More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1063 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1063  ribosomal protein L9  100 
 
 		 147 aa  286  6e-77  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.342712  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0755  50S ribosomal protein L9  59.86 
 
 		 147 aa  179  1e-44  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.123004  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0766  50S ribosomal protein L9  60.54 
 
 		 147 aa  178  2e-44  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1335  50S ribosomal protein L9  60.54 
 
 		 147 aa  178  2e-44  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.779246  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0691  50S ribosomal protein L9  59.86 
 
 		 147 aa  175  1e-43  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.965634  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1000  50S ribosomal protein L9  58.5 
 
 		 147 aa  172  1.9999999999999998e-42  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1375  50S ribosomal protein L9  56.08 
 
 		 148 aa  154  4e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0636184  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1220  50S ribosomal protein L9  51.35 
 
 		 148 aa  151  4e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.592412  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1975  50S ribosomal protein L9  49.66 
 
 		 149 aa  149  1e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1029  ribosomal protein L9  52.7 
 
 		 148 aa  145  2.0000000000000003e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0075177  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2257  50S ribosomal protein L9  42.76 
 
 		 148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000108464  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4542  50S ribosomal protein L9  41.5 
 
 		 152 aa  108  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.736351 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0081  50S ribosomal protein L9  40 
 
 		 148 aa  106  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.957353  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2535  ribosomal protein L9  40.54 
 
 		 148 aa  104  4e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000849852  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2925  ribosomal protein L9  39.86 
 
 		 147 aa  104  5e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0843322  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18001  50S ribosomal protein L9  38.36 
 
 		 152 aa  100  6e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0602  ribosomal protein L9  39.19 
 
 		 159 aa  99.4  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2911  ribosomal protein L9  41.67 
 
 		 147 aa  99.8  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000198897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3244  50S ribosomal protein L9  38.78 
 
 		 152 aa  99.8  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.65089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0014  50S ribosomal protein L9P  39.46 
 
 		 151 aa  99.8  1e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2388  50S ribosomal protein L9  42.57 
 
 		 147 aa  99.4  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2852  50S ribosomal protein L9  38.78 
 
 		 152 aa  99.4  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3528  50S ribosomal protein L9  35.81 
 
 		 168 aa  97.1  7e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.156676  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1422  50S ribosomal protein L9  41.67 
 
 		 151 aa  97.1  7e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0660955  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2193  50S ribosomal protein L9  39.19 
 
 		 152 aa  96.7  1e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0132  50S ribosomal protein L9P  37.16 
 
 		 150 aa  96.3  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.191578  normal  0.450064 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5262  50S ribosomal protein L9  37.93 
 
 		 148 aa  95.9  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00409171  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0117  50S ribosomal protein L9  40.27 
 
 		 151 aa  95.5  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2542  50S ribosomal protein L9  39.6 
 
 		 152 aa  95.9  2e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2559  50S ribosomal protein L9  37.24 
 
 		 152 aa  95.5  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4931  50S ribosomal protein L9  40.69 
 
 		 148 aa  95.5  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.108353  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0150  50S ribosomal protein L9  39.19 
 
 		 151 aa  94.7  3e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157053  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3092  50S ribosomal protein L9  36.73 
 
 		 148 aa  95.1  3e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0370883  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1814  ribosomal protein L9  40 
 
 		 149 aa  94.7  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1410  50S ribosomal protein L9  36.91 
 
 		 171 aa  94.7  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000225617  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4506  ribosomal protein L9  34.69 
 
 		 149 aa  94.7  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.594005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0165  50S ribosomal protein L9  35.81 
 
 		 148 aa  94  5e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000317895  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3412  50S ribosomal protein L9  40 
 
 		 149 aa  94  6e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4351  ribosomal protein L9  40.94 
 
 		 148 aa  94  6e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0334  50S ribosomal protein L9  37.75 
 
 		 151 aa  92.8  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.801723 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0654  ribosomal protein L9  36.11 
 
 		 146 aa  93.2  1e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.233351  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2509  50S ribosomal protein L9  38.51 
 
 		 151 aa  93.2  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000781135  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0110  50S ribosomal protein L9  37.58 
 
 		 151 aa  92  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000508651  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2130  50S ribosomal protein L9  34.25 
 
 		 149 aa  92.4  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.929246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5065  50S ribosomal protein L9  34.93 
 
 		 148 aa  92.4  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.972236  hitchhiker  0.000155251 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3888  50S ribosomal protein L9  37.93 
 
 		 150 aa  91.7  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00361277 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4553  50S ribosomal protein L9  34.25 
 
 		 148 aa  91.7  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.156994  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2897  50S ribosomal protein L9  38.78 
 
 		 152 aa  90.9  5e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000174347  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1150  50S ribosomal protein L9  34.46 
 
 		 165 aa  90.9  5e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0292661  hitchhiker  0.00494207 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4117  50S ribosomal protein L9  37.24 
 
