More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4535 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_4535  50S ribosomal protein L9  100 
 
 
153 aa  307  4e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.323692 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0761  50S ribosomal protein L9  45.95 
 
 
151 aa  135  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000425439  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1692  50S ribosomal protein L9  41.89 
 
 
149 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0602  ribosomal protein L9  42.18 
 
 
159 aa  127  6e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3121  ribosomal protein L9  46.36 
 
 
193 aa  127  8.000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2610  50S ribosomal protein L9  43.62 
 
 
147 aa  125  1.0000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.196058  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2925  ribosomal protein L9  44.9 
 
 
147 aa  126  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0843322  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0668  50S ribosomal protein L9  42.47 
 
 
148 aa  124  3e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00124479  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3675  50S ribosomal protein L9  41.1 
 
 
147 aa  124  3e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0017578  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2761  50S ribosomal protein L9  42 
 
 
147 aa  124  6e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2841  50S ribosomal protein L9  41.78 
 
 
148 aa  124  7e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000145753  hitchhiker  0.000000000000102152 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2911  ribosomal protein L9  42.76 
 
 
147 aa  123  9e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000198897  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4506  ribosomal protein L9  40.97 
 
 
149 aa  122  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.594005  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0448  50S ribosomal protein L9  37.41 
 
 
148 aa  122  2e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000315624  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0116  50S ribosomal protein L9  46.98 
 
 
149 aa  122  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1479  50S ribosomal protein L9  41.33 
 
 
147 aa  122  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00653221 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4519  50S ribosomal protein L9  42.86 
 
 
148 aa  121  3e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.986951  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0123  50S ribosomal protein L9  46.31 
 
 
149 aa  120  8e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0134  50S ribosomal protein L9  46.31 
 
 
149 aa  120  8e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0097  50S ribosomal protein L9  41.5 
 
 
151 aa  119  9.999999999999999e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.625219  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2388  50S ribosomal protein L9  40.82 
 
 
147 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0738  50S ribosomal protein L9  42.38 
 
 
191 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.823068  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0132  50S ribosomal protein L9P  44.97 
 
 
150 aa  119  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.191578  normal  0.450064 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0150  50S ribosomal protein L9  40.79 
 
 
151 aa  118  3e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157053  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0491  ribosomal protein L9  39.07 
 
 
179 aa  118  3e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3490  50S ribosomal protein L9  43.05 
 
 
195 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3558  50S ribosomal protein L9  42.76 
 
 
148 aa  117  4.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.882223 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2188  50S ribosomal protein L9  44.37 
 
 
209 aa  117  6e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2257  50S ribosomal protein L9  39.86 
 
 
148 aa  117  7e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000108464  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2306  50S ribosomal protein L9  41.78 
 
 
189 aa  117  7e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.891012  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1096  50S ribosomal protein L9  40.41 
 
 
160 aa  117  7.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.547655  normal  0.0167988 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0120  50S ribosomal protein L9  45.93 
 
 
149 aa  116  9e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0927016  normal  0.199932 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1205  ribosomal protein L9  41.22 
 
 
151 aa  116  9.999999999999999e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2332  ribosomal protein L9  39.07 
 
 
170 aa  116  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.640711  hitchhiker  0.00706783 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4351  ribosomal protein L9  44.52 
 
 
148 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0901  50S ribosomal protein L9  42.47 
 
 
189 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0476125 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2458  50S ribosomal protein L9P  42.47 
 
 
149 aa  116  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.174518 
 
 
-
 
NC_004310  BR0452  50S ribosomal protein L9  41.06 
 
 
189 aa  115  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.206752  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1516  50S ribosomal protein L9  41.06 
 
 
191 aa  115  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101233  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0458  50S ribosomal protein L9  41.06 
 
 
189 aa  115  3e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0566  50S ribosomal protein L9  39.74 
 
 
189 aa  114  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7309  50S ribosomal protein L9  41.38 
 
 
148 aa  115  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.937449  normal  0.0304173 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0081  50S ribosomal protein L9  40 
 
 
148 aa  114  3.9999999999999997e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.957353  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0165  50S ribosomal protein L9  38.51 
 
 
148 aa  114  3.9999999999999997e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000317895  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0741  ribosomal protein L9  41.22 
 
 
147 aa  114  5e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0681469  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3092  50S ribosomal protein L9  39.31 
 
 
148 aa  114  6.9999999999999995e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0370883  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1112  ribosomal protein L9  40.44 
 
 
147 aa  113  7.999999999999999e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.573323  normal  0.866168 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2212  50S ribosomal protein L9  47.01 
 
 
150 aa  113  8.999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2130  50S ribosomal protein L9  45.21 
 
