More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_18001 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009976  P9211_18001  50S ribosomal protein L9  100 
 
 		 152 aa  305  2.0000000000000002e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28961  50S ribosomal protein L9  80.92 
 
 		 152 aa  253  5e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2193  50S ribosomal protein L9  79.61 
 
 		 152 aa  248  2e-65  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21431  50S ribosomal protein L9  77.63 
 
 		 152 aa  246  7e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1272  50S ribosomal protein L9  76.97 
 
 		 152 aa  246  9e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2542  50S ribosomal protein L9  77.63 
 
 		 152 aa  243  6.999999999999999e-64  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18631  50S ribosomal protein L9  68.87 
 
 		 151 aa  219  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18821  50S ribosomal protein L9  68.21 
 
 		 151 aa  218  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0277205  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1765  50S ribosomal protein L9  67.55 
 
 		 151 aa  216  7.999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18631  50S ribosomal protein L9  66.23 
 
 		 151 aa  215  2e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.58702  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2559  50S ribosomal protein L9  60.93 
 
 		 152 aa  193  6e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4542  50S ribosomal protein L9  55.03 
 
 		 152 aa  170  5e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.736351 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3244  50S ribosomal protein L9  53.02 
 
 		 152 aa  164  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.65089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2852  50S ribosomal protein L9  52.35 
 
 		 152 aa  164  5e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1460  50S ribosomal protein L9  51.32 
 
 		 152 aa  155  1e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0890745  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2897  50S ribosomal protein L9  50.99 
 
 		 152 aa  149  2e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000174347  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0329  50S ribosomal protein L9  48.34 
 
 		 152 aa  145  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.355323  normal  0.434143 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0287  ribosomal protein L9  48.34 
 
 		 152 aa  140  5e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0120134  normal  0.0123082 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3697  ribosomal protein L9  40.14 
 
 		 149 aa  105  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0654  ribosomal protein L9  39.73 
 
 		 146 aa  105  2e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.233351  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9354  50S ribosomal protein L9P  38 
 
 		 148 aa  105  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.837132 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2911  ribosomal protein L9  37.24 
 
 		 147 aa  104  5e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000198897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4351  ribosomal protein L9  37.58 
 
 		 148 aa  103  6e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3352  ribosomal protein L9  41.5 
 
 		 151 aa  101  3e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.600621  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29830  Plastid ribosomal protein L9, imported to chloroplast, large ribosomal subunit  38.81 
 
 		 195 aa  101  4e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3558  50S ribosomal protein L9  37.75 
 
 		 148 aa  100  5e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.882223 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1063  ribosomal protein L9  38.36 
 
 		 147 aa  100  7e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.342712  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31750  LSU ribosomal protein L9P  34.69 
 
 		 157 aa  100  7e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3092  50S ribosomal protein L9  37.84 
 
 		 148 aa  99.8  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0370883  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4117  50S ribosomal protein L9  39.47 
 
 		 150 aa  100  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5065  50S ribosomal protein L9  39.19 
 
 		 148 aa  98.6  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.972236  hitchhiker  0.000155251 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1642  50S ribosomal protein L9  38.93 
 
 		 164 aa  98.6  3e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0557513  normal  0.0367892 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2130  50S ribosomal protein L9  37.41 
 
 		 149 aa  97.8  4e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.929246  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09988  ribosomal protein L9  35.14 
 
 		 149 aa  97.8  5e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.536224  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3888  50S ribosomal protein L9  40.82 
 
 		 150 aa  97.4  5e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00361277 
 
 
-
 
NC_002950  PG0597  50S ribosomal protein L9  40.27 
 
 		 179 aa  97.1  7e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0851  50S ribosomal protein L9P  37.58 
 
 		 149 aa  97.4  7e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1329  50S ribosomal protein L9P  40.94 
 
 		 148 aa  96.7  9e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.556068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4737  ribosomal protein L9  36.91 
 
 		 150 aa  96.3  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0602  ribosomal protein L9  37.84 
 
 		 159 aa  96.3  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3480  50S ribosomal protein L9  40.54 
 
 		 146 aa  96.3  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.34024  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4841  ribosomal protein L9  37.16 
 
 		 148 aa  96.7  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39420  LSU ribosomal protein L9P  36.91 
 
 		 152 aa  95.5  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23230  LSU ribosomal protein L9P  37.91 
 
 		 153 aa  95.5  2e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1814  ribosomal protein L9  42 
 
 		 149 aa  95.5  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5065  ribosomal protein L9  36.99 
 
 		 151 aa  95.9  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.366091  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2925  ribosomal protein L9  39.44 
 
 		 147 aa  95.9  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0843322  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1339  50S ribosomal protein L9  42.28 
 
 		 166 aa  95.1  3e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.361215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0132  50S ribosomal protein L9P  36.13 
 
 		 150 aa  95.1  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.191578  normal  0.450064 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1030  50S ribosomal protein L9  42.28 
 
 		 170 aa  95.1  3e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1359  ribosomal protein L9  35.42 
 
