More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4506 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4506  ribosomal protein L9  100 
 
 		 149 aa  302  1.0000000000000001e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.594005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1996  50S ribosomal protein L9  44.44 
 
 		 148 aa  139  9.999999999999999e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1479  50S ribosomal protein L9  43.06 
 
 		 147 aa  136  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00653221 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1150  50S ribosomal protein L9  47.02 
 
 		 165 aa  134  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0292661  hitchhiker  0.00494207 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2761  50S ribosomal protein L9  42.36 
 
 		 147 aa  134  4e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2610  50S ribosomal protein L9  43.06 
 
 		 147 aa  134  5e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.196058  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1410  50S ribosomal protein L9  45.58 
 
 		 171 aa  133  7.000000000000001e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000225617  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0161  50S ribosomal protein L9  43.75 
 
 		 148 aa  132  9.999999999999999e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000723092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0761  50S ribosomal protein L9  45.14 
 
 		 151 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000425439  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0123  50S ribosomal protein L9  45.83 
 
 		 149 aa  131  3e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0134  50S ribosomal protein L9  45.83 
 
 		 149 aa  131  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0116  50S ribosomal protein L9  45.83 
 
 		 149 aa  130  5e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0120  50S ribosomal protein L9  49.25 
 
 		 149 aa  129  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0927016  normal  0.199932 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2002  50S ribosomal protein L9  47.97 
 
 		 153 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0148705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2028  50S ribosomal protein L9  42.57 
 
 		 167 aa  128  3e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.728229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2388  50S ribosomal protein L9  42.07 
 
 		 147 aa  127  5.0000000000000004e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1352  50S ribosomal protein L9  43.24 
 
 		 167 aa  126  8.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0117  50S ribosomal protein L9  42.36 
 
 		 151 aa  125  1.0000000000000001e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3991  50S ribosomal protein L9  43.62 
 
 		 165 aa  125  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00054476 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1096  50S ribosomal protein L9  41.67 
 
 		 160 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.547655  normal  0.0167988 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2509  50S ribosomal protein L9  42.36 
 
 		 151 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000781135  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0110  50S ribosomal protein L9  40.97 
 
 		 151 aa  124  5e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000508651  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0150  50S ribosomal protein L9  40.97 
 
 		 151 aa  123  7e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157053  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4519  50S ribosomal protein L9  42.76 
 
 		 148 aa  123  7e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.986951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4535  50S ribosomal protein L9  40.97 
 
 		 153 aa  122  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.323692 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4841  ribosomal protein L9  42.18 
 
 		 148 aa  122  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2022  50S ribosomal protein L9  40.69 
 
 		 168 aa  122  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.278988  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3675  50S ribosomal protein L9  36.81 
 
 		 147 aa  122  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0017578  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2332  ribosomal protein L9  43.75 
 
 		 170 aa  121  3e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.640711  hitchhiker  0.00706783 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3185  ribosomal protein L9  39.6 
 
 		 148 aa  120  5e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.564436  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09988  ribosomal protein L9  41.89 
 
 		 149 aa  120  5e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.536224  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0165  50S ribosomal protein L9  38.89 
 
 		 148 aa  120  6e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000317895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3528  50S ribosomal protein L9  42.67 
 
 		 168 aa  120  9e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.156676  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2841  50S ribosomal protein L9  36.91 
 
 		 148 aa  118  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000145753  hitchhiker  0.000000000000102152 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2257  50S ribosomal protein L9  40.43 
 
 		 148 aa  118  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000108464  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0851  50S ribosomal protein L9P  42.38 
 
 		 149 aa  118  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0534  ribosomal protein L9  41.22 
 
 		 149 aa  117  3.9999999999999996e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2535  ribosomal protein L9  38.62 
 
 		 148 aa  116  9.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000849852  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1205  ribosomal protein L9  40.28 
 
 		 151 aa  115  1.9999999999999998e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0132  50S ribosomal protein L9P  41.22 
 
 		 150 aa  115  3e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.191578  normal  0.450064 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0668  50S ribosomal protein L9  35.14 
 
 		 148 aa  114  6e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00124479  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3558  50S ribosomal protein L9  40.41 
 
 		 148 aa  113  6.9999999999999995e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.882223 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2925  ribosomal protein L9  39.58 
 
 		 147 aa  113  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0843322  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0602  ribosomal protein L9  38.89 
 
 		 159 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3092  50S ribosomal protein L9  42.18 
 
 		 148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0370883  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0097  50S ribosomal protein L9  37.5 
 
 		 151 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.625219  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0397  hypothetical protein  37.58 
 
 		 149 aa  110  5e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1828  50S ribosomal protein L9  41.38 
 
 		 168 aa  110  6e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2911  ribosomal protein L9  38.1 
 
 		 147 aa  110  7.000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000198897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2780  50S ribosomal protein L9  38.93 
 
