More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_9354 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_9354  50S ribosomal protein L9P  100 
 
 
148 aa  290  4e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.837132 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3558  50S ribosomal protein L9  73.65 
 
 
148 aa  223  9e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.882223 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5065  50S ribosomal protein L9  69.86 
 
 
148 aa  213  7e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.972236  hitchhiker  0.000155251 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4553  50S ribosomal protein L9  69.86 
 
 
148 aa  212  9.999999999999999e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.156994  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4841  ribosomal protein L9  67.57 
 
 
148 aa  208  2e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4946  ribosomal protein L9  65.54 
 
 
148 aa  201  2e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0334  50S ribosomal protein L9  65.99 
 
 
151 aa  197  5e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.801723 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4519  50S ribosomal protein L9  63.51 
 
 
148 aa  195  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.986951  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7309  50S ribosomal protein L9  63.51 
 
 
148 aa  194  4.0000000000000005e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.937449  normal  0.0304173 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3092  50S ribosomal protein L9  67.81 
 
 
148 aa  192  1e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0370883  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0130  50S ribosomal protein L9  61.49 
 
 
149 aa  191  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0311991 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2130  50S ribosomal protein L9  60.14 
 
 
149 aa  180  7e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.929246  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3697  ribosomal protein L9  57.14 
 
 
149 aa  179  1e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5065  ribosomal protein L9  61.64 
 
 
151 aa  172  9.999999999999999e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.366091  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4336  50S ribosomal protein L9  56.76 
 
 
150 aa  171  2.9999999999999996e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37780  LSU ribosomal protein L9P  57.14 
 
 
149 aa  171  2.9999999999999996e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.236654  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4178  ribosomal protein L9  57.93 
 
 
151 aa  169  1e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7042  ribosomal protein L9  57.82 
 
 
151 aa  169  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4117  50S ribosomal protein L9  57.53 
 
 
150 aa  168  2e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4661  50S ribosomal protein L9P  56.08 
 
 
148 aa  168  2e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3888  50S ribosomal protein L9  56.85 
 
 
150 aa  167  3e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00361277 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3352  ribosomal protein L9  59.18 
 
 
151 aa  165  2e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.600621  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39420  LSU ribosomal protein L9P  54.36 
 
 
152 aa  157  4e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26560  LSU ribosomal protein L9P  53.38 
 
 
148 aa  156  1e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.199017 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5366  ribosomal protein L9  53.33 
 
 
151 aa  154  3e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23230  LSU ribosomal protein L9P  55.78 
 
 
153 aa  153  8e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6031  50S ribosomal protein L9  53.64 
 
 
151 aa  153  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.827335  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4737  ribosomal protein L9  54.36 
 
 
150 aa  151  4e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5743  50S ribosomal protein L9  53.33 
 
 
152 aa  150  4e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.245852 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5367  50S ribosomal protein L9  53.33 
 
 
152 aa  150  4e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5456  50S ribosomal protein L9  53.33 
 
 
152 aa  150  4e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.166119  normal  0.0135281 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0877  50S ribosomal protein L9  52.32 
 
 
151 aa  150  5e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4166  ribosomal protein L9  53.02 
 
 
150 aa  150  7e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31750  LSU ribosomal protein L9P  48.98 
 
 
157 aa  148  3e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2522  ribosomal protein L9  50 
 
 
150 aa  146  7e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.559663  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10055  50S ribosomal protein L9  50 
 
 
152 aa  146  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.95125e-19  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0132  50S ribosomal protein L9P  46.26 
 
 
150 aa  131  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.191578  normal  0.450064 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2911  ribosomal protein L9  42.76 
 
 
147 aa  127  7.000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000198897  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2332  ribosomal protein L9  41.78 
 
 
170 aa  125  2.0000000000000002e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.640711  hitchhiker  0.00706783 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1205  ribosomal protein L9  44.14 
 
 
151 aa  123  7e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2257  50S ribosomal protein L9  41.38 
 
 
148 aa  121  3e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000108464  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4931  50S ribosomal protein L9  41.89 
 
 
148 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.108353  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0081  50S ribosomal protein L9  37.93 
 
 
148 aa  118  3e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.957353  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2388  50S ribosomal protein L9  42.86 
 
 
147 aa  116  9e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2610  50S ribosomal protein L9  42.57 
 
 
147 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.196058  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2022  50S ribosomal protein L9  42.18 
 
 
168 aa  114  5e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.278988  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1479  50S ribosomal protein L9  41.89 
 
 
147 aa  114  5e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00653221 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0654  ribosomal protein L9  40.82 
 
 
146 aa  113  6.9999999999999995e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.233351  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2761  50S ribosomal protein L9  41.22 
 