 		 151 aa  95.1  3e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0122536  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0081  50S ribosomal protein L9  35.57 
 
 		 148 aa  95.5  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.957353  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0534  ribosomal protein L9  38.41 
 
 		 149 aa  94.7  4e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3303  ribosomal protein L9  39.07 
 
 		 149 aa  94.7  4e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204917  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1410  50S ribosomal protein L9  37.84 
 
 		 171 aa  94.7  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000225617  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0123  50S ribosomal protein L9  40.41 
 
 		 149 aa  94.4  5e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0134  50S ribosomal protein L9  40.41 
 
 		 149 aa  94.4  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2022  50S ribosomal protein L9  37.84 
 
 		 168 aa  94.4  5e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.278988  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4178  ribosomal protein L9  36.99 
 
 		 151 aa  94  7e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10055  50S ribosomal protein L9  37.75 
 
 		 152 aa  93.6  9e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.95125e-19  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37780  LSU ribosomal protein L9P  36.05 
 
 		 149 aa  93.6  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.236654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1780  50S ribosomal protein L9  38.82 
 
 		 150 aa  93.2  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5171  50S ribosomal protein L9  38.82 
 
 		 150 aa  93.2  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0116  50S ribosomal protein L9  39.73 
 
 		 149 aa  93.2  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0449  50S ribosomal protein L9  35.57 
 
 		 150 aa  92.8  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00474942 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1808  50S ribosomal protein L9  38.82 
 
 		 150 aa  93.2  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.432428  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4553  50S ribosomal protein L9  37.16 
 
 		 148 aa  93.2  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.156994  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1975  50S ribosomal protein L9  38.26 
 
 		 149 aa  92.8  1e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4946  ribosomal protein L9  34.46 
 
 		 148 aa  92.8  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2257  50S ribosomal protein L9  35.57 
 
 		 148 aa  92.4  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000108464  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00020  50S ribosomal protein L9  37.5 
 
 		 150 aa  92.4  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2610  50S ribosomal protein L9  41.29 
 
 		 147 aa  92.4  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.196058  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1219  50S ribosomal protein L9P  38.67 
 
 		 148 aa  92.8  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.405746 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0777  50S ribosomal protein L9  36.18 
 
 		 149 aa  92  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000131124  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1894  50S ribosomal protein L9  38.16 
 
 		 150 aa  92.8  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000492255  hitchhiker  0.000000062237 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3432  50S ribosomal protein L9  37.5 
 
 		 150 aa  92.4  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0102132  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6208  50S ribosomal protein L9  38.16 
 
 		 150 aa  92.8  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1871  50S ribosomal protein L9  38.16 
 
 		 150 aa  92.8  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.539407  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3589  50S ribosomal protein L9  36.84 
 
 		 150 aa  92  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.229017  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2028  50S ribosomal protein L9  35.81 
 
 		 167 aa  92  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.728229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1948  ribosomal protein L9  39.19 
 
 		 151 aa  91.7  3e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4519  50S ribosomal protein L9  37.16 
 
 		 148 aa  91.7  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.986951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002335  LSU ribosomal protein L9p  36.18 
 
 		 150 aa  91.7  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.178305  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2522  ribosomal protein L9  40.14 
 
 		 150 aa  91.7  4e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.559663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7042  ribosomal protein L9  34.9 
 
 		 151 aa  91.3  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0761  50S ribosomal protein L9  42.28 
 
 		 151 aa  91.3  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000425439  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2780  50S ribosomal protein L9  36.84 
 
 		 149 aa  90.9  5e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000928974  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1479  50S ribosomal protein L9  40.27 
 
 		 147 aa  91.3  5e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00653221 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0150  50S ribosomal protein L9  40.27 
 
 		 151 aa  91.3  5e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157053  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4506  ribosomal protein L9  38.93 
 
 		 149 aa  90.9  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.594005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1112  ribosomal protein L9  36.49 
 
 		 147 aa  90.9  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.573323  normal  0.866168 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2188  50S ribosomal protein L9  39.04 
 
 		 209 aa  90.5  7e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1150  50S ribosomal protein L9  38.16 
 
 		 165 aa  90.5  7e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0292661  hitchhiker  0.00494207 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6031  50S ribosomal protein L9  37.18 
 
 		 151 aa  90.5  7e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.827335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0097  50S ribosomal protein L9  38.71 
 
 		 151 aa  90.5  8e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.625219  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2841  50S ribosomal protein L9  39.04 
 
 		 148 aa  90.1  8e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000145753  hitchhiker  0.000000000000102152 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2509  50S ribosomal protein L9  39.19 
 
 		 151 aa  90.5  8e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000781135  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0130  50S ribosomal protein L9  35.14 
 
 		 149 aa  90.1  9e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0311991 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0877  50S ribosomal protein L9  35.9 
 
 		 151 aa  90.1  9e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3675  50S ribosomal protein L9  36.3 
 
 		 147 aa  90.1  9e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0017578  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>