More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3991 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3991  50S ribosomal protein L9  100 
 
 		 165 aa  323  8.000000000000001e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00054476 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1150  50S ribosomal protein L9  92.68 
 
 		 165 aa  301  3.0000000000000004e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0292661  hitchhiker  0.00494207 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3528  50S ribosomal protein L9  59.63 
 
 		 168 aa  196  1.0000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.156676  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2002  50S ribosomal protein L9  63.09 
 
 		 153 aa  148  3e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0148705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1814  ribosomal protein L9  47.3 
 
 		 149 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2535  ribosomal protein L9  42.57 
 
 		 148 aa  132  1.9999999999999998e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000849852  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4506  ribosomal protein L9  45.03 
 
 		 149 aa  128  3e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.594005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0132  50S ribosomal protein L9P  43.92 
 
 		 150 aa  117  6e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.191578  normal  0.450064 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0150  50S ribosomal protein L9  41.06 
 
 		 151 aa  117  7e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157053  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5065  ribosomal protein L9  47.41 
 
 		 151 aa  116  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.366091  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0161  50S ribosomal protein L9  43.24 
 
 		 148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000723092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0561  ribosomal protein L9  40.54 
 
 		 149 aa  115  3e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.204129  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4519  50S ribosomal protein L9  43.24 
 
 		 148 aa  115  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.986951  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4841  ribosomal protein L9  41.89 
 
 		 148 aa  114  5e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2509  50S ribosomal protein L9  41.89 
 
 		 151 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000781135  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3092  50S ribosomal protein L9  44.06 
 
 		 148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0370883  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0165  50S ribosomal protein L9  40.54 
 
 		 148 aa  112  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000317895  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3558  50S ribosomal protein L9  43.24 
 
 		 148 aa  112  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.882223 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0851  50S ribosomal protein L9P  42.18 
 
 		 149 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4178  ribosomal protein L9  43.06 
 
 		 151 aa  108  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0117  50S ribosomal protein L9  40.54 
 
 		 151 aa  108  3e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0097  50S ribosomal protein L9  40.54 
 
 		 151 aa  108  4.0000000000000004e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.625219  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2022  50S ribosomal protein L9  37.58 
 
 		 168 aa  107  6e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.278988  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2212  50S ribosomal protein L9  45.59 
 
 		 150 aa  107  8.000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4946  ribosomal protein L9  40 
 
 		 148 aa  107  9.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0894  50S ribosomal protein L9  42.28 
 
 		 149 aa  107  9.000000000000001e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000571684  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7309  50S ribosomal protein L9  40.54 
 
 		 148 aa  106  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.937449  normal  0.0304173 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2911  ribosomal protein L9  36.55 
 
 		 147 aa  107  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000198897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4117  50S ribosomal protein L9  41.22 
 
 		 150 aa  106  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2028  50S ribosomal protein L9  42.28 
 
 		 167 aa  106  1e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.728229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4336  50S ribosomal protein L9  39.46 
 
 		 150 aa  106  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0110  50S ribosomal protein L9  37.84 
 
 		 151 aa  105  3e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000508651  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0116  50S ribosomal protein L9  41.22 
 
 		 149 aa  105  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3888  50S ribosomal protein L9  41.22 
 
 		 150 aa  105  3e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00361277 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3352  ribosomal protein L9  43.75 
 
 		 151 aa  105  3e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.600621  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0541  50S ribosomal protein L9  36 
 
 		 151 aa  105  4e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1410  50S ribosomal protein L9  41.61 
 
 		 171 aa  104  4e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000225617  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4535  50S ribosomal protein L9  41.89 
 
 		 153 aa  105  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.323692 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0123  50S ribosomal protein L9  40.54 
 
 		 149 aa  104  5e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0134  50S ribosomal protein L9  40.54 
 
 		 149 aa  104  5e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4351  ribosomal protein L9  34.48 
 
 		 148 aa  103  7e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0517  50S ribosomal protein L9  37.33 
 
 		 151 aa  103  8e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0602  ribosomal protein L9  40.54 
 
 		 159 aa  102  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_482  ribosomal protein L9  35.33 
 
 		 151 aa  102  2e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5065  50S ribosomal protein L9  39.86 
 
 		 148 aa  102  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.972236  hitchhiker  0.000155251 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31750  LSU ribosomal protein L9P  37.24 
 
 		 157 aa  102  2e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0881  50S ribosomal protein L9  44.53 
 
 		 148 aa  102  3e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00774862  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09988  ribosomal protein L9  38.93 
 
 		 149 aa  101  4e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.536224  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4553  50S ribosomal protein L9  39.86 
 
 		 148 aa  101  5e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.156994  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9354  50S ribosomal protein L9P  37.93 
 
 		 148 aa  101  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.837132 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2130  50S ribosomal protein L9  40.69 
 
