More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0411 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0411  50S ribosomal protein L9  100 
 
 		 195 aa  385  1e-106  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.112533  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3121  ribosomal protein L9  59.76 
 
 		 193 aa  198  3e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0452  50S ribosomal protein L9  57.75 
 
 		 189 aa  194  7e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.206752  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0566  50S ribosomal protein L9  57.75 
 
 		 189 aa  194  7e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3040  50S ribosomal protein L9  58.71 
 
 		 188 aa  191  7e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.186174 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0458  50S ribosomal protein L9  57.22 
 
 		 189 aa  190  1e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1918  50S ribosomal protein L9  55.25 
 
 		 196 aa  187  5.999999999999999e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.403674  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0491  ribosomal protein L9  56.58 
 
 		 179 aa  185  4e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3363  ribosomal protein L9  56.05 
 
 		 201 aa  184  6e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0901  50S ribosomal protein L9  59.24 
 
 		 189 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0476125 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0141  50S ribosomal protein L9  57.32 
 
 		 189 aa  179  2e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1774  50S ribosomal protein L9  57.32 
 
 		 189 aa  179  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1510  ribosomal protein L9  53.61 
 
 		 186 aa  176  3e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0889  50S ribosomal protein L9  58.33 
 
 		 194 aa  175  3e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.301047  normal  0.514488 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1350  50S ribosomal protein L9  57.05 
 
 		 189 aa  174  6e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0676227  normal  0.268494 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2510  50S ribosomal protein L9  54.84 
 
 		 194 aa  174  6e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.531472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4414  50S ribosomal protein L9  54.84 
 
 		 190 aa  174  9e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.248049 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3812  50S ribosomal protein L9  56.58 
 
 		 197 aa  174  9e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.740565  normal  0.136797 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4307  50S ribosomal protein L9  54.84 
 
 		 190 aa  173  9.999999999999999e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0939755 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3939  50S ribosomal protein L9  54.84 
 
 		 190 aa  173  9.999999999999999e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.613806  normal  0.190537 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2306  50S ribosomal protein L9  54.19 
 
 		 189 aa  172  3.9999999999999995e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.891012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3490  50S ribosomal protein L9  55.92 
 
 		 195 aa  171  7.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1516  50S ribosomal protein L9  53.76 
 
 		 191 aa  170  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101233  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0738  50S ribosomal protein L9  56.65 
 
 		 191 aa  170  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.823068  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5418  50S ribosomal protein L9  54.84 
 
 		 190 aa  168  5e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0206045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2188  50S ribosomal protein L9  54.49 
 
 		 209 aa  167  1e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1694  50S ribosomal protein L9  53.95 
 
 		 202 aa  166  2e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0817246  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1194  50S ribosomal protein L9  55.92 
 
 		 192 aa  166  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.762079  normal  0.0731596 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1620  50S ribosomal protein L9  57.32 
 
 		 211 aa  165  4e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0645747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2461  50S ribosomal protein L9  55.92 
 
 		 196 aa  164  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.384902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1051  50S ribosomal protein L9  55.26 
 
 		 192 aa  163  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.289991 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1414  50S ribosomal protein L9  52.63 
 
 		 199 aa  162  3e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1210  50S ribosomal protein L9  44.08 
 
 		 209 aa  161  5.0000000000000005e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0873917  normal  0.750153 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2988  50S ribosomal protein L9  55.26 
 
 		 194 aa  161  7e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0083  50S ribosomal protein L9  49.7 
 
 		 202 aa  161  7e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.584189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1043  50S ribosomal protein L9  54.78 
 
 		 204 aa  161  7e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0955164 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2415  50S ribosomal protein L9  52.63 
 
 		 202 aa  160  8.000000000000001e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.295062  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4634  50S ribosomal protein L9  55.48 
 
 		 189 aa  157  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.269406  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2293  50S ribosomal protein L9  53.95 
 
 		 198 aa  156  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.14836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2593  50S ribosomal protein L9  55.48 
 
 		 189 aa  155  3e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0267673 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1902  50S ribosomal protein L9  52.94 
 
 		 210 aa  151  7e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.171336 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3666  50S ribosomal protein L9  47.95 
 
 		 149 aa  139  3e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.006093  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2102  50S ribosomal protein L9P  44.83 
 
 		 149 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5226  ribosomal protein L9  46.9 
 
 		 150 aa  127  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2827  ribosomal protein L9  44.83 
 
 		 150 aa  127  1.0000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07670  50S ribosomal protein L9  46.21 
 
 		 148 aa  126  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.957501  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00020  50S ribosomal protein L9  44.67 
 
 		 150 aa  124  6e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1329  50S ribosomal protein L9P  46.21 
 
 		 148 aa  124  7e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.556068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002335  LSU ribosomal protein L9p  44 
 