 		 149 aa  110  7.000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000928974  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0163  50S ribosomal protein L9  40.28 
 
 		 146 aa  110  8.000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00237667  normal  0.639266 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1692  50S ribosomal protein L9  33.79 
 
 		 149 aa  110  8.000000000000001e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9354  50S ribosomal protein L9P  37.67 
 
 		 148 aa  110  9e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.837132 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3121  ribosomal protein L9  39.6 
 
 		 193 aa  109  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002335  LSU ribosomal protein L9p  37.33 
 
 		 150 aa  108  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.178305  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5065  50S ribosomal protein L9  40.41 
 
 		 148 aa  108  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.972236  hitchhiker  0.000155251 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00020  50S ribosomal protein L9  37.33 
 
 		 150 aa  108  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0830  ribosomal protein L9  40 
 
 		 149 aa  108  3e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.211438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0025  ribosomal protein L9  39.33 
 
 		 178 aa  107  4.0000000000000004e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00173008  normal  0.984167 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0889  50S ribosomal protein L9  39.58 
 
 		 194 aa  108  4.0000000000000004e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.301047  normal  0.514488 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0081  50S ribosomal protein L9  35.86 
 
 		 148 aa  108  4.0000000000000004e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.957353  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7309  50S ribosomal protein L9  38.62 
 
 		 148 aa  107  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.937449  normal  0.0304173 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1775  50S ribosomal protein L9  40.14 
 
 		 149 aa  107  5e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000651865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4553  50S ribosomal protein L9  40.41 
 
 		 148 aa  107  7.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.156994  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3040  50S ribosomal protein L9  36.91 
 
 		 188 aa  106  8.000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.186174 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0654  ribosomal protein L9  40.69 
 
 		 146 aa  106  1e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.233351  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1510  ribosomal protein L9  41.91 
 
 		 186 aa  106  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1435  50S ribosomal protein L9  37.58 
 
 		 149 aa  106  1e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0986557  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0777  50S ribosomal protein L9  40.27 
 
 		 149 aa  105  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000131124  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2130  50S ribosomal protein L9  40.41 
 
 		 149 aa  106  1e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.929246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11530  ribosomal protein L9  39.31 
 
 		 191 aa  105  2e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0446546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1112  ribosomal protein L9  39.19 
 
 		 147 aa  105  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.573323  normal  0.866168 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0334  50S ribosomal protein L9  36.55 
 
 		 151 aa  105  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.801723 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3303  ribosomal protein L9  39.85 
 
 		 149 aa  105  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204917  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4790  50S ribosomal protein L9  39.6 
 
 		 149 aa  104  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.131212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4754  50S ribosomal protein L9  39.6 
 
 		 149 aa  104  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0190714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4812  50S ribosomal protein L9  39.6 
 
 		 149 aa  104  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0162172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2188  50S ribosomal protein L9  38.19 
 
 		 209 aa  104  4e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0597  50S ribosomal protein L9  36.24 
 
 		 179 aa  104  5e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4351  ribosomal protein L9  35.57 
 
 		 148 aa  103  6e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3281  50S ribosomal protein L9  37.33 
 
 		 150 aa  103  6e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.134585  hitchhiker  0.000210385 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4672  50S ribosomal protein L9  38.93 
 
 		 149 aa  103  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00136692  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4662  50S ribosomal protein L9  38.93 
 
 		 149 aa  103  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0630658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0491  ribosomal protein L9  37.5 
 
 		 179 aa  103  9e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3636  50S ribosomal protein L9  39.46 
 
 		 150 aa  102  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4946  ribosomal protein L9  38.51 
 
 		 148 aa  102  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0681  50S ribosomal protein L9  39.46 
 
 		 150 aa  102  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3781  50S ribosomal protein L9  39.46 
 
 		 150 aa  102  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2007  ribosomal protein L9  36.91 
 
 		 148 aa  102  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.474404 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2212  50S ribosomal protein L9  41.18 
 
 		 150 aa  102  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07670  50S ribosomal protein L9  36.73 
 
 		 148 aa  102  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.957501  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2763  50S ribosomal protein L9  42.28 
 
 		 149 aa  102  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2625  ribosomal protein L9  34.48 
 
 		 167 aa  102  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.24643  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4931  50S ribosomal protein L9  36.55 
 
 		 148 aa  101  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.108353  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2458  50S ribosomal protein L9P  38.19 
 
 		 149 aa  101  3e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.174518 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2383  50S ribosomal protein L9  39.73 
 
 		 148 aa  101  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1375  50S ribosomal protein L9  35.81 
 
 		 148 aa  101  4e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0636184  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0901  50S ribosomal protein L9  36.81 
 
 		 189 aa  101  4e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0476125 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0112  50S ribosomal protein L9  35.25 
 
 		 173 aa  100  5e-21  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5065  ribosomal protein L9  38.62 
 
 		 151 aa  100  6e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.366091  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>