More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2625 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2625  ribosomal protein L9  100 
 
 		 167 aa  338  2e-92  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.24643  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1510  ribosomal protein L9  43.45 
 
 		 186 aa  118  3.9999999999999996e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3040  50S ribosomal protein L9  41.67 
 
 		 188 aa  117  4.9999999999999996e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.186174 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2332  ribosomal protein L9  41.1 
 
 		 170 aa  111  4.0000000000000004e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.640711  hitchhiker  0.00706783 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2102  50S ribosomal protein L9P  40.41 
 
 		 149 aa  110  7.000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0851  50S ribosomal protein L9P  36.73 
 
 		 149 aa  110  9e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0738  50S ribosomal protein L9  37.5 
 
 		 191 aa  109  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.823068  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2610  50S ribosomal protein L9  40.14 
 
 		 147 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.196058  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0648  50S ribosomal protein L9  40.54 
 
 		 148 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000594391 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3121  ribosomal protein L9  40.28 
 
 		 193 aa  108  5e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07670  50S ribosomal protein L9  37.67 
 
 		 148 aa  107  9.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.957501  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2820  50S ribosomal protein L9  40 
 
 		 148 aa  105  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2443  50S ribosomal protein L9  40 
 
 		 148 aa  105  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00389118 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0889  50S ribosomal protein L9  37.5 
 
 		 194 aa  105  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.301047  normal  0.514488 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3666  50S ribosomal protein L9  38.62 
 
 		 149 aa  104  7e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.006093  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2925  ribosomal protein L9  35.42 
 
 		 147 aa  103  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0843322  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5226  ribosomal protein L9  39.31 
 
 		 150 aa  102  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1479  50S ribosomal protein L9  36.73 
 
 		 147 aa  102  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00653221 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1410  50S ribosomal protein L9  36.99 
 
 		 171 aa  102  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000225617  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1808  50S ribosomal protein L9  38.36 
 
 		 150 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.432428  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1780  50S ribosomal protein L9  38.36 
 
 		 150 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4506  ribosomal protein L9  34.48 
 
 		 149 aa  102  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.594005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5659  50S ribosomal protein L9  41.1 
 
 		 148 aa  102  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.935785  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65150  50S ribosomal protein L9  41.1 
 
 		 148 aa  102  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1516  50S ribosomal protein L9  32.64 
 
 		 191 aa  101  5e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101233  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4665  50S ribosomal protein L9  39.71 
 
 		 148 aa  101  6e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0656931 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3034  50S ribosomal protein L9  38.62 
 
 		 150 aa  100  7e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000136909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2761  50S ribosomal protein L9  36.05 
 
 		 147 aa  100  8e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2841  50S ribosomal protein L9  35.37 
 
 		 148 aa  100  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000145753  hitchhiker  0.000000000000102152 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3490  50S ribosomal protein L9  37.5 
 
 		 195 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6208  50S ribosomal protein L9  36.99 
 
 		 150 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1871  50S ribosomal protein L9  36.99 
 
 		 150 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.539407  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1894  50S ribosomal protein L9  36.99 
 
 		 150 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000492255  hitchhiker  0.000000062237 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4931  50S ribosomal protein L9  38.97 
 
 		 148 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000100703 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1403  50S ribosomal protein L9  36.3 
 
 		 150 aa  99.8  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.318005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3939  50S ribosomal protein L9  36.81 
 
 		 190 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.613806  normal  0.190537 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4414  50S ribosomal protein L9  36.81 
 
 		 190 aa  99  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.248049 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0566  50S ribosomal protein L9  34.67 
 
 		 189 aa  99.4  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4307  50S ribosomal protein L9  36.81 
 
 		 190 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0939755 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3675  50S ribosomal protein L9  35.37 
 
 		 147 aa  99.8  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0017578  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1096  50S ribosomal protein L9  34.72 
 
 		 160 aa  98.6  3e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.547655  normal  0.0167988 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5171  50S ribosomal protein L9  35.62 
 
 		 150 aa  99  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1219  50S ribosomal protein L9P  37.67 
 
 		 148 aa  98.2  4e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.405746 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00744  50S ribosomal protein L9  39.19 
 
 		 149 aa  98.2  5e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.73532  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3185  ribosomal protein L9  34.03 
 
 		 148 aa  98.2  5e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.564436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0602  ribosomal protein L9  30.82 
 
 		 159 aa  97.8  6e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0491  ribosomal protein L9  34.03 
 
 		 179 aa  97.8  7e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2827  ribosomal protein L9  34.93 
 
 		 150 aa  97.1  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0222  ribosomal protein L9  38.36 
 
 		 151 aa  96.7  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5418  50S ribosomal protein L9  35.42 
 
 		 190 aa  96.7  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0206045  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0830  ribosomal protein L9  37.67 
 
 		 149 aa  96.7  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.211438  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0668  50S ribosomal protein L9  34.69 
 
