More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2332 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2332  ribosomal protein L9  100 
 
 		 170 aa  338  1e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.640711  hitchhiker  0.00706783 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1205  ribosomal protein L9  45.03 
 
 		 151 aa  132  1.9999999999999998e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9354  50S ribosomal protein L9P  41.78 
 
 		 148 aa  125  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.837132 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0334  50S ribosomal protein L9  40 
 
 		 151 aa  122  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.801723 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0150  50S ribosomal protein L9  42.86 
 
 		 151 aa  122  2e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157053  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4506  ribosomal protein L9  43.75 
 
 		 149 aa  121  4e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.594005  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4841  ribosomal protein L9  37.41 
 
 		 148 aa  118  3.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4553  50S ribosomal protein L9  41.38 
 
 		 148 aa  118  3.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.156994  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5065  ribosomal protein L9  41.61 
 
 		 151 aa  118  3.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.366091  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4946  ribosomal protein L9  40.28 
 
 		 148 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0117  50S ribosomal protein L9  42.76 
 
 		 151 aa  116  1.9999999999999998e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4535  50S ribosomal protein L9  39.07 
 
 		 153 aa  116  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.323692 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3589  50S ribosomal protein L9  45.7 
 
 		 150 aa  115  3e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.229017  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5065  50S ribosomal protein L9  39.31 
 
 		 148 aa  115  3e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.972236  hitchhiker  0.000155251 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0777  50S ribosomal protein L9  45.7 
 
 		 149 aa  115  3.9999999999999997e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000131124  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2130  50S ribosomal protein L9  39.31 
 
 		 149 aa  115  3.9999999999999997e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.929246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0449  50S ribosomal protein L9  45.7 
 
 		 150 aa  114  6e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00474942 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2028  50S ribosomal protein L9  40.27 
 
 		 167 aa  114  6e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.728229  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3558  50S ribosomal protein L9  35.86 
 
 		 148 aa  114  7.999999999999999e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.882223 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4336  50S ribosomal protein L9  38.62 
 
 		 150 aa  113  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2509  50S ribosomal protein L9  40.14 
 
 		 151 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000781135  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4661  50S ribosomal protein L9P  39.31 
 
 		 148 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3092  50S ribosomal protein L9  39.58 
 
 		 148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0370883  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1410  50S ribosomal protein L9  40.41 
 
 		 171 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000225617  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1352  50S ribosomal protein L9  38.31 
 
 		 167 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3352  ribosomal protein L9  38.67 
 
 		 151 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.600621  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2625  ribosomal protein L9  41.1 
 
 		 167 aa  111  4.0000000000000004e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.24643  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3675  50S ribosomal protein L9  42.96 
 
 		 147 aa  111  5e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0017578  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3781  50S ribosomal protein L9  45.03 
 
 		 150 aa  111  5e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0681  50S ribosomal protein L9  45.03 
 
 		 150 aa  111  5e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3636  50S ribosomal protein L9  45.03 
 
 		 150 aa  111  5e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2388  50S ribosomal protein L9  42.76 
 
 		 147 aa  111  5e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3432  50S ribosomal protein L9  46.36 
 
 		 150 aa  111  6e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0102132  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4519  50S ribosomal protein L9  37.5 
 
 		 148 aa  111  6e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.986951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4117  50S ribosomal protein L9  39.46 
 
 		 150 aa  111  6e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3888  50S ribosomal protein L9  39.46 
 
 		 150 aa  110  7.000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00361277 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1692  50S ribosomal protein L9  37.67 
 
 		 149 aa  110  8.000000000000001e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3666  50S ribosomal protein L9  44.37 
 
 		 149 aa  110  9e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.006093  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1435  50S ribosomal protein L9  41.06 
 
 		 149 aa  110  9e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0986557  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0448  50S ribosomal protein L9  37.76 
 
 		 148 aa  109  1.0000000000000001e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000315624  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1996  50S ribosomal protein L9  42.65 
 
 		 148 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3121  ribosomal protein L9  38.46 
 
 		 193 aa  110  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2522  ribosomal protein L9  34.67 
 
 		 150 aa  109  2.0000000000000002e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.559663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0097  50S ribosomal protein L9  38.62 
 
 		 151 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.625219  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2761  50S ribosomal protein L9  41.26 
 
 		 147 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1479  50S ribosomal protein L9  41.26 
 
 		 147 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00653221 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2610  50S ribosomal protein L9  42.25 
 
 		 147 aa  108  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.196058  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2911  ribosomal protein L9  39.44 
 
 		 147 aa  108  3e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000198897  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4178  ribosomal protein L9  36.99 
 
 		 151 aa  108  4.0000000000000004e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1194  50S ribosomal protein L9  36.14 
 
