More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3528 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3528  50S ribosomal protein L9  100 
 
 
168 aa  332  1e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.156676  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1150  50S ribosomal protein L9  58.49 
 
 
165 aa  186  1e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0292661  hitchhiker  0.00494207 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3991  50S ribosomal protein L9  59.63 
 
 
165 aa  183  9e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00054476 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2002  50S ribosomal protein L9  62.84 
 
 
153 aa  157  6e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0148705  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1814  ribosomal protein L9  46.31 
 
 
149 aa  133  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2535  ribosomal protein L9  42.57 
 
 
148 aa  124  9e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000849852  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0602  ribosomal protein L9  44.08 
 
 
159 aa  123  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4506  ribosomal protein L9  42.67 
 
 
149 aa  120  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.594005  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0165  50S ribosomal protein L9  44 
 
 
148 aa  118  4.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000317895  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0150  50S ribosomal protein L9  43.62 
 
 
151 aa  117  9e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157053  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0851  50S ribosomal protein L9P  40 
 
 
149 aa  115  3e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0541  50S ribosomal protein L9  36.49 
 
 
151 aa  113  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4535  50S ribosomal protein L9  45.86 
 
 
153 aa  113  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.323692 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1410  50S ribosomal protein L9  46.71 
 
 
171 aa  112  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000225617  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0517  50S ribosomal protein L9  37.16 
 
 
151 aa  111  4.0000000000000004e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3092  50S ribosomal protein L9  39.86 
 
 
148 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0370883  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0132  50S ribosomal protein L9P  41.89 
 
 
150 aa  111  4.0000000000000004e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.191578  normal  0.450064 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0116  50S ribosomal protein L9  45.27 
 
 
149 aa  111  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0097  50S ribosomal protein L9  43.14 
 
 
151 aa  111  5e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.625219  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2925  ribosomal protein L9  41.22 
 
 
147 aa  110  7.000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0843322  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0123  50S ribosomal protein L9  44.59 
 
 
149 aa  110  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_482  ribosomal protein L9  35.81 
 
 
151 aa  110  7.000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0134  50S ribosomal protein L9  44.59 
 
 
149 aa  110  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0161  50S ribosomal protein L9  43.62 
 
 
148 aa  110  1.0000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000723092  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0561  ribosomal protein L9  41.18 
 
 
149 aa  109  2.0000000000000002e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.204129  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4519  50S ribosomal protein L9  36.99 
 
 
148 aa  108  3e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.986951  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2509  50S ribosomal protein L9  41.45 
 
 
151 aa  107  6e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000781135  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5065  ribosomal protein L9  40.15 
 
 
151 aa  106  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.366091  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2130  50S ribosomal protein L9  39.19 
 
 
149 aa  106  1e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.929246  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0117  50S ribosomal protein L9  41.83 
 
 
151 aa  106  2e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0120  50S ribosomal protein L9  45.11 
 
 
149 aa  105  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0927016  normal  0.199932 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2388  50S ribosomal protein L9  39.19 
 
 
147 aa  105  3e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1996  50S ribosomal protein L9  42.57 
 
 
148 aa  105  4e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3558  50S ribosomal protein L9  41.79 
 
 
148 aa  104  5e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.882223 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0654  ribosomal protein L9  42.67 
 
 
146 aa  104  7e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.233351  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09988  ribosomal protein L9  39.33 
 
 
149 aa  102  2e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.536224  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4336  50S ribosomal protein L9  42.54 
 
 
150 aa  102  3e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2852  50S ribosomal protein L9  43.07 
 
 
152 aa  102  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3244  50S ribosomal protein L9  43.07 
 
 
152 aa  102  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.65089  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3185  ribosomal protein L9  41.06 
 
 
148 aa  102  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.564436  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0287  ribosomal protein L9  41.72 
 
 
152 aa  102  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0120134  normal  0.0123082 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2841  50S ribosomal protein L9  41.22 
 
 
148 aa  101  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000145753  hitchhiker  0.000000000000102152 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0110  50S ribosomal protein L9  37.5 
 
 
151 aa  101  4e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000508651  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2911  ribosomal protein L9  39.31 
 
 
147 aa  101  5e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000198897  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7309  50S ribosomal protein L9  37.96 
 
 
148 aa  101  6e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.937449  normal  0.0304173 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4351  ribosomal protein L9  39.46 
 
 
148 aa  100  8e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0448  50S ribosomal protein L9  41.5 
 
 
148 aa  100  9e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000315624  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0025  ribosomal protein L9  39.22 
 
 
178 aa  100  1e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00173008  normal  0.984167 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4841  ribosomal protein L9  39.1 
 
 
148 aa  100  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2028  50S ribosomal protein L9  43.33 
 
