More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_2542 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_2542  50S ribosomal protein L9  100 
 
 		 152 aa  308  2e-83  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2193  50S ribosomal protein L9  91.45 
 
 		 152 aa  286  1e-76  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28961  50S ribosomal protein L9  86.18 
 
 		 152 aa  271  3e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18001  50S ribosomal protein L9  77.63 
 
 		 152 aa  243  6.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21431  50S ribosomal protein L9  76.97 
 
 		 152 aa  243  8e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1272  50S ribosomal protein L9  76.32 
 
 		 152 aa  242  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18631  50S ribosomal protein L9  68.46 
 
 		 151 aa  220  6e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.58702  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18631  50S ribosomal protein L9  70.47 
 
 		 151 aa  219  8e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18821  50S ribosomal protein L9  69.8 
 
 		 151 aa  218  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0277205  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1765  50S ribosomal protein L9  69.13 
 
 		 151 aa  216  1e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2559  50S ribosomal protein L9  65.1 
 
 		 152 aa  198  1.9999999999999998e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2852  50S ribosomal protein L9  60.4 
 
 		 152 aa  179  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3244  50S ribosomal protein L9  60.4 
 
 		 152 aa  179  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.65089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4542  50S ribosomal protein L9  57.72 
 
 		 152 aa  170  7.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.736351 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1460  50S ribosomal protein L9  51.32 
 
 		 152 aa  149  1e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0890745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0287  ribosomal protein L9  52 
 
 		 152 aa  143  9e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0120134  normal  0.0123082 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0329  50S ribosomal protein L9  52 
 
 		 152 aa  142  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.355323  normal  0.434143 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2897  50S ribosomal protein L9  52.32 
 
 		 152 aa  142  2e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000174347  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0654  ribosomal protein L9  40.69 
 
 		 146 aa  106  9.000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.233351  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4351  ribosomal protein L9  38.93 
 
 		 148 aa  106  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2911  ribosomal protein L9  39.31 
 
 		 147 aa  105  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000198897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0602  ribosomal protein L9  39.73 
 
 		 159 aa  101  4e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3558  50S ribosomal protein L9  37.16 
 
 		 148 aa  99.4  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.882223 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4737  ribosomal protein L9  38.51 
 
 		 150 aa  99.4  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3697  ribosomal protein L9  41.22 
 
 		 149 aa  99  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4117  50S ribosomal protein L9  42.18 
 
 		 150 aa  98.6  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0597  50S ribosomal protein L9  40.27 
 
 		 179 aa  98.6  3e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9354  50S ribosomal protein L9P  37.25 
 
 		 148 aa  98.6  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.837132 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0851  50S ribosomal protein L9P  38.1 
 
 		 149 aa  98.6  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0134  50S ribosomal protein L9  44.52 
 
 		 149 aa  97.4  7e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0123  50S ribosomal protein L9  44.52 
 
 		 149 aa  97.4  7e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09988  ribosomal protein L9  36.08 
 
 		 149 aa  97.1  9e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.536224  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3528  50S ribosomal protein L9  37.58 
 
 		 168 aa  96.3  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.156676  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0116  50S ribosomal protein L9  43.84 
 
 		 149 aa  96.3  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1479  50S ribosomal protein L9  38.71 
 
 		 147 aa  95.5  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00653221 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7042  ribosomal protein L9  39.86 
 
 		 151 aa  95.9  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1063  ribosomal protein L9  39.6 
 
 		 147 aa  95.9  2e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.342712  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5065  ribosomal protein L9  40.41 
 
 		 151 aa  95.9  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.366091  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2761  50S ribosomal protein L9  38.71 
 
 		 147 aa  95.1  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2841  50S ribosomal protein L9  41.78 
 
 		 148 aa  94.7  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000145753  hitchhiker  0.000000000000102152 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3352  ribosomal protein L9  39.73 
 
 		 151 aa  94.7  4e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.600621  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4166  ribosomal protein L9  40.54 
 
 		 150 aa  94.7  4e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0761  50S ribosomal protein L9  41.89 
 
 		 151 aa  94.4  5e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000425439  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3888  50S ribosomal protein L9  42.18 
 
 		 150 aa  94.4  5e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00361277 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1814  ribosomal protein L9  39.04 
 
 		 149 aa  94  6e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31750  LSU ribosomal protein L9P  34.93 
 
 		 157 aa  94  7e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29830  Plastid ribosomal protein L9, imported to chloroplast, large ribosomal subunit  38.81 
 
 		 195 aa  93.2  1e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3480  50S ribosomal protein L9  36.73 
 
 		 146 aa  92.8  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.34024  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26560  LSU ribosomal protein L9P  39.87 
 
 		 148 aa  93.2  1e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.199017 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00020  50S ribosomal protein L9  40.79 
 
 		 150 aa  93.2  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0668  50S ribosomal protein L9  41.33 
 
 		 148 aa  92.4  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00124479  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3092  50S ribosomal protein L9  37.16 
 
