More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1359 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_1359  ribosomal protein L9  100 
 
 
151 aa  290  5e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0122536  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0132  50S ribosomal protein L9P  46.62 
 
 
150 aa  140  5e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.191578  normal  0.450064 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2535  ribosomal protein L9  44.59 
 
 
148 aa  133  9e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000849852  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0654  ribosomal protein L9  43.54 
 
 
146 aa  130  9e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.233351  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3757  50S ribosomal protein L9  43.54 
 
 
148 aa  125  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2257  50S ribosomal protein L9  45.27 
 
 
148 aa  124  4.0000000000000003e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000108464  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0851  50S ribosomal protein L9P  40 
 
 
149 aa  123  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0602  ribosomal protein L9  43.92 
 
 
159 aa  122  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2972  50S ribosomal protein L9  44.83 
 
 
148 aa  122  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2650  50S ribosomal protein L9  44.83 
 
 
148 aa  122  2e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.502254  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0165  50S ribosomal protein L9  41.89 
 
 
148 aa  120  5e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000317895  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3412  50S ribosomal protein L9  46.9 
 
 
149 aa  120  6e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3303  ribosomal protein L9  44.52 
 
 
149 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204917  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0161  50S ribosomal protein L9  41.89 
 
 
148 aa  119  9.999999999999999e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000723092  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0881  50S ribosomal protein L9  49.32 
 
 
148 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00774862  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4931  50S ribosomal protein L9  43.92 
 
 
148 aa  118  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.108353  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0081  50S ribosomal protein L9  41.1 
 
 
148 aa  117  3.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.957353  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2911  ribosomal protein L9  42.76 
 
 
147 aa  117  4.9999999999999996e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000198897  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37780  LSU ribosomal protein L9P  36.23 
 
 
149 aa  117  4.9999999999999996e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.236654  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0117  50S ribosomal protein L9  41.89 
 
 
151 aa  117  6e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0894  50S ribosomal protein L9  47.55 
 
 
149 aa  116  7.999999999999999e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000571684  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0064  50S ribosomal protein L9  47.3 
 
 
149 aa  116  9e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23320  ribosomal protein L9  50 
 
 
147 aa  116  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.507738  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2212  50S ribosomal protein L9  40.74 
 
 
150 aa  116  9.999999999999999e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5262  50S ribosomal protein L9  45.52 
 
 
148 aa  115  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00409171  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0064  50S ribosomal protein L9  47.3 
 
 
149 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.452229  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2388  50S ribosomal protein L9  43.24 
 
 
147 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2509  50S ribosomal protein L9  42.57 
 
 
151 aa  114  5e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000781135  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3697  ribosomal protein L9  36.11 
 
 
149 aa  114  5e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0150  50S ribosomal protein L9  41.22 
 
 
151 aa  114  6e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157053  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0116  50S ribosomal protein L9  41.89 
 
 
149 aa  114  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2925  ribosomal protein L9  42.11 
 
 
147 aa  113  6.9999999999999995e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0843322  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2135  ribosomal protein L9  44.36 
 
 
148 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000758155  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1814  ribosomal protein L9  35.81 
 
 
149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4351  ribosomal protein L9  41.1 
 
 
148 aa  111  3e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1150  50S ribosomal protein L9  38.67 
 
 
165 aa  112  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0292661  hitchhiker  0.00494207 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0011  50S ribosomal protein L9  38.1 
 
 
150 aa  110  5e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.557694  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0123  50S ribosomal protein L9  40.54 
 
 
149 aa  110  5e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0134  50S ribosomal protein L9  40.54 
 
 
149 aa  110  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4009  50S ribosomal protein L9  47.59 
 
 
148 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.015297  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2130  50S ribosomal protein L9  34.97 
 
 
149 aa  110  8.000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.929246  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2841  50S ribosomal protein L9  43.92 
 
 
148 aa  110  9e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000145753  hitchhiker  0.000000000000102152 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0097  50S ribosomal protein L9  39.86 
 
 
151 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.625219  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3352  ribosomal protein L9  36.91 
 
 
151 aa  110  1.0000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.600621  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2610  50S ribosomal protein L9  44 
 
 
147 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.196058  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0830  ribosomal protein L9  40.14 
 
 
149 aa  109  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.211438  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0668  50S ribosomal protein L9  44.59 
 
 
148 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00124479  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31750  LSU ribosomal protein L9P  36.43 
 
 
157 aa  108  2.0000000000000002e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4946  ribosomal protein L9  36.43 
 
 
148 aa  108  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0110  50S ribosomal protein L9  39.19 
 
 
151 aa  108  3e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000508651  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0761  50S ribosomal protein L9  42.67 
 
