 153 aa  97.8  4e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0165  50S ribosomal protein L9  40.82 
 
 		 148 aa  97.8  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000317895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2559  50S ribosomal protein L9  38.67 
 
 		 152 aa  97.4  5e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1775  50S ribosomal protein L9  39.86 
 
 		 149 aa  97.4  5e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000651865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39420  LSU ribosomal protein L9P  42.21 
 
 		 152 aa  97.8  5e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2911  ribosomal protein L9  37.41 
 
 		 147 aa  97.1  8e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000198897  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0830  ribosomal protein L9  37.84 
 
 		 149 aa  97.1  8e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.211438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4506  ribosomal protein L9  38.51 
 
 		 149 aa  96.7  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.594005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18001  50S ribosomal protein L9  40.54 
 
 		 152 aa  96.3  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4946  ribosomal protein L9  38.78 
 
 		 148 aa  95.1  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5366  ribosomal protein L9  40.67 
 
 		 151 aa  95.1  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2925  ribosomal protein L9  37.41 
 
 		 147 aa  94.4  4e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0843322  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2257  50S ribosomal protein L9  40.54 
 
 		 148 aa  94.7  4e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000108464  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2332  ribosomal protein L9  39.04 
 
 		 170 aa  94.4  5e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.640711  hitchhiker  0.00706783 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1948  ribosomal protein L9  44.37 
 
 		 151 aa  94.4  5e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0081  50S ribosomal protein L9  40.58 
 
 		 148 aa  94.4  5e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.957353  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2028  50S ribosomal protein L9  36.05 
 
 		 167 aa  94.4  5e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.728229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0134  50S ribosomal protein L9  43.38 
 
 		 149 aa  94  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0123  50S ribosomal protein L9  43.38 
 
 		 149 aa  94  6e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2212  50S ribosomal protein L9  42.54 
 
 		 150 aa  93.6  7e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4553  50S ribosomal protein L9  36.99 
 
 		 148 aa  93.6  8e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.156994  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2827  ribosomal protein L9  41.72 
 
 		 150 aa  93.6  9e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2542  50S ribosomal protein L9  36.73 
 
 		 152 aa  92.8  1e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2196  50S ribosomal protein L9  41.89 
 
 		 150 aa  92.8  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0214296  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0851  50S ribosomal protein L9P  36.5 
 
 		 149 aa  93.2  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7309  50S ribosomal protein L9  34.69 
 
 		 148 aa  93.2  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.937449  normal  0.0304173 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2625  ribosomal protein L9  39.1 
 
 		 167 aa  92  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.24643  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1339  50S ribosomal protein L9  43.92 
 
 		 166 aa  92  2e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.361215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2102  50S ribosomal protein L9P  38.93 
 
 		 149 aa  92.4  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00744  50S ribosomal protein L9  38.69 
 
 		 149 aa  92.4  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.73532  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3666  50S ribosomal protein L9  42.76 
 
 		 149 aa  92  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.006093  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0116  50S ribosomal protein L9  42.65 
 
 		 149 aa  92  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4519  50S ribosomal protein L9  34.48 
 
 		 148 aa  92.4  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.986951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1329  50S ribosomal protein L9P  41.72 
 
 		 148 aa  92.4  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.556068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1030  50S ribosomal protein L9  43.92 
 
 		 170 aa  92  2e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0534  ribosomal protein L9  40.94 
 
 		 149 aa  92  2e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4841  ribosomal protein L9  35.37 
 
 		 148 aa  91.7  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0120  50S ribosomal protein L9  42.96 
 
 		 149 aa  92  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0927016  normal  0.199932 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5065  50S ribosomal protein L9  36.99 
 
 		 148 aa  91.7  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.972236  hitchhiker  0.000155251 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2780  50S ribosomal protein L9  40.13 
 
 		 149 aa  91.7  3e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000928974  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1642  50S ribosomal protein L9  39.86 
 
 		 164 aa  91.7  3e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0557513  normal  0.0367892 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1894  50S ribosomal protein L9  39.74 
 
 		 150 aa  91.3  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000492255  hitchhiker  0.000000062237 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3558  50S ribosomal protein L9  37.41 
 
 		 148 aa  91.3  4e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.882223 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3888  50S ribosomal protein L9  38.1 
 
 		 150 aa  91.3  4e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00361277 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4931  50S ribosomal protein L9  45 
 
 		 148 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000100703 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3697  ribosomal protein L9  37.67 
 
 		 149 aa  91.3  4e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2388  50S ribosomal protein L9  40.14 
 
 		 147 aa  91.3  4e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6208  50S ribosomal protein L9  39.74 
 
 		 150 aa  91.3  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1871  50S ribosomal protein L9  39.74 
 
 		 150 aa  91.3  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.539407  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00020  50S ribosomal protein L9  40.4 
 
 		 150 aa  91.3  5e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4665  50S ribosomal protein L9  45 
 
 		 148 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0656931 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5065  ribosomal protein L9  38.19 
 
 		 151 aa  90.5  6e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.366091  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4117  50S ribosomal protein L9  39.19 
 
 		 150 aa  90.5  6e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2193  50S ribosomal protein L9  36.05 
 
 		 152 aa  90.5  7e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1205  ribosomal protein L9  38.24 
 
 		 151 aa  90.5  7e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0777  50S ribosomal protein L9  40.79 
 
 		 149 aa  90.5  7e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000131124  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1219  50S ribosomal protein L9P  39.86 
 
 		 148 aa  90.1  9e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.405746 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2587  50S ribosomal protein L9  42.11 
 
 		 150 aa  90.1  9e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.800649 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1780  50S ribosomal protein L9  39.74 
 
 		 150 aa  89.7  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1808  50S ribosomal protein L9  39.74 
 
 		 150 aa  89.7  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.432428  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1828  50S ribosomal protein L9  37.24 
 
 		 168 aa  90.1  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1403  50S ribosomal protein L9  39.07 
 
 		 150 aa  89.7  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.318005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3528  50S ribosomal protein L9  37.67 
 
 		 168 aa  89.4  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.156676  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>