 		 148 aa  92  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0370883  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5065  50S ribosomal protein L9  36.73 
 
 		 148 aa  92.4  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.972236  hitchhiker  0.000155251 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2610  50S ribosomal protein L9  39.04 
 
 		 147 aa  92.4  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.196058  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0081  50S ribosomal protein L9  35.57 
 
 		 148 aa  92  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.957353  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39420  LSU ribosomal protein L9P  38.26 
 
 		 152 aa  91.7  3e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1150  50S ribosomal protein L9  37.25 
 
 		 165 aa  91.7  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0292661  hitchhiker  0.00494207 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4553  50S ribosomal protein L9  36.73 
 
 		 148 aa  91.7  4e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.156994  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2102  50S ribosomal protein L9P  36.91 
 
 		 149 aa  90.9  5e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3675  50S ribosomal protein L9  36.99 
 
 		 147 aa  91.3  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0017578  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002335  LSU ribosomal protein L9p  39.47 
 
 		 150 aa  90.9  6e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.178305  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0534  ribosomal protein L9  37.58 
 
 		 149 aa  90.5  8e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07670  50S ribosomal protein L9  38.26 
 
 		 148 aa  90.5  8e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.957501  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4506  ribosomal protein L9  38.31 
 
 		 149 aa  89.7  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.594005  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4178  ribosomal protein L9  36.3 
 
 		 151 aa  89.7  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0150  50S ribosomal protein L9  36.3 
 
 		 151 aa  89.7  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157053  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2522  ribosomal protein L9  40.54 
 
 		 150 aa  89.7  1e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.559663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0132  50S ribosomal protein L9P  37.09 
 
 		 150 aa  90.1  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.191578  normal  0.450064 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4946  ribosomal protein L9  34.25 
 
 		 148 aa  89.7  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5171  50S ribosomal protein L9  38.93 
 
 		 150 aa  88.6  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1410  50S ribosomal protein L9  37.84 
 
 		 171 aa  89.4  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000225617  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10055  50S ribosomal protein L9  38 
 
 		 152 aa  89  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.95125e-19  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0449  50S ribosomal protein L9  35.14 
 
 		 150 aa  89  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00474942 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3303  ribosomal protein L9  37.58 
 
 		 149 aa  89.4  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204917  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1808  50S ribosomal protein L9  38.26 
 
 		 150 aa  89.4  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.432428  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1780  50S ribosomal protein L9  38.26 
 
 		 150 aa  89.4  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2130  50S ribosomal protein L9  37.16 
 
 		 149 aa  88.6  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.929246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2028  50S ribosomal protein L9  36.73 
 
 		 167 aa  88.6  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.728229  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4841  ribosomal protein L9  37.09 
 
 		 148 aa  88.6  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1948  ribosomal protein L9  37.58 
 
 		 151 aa  88.6  3e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0877  50S ribosomal protein L9  36 
 
 		 151 aa  88.2  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6031  50S ribosomal protein L9  37.33 
 
 		 151 aa  88.6  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.827335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2383  50S ribosomal protein L9  38.51 
 
 		 148 aa  88.6  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2780  50S ribosomal protein L9  39.47 
 
 		 149 aa  88.6  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000928974  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4519  50S ribosomal protein L9  37.58 
 
 		 148 aa  88.2  4e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.986951  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23230  LSU ribosomal protein L9P  37.67 
 
 		 153 aa  88.2  4e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1894  50S ribosomal protein L9  38.26 
 
 		 150 aa  87.8  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000492255  hitchhiker  0.000000062237 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1359  ribosomal protein L9  34.72 
 
 		 151 aa  87.8  5e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0122536  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1642  50S ribosomal protein L9  35.66 
 
 		 164 aa  87.8  5e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0557513  normal  0.0367892 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1329  50S ribosomal protein L9P  38.93 
 
 		 148 aa  87.8  5e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.556068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6208  50S ribosomal protein L9  38.26 
 
 		 150 aa  87.8  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1871  50S ribosomal protein L9  38.26 
 
 		 150 aa  87.8  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.539407  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0120  50S ribosomal protein L9  42.34 
 
 		 149 aa  87.4  6e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0927016  normal  0.199932 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0334  50S ribosomal protein L9  36.99 
 
 		 151 aa  87.4  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.801723 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0586  50S ribosomal protein L9  39.01 
 
 		 150 aa  87.4  7e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.482938  hitchhiker  3.77539e-17 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0023  ribosomal protein L9  37.06 
 
 		 174 aa  86.3  1e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.725827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2332  ribosomal protein L9  40.14 
 
 		 170 aa  86.7  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.640711  hitchhiker  0.00706783 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2925  ribosomal protein L9  36.11 
 
 		 147 aa  86.3  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0843322  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3281  50S ribosomal protein L9  36.49 
 
 		 150 aa  86.7  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.134585  hitchhiker  0.000210385 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1339  50S ribosomal protein L9  38.46 
 
 		 166 aa  85.5  2e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.361215  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>