 		 149 aa  100  6e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.929246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2257  50S ribosomal protein L9  35.14 
 
 		 148 aa  100  7e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000108464  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0654  ribosomal protein L9  39.04 
 
 		 146 aa  100  8e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.233351  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0120  50S ribosomal protein L9  41.48 
 
 		 149 aa  100  9e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0927016  normal  0.199932 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2388  50S ribosomal protein L9  37.84 
 
 		 147 aa  100  9e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1359  ribosomal protein L9  38.67 
 
 		 151 aa  100  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0122536  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2925  ribosomal protein L9  41.22 
 
 		 147 aa  100  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0843322  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4661  50S ribosomal protein L9P  39.04 
 
 		 148 aa  100  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0334  50S ribosomal protein L9  37.5 
 
 		 151 aa  99.8  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.801723 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7042  ribosomal protein L9  43.38 
 
 		 151 aa  99  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3185  ribosomal protein L9  37.42 
 
 		 148 aa  99.8  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.564436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1096  50S ribosomal protein L9  36.99 
 
 		 160 aa  98.6  3e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.547655  normal  0.0167988 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0025  ribosomal protein L9  37.41 
 
 		 178 aa  98.2  4e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00173008  normal  0.984167 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2841  50S ribosomal protein L9  35.86 
 
 		 148 aa  97.8  6e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000145753  hitchhiker  0.000000000000102152 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3303  ribosomal protein L9  35.86 
 
 		 149 aa  97.8  6e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204917  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3697  ribosomal protein L9  38.89 
 
 		 149 aa  97.8  6e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4931  50S ribosomal protein L9  39.73 
 
 		 148 aa  97.4  8e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.108353  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1352  50S ribosomal protein L9  36.91 
 
 		 167 aa  96.7  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0448  50S ribosomal protein L9  35.62 
 
 		 148 aa  97.1  1e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000315624  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1996  50S ribosomal protein L9  38.51 
 
 		 148 aa  97.1  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2761  50S ribosomal protein L9  34.48 
 
 		 147 aa  97.1  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3675  50S ribosomal protein L9  33.79 
 
 		 147 aa  96.7  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0017578  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4542  50S ribosomal protein L9  38.82 
 
 		 152 aa  95.9  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.736351 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0106  50S ribosomal protein L9  34.25 
 
 		 147 aa  95.9  2e-19  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1479  50S ribosomal protein L9  33.79 
 
 		 147 aa  95.1  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00653221 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2522  ribosomal protein L9  40.14 
 
 		 150 aa  95.1  3e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.559663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2188  50S ribosomal protein L9  38.06 
 
 		 209 aa  95.5  3e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37780  LSU ribosomal protein L9P  36.81 
 
 		 149 aa  94.4  6e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.236654  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0668  50S ribosomal protein L9  35.86 
 
 		 148 aa  93.6  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00124479  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0287  ribosomal protein L9  38.56 
 
 		 152 aa  93.2  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0120134  normal  0.0123082 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0534  ribosomal protein L9  36.24 
 
 		 149 aa  93.6  1e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2135  ribosomal protein L9  41.48 
 
 		 148 aa  92.4  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000758155  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1205  ribosomal protein L9  37.84 
 
 		 151 aa  92.4  2e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1692  50S ribosomal protein L9  36.55 
 
 		 149 aa  92.4  2e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1355  ribosomal protein L9  39.86 
 
 		 152 aa  92.8  2e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2559  50S ribosomal protein L9  38.71 
 
 		 152 aa  92  3e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2332  ribosomal protein L9  35.67 
 
 		 170 aa  92.4  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.640711  hitchhiker  0.00706783 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0761  50S ribosomal protein L9  35.71 
 
 		 151 aa  92  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000425439  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0130  50S ribosomal protein L9  37.93 
 
 		 149 aa  91.7  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0311991 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2852  50S ribosomal protein L9  36.6 
 
 		 152 aa  92  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3244  50S ribosomal protein L9  36.6 
 
 		 152 aa  92  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.65089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3121  ribosomal protein L9  37.24 
 
 		 193 aa  91.3  5e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1422  50S ribosomal protein L9  35.66 
 
 		 151 aa  91.3  5e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0660955  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0081  50S ribosomal protein L9  31.29 
 
 		 148 aa  91.3  6e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.957353  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4737  ribosomal protein L9  38.1 
 
 		 150 aa  90.9  6e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5913  ribosomal protein L9  43.06 
 
 		 150 aa  90.9  6e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4166  ribosomal protein L9  38.13 
 
 		 150 aa  90.9  7e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0397  hypothetical protein  33.56 
 
 		 149 aa  90.9  7e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1350  50S ribosomal protein L9  36.77 
 
 		 189 aa  90.5  8e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0676227  normal  0.268494 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18001  50S ribosomal protein L9  38.16 
 
 		 152 aa  90.5  8e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>