More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_00020 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_00020  50S ribosomal protein L9  100 
 
 		 150 aa  292  1e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002335  LSU ribosomal protein L9p  96 
 
 		 150 aa  283  5e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.178305  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2780  50S ribosomal protein L9  87.16 
 
 		 149 aa  260  4e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000928974  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04070  50S ribosomal protein L9  79.05 
 
 		 149 aa  234  2e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3790  ribosomal protein L9  79.05 
 
 		 149 aa  234  2e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00574678  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4447  50S ribosomal protein L9  79.05 
 
 		 149 aa  234  2e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3810  50S ribosomal protein L9  79.05 
 
 		 149 aa  234  2e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0581092 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04032  hypothetical protein  79.05 
 
 		 149 aa  234  2e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4764  50S ribosomal protein L9  79.05 
 
 		 149 aa  234  2e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4736  50S ribosomal protein L9  79.05 
 
 		 149 aa  234  2e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.257928  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4673  50S ribosomal protein L9  79.05 
 
 		 149 aa  234  2e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5718  50S ribosomal protein L9  79.05 
 
 		 149 aa  234  2e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.595872  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0777  50S ribosomal protein L9  79.05 
 
 		 149 aa  233  8e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000131124  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2763  50S ribosomal protein L9  84 
 
 		 149 aa  231  2.0000000000000002e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4662  50S ribosomal protein L9  77.7 
 
 		 149 aa  231  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0630658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4672  50S ribosomal protein L9  77.7 
 
 		 149 aa  231  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00136692  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4790  50S ribosomal protein L9  77.03 
 
 		 149 aa  230  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.131212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4754  50S ribosomal protein L9  77.03 
 
 		 149 aa  230  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0190714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4812  50S ribosomal protein L9  77.03 
 
 		 149 aa  230  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0162172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0449  50S ribosomal protein L9  75.68 
 
 		 150 aa  225  1e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00474942 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3636  50S ribosomal protein L9  75.51 
 
 		 150 aa  224  3e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0681  50S ribosomal protein L9  75.51 
 
 		 150 aa  224  3e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3781  50S ribosomal protein L9  75.51 
 
 		 150 aa  224  3e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3281  50S ribosomal protein L9  75.68 
 
 		 150 aa  219  9.999999999999999e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.134585  hitchhiker  0.000210385 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3589  50S ribosomal protein L9  72.97 
 
 		 150 aa  219  9.999999999999999e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.229017  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4209  50S ribosomal protein L9  74.32 
 
 		 150 aa  218  1.9999999999999999e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.828057  hitchhiker  0.000279421 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0760  50S ribosomal protein L9  73.65 
 
 		 150 aa  218  1.9999999999999999e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.242158  hitchhiker  0.000000266441 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03776  50S ribosomal protein L9  72.97 
 
 		 150 aa  218  3e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3432  50S ribosomal protein L9  75 
 
 		 150 aa  210  4.9999999999999996e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0102132  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0418  ribosomal protein L9  69.59 
 
 		 150 aa  209  1e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.291311  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1435  50S ribosomal protein L9  67.57 
 
 		 149 aa  204  3e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0986557  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0374  50S ribosomal protein L9  75 
 
 		 149 aa  204  3e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0230672  normal  0.0319555 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3583  50S ribosomal protein L9  73.65 
 
 		 150 aa  201  3e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.237319  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3927  50S ribosomal protein L9  72.97 
 
 		 150 aa  199  9.999999999999999e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3348  50S ribosomal protein L9  71.62 
 
 		 150 aa  197  3e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000169987  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3744  50S ribosomal protein L9  76.19 
 
 		 150 aa  197  6e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00940058  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0756  50S ribosomal protein L9  72.97 
 
 		 150 aa  196  1.0000000000000001e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000105777  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3061  50S ribosomal protein L9  76.64 
 
 		 149 aa  192  9e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.746376  normal  0.220477 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0518  50S ribosomal protein L9  76.47 
 
 		 150 aa  191  3e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.497123  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3257  50S ribosomal protein L9  75.74 
 
 		 150 aa  191  4e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000119388  hitchhiker  0.0000104179 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0690  50S ribosomal protein L9  75.74 
 
 		 150 aa  191  4e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00390945  hitchhiker  0.000308121 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0704  50S ribosomal protein L9  75.74 
 
 		 150 aa  191  4e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000907287  hitchhiker  0.000477361 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0797  50S ribosomal protein L9  76.35 
 
 		 150 aa  189  7e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0000346105  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0714  50S ribosomal protein L9  76.47 
 
 		 150 aa  189  1e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.494511  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0735  50S ribosomal protein L9  76.47 
 
 		 150 aa  189  1e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0626075  hitchhiker  0.0000000116035 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0744  50S ribosomal protein L9  76.47 
 
 		 150 aa  189  1e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00359024  hitchhiker  0.000144513 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3640  50S ribosomal protein L9  75.74 
 
 		 150 aa  187  4e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00911662  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07670  50S ribosomal protein L9  64.63 
 