 		 192 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.762079  normal  0.0731596 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09988  ribosomal protein L9  39.86 
 
 		 149 aa  108  5e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.536224  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1051  50S ribosomal protein L9  37.41 
 
 		 192 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.289991 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0165  50S ribosomal protein L9  36.3 
 
 		 148 aa  107  7.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000317895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1096  50S ribosomal protein L9  38.41 
 
 		 160 aa  107  7.000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.547655  normal  0.0167988 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0130  50S ribosomal protein L9  36.99 
 
 		 149 aa  107  9.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0311991 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04070  50S ribosomal protein L9  41.72 
 
 		 149 aa  107  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3790  ribosomal protein L9  41.72 
 
 		 149 aa  107  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00574678  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1780  50S ribosomal protein L9  39.07 
 
 		 150 aa  106  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4736  50S ribosomal protein L9  41.72 
 
 		 149 aa  107  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.257928  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4673  50S ribosomal protein L9  41.72 
 
 		 149 aa  107  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4447  50S ribosomal protein L9  41.72 
 
 		 149 aa  107  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5718  50S ribosomal protein L9  41.72 
 
 		 149 aa  107  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.595872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4764  50S ribosomal protein L9  41.72 
 
 		 149 aa  107  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3810  50S ribosomal protein L9  41.72 
 
 		 149 aa  107  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0581092 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1808  50S ribosomal protein L9  39.07 
 
 		 150 aa  106  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.432428  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04032  hypothetical protein  41.72 
 
 		 149 aa  107  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0007  50S ribosomal protein L9  37.33 
 
 		 151 aa  106  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4790  50S ribosomal protein L9  41.72 
 
 		 149 aa  106  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.131212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2841  50S ribosomal protein L9  42.03 
 
 		 148 aa  105  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000145753  hitchhiker  0.000000000000102152 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4812  50S ribosomal protein L9  41.72 
 
 		 149 aa  106  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0162172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4672  50S ribosomal protein L9  41.72 
 
 		 149 aa  106  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00136692  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4662  50S ribosomal protein L9  41.72 
 
 		 149 aa  106  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0630658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0571  ribosomal protein L9  42.38 
 
 		 150 aa  105  2e-22  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.409562  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0738  50S ribosomal protein L9  36.75 
 
 		 191 aa  106  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.823068  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4754  50S ribosomal protein L9  41.72 
 
 		 149 aa  106  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0190714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37780  LSU ribosomal protein L9P  34.46 
 
 		 149 aa  105  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.236654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03776  50S ribosomal protein L9  40 
 
 		 150 aa  105  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5171  50S ribosomal protein L9  37.75 
 
 		 150 aa  105  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0491  ribosomal protein L9  37.06 
 
 		 179 aa  105  3e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39420  LSU ribosomal protein L9P  40.4 
 
 		 152 aa  105  4e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_002950  PG0597  50S ribosomal protein L9  37.79 
 
 		 179 aa  104  5e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1516  50S ribosomal protein L9  35.54 
 
 		 191 aa  104  5e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101233  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31750  LSU ribosomal protein L9P  32.68 
 
 		 157 aa  104  5e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7309  50S ribosomal protein L9  35.62 
 
 		 148 aa  104  5e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.937449  normal  0.0304173 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0083  50S ribosomal protein L9  39.87 
 
 		 202 aa  104  6e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.584189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0602  ribosomal protein L9  35.62 
 
 		 159 aa  104  6e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2383  50S ribosomal protein L9  43.54 
 
 		 148 aa  104  7e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0668  50S ribosomal protein L9  40.85 
 
 		 148 aa  103  8e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00124479  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0452  50S ribosomal protein L9  37.67 
 
 		 189 aa  103  9e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.206752  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1894  50S ribosomal protein L9  37.75 
 
 		 150 aa  103  9e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000492255  hitchhiker  0.000000062237 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6208  50S ribosomal protein L9  37.75 
 
 		 150 aa  103  9e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1210  50S ribosomal protein L9  39.44 
 
 		 209 aa  103  9e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0873917  normal  0.750153 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1871  50S ribosomal protein L9  37.75 
 
 		 150 aa  103  9e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.539407  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2306  50S ribosomal protein L9  35.1 
 
 		 189 aa  103  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.891012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002335  LSU ribosomal protein L9p  39.33 
 
 		 150 aa  103  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.178305  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2293  50S ribosomal protein L9  38.64 
 
 		 198 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.14836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0566  50S ribosomal protein L9  36.99 
 
 		 189 aa  103  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0110  50S ribosomal protein L9  35.86 
 
 		 151 aa  103  1e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000508651  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0397  hypothetical protein  39.46 
 
 		 149 aa  103  2e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1403  50S ribosomal protein L9  37.09 
 
 		 150 aa  102  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.318005  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>