 		 150 aa  124  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.178305  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1403  50S ribosomal protein L9  42.07 
 
 		 150 aa  123  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.318005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1219  50S ribosomal protein L9P  46.21 
 
 		 148 aa  122  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.405746 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3675  50S ribosomal protein L9  43.54 
 
 		 147 aa  122  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0017578  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5171  50S ribosomal protein L9  42.07 
 
 		 150 aa  121  5e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2841  50S ribosomal protein L9  41.22 
 
 		 148 aa  122  5e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000145753  hitchhiker  0.000000000000102152 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1185  50S ribosomal protein L9  46.9 
 
 		 150 aa  121  8e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.152259  normal  0.105379 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1246  50S ribosomal protein L9  46.9 
 
 		 150 aa  121  8e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00525572  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0783  50S ribosomal protein L9  45.39 
 
 		 184 aa  120  1.9999999999999998e-26  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0117191  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1780  50S ribosomal protein L9  41.38 
 
 		 150 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1808  50S ribosomal protein L9  41.38 
 
 		 150 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.432428  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2458  50S ribosomal protein L9P  42.86 
 
 		 149 aa  119  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.174518 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6208  50S ribosomal protein L9  40.69 
 
 		 150 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1871  50S ribosomal protein L9  40.69 
 
 		 150 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.539407  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1894  50S ribosomal protein L9  40.69 
 
 		 150 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000492255  hitchhiker  0.000000062237 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1435  50S ribosomal protein L9  42.47 
 
 		 149 aa  118  4.9999999999999996e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0986557  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0668  50S ribosomal protein L9  41.89 
 
 		 148 aa  118  6e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00124479  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0777  50S ribosomal protein L9  43.84 
 
 		 149 aa  118  6e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000131124  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1310  50S ribosomal protein L9  47.01 
 
 		 150 aa  117  7.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2780  50S ribosomal protein L9  42.47 
 
 		 149 aa  117  7.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000928974  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3781  50S ribosomal protein L9  43.15 
 
 		 150 aa  116  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0681  50S ribosomal protein L9  43.15 
 
 		 150 aa  116  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2453  50S ribosomal protein L9  44.14 
 
 		 150 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0207068  normal  0.322148 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0586  50S ribosomal protein L9  42.67 
 
 		 150 aa  116  1.9999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.482938  hitchhiker  3.77539e-17 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3636  50S ribosomal protein L9  43.15 
 
 		 150 aa  116  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2249  50S ribosomal protein L9  42 
 
 		 150 aa  116  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.128176  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4672  50S ribosomal protein L9  43.15 
 
 		 149 aa  115  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00136692  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4662  50S ribosomal protein L9  43.15 
 
 		 149 aa  115  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0630658  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04070  50S ribosomal protein L9  43.15 
 
 		 149 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3790  ribosomal protein L9  43.15 
 
 		 149 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00574678  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0449  50S ribosomal protein L9  42.47 
 
 		 150 aa  115  3.9999999999999997e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00474942 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4736  50S ribosomal protein L9  43.15 
 
 		 149 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.257928  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5718  50S ribosomal protein L9  43.15 
 
 		 149 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.595872  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04032  hypothetical protein  43.15 
 
 		 149 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4447  50S ribosomal protein L9  43.15 
 
 		 149 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4764  50S ribosomal protein L9  43.15 
 
 		 149 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4673  50S ribosomal protein L9  43.15 
 
 		 149 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3810  50S ribosomal protein L9  43.15 
 
 		 149 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0581092 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2022  50S ribosomal protein L9  40.28 
 
 		 168 aa  115  5e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.278988  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0648  50S ribosomal protein L9  45.52 
 
 		 148 aa  115  6e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000594391 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0431  50S ribosomal protein L9  44.67 
 
 		 150 aa  114  7.999999999999999e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.740321 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4790  50S ribosomal protein L9  42.47 
 
 		 149 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.131212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4812  50S ribosomal protein L9  42.47 
 
 		 149 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0162172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3034  50S ribosomal protein L9  42.76 
 
 		 150 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000136909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0423  50S ribosomal protein L9  44 
 
 		 150 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000011368  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0914  50S ribosomal protein L9  44.03 
 
 		 150 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.334096 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4754  50S ribosomal protein L9  42.47 
 
 		 149 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0190714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2761  50S ribosomal protein L9  40.82 
 
 		 147 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2443  50S ribosomal protein L9  45.27 
 
 		 148 aa  112  3e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00389118 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4665  50S ribosomal protein L9  44.12 
 
 		 148 aa  112  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0656931 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2820  50S ribosomal protein L9  45.27 
 
 		 148 aa  112  3e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4535  50S ribosomal protein L9  41.18 
 
 		 153 aa  112  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.323692 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>