 		 148 aa  187  4e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.957501  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0571  ribosomal protein L9  60.81 
 
 		 150 aa  186  1e-46  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.409562  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3422  ribosomal protein L9  70.67 
 
 		 150 aa  176  1e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.182798 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0648  50S ribosomal protein L9  63.76 
 
 		 148 aa  174  4e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000594391 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4930  ribosomal protein L9  63.5 
 
 		 148 aa  166  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.958603  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0584  50S ribosomal protein L9  63.5 
 
 		 148 aa  166  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.724404 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0222  ribosomal protein L9  56.67 
 
 		 151 aa  165  2e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4931  50S ribosomal protein L9  58.39 
 
 		 148 aa  165  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000100703 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4665  50S ribosomal protein L9  58.39 
 
 		 148 aa  164  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0656931 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0537  50S ribosomal protein L9  63.24 
 
 		 148 aa  164  4e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233659 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0586  50S ribosomal protein L9  58 
 
 		 150 aa  164  4e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.482938  hitchhiker  3.77539e-17 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1642  50S ribosomal protein L9  59.33 
 
 		 164 aa  163  6.9999999999999995e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0557513  normal  0.0367892 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0891  50S ribosomal protein L9P  62.16 
 
 		 148 aa  162  1.0000000000000001e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5659  50S ribosomal protein L9  65.54 
 
 		 148 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.935785  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65150  50S ribosomal protein L9  65.54 
 
 		 148 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0926  ribosomal protein L9  64.54 
 
 		 150 aa  160  4.0000000000000004e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.50143  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3462  ribosomal protein L9  63.51 
 
 		 147 aa  159  9e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4874  50S ribosomal protein L9  59.12 
 
 		 148 aa  159  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1436  50S ribosomal protein L9  49.33 
 
 		 149 aa  159  1e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1361  ribosomal protein L9  60.67 
 
 		 150 aa  159  1e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4755  50S ribosomal protein L9  59.12 
 
 		 148 aa  159  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.824983  normal  0.0743731 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00744  50S ribosomal protein L9  55.48 
 
 		 149 aa  159  2e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.73532  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3666  50S ribosomal protein L9  56 
 
 		 149 aa  157  3e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.006093  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1547  50S ribosomal protein L9  48.67 
 
 		 149 aa  158  3e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1059  LSU ribosomal protein L9P / transcriptional regulator GntR family protein  60 
 
 		 152 aa  157  7e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2102  50S ribosomal protein L9P  54.42 
 
 		 149 aa  155  2e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2383  50S ribosomal protein L9  62.84 
 
 		 148 aa  152  1e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1030  50S ribosomal protein L9  57.33 
 
 		 170 aa  152  2e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1339  50S ribosomal protein L9  57.33 
 
 		 166 aa  151  2.9999999999999998e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.361215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1381  ribosomal protein L9  60.93 
 
 		 150 aa  150  5.9999999999999996e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2827  ribosomal protein L9  53.74 
 
 		 150 aa  148  2e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2587  50S ribosomal protein L9  56.2 
 
 		 150 aa  148  2e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.800649 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2035  ribosomal protein L9  61.9 
 
 		 148 aa  146  8e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0820027  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1329  50S ribosomal protein L9P  57.14 
 
 		 148 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.556068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1780  50S ribosomal protein L9  51.02 
 
 		 150 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1808  50S ribosomal protein L9  51.02 
 
 		 150 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.432428  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1403  50S ribosomal protein L9  50.34 
 
 		 150 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.318005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5171  50S ribosomal protein L9  51.02 
 
 		 150 aa  144  5e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1894  50S ribosomal protein L9  50.34 
 
 		 150 aa  143  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000492255  hitchhiker  0.000000062237 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6208  50S ribosomal protein L9  50.34 
 
 		 150 aa  143  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1871  50S ribosomal protein L9  50.34 
 
 		 150 aa  143  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.539407  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2050  50S ribosomal protein L9  50.68 
 
 		 149 aa  143  1e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.889408  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2131  50S ribosomal protein L9  50.68 
 
 		 149 aa  143  1e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.103333  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5226  ribosomal protein L9  53.42 
 
 		 150 aa  142  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0654  50S ribosomal protein L9  50.68 
 
 		 150 aa  140  4e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1219  50S ribosomal protein L9P  57.43 
 
 		 148 aa  140  8e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.405746 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1932  ribosomal protein L9  64.49 
 
 		 149 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0914  50S ribosomal protein L9  54.07 
 
 		 150 aa  138  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.334096 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0984  50S ribosomal protein L9  51.82 
 
 		 150 aa  134  5e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1948  ribosomal protein L9  51.02 
 
 		 151 aa  133  8e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0452  50S ribosomal protein L9  50 
 
 		 189 aa  131  1.9999999999999998e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.206752  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1310  50S ribosomal protein L9  54.81 
 
 		 150 aa  130  3.9999999999999996e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0458  50S ribosomal protein L9  50 
 
 		 189 aa  130  5e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>