 		 150 aa  90.9  5e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0329  50S ribosomal protein L9  36.73 
 
 		 152 aa  90.5  7e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.355323  normal  0.434143 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2972  50S ribosomal protein L9  40 
 
 		 148 aa  90.1  8e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2650  50S ribosomal protein L9  40 
 
 		 148 aa  90.1  8e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.502254  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9354  50S ribosomal protein L9P  37.25 
 
 		 148 aa  90.1  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.837132 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3541  50S ribosomal protein L9  40.69 
 
 		 149 aa  90.1  9e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2538  50S ribosomal protein L9  37.67 
 
 		 148 aa  89.7  1e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1948  ribosomal protein L9  36.84 
 
 		 151 aa  89.7  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1460  50S ribosomal protein L9  38.51 
 
 		 152 aa  89.4  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0890745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6995  ribosomal protein L9  37.16 
 
 		 148 aa  89  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.142438 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1272  50S ribosomal protein L9  35.86 
 
 		 152 aa  89  2e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0161  50S ribosomal protein L9  33.78 
 
 		 148 aa  89  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000723092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5065  ribosomal protein L9  33.79 
 
 		 151 aa  89  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.366091  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21431  50S ribosomal protein L9  35.86 
 
 		 152 aa  88.6  2e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0130  50S ribosomal protein L9  32.19 
 
 		 149 aa  88.6  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0311991 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2102  50S ribosomal protein L9P  38.82 
 
 		 149 aa  88.6  3e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0011  50S ribosomal protein L9  32.65 
 
 		 150 aa  88.6  3e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.557694  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4946  ribosomal protein L9  34.48 
 
 		 148 aa  87.8  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1765  50S ribosomal protein L9  38.1 
 
 		 151 aa  87.8  5e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0287  ribosomal protein L9  35.03 
 
 		 152 aa  87.4  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0120134  normal  0.0123082 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0894  50S ribosomal protein L9  42.28 
 
 		 149 aa  87.4  6e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000571684  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl083  50S ribosomal protein L9  34.01 
 
 		 147 aa  87  7e-17  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000770286  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4166  ribosomal protein L9  37.91 
 
 		 150 aa  87  7e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5620  50S ribosomal protein L9  40 
 
 		 148 aa  86.7  9e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000412151  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5657  50S ribosomal protein L9  40 
 
 		 148 aa  86.7  9e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000227696  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3303  ribosomal protein L9  36.55 
 
 		 149 aa  86.3  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204917  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2002  50S ribosomal protein L9  36.91 
 
 		 153 aa  86.3  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0148705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18631  50S ribosomal protein L9  37.41 
 
 		 151 aa  86.3  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4178  ribosomal protein L9  31.03 
 
 		 151 aa  86.3  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5322  50S ribosomal protein L9  40 
 
 		 148 aa  85.5  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5150  50S ribosomal protein L9  40 
 
 		 148 aa  85.5  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000483517  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5166  50S ribosomal protein L9  40 
 
 		 148 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0461945  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1219  50S ribosomal protein L9P  31.54 
 
 		 148 aa  85.5  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.405746 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1692  50S ribosomal protein L9  37.16 
 
 		 149 aa  85.9  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5718  50S ribosomal protein L9  40 
 
 		 148 aa  85.5  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000626689  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3558  50S ribosomal protein L9  33.97 
 
 		 148 aa  85.9  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.882223 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5579  50S ribosomal protein L9  40 
 
 		 148 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.17506e-22 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2212  50S ribosomal protein L9  36.96 
 
 		 150 aa  85.1  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4841  ribosomal protein L9  33.11 
 
 		 148 aa  84.7  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0097  50S ribosomal protein L9  36.67 
 
 		 151 aa  84.7  3e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.625219  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3666  50S ribosomal protein L9  37.5 
 
 		 149 aa  84.7  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.006093  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28961  50S ribosomal protein L9  36.49 
 
 		 152 aa  85.1  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4737  ribosomal protein L9  35.81 
 
 		 150 aa  85.1  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18631  50S ribosomal protein L9  36.05 
 
 		 151 aa  84.7  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.58702  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7042  ribosomal protein L9  36.6 
 
 		 151 aa  84.7  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5339  50S ribosomal protein L9  39.31 
 
 		 148 aa  84.3  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000103383  hitchhiker  0.00000000147927 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0012  50S ribosomal protein L9  34.84 
 
 		 154 aa  84.3  5e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.181348  hitchhiker  0.0000209307 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18821  50S ribosomal protein L9  36.73 
 
 		 151 aa  84  7e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0277205  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0015  50S ribosomal protein L9  40.41 
 
 		 148 aa  83.6  8e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0923688  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0015  50S ribosomal protein L9  40.41 
 
 		 148 aa  83.6  8e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11530  ribosomal protein L9  35.07 
 
 		 191 aa  83.6  8e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0446546  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>