More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0741 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0741  ribosomal protein L9  100 
 
 		 147 aa  291  2e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0681469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1112  ribosomal protein L9  59.59 
 
 		 147 aa  172  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.573323  normal  0.866168 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2593  50S ribosomal protein L9  56.46 
 
 		 147 aa  166  1e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3480  50S ribosomal protein L9  57.14 
 
 		 146 aa  158  2e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.34024  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0597  50S ribosomal protein L9  56.46 
 
 		 179 aa  157  6e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2007  ribosomal protein L9  54.11 
 
 		 148 aa  155  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.474404 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0397  hypothetical protein  56.76 
 
 		 149 aa  156  1e-37  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1668  50S ribosomal protein L9  53.38 
 
 		 175 aa  149  1e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.197637  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09988  ribosomal protein L9  45.95 
 
 		 149 aa  133  7.000000000000001e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.536224  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0150  50S ribosomal protein L9  46.26 
 
 		 151 aa  127  4.0000000000000003e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157053  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0602  ribosomal protein L9  42.18 
 
 		 159 aa  120  5e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0097  50S ribosomal protein L9  44.22 
 
 		 151 aa  119  9.999999999999999e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.625219  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2509  50S ribosomal protein L9  42.86 
 
 		 151 aa  119  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000781135  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0161  50S ribosomal protein L9  42.18 
 
 		 148 aa  119  9.999999999999999e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000723092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0117  50S ribosomal protein L9  44.22 
 
 		 151 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2841  50S ribosomal protein L9  41.18 
 
 		 148 aa  117  3.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000145753  hitchhiker  0.000000000000102152 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1410  50S ribosomal protein L9  37.41 
 
 		 171 aa  117  6e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000225617  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2028  50S ribosomal protein L9  38.78 
 
 		 167 aa  117  6e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.728229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6995  ribosomal protein L9  44.59 
 
 		 148 aa  116  9e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.142438 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2388  50S ribosomal protein L9  42.18 
 
 		 147 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4535  50S ribosomal protein L9  41.22 
 
 		 153 aa  114  5e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.323692 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2022  50S ribosomal protein L9  36.05 
 
 		 168 aa  114  6e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.278988  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0110  50S ribosomal protein L9  41.5 
 
 		 151 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000508651  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1352  50S ribosomal protein L9  36.05 
 
 		 167 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3675  50S ribosomal protein L9  38.19 
 
 		 147 aa  110  6e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0017578  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0668  50S ribosomal protein L9  39.71 
 
 		 148 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00124479  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0165  50S ribosomal protein L9  40.82 
 
 		 148 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000317895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0761  50S ribosomal protein L9  39.73 
 
 		 151 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000425439  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2925  ribosomal protein L9  39.46 
 
 		 147 aa  108  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0843322  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0163  50S ribosomal protein L9  42.86 
 
 		 146 aa  108  3e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00237667  normal  0.639266 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0116  50S ribosomal protein L9  42.95 
 
 		 149 aa  107  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0851  50S ribosomal protein L9P  37.67 
 
 		 149 aa  107  7.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0134  50S ribosomal protein L9  42.95 
 
 		 149 aa  106  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0123  50S ribosomal protein L9  42.95 
 
 		 149 aa  106  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3092  50S ribosomal protein L9  39.46 
 
 		 148 aa  106  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0370883  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1096  50S ribosomal protein L9  35.04 
 
 		 160 aa  104  3e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.547655  normal  0.0167988 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2610  50S ribosomal protein L9  37.67 
 
 		 147 aa  103  7e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.196058  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4351  ribosomal protein L9  39.07 
 
 		 148 aa  102  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1479  50S ribosomal protein L9  36.11 
 
 		 147 aa  102  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00653221 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2761  50S ribosomal protein L9  35.42 
 
 		 147 aa  102  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1828  50S ribosomal protein L9  37.24 
 
 		 168 aa  100  6e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3558  50S ribosomal protein L9  37.41 
 
 		 148 aa  100  6e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.882223 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2911  ribosomal protein L9  39.31 
 
 		 147 aa  98.6  3e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000198897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0120  50S ribosomal protein L9  38.52 
 
 		 149 aa  97.4  6e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0927016  normal  0.199932 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0654  ribosomal protein L9  40.14 
 
 		 146 aa  96.7  8e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.233351  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9354  50S ribosomal protein L9P  36.73 
 
 		 148 aa  96.3  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.837132 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4506  ribosomal protein L9  35.86 
 
 		 149 aa  95.5  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.594005  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3697  ribosomal protein L9  37.67 
 
 		 149 aa  94.7  4e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0830  ribosomal protein L9  38.1 
 
 		 149 aa  94  6e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.211438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5065  50S ribosomal protein L9  36.99 
 
 		 148 aa  93.2  9e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.972236  hitchhiker  0.000155251 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0210  ribosomal protein L9  35.17 
 