 
149 aa  113  8.999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.929246  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0597  50S ribosomal protein L9  39.33 
 
 
179 aa  112  1.0000000000000001e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4931  50S ribosomal protein L9  45.52 
 
 
148 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.108353  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3528  50S ribosomal protein L9  45.86 
 
 
168 aa  113  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.156676  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0397  hypothetical protein  37.84 
 
 
149 aa  113  1.0000000000000001e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0517  50S ribosomal protein L9  39.19 
 
 
151 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0083  50S ribosomal protein L9  42.95 
 
 
202 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.584189  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1410  50S ribosomal protein L9  40.14 
 
 
171 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000225617  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5226  ribosomal protein L9  43.45 
 
 
150 aa  112  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1051  50S ribosomal protein L9  41.06 
 
 
192 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.289991 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1194  50S ribosomal protein L9  40.4 
 
 
192 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.762079  normal  0.0731596 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2028  50S ribosomal protein L9  39.33 
 
 
167 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.728229  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3040  50S ribosomal protein L9  41.29 
 
 
188 aa  112  3e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.186174 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5418  50S ribosomal protein L9  41.72 
 
 
190 aa  111  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0206045  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0117  50S ribosomal protein L9  39.46 
 
 
151 aa  111  4.0000000000000004e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4178  ribosomal protein L9  41.22 
 
 
151 aa  111  4.0000000000000004e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3812  50S ribosomal protein L9  41.72 
 
 
197 aa  111  5e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.740565  normal  0.136797 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3757  50S ribosomal protein L9  41.38 
 
 
148 aa  110  5e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2509  50S ribosomal protein L9  39.19 
 
 
151 aa  110  5e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000781135  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3363  ribosomal protein L9  42.38 
 
 
201 aa  110  5e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2461  50S ribosomal protein L9  43.71 
 
 
196 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.384902  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1510  ribosomal protein L9  40.4 
 
 
186 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1150  50S ribosomal protein L9  41.89 
 
 
165 aa  108  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0292661  hitchhiker  0.00494207 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1918  50S ribosomal protein L9  37.09 
 
 
196 aa  109  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.403674  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2988  50S ribosomal protein L9  43.05 
 
 
194 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1996  50S ribosomal protein L9  38.89 
 
 
148 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4841  ribosomal protein L9  40.69 
 
 
148 aa  108  4.0000000000000004e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0541  50S ribosomal protein L9  38.51 
 
 
151 aa  107  5e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1814  ribosomal protein L9  43.05 
 
 
149 aa  107  5e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0889  50S ribosomal protein L9  41.06 
 
 
194 aa  107  5e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.301047  normal  0.514488 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2022  50S ribosomal protein L9  36.91 
 
 
168 aa  107  6e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.278988  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0851  50S ribosomal protein L9P  41.38 
 
 
149 aa  107  6e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0161  50S ribosomal protein L9  38.1 
 
 
148 aa  107  6e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000723092  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3939  50S ribosomal protein L9  38.41 
 
 
190 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.613806  normal  0.190537 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4307  50S ribosomal protein L9  38.41 
 
 
190 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0939755 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2593  50S ribosomal protein L9  42.86 
 
 
189 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0267673 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4946  ribosomal protein L9  43.54 
 
 
148 aa  107  8.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1329  50S ribosomal protein L9P  41.89 
 
 
148 aa  106  9.000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.556068  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2535  ribosomal protein L9  37.84 
 
 
148 aa  106  9.000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000849852  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0130  50S ribosomal protein L9  42.34 
 
 
149 aa  106  9.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0311991 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_482  ribosomal protein L9  37.84 
 
 
151 aa  107  9.000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1620  50S ribosomal protein L9  39.74 
 
 
211 aa  106  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0645747  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5065  ribosomal protein L9  40.28 
 
 
151 aa  106  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.366091  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4414  50S ribosomal protein L9  38.41 
 
 
190 aa  106  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.248049 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0163  50S ribosomal protein L9  39.29 
 
 
146 aa  106  1e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00237667  normal  0.639266 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3303  ribosomal protein L9  40.41 
 
 
149 aa  105  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204917  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0534  ribosomal protein L9  37.41 
 
 
149 aa  105  2e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5065  50S ribosomal protein L9  42.03 
 
 
148 aa  105  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.972236  hitchhiker  0.000155251 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1043  50S ribosomal protein L9  41.72 
 
 
204 aa  105  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0955164 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4336  50S ribosomal protein L9  37.93 
 
 
150 aa  105  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3666  50S ribosomal protein L9  41.22 
 
 
149 aa  105  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.006093  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2522  ribosomal protein L9  39.04 
 
 
150 aa  105  2e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.559663  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>