More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_27890 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_27890  ribosomal protein L9  100 
 
 		 181 aa  348  2e-95  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00233062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0025  ribosomal protein L9  64.67 
 
 		 178 aa  199  9.999999999999999e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00173008  normal  0.984167 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0023  ribosomal protein L9  60.27 
 
 		 174 aa  176  2e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.725827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11530  ribosomal protein L9  53.06 
 
 		 191 aa  158  4e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0446546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2509  50S ribosomal protein L9  46.15 
 
 		 151 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000781135  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4519  50S ribosomal protein L9  43.92 
 
 		 148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.986951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0117  50S ribosomal protein L9  45.45 
 
 		 151 aa  114  5e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0150  50S ribosomal protein L9  44.83 
 
 		 151 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157053  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1352  50S ribosomal protein L9  39.64 
 
 		 167 aa  110  8.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0110  50S ribosomal protein L9  40 
 
 		 151 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000508651  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7309  50S ribosomal protein L9  40.54 
 
 		 148 aa  107  7.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.937449  normal  0.0304173 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0097  50S ribosomal protein L9  42.66 
 
 		 151 aa  107  8.000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.625219  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4553  50S ribosomal protein L9  44.83 
 
 		 148 aa  106  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.156994  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5065  50S ribosomal protein L9  44.14 
 
 		 148 aa  106  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.972236  hitchhiker  0.000155251 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0161  50S ribosomal protein L9  40.69 
 
 		 148 aa  106  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000723092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0334  50S ribosomal protein L9  42.36 
 
 		 151 aa  105  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.801723 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1410  50S ribosomal protein L9  44.52 
 
 		 171 aa  104  6e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000225617  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0165  50S ribosomal protein L9  40.69 
 
 		 148 aa  103  9e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000317895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0448  50S ribosomal protein L9  39.73 
 
 		 148 aa  103  1e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000315624  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9354  50S ribosomal protein L9P  39.16 
 
 		 148 aa  102  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.837132 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0132  50S ribosomal protein L9P  39.31 
 
 		 150 aa  103  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.191578  normal  0.450064 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2130  50S ribosomal protein L9  39.86 
 
 		 149 aa  102  4e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.929246  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0668  50S ribosomal protein L9  41.89 
 
 		 148 aa  101  5e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00124479  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2022  50S ribosomal protein L9  36.5 
 
 		 168 aa  101  5e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.278988  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2535  ribosomal protein L9  36.55 
 
 		 148 aa  100  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000849852  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2332  ribosomal protein L9  39.24 
 
 		 170 aa  99.8  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.640711  hitchhiker  0.00706783 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0740  ribosomal protein L9  40 
 
 		 150 aa  99.8  2e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2610  50S ribosomal protein L9  41.89 
 
 		 147 aa  99  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.196058  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0654  ribosomal protein L9  38.62 
 
 		 146 aa  99  3e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.233351  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4946  ribosomal protein L9  38.51 
 
 		 148 aa  98.6  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31750  LSU ribosomal protein L9P  37.5 
 
 		 157 aa  99  4e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2841  50S ribosomal protein L9  40.54 
 
 		 148 aa  98.2  5e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000145753  hitchhiker  0.000000000000102152 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3558  50S ribosomal protein L9  38.51 
 
 		 148 aa  98.2  6e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.882223 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0130  50S ribosomal protein L9  40 
 
 		 149 aa  98.2  6e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0311991 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2925  ribosomal protein L9  36.55 
 
 		 147 aa  97.8  7e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0843322  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4841  ribosomal protein L9  37.76 
 
 		 148 aa  97.4  9e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2028  50S ribosomal protein L9  37.23 
 
 		 167 aa  97.4  9e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.728229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1096  50S ribosomal protein L9  37.24 
 
 		 160 aa  97.4  1e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.547655  normal  0.0167988 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4506  ribosomal protein L9  37.93 
 
 		 149 aa  97.4  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.594005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1814  ribosomal protein L9  35.17 
 
 		 149 aa  96.7  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3675  50S ribosomal protein L9  39.19 
 
 		 147 aa  96.3  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0017578  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7042  ribosomal protein L9  41.38 
 
 		 151 aa  95.5  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3092  50S ribosomal protein L9  39.86 
 
 		 148 aa  95.5  4e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0370883  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2510  50S ribosomal protein L9  37.18 
 
 		 194 aa  95.5  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.531472  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1436  50S ribosomal protein L9  38.89 
 
 		 149 aa  93.6  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0761  50S ribosomal protein L9  40.94 
 
 		 151 aa  94  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000425439  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2257  50S ribosomal protein L9  36.17 
 
 		 148 aa  94  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000108464  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0830  ribosomal protein L9  38.67 
 
 		 149 aa  93.2  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.211438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4336  50S ribosomal protein L9  37.06 
 
 		 150 aa  92.8  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1547  50S ribosomal protein L9  38.19 
 