 
167 aa  100  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.728229  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3303  ribosomal protein L9  41.38 
 
 
149 aa  99.8  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204917  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0668  50S ribosomal protein L9  41.22 
 
 
148 aa  99.4  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00124479  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0881  50S ribosomal protein L9  40 
 
 
148 aa  99.4  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00774862  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1359  ribosomal protein L9  40.54 
 
 
151 aa  99.4  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0122536  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4931  50S ribosomal protein L9  42.86 
 
 
148 aa  99  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.108353  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1352  50S ribosomal protein L9  40.12 
 
 
167 aa  98.2  5e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3675  50S ribosomal protein L9  39.6 
 
 
147 aa  97.8  6e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0017578  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1975  50S ribosomal protein L9  41.72 
 
 
149 aa  97.8  7e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1000  50S ribosomal protein L9  39.74 
 
 
147 aa  97.4  7e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3757  50S ribosomal protein L9  35.37 
 
 
148 aa  97.4  8e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2022  50S ribosomal protein L9  39.71 
 
 
168 aa  97.1  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.278988  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1063  ribosomal protein L9  35.81 
 
 
147 aa  97.1  1e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.342712  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4542  50S ribosomal protein L9  39.6 
 
 
152 aa  95.9  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.736351 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1828  50S ribosomal protein L9  42.77 
 
 
168 aa  95.9  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2610  50S ribosomal protein L9  41.18 
 
 
147 aa  95.9  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.196058  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2193  50S ribosomal protein L9  38.36 
 
 
152 aa  96.3  2e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2542  50S ribosomal protein L9  37.58 
 
 
152 aa  96.3  2e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1692  50S ribosomal protein L9  42 
 
 
149 aa  96.3  2e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2212  50S ribosomal protein L9  40.88 
 
 
150 aa  95.9  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1479  50S ribosomal protein L9  41.91 
 
 
147 aa  96.3  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00653221 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2761  50S ribosomal protein L9  41.91 
 
 
147 aa  96.3  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1422  50S ribosomal protein L9  38.41 
 
 
151 aa  95.5  3e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0660955  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3352  ribosomal protein L9  38.89 
 
 
151 aa  95.5  3e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.600621  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4946  ribosomal protein L9  34.93 
 
 
148 aa  94.7  5e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7042  ribosomal protein L9  40.41 
 
 
151 aa  95.1  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0329  50S ribosomal protein L9  36.67 
 
 
152 aa  94.4  6e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.355323  normal  0.434143 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4178  ribosomal protein L9  36.81 
 
 
151 aa  94.4  6e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2257  50S ribosomal protein L9  34.46 
 
 
148 aa  94.4  6e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000108464  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28961  50S ribosomal protein L9  40.41 
 
 
152 aa  94.7  6e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3697  ribosomal protein L9  37.88 
 
 
149 aa  93.6  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0334  50S ribosomal protein L9  36.49 
 
 
151 aa  94  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.801723 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2522  ribosomal protein L9  36.05 
 
 
150 aa  93.6  1e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.559663  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0761  50S ribosomal protein L9  43.7 
 
 
151 aa  93.6  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000425439  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6995  ribosomal protein L9  37.8 
 
 
148 aa  93.2  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.142438 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1668  50S ribosomal protein L9  35.82 
 
 
175 aa  92.4  2e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.197637  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2332  ribosomal protein L9  37.04 
 
 
170 aa  92.8  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.640711  hitchhiker  0.00706783 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0081  50S ribosomal protein L9  36 
 
 
148 aa  92.4  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.957353  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0877  50S ribosomal protein L9  40.54 
 
 
151 aa  92.4  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21431  50S ribosomal protein L9  36.73 
 
 
152 aa  92  3e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1272  50S ribosomal protein L9  36.73 
 
 
152 aa  92.4  3e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1775  50S ribosomal protein L9  37.76 
 
 
149 aa  91.7  4e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000651865  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5743  50S ribosomal protein L9  36.6 
 
 
152 aa  91.3  5e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.245852 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2559  50S ribosomal protein L9  40.94 
 
 
152 aa  91.3  5e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5367  50S ribosomal protein L9  36.6 
 
 
152 aa  91.3  5e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0014  50S ribosomal protein L9P  37.75 
 
 
151 aa  91.7  5e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5456  50S ribosomal protein L9  36.6 
 
 
152 aa  91.3  5e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.166119  normal  0.0135281 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0007  50S ribosomal protein L9  38.82 
 
 
151 aa  91.3  6e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4166  ribosomal protein L9  40.74 
 
 
150 aa  91.3  6e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1675  50S ribosomal protein L9  33.12 
 
 
199 aa  90.9  7e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000107335  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2897  50S ribosomal protein L9  37.66 
 
 
152 aa  90.5  9e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000174347  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>