More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4542 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4542  50S ribosomal protein L9  100 
 
 
152 aa  301  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.736351 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3244  50S ribosomal protein L9  83.55 
 
 
152 aa  259  1e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.65089  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2852  50S ribosomal protein L9  82.89 
 
 
152 aa  258  2e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2559  50S ribosomal protein L9  69.74 
 
 
152 aa  213  5.9999999999999996e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1460  50S ribosomal protein L9  70.47 
 
 
152 aa  198  3e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0890745  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0329  50S ribosomal protein L9  66.44 
 
 
152 aa  178  2.9999999999999997e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.355323  normal  0.434143 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2193  50S ribosomal protein L9  59.73 
 
 
152 aa  176  9e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1272  50S ribosomal protein L9  57.05 
 
 
152 aa  171  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18631  50S ribosomal protein L9  57.05 
 
 
151 aa  172  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21431  50S ribosomal protein L9  57.05 
 
 
152 aa  171  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2897  50S ribosomal protein L9  67.11 
 
 
152 aa  171  3.9999999999999995e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000174347  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18821  50S ribosomal protein L9  56.38 
 
 
151 aa  171  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0277205  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18001  50S ribosomal protein L9  55.03 
 
 
152 aa  170  5e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28961  50S ribosomal protein L9  58.39 
 
 
152 aa  170  5.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2542  50S ribosomal protein L9  57.72 
 
 
152 aa  170  7.999999999999999e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1765  50S ribosomal protein L9  55.7 
 
 
151 aa  170  7.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18631  50S ribosomal protein L9  56.38 
 
 
151 aa  167  4e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.58702  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0287  ribosomal protein L9  59.06 
 
 
152 aa  164  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0120134  normal  0.0123082 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0602  ribosomal protein L9  45.95 
 
 
159 aa  120  9e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0654  ribosomal protein L9  40.41 
 
 
146 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.233351  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1063  ribosomal protein L9  41.5 
 
 
147 aa  108  3e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.342712  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0132  50S ribosomal protein L9P  45.03 
 
 
150 aa  105  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.191578  normal  0.450064 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2257  50S ribosomal protein L9  37.41 
 
 
148 aa  104  5e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000108464  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0851  50S ribosomal protein L9P  40.13 
 
 
149 aa  104  6e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2911  ribosomal protein L9  37.67 
 
 
147 aa  103  7e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000198897  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2925  ribosomal protein L9  39.73 
 
 
147 aa  103  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0843322  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31750  LSU ribosomal protein L9P  38.62 
 
 
157 aa  102  2e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1828  50S ribosomal protein L9  40.41 
 
 
168 aa  101  3e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29830  Plastid ribosomal protein L9, imported to chloroplast, large ribosomal subunit  35.57 
 
 
195 aa  101  3e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4841  ribosomal protein L9  40.94 
 
 
148 aa  100  5e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7042  ribosomal protein L9  34 
 
 
151 aa  99.8  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3697  ribosomal protein L9  38.62 
 
 
149 aa  100  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4351  ribosomal protein L9  38 
 
 
148 aa  100  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37780  LSU ribosomal protein L9P  37.24 
 
 
149 aa  99.8  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.236654  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9354  50S ribosomal protein L9P  37.58 
 
 
148 aa  99.8  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.837132 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2535  ribosomal protein L9  37.16 
 
 
148 aa  100  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000849852  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1043  50S ribosomal protein L9  40.82 
 
 
204 aa  99.4  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0955164 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0311  ribosomal protein L9  37.93 
 
 
148 aa  98.6  3e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0979697 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4553  50S ribosomal protein L9  37.67 
 
 
148 aa  98.2  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.156994  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1359  ribosomal protein L9  36.62 
 
 
151 aa  98.6  3e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0122536  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2610  50S ribosomal protein L9  39.6 
 
 
147 aa  98.2  4e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.196058  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1150  50S ribosomal protein L9  40.79 
 
 
165 aa  97.8  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0292661  hitchhiker  0.00494207 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1000  50S ribosomal protein L9  31.51 
 
 
147 aa  97.4  5e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5065  50S ribosomal protein L9  36.99 
 
 
148 aa  97.4  6e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.972236  hitchhiker  0.000155251 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2188  50S ribosomal protein L9  38.78 
 
 
209 aa  97.1  7e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2522  ribosomal protein L9  40 
 
 
150 aa  97.1  7e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.559663  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3558  50S ribosomal protein L9  36.3 
 
 
148 aa  96.3  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.882223 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5065  ribosomal protein L9  40.14 
 
 
151 aa  96.3  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.366091  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3528  50S ribosomal protein L9  39.6 
 
 
168 aa  95.9  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.156676  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0761  50S ribosomal protein L9  40.14 
 
