More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_2911 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_2911  ribosomal protein L9  100 
 
 
147 aa  287  3e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000198897  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2925  ribosomal protein L9  53.47 
 
 
147 aa  144  6e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0843322  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4931  50S ribosomal protein L9  53.79 
 
 
148 aa  141  4e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.108353  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0132  50S ribosomal protein L9P  48.28 
 
 
150 aa  138  3e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.191578  normal  0.450064 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3558  50S ribosomal protein L9  45.52 
 
 
148 aa  137  3.9999999999999997e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.882223 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0602  ribosomal protein L9  46.53 
 
 
159 aa  137  4.999999999999999e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2188  50S ribosomal protein L9  44.14 
 
 
209 aa  137  6e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4351  ribosomal protein L9  47.59 
 
 
148 aa  135  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2535  ribosomal protein L9  50.33 
 
 
148 aa  134  4e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000849852  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2388  50S ribosomal protein L9  51.39 
 
 
147 aa  133  7.000000000000001e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4946  ribosomal protein L9  43.84 
 
 
148 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2509  50S ribosomal protein L9  43.06 
 
 
151 aa  130  5e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000781135  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0141  50S ribosomal protein L9  45.52 
 
 
189 aa  130  6.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0097  50S ribosomal protein L9  43.75 
 
 
151 aa  130  6.999999999999999e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.625219  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1774  50S ribosomal protein L9  45.52 
 
 
189 aa  130  6.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0761  50S ribosomal protein L9  47.59 
 
 
151 aa  130  7.999999999999999e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000425439  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0150  50S ribosomal protein L9  41.67 
 
 
151 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157053  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0165  50S ribosomal protein L9  43.75 
 
 
148 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000317895  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2306  50S ribosomal protein L9  42.07 
 
 
189 aa  128  3e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.891012  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1350  50S ribosomal protein L9  43.45 
 
 
189 aa  127  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0676227  normal  0.268494 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0110  50S ribosomal protein L9  43.06 
 
 
151 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000508651  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3303  ribosomal protein L9  45.58 
 
 
149 aa  127  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204917  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0901  50S ribosomal protein L9  43.45 
 
 
189 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0476125 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2841  50S ribosomal protein L9  43.45 
 
 
148 aa  127  7.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000145753  hitchhiker  0.000000000000102152 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2610  50S ribosomal protein L9  44.83 
 
 
147 aa  127  7.000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.196058  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9354  50S ribosomal protein L9P  42.76 
 
 
148 aa  127  7.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.837132 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0668  50S ribosomal protein L9  45.52 
 
 
148 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00124479  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0654  ribosomal protein L9  45.14 
 
 
146 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.233351  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3757  50S ribosomal protein L9  43.45 
 
 
148 aa  125  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0566  50S ribosomal protein L9  39.31 
 
 
189 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0889  50S ribosomal protein L9  42.76 
 
 
194 aa  125  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.301047  normal  0.514488 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4414  50S ribosomal protein L9  43.45 
 
 
190 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.248049 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4336  50S ribosomal protein L9  43.54 
 
 
150 aa  124  6e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3675  50S ribosomal protein L9  42.76 
 
 
147 aa  123  8.000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0017578  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4535  50S ribosomal protein L9  42.76 
 
 
153 aa  123  9e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.323692 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3363  ribosomal protein L9  40 
 
 
201 aa  123  9e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0452  50S ribosomal protein L9  40 
 
 
189 aa  122  1e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.206752  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3939  50S ribosomal protein L9  42.76 
 
 
190 aa  123  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.613806  normal  0.190537 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2257  50S ribosomal protein L9  46.21 
 
 
148 aa  122  1e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000108464  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0117  50S ribosomal protein L9  43.06 
 
 
151 aa  122  1e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3121  ribosomal protein L9  41.38 
 
 
193 aa  123  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4307  50S ribosomal protein L9  42.76 
 
 
190 aa  123  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0939755 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2022  50S ribosomal protein L9  40.28 
 
 
168 aa  122  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.278988  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0081  50S ribosomal protein L9  44.83 
 
 
148 aa  122  2e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.957353  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0458  50S ribosomal protein L9  40 
 
 
189 aa  122  2e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4841  ribosomal protein L9  40 
 
 
148 aa  122  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2761  50S ribosomal protein L9  42.07 
 
 
147 aa  122  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1479  50S ribosomal protein L9  42.07 
 
 
147 aa  122  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00653221 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0491  ribosomal protein L9  35.86 
 
 
179 aa  122  2e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3092  50S ribosomal protein L9  42.76 
 
