More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3034 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3034  50S ribosomal protein L9  100 
 
 		 150 aa  303  7e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000136909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0984  50S ribosomal protein L9  79.33 
 
 		 150 aa  236  5.999999999999999e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2566  50S ribosomal protein L9  84 
 
 		 150 aa  233  9e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3213  50S ribosomal protein L9  84 
 
 		 150 aa  233  9e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2196  50S ribosomal protein L9  83.33 
 
 		 150 aa  225  1e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0214296  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5226  ribosomal protein L9  75.68 
 
 		 150 aa  226  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1231  50S ribosomal protein L9  86.67 
 
 		 150 aa  223  5.0000000000000005e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.662893  normal  0.0262623 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1821  50S ribosomal protein L9  85.33 
 
 		 150 aa  213  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.215704  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2827  ribosomal protein L9  70.27 
 
 		 150 aa  208  2e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1403  50S ribosomal protein L9  67.33 
 
 		 150 aa  206  6e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.318005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5171  50S ribosomal protein L9  67.33 
 
 		 150 aa  205  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1329  50S ribosomal protein L9P  68.92 
 
 		 148 aa  204  2e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.556068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2453  50S ribosomal protein L9  71.62 
 
 		 150 aa  204  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0207068  normal  0.322148 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1780  50S ribosomal protein L9  66.67 
 
 		 150 aa  203  6e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1808  50S ribosomal protein L9  66.67 
 
 		 150 aa  203  6e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.432428  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6208  50S ribosomal protein L9  66 
 
 		 150 aa  201  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1894  50S ribosomal protein L9  66 
 
 		 150 aa  201  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000492255  hitchhiker  0.000000062237 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1871  50S ribosomal protein L9  66 
 
 		 150 aa  201  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.539407  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1185  50S ribosomal protein L9  73.65 
 
 		 150 aa  199  8e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.152259  normal  0.105379 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1246  50S ribosomal protein L9  73.65 
 
 		 150 aa  199  8e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00525572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2392  50S ribosomal protein L9  86 
 
 		 150 aa  198  1.9999999999999998e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2102  50S ribosomal protein L9P  62.84 
 
 		 149 aa  196  7e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1310  50S ribosomal protein L9  74.5 
 
 		 150 aa  196  1.0000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1529  50S ribosomal protein L9P  78.52 
 
 		 150 aa  196  1.0000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00288476  normal  0.135454 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0914  50S ribosomal protein L9  70.95 
 
 		 150 aa  195  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.334096 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2249  50S ribosomal protein L9  66.67 
 
 		 150 aa  190  5e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.128176  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1789  50S ribosomal protein L9  72.39 
 
 		 150 aa  187  4e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.495555  normal  0.118839 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1948  ribosomal protein L9  65.1 
 
 		 151 aa  187  5e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3666  50S ribosomal protein L9  62.84 
 
 		 149 aa  186  1e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.006093  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1976  50S ribosomal protein L9  70.9 
 
 		 150 aa  185  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.391403  normal  0.167749 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0423  50S ribosomal protein L9  65.33 
 
 		 150 aa  176  7e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000011368  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2003  50S ribosomal protein L9  72.39 
 
 		 150 aa  174  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.499343  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0431  50S ribosomal protein L9  63.33 
 
 		 150 aa  172  9.999999999999999e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.740321 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1401  50S ribosomal protein L9  67.16 
 
 		 150 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.185741  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2413  50S ribosomal protein L9  67.16 
 
 		 150 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.209378  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1892  50S ribosomal protein L9  67.16 
 
 		 150 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.874623  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0005  50S ribosomal protein L9  67.16 
 
 		 150 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.196452  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1165  50S ribosomal protein L9  67.16 
 
 		 150 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.700636  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2288  50S ribosomal protein L9  67.16 
 
 		 150 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.670457  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2182  50S ribosomal protein L9  67.16 
 
 		 150 aa  170  5.999999999999999e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.918152  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1219  50S ribosomal protein L9P  62.84 
 
 		 148 aa  167  5e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.405746 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07670  50S ribosomal protein L9  47.62 
 
 		 148 aa  144  5e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.957501  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1435  50S ribosomal protein L9  48.32 
 
 		 149 aa  144  5e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0986557  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04070  50S ribosomal protein L9  49.66 
 
 		 149 aa  140  4e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3790  ribosomal protein L9  49.66 
 
 		 149 aa  140  4e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00574678  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04032  hypothetical protein  49.66 
 
 		 149 aa  140  4e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4736  50S ribosomal protein L9  49.66 
 
 		 149 aa  140  4e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.257928  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4447  50S ribosomal protein L9  49.66 
 
 		 149 aa  140  4e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1361  ribosomal protein L9  55.17 
 
 		 150 aa  141  4e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0777  50S ribosomal protein L9  49.66 
 