 
151 aa  108  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000425439  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3528  50S ribosomal protein L9  40.54 
 
 
168 aa  107  5e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.156676  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5322  50S ribosomal protein L9  45.52 
 
 
148 aa  107  6e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5150  50S ribosomal protein L9  45.52 
 
 
148 aa  107  6e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000483517  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5166  50S ribosomal protein L9  45.52 
 
 
148 aa  107  6e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0461945  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5579  50S ribosomal protein L9  45.52 
 
 
148 aa  107  6e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.17506e-22 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5718  50S ribosomal protein L9  45.52 
 
 
148 aa  107  6e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000626689  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4178  ribosomal protein L9  33.57 
 
 
151 aa  107  8.000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5596  50S ribosomal protein L9  44.44 
 
 
148 aa  106  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000245736  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4841  ribosomal protein L9  33.57 
 
 
148 aa  106  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5620  50S ribosomal protein L9  43.65 
 
 
148 aa  105  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000412151  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3675  50S ribosomal protein L9  43.92 
 
 
147 aa  105  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0017578  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1775  50S ribosomal protein L9  39.19 
 
 
149 aa  105  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000651865  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4542  50S ribosomal protein L9  39.04 
 
 
152 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.736351 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3541  50S ribosomal protein L9  46.21 
 
 
149 aa  105  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5657  50S ribosomal protein L9  43.65 
 
 
148 aa  105  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000227696  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0561  ribosomal protein L9  45.81 
 
 
149 aa  105  2e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.204129  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1096  50S ribosomal protein L9  40.69 
 
 
160 aa  105  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.547655  normal  0.0167988 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5339  50S ribosomal protein L9  43.65 
 
 
148 aa  105  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000103383  hitchhiker  0.00000000147927 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0287  ribosomal protein L9  36.42 
 
 
152 aa  104  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0120134  normal  0.0123082 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3558  50S ribosomal protein L9  34.69 
 
 
148 aa  104  4e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.882223 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3092  50S ribosomal protein L9  35.04 
 
 
148 aa  104  4e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0370883  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1422  50S ribosomal protein L9  42.67 
 
 
151 aa  104  5e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0660955  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2022  50S ribosomal protein L9  37.06 
 
 
168 aa  103  6e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.278988  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5913  ribosomal protein L9  34.72 
 
 
150 aa  103  6e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2559  50S ribosomal protein L9  39.47 
 
 
152 aa  103  6e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0448  50S ribosomal protein L9  40 
 
 
148 aa  103  6e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000315624  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2002  50S ribosomal protein L9  39.33 
 
 
153 aa  103  9e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0148705  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2522  ribosomal protein L9  34.44 
 
 
150 aa  102  1e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.559663  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1828  50S ribosomal protein L9  41.89 
 
 
168 aa  103  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0023  ribosomal protein L9  32.41 
 
 
174 aa  103  1e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.725827  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26560  LSU ribosomal protein L9P  36.49 
 
 
148 aa  103  1e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.199017 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18821  50S ribosomal protein L9  40.26 
 
 
151 aa  102  2e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0277205  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1765  50S ribosomal protein L9  40.26 
 
 
151 aa  101  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1996  50S ribosomal protein L9  37.93 
 
 
148 aa  101  4e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0311  ribosomal protein L9  37.75 
 
 
148 aa  101  4e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0979697 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18631  50S ribosomal protein L9  39.61 
 
 
151 aa  100  5e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1692  50S ribosomal protein L9  37.75 
 
 
149 aa  100  5e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1410  50S ribosomal protein L9  36.88 
 
 
171 aa  100  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000225617  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0334  50S ribosomal protein L9  32 
 
 
151 aa  100  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.801723 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4336  50S ribosomal protein L9  32.43 
 
 
150 aa  99.4  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0120  50S ribosomal protein L9  39.86 
 
 
149 aa  99  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0927016  normal  0.199932 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1216  50S ribosomal protein L9  38.41 
 
 
148 aa  98.6  2e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18001  50S ribosomal protein L9  36.81 
 
 
152 aa  99  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2761  50S ribosomal protein L9  39.31 
 
 
147 aa  98.6  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4553  50S ribosomal protein L9  35.25 
 
 
148 aa  98.6  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.156994  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5065  50S ribosomal protein L9  34.53 
 
 
148 aa  98.2  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.972236  hitchhiker  0.000155251 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0566  50S ribosomal protein L9  35.53 
 
 
189 aa  98.2  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2188  50S ribosomal protein L9  37.5 
 
 
209 aa  97.8  4e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0491  ribosomal protein L9  35.04 
 
 
179 aa  98.2  4e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>