 		 149 aa  92.4  3e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4535  50S ribosomal protein L9  37.25 
 
 		 153 aa  92.8  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.323692 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0851  50S ribosomal protein L9P  35.62 
 
 		 149 aa  92.4  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5065  ribosomal protein L9  40.14 
 
 		 151 aa  91.3  7e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.366091  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5366  ribosomal protein L9  40.97 
 
 		 151 aa  91.3  7e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2212  50S ribosomal protein L9  43.41 
 
 		 150 aa  91.3  7e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1996  50S ribosomal protein L9  38.35 
 
 		 148 aa  90.9  9e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2761  50S ribosomal protein L9  37.84 
 
 		 147 aa  90.9  9e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1479  50S ribosomal protein L9  37.16 
 
 		 147 aa  90.1  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00653221 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0586  50S ribosomal protein L9  41.1 
 
 		 150 aa  90.5  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.482938  hitchhiker  3.77539e-17 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3888  50S ribosomal protein L9  36.62 
 
 		 150 aa  89.7  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00361277 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4117  50S ribosomal protein L9  36.62 
 
 		 150 aa  89.4  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4178  ribosomal protein L9  37.32 
 
 		 151 aa  89.7  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0534  ribosomal protein L9  40.69 
 
 		 149 aa  89.4  3e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2188  50S ribosomal protein L9  34.39 
 
 		 209 aa  89  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1210  50S ribosomal protein L9  36.79 
 
 		 209 aa  89  3e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0873917  normal  0.750153 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1205  ribosomal protein L9  36.91 
 
 		 151 aa  89  3e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2911  ribosomal protein L9  33.33 
 
 		 147 aa  89  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000198897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1150  50S ribosomal protein L9  36.55 
 
 		 165 aa  89  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0292661  hitchhiker  0.00494207 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3697  ribosomal protein L9  34.03 
 
 		 149 aa  88.6  5e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0081  50S ribosomal protein L9  32.85 
 
 		 148 aa  88.6  5e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.957353  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1043  50S ribosomal protein L9  36.31 
 
 		 204 aa  88.2  5e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0955164 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37780  LSU ribosomal protein L9P  35.42 
 
 		 149 aa  87.4  9e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.236654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1775  50S ribosomal protein L9  37.33 
 
 		 149 aa  87.4  9e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000651865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3303  ribosomal protein L9  34.33 
 
 		 149 aa  87.4  9e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204917  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3528  50S ribosomal protein L9  34.13 
 
 		 168 aa  87.4  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.156676  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2522  ribosomal protein L9  37.5 
 
 		 150 aa  87.4  1e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.559663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0397  hypothetical protein  33.57 
 
 		 149 aa  87.4  1e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0889  50S ribosomal protein L9  34.39 
 
 		 194 aa  87  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.301047  normal  0.514488 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4661  50S ribosomal protein L9P  35.17 
 
 		 148 aa  87  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3666  50S ribosomal protein L9  37.16 
 
 		 149 aa  87  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.006093  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1272  50S ribosomal protein L9  35.62 
 
 		 152 aa  86.7  2e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4737  ribosomal protein L9  39.46 
 
 		 150 aa  86.7  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21431  50S ribosomal protein L9  35.62 
 
 		 152 aa  86.3  2e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3412  50S ribosomal protein L9  36.73 
 
 		 149 aa  85.9  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2388  50S ribosomal protein L9  37.23 
 
 		 147 aa  85.5  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0210  ribosomal protein L9  33.58 
 
 		 172 aa  85.9  3e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000722973  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1828  50S ribosomal protein L9  34.91 
 
 		 168 aa  85.5  4e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0007  50S ribosomal protein L9  35.9 
 
 		 151 aa  85.5  4e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1435  50S ribosomal protein L9  36.67 
 
 		 149 aa  85.5  4e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0986557  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2306  50S ribosomal protein L9  34.73 
 
 		 189 aa  85.5  4e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.891012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39420  LSU ribosomal protein L9P  38.62 
 
 		 152 aa  85.1  5e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3352  ribosomal protein L9  37.93 
 
 		 151 aa  84.7  6e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.600621  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3541  50S ribosomal protein L9  38.62 
 
 		 149 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4414  50S ribosomal protein L9  33.97 
 
 		 190 aa  83.2  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.248049 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4351  ribosomal protein L9  35.37 
 
 		 148 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3939  50S ribosomal protein L9  33.97 
 
 		 190 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.613806  normal  0.190537 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0881  50S ribosomal protein L9  36.55 
 
 		 148 aa  83.2  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00774862  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1918  50S ribosomal protein L9  34.09 
 
 		 196 aa  83.2  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.403674  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26560  LSU ribosomal protein L9P  37.16 
 
 		 148 aa  83.2  0.000000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.199017 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0654  50S ribosomal protein L9  37.09 
 
 		 150 aa  83.2  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>