More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_0120 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_0120  50S ribosomal protein L9  100 
 
 
149 aa  293  4e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0927016  normal  0.199932 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0123  50S ribosomal protein L9  87.16 
 
 
149 aa  231  3e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0134  50S ribosomal protein L9  87.16 
 
 
149 aa  231  3e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0116  50S ribosomal protein L9  86.49 
 
 
149 aa  228  2e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4506  ribosomal protein L9  47.92 
 
 
149 aa  147  5e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.594005  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1410  50S ribosomal protein L9  46.94 
 
 
171 aa  140  5e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000225617  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1352  50S ribosomal protein L9  49.66 
 
 
167 aa  140  5e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2022  50S ribosomal protein L9  47.62 
 
 
168 aa  138  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.278988  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0602  ribosomal protein L9  44.97 
 
 
159 aa  138  3e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2610  50S ribosomal protein L9  48.63 
 
 
147 aa  137  3.9999999999999997e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.196058  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4535  50S ribosomal protein L9  45.27 
 
 
153 aa  136  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.323692 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1479  50S ribosomal protein L9  46.53 
 
 
147 aa  134  3.0000000000000003e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00653221 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3185  ribosomal protein L9  44.22 
 
 
148 aa  133  7.000000000000001e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.564436  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2761  50S ribosomal protein L9  45.83 
 
 
147 aa  132  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0761  50S ribosomal protein L9  46.31 
 
 
151 aa  132  9.999999999999999e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000425439  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3675  50S ribosomal protein L9  45.83 
 
 
147 aa  132  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0017578  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0668  50S ribosomal protein L9  46.53 
 
 
148 aa  131  3e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00124479  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1096  50S ribosomal protein L9  45.83 
 
 
160 aa  131  3e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.547655  normal  0.0167988 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2841  50S ribosomal protein L9  46.48 
 
 
148 aa  130  6.999999999999999e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000145753  hitchhiker  0.000000000000102152 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1996  50S ribosomal protein L9  44.52 
 
 
148 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2028  50S ribosomal protein L9  43.54 
 
 
167 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.728229  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2388  50S ribosomal protein L9  46.94 
 
 
147 aa  127  5.0000000000000004e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0165  50S ribosomal protein L9  42.57 
 
 
148 aa  124  3e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000317895  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0851  50S ribosomal protein L9P  42.76 
 
 
149 aa  123  7e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09988  ribosomal protein L9  42.57 
 
 
149 aa  122  1e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.536224  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0150  50S ribosomal protein L9  40.94 
 
 
151 aa  120  5e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157053  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2509  50S ribosomal protein L9  40.27 
 
 
151 aa  119  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000781135  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2002  50S ribosomal protein L9  48.65 
 
 
153 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0148705  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0161  50S ribosomal protein L9  39.46 
 
 
148 aa  118  1.9999999999999998e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000723092  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2911  ribosomal protein L9  40.97 
 
 
147 aa  118  3e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000198897  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0117  50S ribosomal protein L9  43.54 
 
 
151 aa  118  3e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1828  50S ribosomal protein L9  44.44 
 
 
168 aa  118  3e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0081  50S ribosomal protein L9  42.47 
 
 
148 aa  117  7e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.957353  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1435  50S ribosomal protein L9  41.61 
 
 
149 aa  116  9.999999999999999e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0986557  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0097  50S ribosomal protein L9  40.82 
 
 
151 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.625219  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0110  50S ribosomal protein L9  39.6 
 
 
151 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000508651  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4519  50S ribosomal protein L9  43.45 
 
 
148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.986951  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4931  50S ribosomal protein L9  45.58 
 
 
148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.108353  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3757  50S ribosomal protein L9  43.54 
 
 
148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0452  50S ribosomal protein L9  44.44 
 
 
189 aa  114  3e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.206752  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2925  ribosomal protein L9  41.5 
 
 
147 aa  114  3e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0843322  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0654  50S ribosomal protein L9  44.67 
 
 
150 aa  114  3e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0458  50S ribosomal protein L9  44.44 
 
 
189 aa  114  5e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0534  ribosomal protein L9  42.95 
 
 
149 aa  114  5e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0397  hypothetical protein  40.54 
 
 
149 aa  114  5e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3528  50S ribosomal protein L9  43.24 
 
 
168 aa  114  5e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.156676  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1150  50S ribosomal protein L9  41.22 
 
 
165 aa  114  5e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0292661  hitchhiker  0.00494207 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0830  ribosomal protein L9  45.58 
 
 
149 aa  113  8.999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.211438  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0566  50S ribosomal protein L9  42.36 
 
 
189 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0901  50S ribosomal protein L9  44.44 
 
