More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_26560 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_26560  LSU ribosomal protein L9P  100 
 
 		 148 aa  294  3e-79  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.199017 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4336  50S ribosomal protein L9  64.19 
 
 		 150 aa  186  9e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3697  ribosomal protein L9  63.27 
 
 		 149 aa  182  1.0000000000000001e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37780  LSU ribosomal protein L9P  59.86 
 
 		 149 aa  178  2e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.236654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0130  50S ribosomal protein L9  55.41 
 
 		 149 aa  172  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0311991 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3558  50S ribosomal protein L9  56.76 
 
 		 148 aa  171  3.9999999999999995e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.882223 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4553  50S ribosomal protein L9  57.14 
 
 		 148 aa  170  6.999999999999999e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.156994  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4946  ribosomal protein L9  56.08 
 
 		 148 aa  168  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0334  50S ribosomal protein L9  57.82 
 
 		 151 aa  167  5e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.801723 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5065  50S ribosomal protein L9  55.78 
 
 		 148 aa  167  6e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.972236  hitchhiker  0.000155251 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9354  50S ribosomal protein L9P  53.38 
 
 		 148 aa  167  7e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.837132 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4841  ribosomal protein L9  54.11 
 
 		 148 aa  166  8e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2130  50S ribosomal protein L9  56.08 
 
 		 149 aa  165  2e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.929246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7042  ribosomal protein L9  57.14 
 
 		 151 aa  165  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4661  50S ribosomal protein L9P  58.78 
 
 		 148 aa  164  2.9999999999999998e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2522  ribosomal protein L9  58.62 
 
 		 150 aa  164  5e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.559663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3352  ribosomal protein L9  61.22 
 
 		 151 aa  162  1.0000000000000001e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.600621  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3092  50S ribosomal protein L9  56.16 
 
 		 148 aa  162  1.0000000000000001e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0370883  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23230  LSU ribosomal protein L9P  60.54 
 
 		 153 aa  162  1.0000000000000001e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4117  50S ribosomal protein L9  55.17 
 
 		 150 aa  161  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3888  50S ribosomal protein L9  55.86 
 
 		 150 aa  162  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00361277 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31750  LSU ribosomal protein L9P  52.38 
 
 		 157 aa  161  3e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4519  50S ribosomal protein L9  54.73 
 
 		 148 aa  159  8.000000000000001e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.986951  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4178  ribosomal protein L9  55.17 
 
 		 151 aa  156  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7309  50S ribosomal protein L9  49.32 
 
 		 148 aa  149  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.937449  normal  0.0304173 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4737  ribosomal protein L9  54.73 
 
 		 150 aa  147  4e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39420  LSU ribosomal protein L9P  50 
 
 		 152 aa  144  5e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5743  50S ribosomal protein L9  53.02 
 
 		 152 aa  143  6e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.245852 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5065  ribosomal protein L9  53.79 
 
 		 151 aa  143  6e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.366091  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5367  50S ribosomal protein L9  53.02 
 
 		 152 aa  143  6e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5456  50S ribosomal protein L9  53.02 
 
 		 152 aa  143  6e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.166119  normal  0.0135281 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4166  ribosomal protein L9  52.38 
 
 		 150 aa  140  6e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6031  50S ribosomal protein L9  51.01 
 
 		 151 aa  137  4.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.827335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0877  50S ribosomal protein L9  49.66 
 
 		 151 aa  134  4e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5366  ribosomal protein L9  47.3 
 
 		 151 aa  133  8e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0311  ribosomal protein L9  48.28 
 
 		 148 aa  130  6e-30  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0979697 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10055  50S ribosomal protein L9  47.33 
 
 		 152 aa  130  6.999999999999999e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.95125e-19  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0654  ribosomal protein L9  46.21 
 
 		 146 aa  122  1e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.233351  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2535  ribosomal protein L9  43.45 
 
 		 148 aa  121  4e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000849852  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0132  50S ribosomal protein L9P  44.52 
 
 		 150 aa  120  7e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.191578  normal  0.450064 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1216  50S ribosomal protein L9  44.83 
 
 		 148 aa  119  9.999999999999999e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0448  50S ribosomal protein L9  39.46 
 
 		 148 aa  113  6.9999999999999995e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000315624  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1479  50S ribosomal protein L9  43.24 
 
 		 147 aa  113  8.999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00653221 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2911  ribosomal protein L9  43.54 
 
 		 147 aa  113  1.0000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000198897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2761  50S ribosomal protein L9  42.57 
 
 		 147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0602  ribosomal protein L9  41.38 
 
 		 159 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2559  50S ribosomal protein L9  46.26 
 
 		 152 aa  107  6e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3675  50S ribosomal protein L9  41.22 
 
 		 147 aa  107  7.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0017578  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0025  ribosomal protein L9  44.83 
 
 		 178 aa  106  9.000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00173008  normal  0.984167 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0668  50S ribosomal protein L9  39.86 
 
