More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1205 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_1205  ribosomal protein L9  100 
 
 
151 aa  298  1e-80  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2332  ribosomal protein L9  45.03 
 
 
170 aa  132  9.999999999999999e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.640711  hitchhiker  0.00706783 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4841  ribosomal protein L9  44.83 
 
 
148 aa  131  3.9999999999999996e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3675  50S ribosomal protein L9  45.14 
 
 
147 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0017578  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1692  50S ribosomal protein L9  40.14 
 
 
149 aa  124  4.0000000000000003e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2841  50S ribosomal protein L9  45.83 
 
 
148 aa  124  5e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000145753  hitchhiker  0.000000000000102152 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9354  50S ribosomal protein L9P  44.14 
 
 
148 aa  123  7e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.837132 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2610  50S ribosomal protein L9  45.83 
 
 
147 aa  123  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.196058  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0761  50S ribosomal protein L9  45.14 
 
 
151 aa  120  5e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000425439  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0668  50S ribosomal protein L9  43.75 
 
 
148 aa  120  8e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00124479  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4519  50S ribosomal protein L9  42.18 
 
 
148 aa  120  9e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.986951  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4946  ribosomal protein L9  43.45 
 
 
148 aa  120  9e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2007  ribosomal protein L9  43.33 
 
 
148 aa  119  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.474404 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3558  50S ribosomal protein L9  42.07 
 
 
148 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.882223 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1096  50S ribosomal protein L9  41.83 
 
 
160 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.547655  normal  0.0167988 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5065  ribosomal protein L9  43.92 
 
 
151 aa  118  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.366091  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7309  50S ribosomal protein L9  42.07 
 
 
148 aa  117  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.937449  normal  0.0304173 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0130  50S ribosomal protein L9  42.07 
 
 
149 aa  116  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0311991 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4535  50S ribosomal protein L9  41.22 
 
 
153 aa  116  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.323692 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2593  50S ribosomal protein L9  44.52 
 
 
147 aa  115  9.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2761  50S ribosomal protein L9  40.97 
 
 
147 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1479  50S ribosomal protein L9  40.97 
 
 
147 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00653221 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0132  50S ribosomal protein L9P  43.84 
 
 
150 aa  115  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.191578  normal  0.450064 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4506  ribosomal protein L9  40.28 
 
 
149 aa  115  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.594005  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2257  50S ribosomal protein L9  40.14 
 
 
148 aa  113  6.9999999999999995e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000108464  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2925  ribosomal protein L9  40.97 
 
 
147 aa  113  6.9999999999999995e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0843322  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2212  50S ribosomal protein L9  43.7 
 
 
150 aa  112  1.0000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0163  50S ribosomal protein L9  40.97 
 
 
146 aa  113  1.0000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00237667  normal  0.639266 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4661  50S ribosomal protein L9P  41.84 
 
 
148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11530  ribosomal protein L9  40 
 
 
191 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0446546  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2130  50S ribosomal protein L9  40 
 
 
149 aa  111  3e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.929246  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2022  50S ribosomal protein L9  39.47 
 
 
168 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.278988  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0334  50S ribosomal protein L9  39.19 
 
 
151 aa  111  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.801723 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5065  50S ribosomal protein L9  42.07 
 
 
148 aa  110  5e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.972236  hitchhiker  0.000155251 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4553  50S ribosomal protein L9  42.07 
 
 
148 aa  110  5e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.156994  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1410  50S ribosomal protein L9  41.83 
 
 
171 aa  110  6e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000225617  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0448  50S ribosomal protein L9  39.04 
 
 
148 aa  110  9e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000315624  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0165  50S ribosomal protein L9  41.67 
 
 
148 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000317895  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0397  hypothetical protein  43.26 
 
 
149 aa  109  1.0000000000000001e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3092  50S ribosomal protein L9  40 
 
 
148 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0370883  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1996  50S ribosomal protein L9  40.28 
 
 
148 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3666  50S ribosomal protein L9  41.22 
 
 
149 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.006093  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0081  50S ribosomal protein L9  35.86 
 
 
148 aa  108  3e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.957353  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4931  50S ribosomal protein L9  42.47 
 
 
148 aa  108  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.108353  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2028  50S ribosomal protein L9  40.94 
 
 
167 aa  108  3e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.728229  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3121  ribosomal protein L9  37.84 
 
 
193 aa  106  8.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0161  50S ribosomal protein L9  39.58 
 
 
148 aa  106  1e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000723092  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0116  50S ribosomal protein L9  42.57 
 
