More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0023 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0023  ribosomal protein L9  100 
 
 		 174 aa  342  2e-93  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.725827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0025  ribosomal protein L9  66.44 
 
 		 178 aa  195  2.0000000000000003e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00173008  normal  0.984167 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27890  ribosomal protein L9  60.27 
 
 		 181 aa  176  2e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00233062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11530  ribosomal protein L9  52.74 
 
 		 191 aa  157  9e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0446546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2925  ribosomal protein L9  43.45 
 
 		 147 aa  127  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0843322  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0740  ribosomal protein L9  40 
 
 		 150 aa  119  1.9999999999999998e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0654  ribosomal protein L9  43.45 
 
 		 146 aa  117  6e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.233351  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2130  50S ribosomal protein L9  42.66 
 
 		 149 aa  114  7.999999999999999e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.929246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2535  ribosomal protein L9  35.86 
 
 		 148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000849852  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0448  50S ribosomal protein L9  40.56 
 
 		 148 aa  111  6e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000315624  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2972  50S ribosomal protein L9  37.93 
 
 		 148 aa  108  4.0000000000000004e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2650  50S ribosomal protein L9  37.93 
 
 		 148 aa  108  4.0000000000000004e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.502254  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31750  LSU ribosomal protein L9P  37.25 
 
 		 157 aa  107  7.000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0132  50S ribosomal protein L9P  38.62 
 
 		 150 aa  105  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.191578  normal  0.450064 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3412  50S ribosomal protein L9  41.38 
 
 		 149 aa  105  3e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0851  50S ribosomal protein L9P  37.93 
 
 		 149 aa  105  4e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3697  ribosomal protein L9  40.97 
 
 		 149 aa  103  8e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3541  50S ribosomal protein L9  42.76 
 
 		 149 aa  103  9e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37780  LSU ribosomal protein L9P  40.14 
 
 		 149 aa  103  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.236654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0161  50S ribosomal protein L9  41.78 
 
 		 148 aa  102  2e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000723092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4336  50S ribosomal protein L9  39.16 
 
 		 150 aa  102  3e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2538  50S ribosomal protein L9  41.26 
 
 		 148 aa  102  4e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2257  50S ribosomal protein L9  34.97 
 
 		 148 aa  102  4e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000108464  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0165  50S ribosomal protein L9  41.78 
 
 		 148 aa  101  7e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000317895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5065  50S ribosomal protein L9  41.01 
 
 		 148 aa  100  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.972236  hitchhiker  0.000155251 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2022  50S ribosomal protein L9  39.19 
 
 		 168 aa  99.8  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.278988  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4553  50S ribosomal protein L9  41.01 
 
 		 148 aa  99.8  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.156994  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26560  LSU ribosomal protein L9P  40 
 
 		 148 aa  99  3e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.199017 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4535  50S ribosomal protein L9  37.84 
 
 		 153 aa  98.2  5e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.323692 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5065  ribosomal protein L9  40.14 
 
 		 151 aa  97.8  6e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.366091  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1352  50S ribosomal protein L9  38.95 
 
 		 167 aa  97.8  7e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4519  50S ribosomal protein L9  37.93 
 
 		 148 aa  97.4  8e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.986951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3303  ribosomal protein L9  34.33 
 
 		 149 aa  97.4  9e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204917  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1814  ribosomal protein L9  35.17 
 
 		 149 aa  96.7  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3757  50S ribosomal protein L9  34.48 
 
 		 148 aa  95.9  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0097  50S ribosomal protein L9  39.72 
 
 		 151 aa  95.5  3e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.625219  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2841  50S ribosomal protein L9  35.57 
 
 		 148 aa  95.5  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000145753  hitchhiker  0.000000000000102152 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0015  50S ribosomal protein L9  40.83 
 
 		 148 aa  95.9  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0015  50S ribosomal protein L9  40.83 
 
 		 148 aa  95.9  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0923688  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0150  50S ribosomal protein L9  38.3 
 
 		 151 aa  95.9  3e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157053  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2522  ribosomal protein L9  38.89 
 
 		 150 aa  95.5  3e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.559663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0130  50S ribosomal protein L9  37.24 
 
 		 149 aa  95.1  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0311991 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3888  50S ribosomal protein L9  37.14 
 
 		 150 aa  95.5  4e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00361277 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2510  50S ribosomal protein L9  38.65 
 
 		 194 aa  95.1  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.531472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1096  50S ribosomal protein L9  34.23 
 
 		 160 aa  95.1  4e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.547655  normal  0.0167988 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2212  50S ribosomal protein L9  40.3 
 
 		 150 aa  95.1  4e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0011  50S ribosomal protein L9  34.69 
 
 		 150 aa  94.7  6e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.557694  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4506  ribosomal protein L9  37.33 
 
 		 149 aa  94.7  6e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.594005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9354  50S ribosomal protein L9P  36.17 
 
 		 148 aa  94.4  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.837132 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0761  50S ribosomal protein L9  39.74 
 