 
148 aa  121  3e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0370883  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4178  ribosomal protein L9  42.36 
 
 
151 aa  121  3e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5418  50S ribosomal protein L9  42.76 
 
 
190 aa  121  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0206045  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1620  50S ribosomal protein L9  43.45 
 
 
211 aa  121  3e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0645747  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1043  50S ribosomal protein L9  42.76 
 
 
204 aa  120  4e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0955164 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0851  50S ribosomal protein L9P  40.54 
 
 
149 aa  121  4e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2130  50S ribosomal protein L9  40.69 
 
 
149 aa  120  5e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.929246  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1814  ribosomal protein L9  44.14 
 
 
149 aa  120  6e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2510  50S ribosomal protein L9  41.22 
 
 
194 aa  120  7e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.531472  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3040  50S ribosomal protein L9  42.07 
 
 
188 aa  120  7e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.186174 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23320  ribosomal protein L9  51.37 
 
 
147 aa  119  9e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.507738  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0448  50S ribosomal protein L9  39.19 
 
 
148 aa  119  9.999999999999999e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000315624  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7042  ribosomal protein L9  42.28 
 
 
151 aa  119  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0161  50S ribosomal protein L9  40.28 
 
 
148 aa  118  3e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000723092  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1692  50S ribosomal protein L9  44.44 
 
 
149 aa  118  3e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3412  50S ribosomal protein L9  45.64 
 
 
149 aa  117  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5065  50S ribosomal protein L9  39.31 
 
 
148 aa  117  4.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.972236  hitchhiker  0.000155251 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4519  50S ribosomal protein L9  40.14 
 
 
148 aa  117  6e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.986951  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0334  50S ribosomal protein L9  43.06 
 
 
151 aa  117  7e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.801723 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4166  ribosomal protein L9  45.95 
 
 
150 aa  116  7.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1352  50S ribosomal protein L9  38.19 
 
 
167 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1403  50S ribosomal protein L9  42.07 
 
 
150 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.318005  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5171  50S ribosomal protein L9  42.76 
 
 
150 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1894  50S ribosomal protein L9  42.76 
 
 
150 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000492255  hitchhiker  0.000000062237 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2249  50S ribosomal protein L9  43.45 
 
 
150 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.128176  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6208  50S ribosomal protein L9  42.76 
 
 
150 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1780  50S ribosomal protein L9  42.07 
 
 
150 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3697  ribosomal protein L9  39.58 
 
 
149 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37780  LSU ribosomal protein L9P  42.36 
 
 
149 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.236654  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1808  50S ribosomal protein L9  42.07 
 
 
150 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.432428  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1871  50S ribosomal protein L9  42.76 
 
 
150 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.539407  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7309  50S ribosomal protein L9  37.41 
 
 
148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.937449  normal  0.0304173 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4737  ribosomal protein L9  43.54 
 
 
150 aa  115  3e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1096  50S ribosomal protein L9  40.97 
 
 
160 aa  115  3e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.547655  normal  0.0167988 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4553  50S ribosomal protein L9  38.62 
 
 
148 aa  114  3.9999999999999997e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.156994  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1516  50S ribosomal protein L9  36.55 
 
 
191 aa  114  5e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101233  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31750  LSU ribosomal protein L9P  39.86 
 
 
157 aa  114  6e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2458  50S ribosomal protein L9P  42.36 
 
 
149 aa  114  6e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.174518 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5226  ribosomal protein L9  42.07 
 
 
150 aa  113  7.999999999999999e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39420  LSU ribosomal protein L9P  41.5 
 
 
152 aa  113  7.999999999999999e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0738  50S ribosomal protein L9  36.55 
 
 
191 aa  113  8.999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.823068  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2102  50S ribosomal protein L9P  40.69 
 
 
149 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2593  50S ribosomal protein L9  42.54 
 
 
189 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0267673 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2212  50S ribosomal protein L9  43.7 
 
 
150 aa  112  1.0000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3666  50S ribosomal protein L9  40.41 
 
 
149 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.006093  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5262  50S ribosomal protein L9  44.59 
 
 
148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00409171  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0011  50S ribosomal protein L9  43.33 
 
 
150 aa  112  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.557694  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2522  ribosomal protein L9  39.16 
 
 
150 aa  111  3e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.559663  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2827  ribosomal protein L9  42.76 
 
 
150 aa  111  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4634  50S ribosomal protein L9  42.54 
 
 
189 aa  111  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.269406  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2028  50S ribosomal protein L9  37.58 
 
 
167 aa  111  3e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.728229  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>