 
149 aa  106  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2388  50S ribosomal protein L9  38.19 
 
 
147 aa  106  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0586  50S ribosomal protein L9  43.15 
 
 
150 aa  106  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.482938  hitchhiker  3.77539e-17 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1112  ribosomal protein L9  41.1 
 
 
147 aa  106  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.573323  normal  0.866168 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4336  50S ribosomal protein L9  36.73 
 
 
150 aa  105  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2522  ribosomal protein L9  38.1 
 
 
150 aa  105  2e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.559663  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0602  ribosomal protein L9  38.89 
 
 
159 aa  105  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0491  ribosomal protein L9  35.1 
 
 
179 aa  104  3e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0134  50S ribosomal protein L9  41.89 
 
 
149 aa  104  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0123  50S ribosomal protein L9  41.89 
 
 
149 aa  104  4e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3490  50S ribosomal protein L9  37.84 
 
 
195 aa  104  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0210  ribosomal protein L9  37.5 
 
 
172 aa  104  5e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000722973  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1352  50S ribosomal protein L9  40.94 
 
 
167 aa  104  5e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3352  ribosomal protein L9  39.86 
 
 
151 aa  104  5e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.600621  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0150  50S ribosomal protein L9  39.04 
 
 
151 aa  103  7e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157053  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3697  ribosomal protein L9  39.31 
 
 
149 aa  102  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0851  50S ribosomal protein L9P  39.07 
 
 
149 aa  103  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1435  50S ribosomal protein L9  41.1 
 
 
149 aa  102  1e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0986557  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3303  ribosomal protein L9  40 
 
 
149 aa  102  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204917  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0654  ribosomal protein L9  39.31 
 
 
146 aa  102  2e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.233351  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2535  ribosomal protein L9  35.86 
 
 
148 aa  102  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000849852  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2509  50S ribosomal protein L9  40.44 
 
 
151 aa  102  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000781135  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2102  50S ribosomal protein L9P  40 
 
 
149 aa  102  3e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2131  50S ribosomal protein L9  40.94 
 
 
149 aa  101  3e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.103333  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2050  50S ribosomal protein L9  40.94 
 
 
149 aa  101  3e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.889408  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4178  ribosomal protein L9  38 
 
 
151 aa  101  4e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4737  ribosomal protein L9  40.14 
 
 
150 aa  101  4e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0648  50S ribosomal protein L9  46 
 
 
148 aa  101  5e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000594391 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3757  50S ribosomal protein L9  38.62 
 
 
148 aa  100  5e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0681  50S ribosomal protein L9  43.15 
 
 
150 aa  100  7e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07670  50S ribosomal protein L9  41.89 
 
 
148 aa  100  7e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.957501  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3636  50S ribosomal protein L9  43.15 
 
 
150 aa  100  7e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0830  ribosomal protein L9  40.41 
 
 
149 aa  100  7e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.211438  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3781  50S ribosomal protein L9  43.15 
 
 
150 aa  100  7e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0449  50S ribosomal protein L9  43.84 
 
 
150 aa  100  8e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00474942 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31750  LSU ribosomal protein L9P  35.62 
 
 
157 aa  100  8e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37780  LSU ribosomal protein L9P  38.89 
 
 
149 aa  99.8  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.236654  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4351  ribosomal protein L9  37.24 
 
 
148 aa  99.8  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5226  ribosomal protein L9  40.54 
 
 
150 aa  99.8  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7042  ribosomal protein L9  37.24 
 
 
151 aa  98.6  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04070  50S ribosomal protein L9  43.84 
 
 
149 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3790  ribosomal protein L9  43.84 
 
 
149 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00574678  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0777  50S ribosomal protein L9  41.78 
 
 
149 aa  98.2  3e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000131124  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4673  50S ribosomal protein L9  43.84 
 
 
149 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4764  50S ribosomal protein L9  43.84 
 
 
149 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04032  hypothetical protein  43.84 
 
 
149 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3810  50S ribosomal protein L9  43.84 
 
 
149 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0581092 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4447  50S ribosomal protein L9  43.84 
 
 
149 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5718  50S ribosomal protein L9  43.84 
 
 
149 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.595872  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4736  50S ribosomal protein L9  43.84 
 
 
149 aa  98.2  3e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.257928  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0120  50S ribosomal protein L9  39.85 
 
 
149 aa  98.2  4e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0927016  normal  0.199932 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0901  50S ribosomal protein L9  40.82 
 
 
189 aa  97.8  5e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0476125 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1414  50S ribosomal protein L9  39.46 
 
 
199 aa  96.7  9e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>