 
147 aa  113  7.999999999999999e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2925  ribosomal protein L9  40.82 
 
 
147 aa  112  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0843322  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0397  hypothetical protein  38.78 
 
 
149 aa  113  1.0000000000000001e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3675  50S ribosomal protein L9  40.54 
 
 
147 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0017578  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2841  50S ribosomal protein L9  39.19 
 
 
148 aa  111  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000145753  hitchhiker  0.000000000000102152 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0165  50S ribosomal protein L9  42.57 
 
 
148 aa  111  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000317895  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23320  ribosomal protein L9  44.59 
 
 
147 aa  110  6e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.507738  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0602  ribosomal protein L9  41.38 
 
 
159 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1692  50S ribosomal protein L9  38.78 
 
 
149 aa  110  8.000000000000001e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4506  ribosomal protein L9  37.67 
 
 
149 aa  110  9e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.594005  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0311  ribosomal protein L9  39.73 
 
 
148 aa  109  1.0000000000000001e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0979697 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0448  50S ribosomal protein L9  40.82 
 
 
148 aa  108  2.0000000000000002e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000315624  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2780  50S ribosomal protein L9  40.94 
 
 
149 aa  108  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000928974  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2509  50S ribosomal protein L9  39.19 
 
 
151 aa  108  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000781135  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3303  ribosomal protein L9  36.05 
 
 
149 aa  107  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204917  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0851  50S ribosomal protein L9P  39.04 
 
 
149 aa  107  6e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0025  ribosomal protein L9  40.69 
 
 
178 aa  107  6e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00173008  normal  0.984167 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0668  50S ribosomal protein L9  39.19 
 
 
148 aa  107  7.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00124479  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1216  50S ribosomal protein L9  41.22 
 
 
148 aa  107  7.000000000000001e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0117  50S ribosomal protein L9  39.86 
 
 
151 aa  107  7.000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1352  50S ribosomal protein L9  39.46 
 
 
167 aa  107  8.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00020  50S ribosomal protein L9  38.85 
 
 
150 aa  106  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0761  50S ribosomal protein L9  40.14 
 
 
151 aa  106  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000425439  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0097  50S ribosomal protein L9  41.22 
 
 
151 aa  105  2e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.625219  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0110  50S ribosomal protein L9  39.46 
 
 
151 aa  105  2e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000508651  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18001  50S ribosomal protein L9  38 
 
 
152 aa  105  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0150  50S ribosomal protein L9  37.41 
 
 
151 aa  105  2e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157053  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3121  ribosomal protein L9  38.62 
 
 
193 aa  104  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2559  50S ribosomal protein L9  39.74 
 
 
152 aa  104  4e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1435  50S ribosomal protein L9  40.94 
 
 
149 aa  104  5e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0986557  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2535  ribosomal protein L9  35.14 
 
 
148 aa  104  5e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000849852  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2007  ribosomal protein L9  38 
 
 
148 aa  103  6e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.474404 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11530  ribosomal protein L9  36.88 
 
 
191 aa  103  7e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0446546  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4535  50S ribosomal protein L9  38.62 
 
 
153 aa  103  7e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.323692 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2212  50S ribosomal protein L9  41.48 
 
 
150 aa  103  8e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18631  50S ribosomal protein L9  39.87 
 
 
151 aa  103  8e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002335  LSU ribosomal protein L9p  37.58 
 
 
150 aa  102  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.178305  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1765  50S ribosomal protein L9  39.87 
 
 
151 aa  103  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0116  50S ribosomal protein L9  45.58 
 
 
149 aa  102  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27890  ribosomal protein L9  39.31 
 
 
181 aa  102  2e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00233062  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1112  ribosomal protein L9  38 
 
 
147 aa  102  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.573323  normal  0.866168 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2188  50S ribosomal protein L9  39.31 
 
 
209 aa  102  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2028  50S ribosomal protein L9  38.78 
 
 
167 aa  102  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.728229  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0881  50S ribosomal protein L9  37.84 
 
 
148 aa  101  4e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00774862  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0491  ribosomal protein L9  35.86 
 
 
179 aa  101  4e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3541  50S ribosomal protein L9  42.07 
 
 
149 aa  100  5e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0566  50S ribosomal protein L9  35.17 
 
 
189 aa  100  5e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0123  50S ribosomal protein L9  44.22 
 
 
149 aa  100  7e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1410  50S ribosomal protein L9  38.78 
 
 
171 aa  100  7e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000225617  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0134  50S ribosomal protein L9  44.22 
 
 
149 aa  100  7e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09988  ribosomal protein L9  37.41 
 
 
149 aa  100  7e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.536224  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18821  50S ribosomal protein L9  38.56 
 
 
151 aa  100  7e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0277205  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>