 
151 aa  95.9  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000425439  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2022  50S ribosomal protein L9  36.3 
 
 
168 aa  94.7  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.278988  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5366  ribosomal protein L9  38.51 
 
 
151 aa  95.1  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2761  50S ribosomal protein L9  38.26 
 
 
147 aa  94.4  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4737  ribosomal protein L9  36.73 
 
 
150 aa  94.7  4e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4946  ribosomal protein L9  36.73 
 
 
148 aa  94.7  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3352  ribosomal protein L9  38.62 
 
 
151 aa  94.7  4e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.600621  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3757  50S ribosomal protein L9  36.84 
 
 
148 aa  94.7  4e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0117  50S ribosomal protein L9  41.89 
 
 
151 aa  94  6e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1216  50S ribosomal protein L9  36.55 
 
 
148 aa  94  6e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39420  LSU ribosomal protein L9P  34.87 
 
 
152 aa  94  6e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0161  50S ribosomal protein L9  39.04 
 
 
148 aa  94  6e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000723092  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23230  LSU ribosomal protein L9P  42 
 
 
153 aa  94  7e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1479  50S ribosomal protein L9  37.58 
 
 
147 aa  94  8e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00653221 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1410  50S ribosomal protein L9  40.27 
 
 
171 aa  93.6  8e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000225617  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2841  50S ribosomal protein L9  40.14 
 
 
148 aa  93.2  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000145753  hitchhiker  0.000000000000102152 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4166  ribosomal protein L9  35.81 
 
 
150 aa  93.2  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11530  ribosomal protein L9  39.86 
 
 
191 aa  93.2  1e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0446546  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0877  50S ribosomal protein L9  35.14 
 
 
151 aa  92.4  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26560  LSU ribosomal protein L9P  40.82 
 
 
148 aa  92.4  2e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.199017 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0334  50S ribosomal protein L9  38.62 
 
 
151 aa  91.3  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.801723 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2972  50S ribosomal protein L9  32.21 
 
 
148 aa  91.7  4e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2650  50S ribosomal protein L9  32.21 
 
 
148 aa  91.7  4e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.502254  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6031  50S ribosomal protein L9  36.49 
 
 
151 aa  91.3  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.827335  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2028  50S ribosomal protein L9  37.67 
 
 
167 aa  91.3  4e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.728229  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4535  50S ribosomal protein L9  37.41 
 
 
153 aa  91.3  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.323692 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4931  50S ribosomal protein L9  38.36 
 
 
148 aa  90.9  6e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.108353  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4178  ribosomal protein L9  36.05 
 
 
151 aa  90.9  6e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4336  50S ribosomal protein L9  38.51 
 
 
150 aa  90.9  6e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0668  50S ribosomal protein L9  40 
 
 
148 aa  90.5  7e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00124479  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4117  50S ribosomal protein L9  38.36 
 
 
150 aa  90.5  7e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4519  50S ribosomal protein L9  40.14 
 
 
148 aa  90.1  8e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.986951  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0165  50S ribosomal protein L9  39.19 
 
 
148 aa  90.5  8e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000317895  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0025  ribosomal protein L9  37.84 
 
 
178 aa  90.1  9e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00173008  normal  0.984167 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3888  50S ribosomal protein L9  39.33 
 
 
150 aa  90.1  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00361277 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5367  50S ribosomal protein L9  34.23 
 
 
152 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3675  50S ribosomal protein L9  38 
 
 
147 aa  89.4  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0017578  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5743  50S ribosomal protein L9  34.23 
 
 
152 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.245852 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10055  50S ribosomal protein L9  32.43 
 
 
152 aa  89.4  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.95125e-19  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5456  50S ribosomal protein L9  34.23 
 
 
152 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.166119  normal  0.0135281 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0081  50S ribosomal protein L9  32.67 
 
 
148 aa  89.4  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.957353  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0097  50S ribosomal protein L9  39.74 
 
 
151 aa  89.4  2e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.625219  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2130  50S ribosomal protein L9  33.78 
 
 
149 aa  89  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.929246  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1352  50S ribosomal protein L9  34.93 
 
 
167 aa  88.6  3e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0766  50S ribosomal protein L9  34.48 
 
 
147 aa  88.2  4e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0150  50S ribosomal protein L9  37.16 
 
 
151 aa  88.2  4e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157053  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1335  50S ribosomal protein L9  34.48 
 
 
147 aa  88.2  4e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.779246  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0397  hypothetical protein  36.73 
 
 
149 aa  87.8  5e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2509  50S ribosomal protein L9  39.19 
 
 
151 aa  87.4  6e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000781135  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4661  50S ribosomal protein L9P  33.78 
 
 
148 aa  87.4  6e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3303  ribosomal protein L9  34.23 
 
 
149 aa  87.4  6e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204917  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>