 		 148 aa  106  9.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00124479  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0097  50S ribosomal protein L9  41.38 
 
 		 151 aa  106  9.000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.625219  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23320  ribosomal protein L9  43.24 
 
 		 147 aa  105  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.507738  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2841  50S ribosomal protein L9  39.86 
 
 		 148 aa  105  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000145753  hitchhiker  0.000000000000102152 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2610  50S ribosomal protein L9  40.69 
 
 		 147 aa  105  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.196058  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2332  ribosomal protein L9  38.89 
 
 		 170 aa  105  3e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.640711  hitchhiker  0.00706783 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1692  50S ribosomal protein L9  37.67 
 
 		 149 aa  104  4e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0761  50S ribosomal protein L9  40 
 
 		 151 aa  103  8e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000425439  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0023  ribosomal protein L9  40 
 
 		 174 aa  102  1e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.725827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4351  ribosomal protein L9  36.3 
 
 		 148 aa  102  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3757  50S ribosomal protein L9  36.55 
 
 		 148 aa  102  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0881  50S ribosomal protein L9  41.38 
 
 		 148 aa  102  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00774862  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1775  50S ribosomal protein L9  43.92 
 
 		 149 aa  100  5e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000651865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0150  50S ribosomal protein L9  38.62 
 
 		 151 aa  100  8e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157053  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0165  50S ribosomal protein L9  40 
 
 		 148 aa  99.8  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000317895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2188  50S ribosomal protein L9  40 
 
 		 209 aa  99.8  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2542  50S ribosomal protein L9  43.92 
 
 		 152 aa  98.6  2e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2022  50S ribosomal protein L9  40.41 
 
 		 168 aa  99  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.278988  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11530  ribosomal protein L9  40.69 
 
 		 191 aa  99.4  2e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0446546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1359  ribosomal protein L9  35.86 
 
 		 151 aa  98.6  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0122536  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2925  ribosomal protein L9  39.86 
 
 		 147 aa  99  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0843322  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0597  50S ribosomal protein L9  36.99 
 
 		 179 aa  98.2  3e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4931  50S ribosomal protein L9  37.93 
 
 		 148 aa  98.2  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.108353  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0901  50S ribosomal protein L9  40 
 
 		 189 aa  97.8  4e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0476125 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3303  ribosomal protein L9  34.48 
 
 		 149 aa  97.8  5e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204917  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0830  ribosomal protein L9  40 
 
 		 149 aa  97.1  7e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.211438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1205  ribosomal protein L9  37.41 
 
 		 151 aa  97.1  7e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0011  50S ribosomal protein L9  37.58 
 
 		 150 aa  97.1  8e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.557694  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1814  ribosomal protein L9  39.1 
 
 		 149 aa  96.3  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0117  50S ribosomal protein L9  37.24 
 
 		 151 aa  96.3  1e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0851  50S ribosomal protein L9P  39.73 
 
 		 149 aa  96.3  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0161  50S ribosomal protein L9  39.31 
 
 		 148 aa  96.7  1e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000723092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0491  ribosomal protein L9  35.86 
 
 		 179 aa  95.9  1e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4542  50S ribosomal protein L9  40.82 
 
 		 152 aa  95.9  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.736351 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3541  50S ribosomal protein L9  41.5 
 
 		 149 aa  95.5  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0163  50S ribosomal protein L9  40.69 
 
 		 146 aa  95.5  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00237667  normal  0.639266 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0517  50S ribosomal protein L9  34.48 
 
 		 151 aa  95.5  2e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18631  50S ribosomal protein L9  42.86 
 
 		 151 aa  95.1  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.58702  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1780  50S ribosomal protein L9  37.41 
 
 		 150 aa  95.1  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3121  ribosomal protein L9  37.24 
 
 		 193 aa  95.1  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2050  50S ribosomal protein L9  37.24 
 
 		 149 aa  95.1  3e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.889408  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00020  50S ribosomal protein L9  39.33 
 
 		 150 aa  95.1  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1808  50S ribosomal protein L9  37.41 
 
 		 150 aa  95.1  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.432428  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0397  hypothetical protein  35.62 
 
 		 149 aa  95.1  3e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2131  50S ribosomal protein L9  37.24 
 
 		 149 aa  95.1  3e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.103333  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0287  ribosomal protein L9  40.82 
 
 		 152 aa  94.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0120134  normal  0.0123082 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2509  50S ribosomal protein L9  35.86 
 
 		 151 aa  94.7  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000781135  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5913  ribosomal protein L9  44.83 
 
 		 150 aa  94.4  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3412  50S ribosomal protein L9  38.78 
 
 		 149 aa  94.4  5e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1765  50S ribosomal protein L9  41.5 
 
 		 151 aa  94.4  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0110  50S ribosomal protein L9  35.86 
 
 		 151 aa  94.4  5e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000508651  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>