 		 149 aa  141  4e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000131124  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4673  50S ribosomal protein L9  49.66 
 
 		 149 aa  140  4e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3810  50S ribosomal protein L9  49.66 
 
 		 149 aa  140  4e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0581092 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4764  50S ribosomal protein L9  49.66 
 
 		 149 aa  140  4e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5718  50S ribosomal protein L9  49.66 
 
 		 149 aa  140  4e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.595872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4931  50S ribosomal protein L9  50.74 
 
 		 148 aa  140  6e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000100703 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4665  50S ribosomal protein L9  50 
 
 		 148 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0656931 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4672  50S ribosomal protein L9  48.32 
 
 		 149 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00136692  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4662  50S ribosomal protein L9  48.32 
 
 		 149 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0630658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4790  50S ribosomal protein L9  48.32 
 
 		 149 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.131212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4812  50S ribosomal protein L9  48.32 
 
 		 149 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0162172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4754  50S ribosomal protein L9  48.32 
 
 		 149 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0190714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2780  50S ribosomal protein L9  48.32 
 
 		 149 aa  137  3.9999999999999997e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000928974  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0566  50S ribosomal protein L9  45.52 
 
 		 189 aa  137  6e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00020  50S ribosomal protein L9  48.63 
 
 		 150 aa  137  7e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3589  50S ribosomal protein L9  47.65 
 
 		 150 aa  137  7e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.229017  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002335  LSU ribosomal protein L9p  47.95 
 
 		 150 aa  137  7e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.178305  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3781  50S ribosomal protein L9  48.32 
 
 		 150 aa  136  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0648  50S ribosomal protein L9  49.66 
 
 		 148 aa  136  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000594391 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0681  50S ribosomal protein L9  48.32 
 
 		 150 aa  136  1e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3121  ribosomal protein L9  47.59 
 
 		 193 aa  136  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3636  50S ribosomal protein L9  48.32 
 
 		 150 aa  136  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0452  50S ribosomal protein L9  45.52 
 
 		 189 aa  135  2e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.206752  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0458  50S ribosomal protein L9  45.52 
 
 		 189 aa  134  4e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0222  ribosomal protein L9  47.65 
 
 		 151 aa  133  7.000000000000001e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0586  50S ribosomal protein L9  44 
 
 		 150 aa  132  9.999999999999999e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.482938  hitchhiker  3.77539e-17 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3432  50S ribosomal protein L9  47.74 
 
 		 150 aa  133  9.999999999999999e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0102132  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0571  ribosomal protein L9  47.1 
 
 		 150 aa  132  1.9999999999999998e-30  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.409562  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0449  50S ribosomal protein L9  46.31 
 
 		 150 aa  132  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00474942 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4874  50S ribosomal protein L9  51.47 
 
 		 148 aa  131  3e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4755  50S ribosomal protein L9  51.47 
 
 		 148 aa  131  3e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.824983  normal  0.0743731 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2306  50S ribosomal protein L9  46.21 
 
 		 189 aa  131  3e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.891012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4209  50S ribosomal protein L9  46.31 
 
 		 150 aa  130  3.9999999999999996e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.828057  hitchhiker  0.000279421 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3281  50S ribosomal protein L9  45.64 
 
 		 150 aa  130  5e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.134585  hitchhiker  0.000210385 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1381  ribosomal protein L9  52.35 
 
 		 150 aa  130  6e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0491  ribosomal protein L9  44.14 
 
 		 179 aa  130  6e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0797  50S ribosomal protein L9  51.66 
 
 		 150 aa  129  9e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0000346105  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0760  50S ribosomal protein L9  44.97 
 
 		 150 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.242158  hitchhiker  0.000000266441 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4930  ribosomal protein L9  51.47 
 
 		 148 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.958603  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0584  50S ribosomal protein L9  51.47 
 
 		 148 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.724404 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0374  50S ribosomal protein L9  47.1 
 
 		 149 aa  128  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0230672  normal  0.0319555 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1516  50S ribosomal protein L9  43.45 
 
 		 191 aa  128  3e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101233  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4307  50S ribosomal protein L9  45.52 
 
 		 190 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0939755 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2763  50S ribosomal protein L9  46.21 
 
 		 149 aa  127  4.0000000000000003e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3939  50S ribosomal protein L9  45.52 
 
 		 190 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.613806  normal  0.190537 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03776  50S ribosomal protein L9  44.97 
 
 		 150 aa  127  4.0000000000000003e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4414  50S ribosomal protein L9  45.52 
 
 		 190 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.248049 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0537  50S ribosomal protein L9  50.75 
 
 		 148 aa  127  6e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233659 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1642  50S ribosomal protein L9  46.62 
 
 		 164 aa  127  6e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0557513  normal  0.0367892 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3490  50S ribosomal protein L9  44.14 
 
 		 195 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3927  50S ribosomal protein L9  48.32 
 
 		 150 aa  125  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>