 
189 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0476125 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0741  ribosomal protein L9  39.46 
 
 
147 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0681469  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0654  ribosomal protein L9  43.54 
 
 
146 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.233351  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2458  50S ribosomal protein L9P  40.69 
 
 
149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.174518 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2188  50S ribosomal protein L9  42.36 
 
 
209 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0448  50S ribosomal protein L9  35.37 
 
 
148 aa  111  3e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000315624  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3939  50S ribosomal protein L9  43.75 
 
 
190 aa  111  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.613806  normal  0.190537 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4307  50S ribosomal protein L9  43.75 
 
 
190 aa  111  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0939755 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00744  50S ribosomal protein L9  42.28 
 
 
149 aa  111  4.0000000000000004e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.73532  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1775  50S ribosomal protein L9  45.33 
 
 
149 aa  111  4.0000000000000004e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000651865  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4414  50S ribosomal protein L9  43.75 
 
 
190 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.248049 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0132  50S ribosomal protein L9P  43.33 
 
 
150 aa  110  5e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.191578  normal  0.450064 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2257  50S ribosomal protein L9  41.89 
 
 
148 aa  110  6e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000108464  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3040  50S ribosomal protein L9  43.06 
 
 
188 aa  110  6e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.186174 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00020  50S ribosomal protein L9  40.54 
 
 
150 aa  110  6e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1205  ribosomal protein L9  39.19 
 
 
151 aa  110  6e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4351  ribosomal protein L9  38.62 
 
 
148 aa  110  8.000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0007  50S ribosomal protein L9  41.5 
 
 
151 aa  110  9e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1112  ribosomal protein L9  40.28 
 
 
147 aa  109  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.573323  normal  0.866168 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3991  50S ribosomal protein L9  41.22 
 
 
165 aa  109  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00054476 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1359  ribosomal protein L9  39.86 
 
 
151 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0122536  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1510  ribosomal protein L9  44.44 
 
 
186 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002335  LSU ribosomal protein L9p  39.86 
 
 
150 aa  109  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.178305  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1918  50S ribosomal protein L9  40.28 
 
 
196 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.403674  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5418  50S ribosomal protein L9  43.06 
 
 
190 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0206045  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3121  ribosomal protein L9  43.06 
 
 
193 aa  108  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0083  50S ribosomal protein L9  43.06 
 
 
202 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.584189  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1692  50S ribosomal protein L9  38.51 
 
 
149 aa  108  3e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9354  50S ribosomal protein L9P  42.18 
 
 
148 aa  108  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.837132 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2306  50S ribosomal protein L9  42.36 
 
 
189 aa  107  4.0000000000000004e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.891012  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2780  50S ribosomal protein L9  40.27 
 
 
149 aa  108  4.0000000000000004e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000928974  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1084  50S ribosomal protein L9  42 
 
 
152 aa  108  4.0000000000000004e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00450273  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0586  50S ribosomal protein L9  42 
 
 
150 aa  107  4.0000000000000004e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.482938  hitchhiker  3.77539e-17 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0014  50S ribosomal protein L9P  40.82 
 
 
151 aa  107  4.0000000000000004e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0491  ribosomal protein L9  40.28 
 
 
179 aa  107  5e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04070  50S ribosomal protein L9  41.61 
 
 
149 aa  107  6e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3790  ribosomal protein L9  41.61 
 
 
149 aa  107  6e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00574678  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5718  50S ribosomal protein L9  41.61 
 
 
149 aa  107  6e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.595872  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4673  50S ribosomal protein L9  41.61 
 
 
149 aa  107  6e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3092  50S ribosomal protein L9  40.15 
 
 
148 aa  107  6e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0370883  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4447  50S ribosomal protein L9  41.61 
 
 
149 aa  107  6e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3810  50S ribosomal protein L9  41.61 
 
 
149 aa  107  6e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0581092 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04032  hypothetical protein  41.61 
 
 
149 aa  107  6e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4764  50S ribosomal protein L9  41.61 
 
 
149 aa  107  6e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4736  50S ribosomal protein L9  41.61 
 
 
149 aa  107  6e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.257928  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4931  50S ribosomal protein L9  42.65 
 
 
148 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000100703 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4665  50S ribosomal protein L9  42.65 
 
 
148 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0656931 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2510  50S ribosomal protein L9  43.75 
 
 
194 aa  107  7.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.531472  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1219  50S ribosomal protein L9P  41.89 
 
 
148 aa  106  8.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.405746 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3558  50S ribosomal protein L9  40.14 
 
 
148 aa  106  8.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.882223 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0738  50S ribosomal protein L9  40.28 
 
 
191 aa  107  8.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.823068  normal  0.564603 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>