 		 172 aa  93.2  1e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000722973  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0448  50S ribosomal protein L9  35.42 
 
 		 148 aa  93.2  1e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000315624  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0491  ribosomal protein L9  36.11 
 
 		 179 aa  93.2  1e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2625  ribosomal protein L9  32.41 
 
 		 167 aa  92.4  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.24643  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4946  ribosomal protein L9  35.37 
 
 		 148 aa  92.4  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07670  50S ribosomal protein L9  38.06 
 
 		 148 aa  92.4  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.957501  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3185  ribosomal protein L9  34.29 
 
 		 148 aa  92  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.564436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4519  50S ribosomal protein L9  36.49 
 
 		 148 aa  91.7  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.986951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1996  50S ribosomal protein L9  35.62 
 
 		 148 aa  91.3  4e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1642  50S ribosomal protein L9  37.16 
 
 		 164 aa  91.3  4e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0557513  normal  0.0367892 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0081  50S ribosomal protein L9  31.72 
 
 		 148 aa  91.3  4e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.957353  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4553  50S ribosomal protein L9  36.99 
 
 		 148 aa  90.9  5e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.156994  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1775  50S ribosomal protein L9  37.16 
 
 		 149 aa  90.9  6e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000651865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2257  50S ribosomal protein L9  33.11 
 
 		 148 aa  90.5  6e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000108464  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1692  50S ribosomal protein L9  34.69 
 
 		 149 aa  90.5  7e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2522  ribosomal protein L9  36.24 
 
 		 150 aa  90.5  7e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.559663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0130  50S ribosomal protein L9  35.37 
 
 		 149 aa  90.1  8e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0311991 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1043  50S ribosomal protein L9  31.94 
 
 		 204 aa  90.1  8e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0955164 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5065  ribosomal protein L9  33.33 
 
 		 151 aa  90.1  9e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.366091  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1205  ribosomal protein L9  37.68 
 
 		 151 aa  89.7  1e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4841  ribosomal protein L9  35.33 
 
 		 148 aa  89.7  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0132  50S ribosomal protein L9P  37.84 
 
 		 150 aa  89.7  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.191578  normal  0.450064 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5418  50S ribosomal protein L9  35.42 
 
 		 190 aa  89.4  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0206045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7309  50S ribosomal protein L9  31.97 
 
 		 148 aa  89  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.937449  normal  0.0304173 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0881  50S ribosomal protein L9  38.1 
 
 		 148 aa  89  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00774862  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3040  50S ribosomal protein L9  32.68 
 
 		 188 aa  89  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.186174 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2332  ribosomal protein L9  34.25 
 
 		 170 aa  89  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.640711  hitchhiker  0.00706783 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1219  50S ribosomal protein L9P  34.46 
 
 		 148 aa  88.2  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.405746 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1350  50S ribosomal protein L9  34.72 
 
 		 189 aa  88.2  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0676227  normal  0.268494 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0586  50S ribosomal protein L9  38.69 
 
 		 150 aa  88.6  3e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.482938  hitchhiker  3.77539e-17 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0334  50S ribosomal protein L9  34.93 
 
 		 151 aa  88.6  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.801723 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0654  50S ribosomal protein L9  38.36 
 
 		 150 aa  87.8  4e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2306  50S ribosomal protein L9  36.11 
 
 		 189 aa  87.8  5e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.891012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3121  ribosomal protein L9  34.03 
 
 		 193 aa  87.8  5e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1030  50S ribosomal protein L9  37.16 
 
 		 170 aa  87.4  6e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0025  ribosomal protein L9  36.36 
 
 		 178 aa  87  7e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00173008  normal  0.984167 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2130  50S ribosomal protein L9  34.25 
 
 		 149 aa  87  7e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.929246  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0452  50S ribosomal protein L9  35.71 
 
 		 189 aa  87  8e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.206752  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0534  ribosomal protein L9  35.37 
 
 		 149 aa  86.7  1e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2102  50S ribosomal protein L9P  36.24 
 
 		 149 aa  86.3  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4178  ribosomal protein L9  34.48 
 
 		 151 aa  86.3  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1339  50S ribosomal protein L9  36.49 
 
 		 166 aa  85.5  2e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.361215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4307  50S ribosomal protein L9  32.64 
 
 		 190 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0939755 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1355  ribosomal protein L9  40 
 
 		 152 aa  85.5  2e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0141  50S ribosomal protein L9  34.72 
 
 		 189 aa  85.5  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37780  LSU ribosomal protein L9P  37.09 
 
 		 149 aa  85.5  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.236654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0648  50S ribosomal protein L9  40.94 
 
 		 148 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000594391 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23230  LSU ribosomal protein L9P  37.24 
 
 		 153 aa  85.5  2e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3939  50S ribosomal protein L9  32.64 
 
 		 190 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.613806  normal  0.190537 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1774  50S ribosomal protein L9  34.72 
 
 		 189 aa  85.5  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>