 		 151 aa  94.4  8e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000425439  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1410  50S ribosomal protein L9  37.93 
 
 		 171 aa  93.6  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000225617  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0081  50S ribosomal protein L9  31.47 
 
 		 148 aa  93.6  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.957353  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1359  ribosomal protein L9  32.41 
 
 		 151 aa  93.6  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0122536  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2911  ribosomal protein L9  35.86 
 
 		 147 aa  92.8  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000198897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0602  ribosomal protein L9  35.17 
 
 		 159 aa  93.2  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3528  50S ribosomal protein L9  33.93 
 
 		 168 aa  92.8  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.156676  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0586  50S ribosomal protein L9  41.78 
 
 		 150 aa  92.8  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.482938  hitchhiker  3.77539e-17 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0014  50S ribosomal protein L9P  36.49 
 
 		 151 aa  93.2  2e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2332  ribosomal protein L9  35.22 
 
 		 170 aa  93.2  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.640711  hitchhiker  0.00706783 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3675  50S ribosomal protein L9  35.37 
 
 		 147 aa  92.8  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0017578  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1642  50S ribosomal protein L9  38.27 
 
 		 164 aa  92.4  3e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0557513  normal  0.0367892 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0334  50S ribosomal protein L9  39.58 
 
 		 151 aa  92  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.801723 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4117  50S ribosomal protein L9  36.43 
 
 		 150 aa  92.4  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2028  50S ribosomal protein L9  35.57 
 
 		 167 aa  92.4  3e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.728229  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0668  50S ribosomal protein L9  36.05 
 
 		 148 aa  92  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00124479  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3462  ribosomal protein L9  41.26 
 
 		 147 aa  91.7  4e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3352  ribosomal protein L9  38.89 
 
 		 151 aa  91.7  4e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.600621  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7309  50S ribosomal protein L9  36.55 
 
 		 148 aa  91.7  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.937449  normal  0.0304173 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0007  50S ribosomal protein L9  35.1 
 
 		 151 aa  91.7  5e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4178  ribosomal protein L9  40.58 
 
 		 151 aa  91.3  6e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0117  50S ribosomal protein L9  36.17 
 
 		 151 aa  91.3  6e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2193  50S ribosomal protein L9  38.46 
 
 		 152 aa  91.3  6e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0397  hypothetical protein  33.57 
 
 		 149 aa  91.3  7e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2509  50S ribosomal protein L9  35.92 
 
 		 151 aa  90.9  8e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000781135  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4841  ribosomal protein L9  35.66 
 
 		 148 aa  90.1  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1675  50S ribosomal protein L9  33.56 
 
 		 199 aa  90.1  1e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000107335  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0110  50S ribosomal protein L9  37.59 
 
 		 151 aa  90.5  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000508651  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3121  ribosomal protein L9  38.51 
 
 		 193 aa  90.5  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1381  ribosomal protein L9  36.3 
 
 		 150 aa  89.7  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0881  50S ribosomal protein L9  37.24 
 
 		 148 aa  89.4  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00774862  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1996  50S ribosomal protein L9  37.24 
 
 		 148 aa  89.4  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03776  50S ribosomal protein L9  37.84 
 
 		 150 aa  89.4  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2593  50S ribosomal protein L9  37.23 
 
 		 147 aa  89.7  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21431  50S ribosomal protein L9  35.66 
 
 		 152 aa  89.4  2e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1272  50S ribosomal protein L9  35.66 
 
 		 152 aa  89.4  3e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1361  ribosomal protein L9  38.19 
 
 		 150 aa  89.4  3e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7042  ribosomal protein L9  35.86 
 
 		 151 aa  89  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1150  50S ribosomal protein L9  37.27 
 
 		 165 aa  89  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0292661  hitchhiker  0.00494207 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2388  50S ribosomal protein L9  34.97 
 
 		 147 aa  89  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23230  LSU ribosomal protein L9P  40.28 
 
 		 153 aa  88.6  4e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1966  50S ribosomal protein L9  33.77 
 
 		 150 aa  88.6  4e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4931  50S ribosomal protein L9  37.24 
 
 		 148 aa  88.2  6e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.108353  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0541  50S ribosomal protein L9  32.45 
 
 		 151 aa  87.8  7e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0517  50S ribosomal protein L9  33.77 
 
 		 151 aa  87.8  7e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18001  50S ribosomal protein L9  37.67 
 
 		 152 aa  87.8  7e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1210  50S ribosomal protein L9  36.42 
 
 		 209 aa  87.8  7e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0873917  normal  0.750153 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2006  ribosomal protein L9  31.33 
 
 		 152 aa  87.4  8e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1205  ribosomal protein L9  35.86 
 
 		 151 aa  87.8  8e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2610  50S ribosomal protein L9  35.86 
 
 		 147 aa  87  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.196058  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0163  50S ribosomal protein L9  37.41 
 
 		 146 aa  87.4  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00237667  normal  0.639266 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>