 		 148 aa  96.3  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00124479  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0452  50S ribosomal protein L9  32.67 
 
 		 189 aa  95.9  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.206752  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1996  50S ribosomal protein L9  35.86 
 
 		 148 aa  95.9  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3812  50S ribosomal protein L9  39.58 
 
 		 197 aa  96.3  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.740565  normal  0.136797 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0654  50S ribosomal protein L9  37.24 
 
 		 150 aa  96.3  2e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4874  50S ribosomal protein L9  39.71 
 
 		 148 aa  95.5  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0411  50S ribosomal protein L9  37.78 
 
 		 195 aa  95.5  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.112533  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2293  50S ribosomal protein L9  39.1 
 
 		 198 aa  95.5  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.14836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2453  50S ribosomal protein L9  37.58 
 
 		 150 aa  95.5  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0207068  normal  0.322148 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2388  50S ribosomal protein L9  34.25 
 
 		 147 aa  95.5  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4755  50S ribosomal protein L9  39.71 
 
 		 148 aa  95.5  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.824983  normal  0.0743731 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4209  50S ribosomal protein L9  39.19 
 
 		 150 aa  95.1  4e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.828057  hitchhiker  0.000279421 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0025  ribosomal protein L9  34.48 
 
 		 178 aa  95.1  4e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00173008  normal  0.984167 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1329  50S ribosomal protein L9P  38.36 
 
 		 148 aa  95.1  4e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.556068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0458  50S ribosomal protein L9  32.67 
 
 		 189 aa  95.1  4e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1051  50S ribosomal protein L9  34.03 
 
 		 192 aa  95.1  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.289991 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0397  hypothetical protein  34.31 
 
 		 149 aa  95.1  4e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0761  50S ribosomal protein L9  36.81 
 
 		 151 aa  95.1  4e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000425439  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0760  50S ribosomal protein L9  38.51 
 
 		 150 aa  94.7  5e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.242158  hitchhiker  0.000000266441 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2535  ribosomal protein L9  34.48 
 
 		 148 aa  94.7  5e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000849852  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1231  50S ribosomal protein L9  42.54 
 
 		 150 aa  94.7  5e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.662893  normal  0.0262623 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0134  50S ribosomal protein L9  37.5 
 
 		 149 aa  94  8e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2458  50S ribosomal protein L9P  35.57 
 
 		 149 aa  94  8e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.174518 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0123  50S ribosomal protein L9  37.5 
 
 		 149 aa  94  8e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4535  50S ribosomal protein L9  34.72 
 
 		 153 aa  94  9e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.323692 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2050  50S ribosomal protein L9  36.49 
 
 		 149 aa  93.2  1e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.889408  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2780  50S ribosomal protein L9  35.37 
 
 		 149 aa  93.6  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000928974  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2988  50S ribosomal protein L9  36.67 
 
 		 194 aa  93.6  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2131  50S ribosomal protein L9  36.49 
 
 		 149 aa  93.2  1e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.103333  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0161  50S ribosomal protein L9  33.1 
 
 		 148 aa  93.2  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000723092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4634  50S ribosomal protein L9  37.59 
 
 		 189 aa  94  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.269406  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0586  50S ribosomal protein L9  35.86 
 
 		 150 aa  93.6  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.482938  hitchhiker  3.77539e-17 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1194  50S ribosomal protein L9  33.33 
 
 		 192 aa  92.8  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.762079  normal  0.0731596 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0901  50S ribosomal protein L9  34.01 
 
 		 189 aa  92.8  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0476125 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0116  50S ribosomal protein L9  37.5 
 
 		 149 aa  92.8  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2461  50S ribosomal protein L9  37.5 
 
 		 196 aa  93.2  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.384902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2188  50S ribosomal protein L9  33.33 
 
 		 209 aa  93.2  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1435  50S ribosomal protein L9  35.33 
 
 		 149 aa  92.8  2e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0986557  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1084  50S ribosomal protein L9  38.1 
 
 		 152 aa  92.8  2e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00450273  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0741  ribosomal protein L9  32.41 
 
 		 147 aa  92.4  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0681469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0165  50S ribosomal protein L9  31.72 
 
 		 148 aa  92  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000317895  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0418  ribosomal protein L9  37.09 
 
 		 150 aa  92.4  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.291311  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03776  50S ribosomal protein L9  36.49 
 
 		 150 aa  92.4  3e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3480  50S ribosomal protein L9  39.1 
 
 		 146 aa  92  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.34024  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2566  50S ribosomal protein L9  39.31 
 
 		 150 aa  92  4e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0141  50S ribosomal protein L9  32 
 
 		 189 aa  91.7  4e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4519  50S ribosomal protein L9  34.46 
 
 		 148 aa  91.7  4e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.986951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3363  ribosomal protein L9  36.24 
 
 		 201 aa  91.7  4e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3213  50S ribosomal protein L9  39.31 
 
 		 150 aa  92  4e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>