More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1966 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_1966  50S ribosomal protein L9  100 
 
 
150 aa  301  3.0000000000000004e-81  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0011  50S ribosomal protein L9  61.07 
 
 
150 aa  197  5e-50  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.557694  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0014  50S ribosomal protein L9P  53.69 
 
 
151 aa  164  2.9999999999999998e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0012  50S ribosomal protein L9  55.03 
 
 
154 aa  162  2.0000000000000002e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.181348  hitchhiker  0.0000209307 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3412  50S ribosomal protein L9  57.72 
 
 
149 aa  155  2e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1976  50S ribosomal protein L9  55.78 
 
 
152 aa  152  2e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5262  50S ribosomal protein L9  53.69 
 
 
148 aa  144  4.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00409171  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3541  50S ribosomal protein L9  57.72 
 
 
149 aa  141  3e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2538  50S ribosomal protein L9  54.36 
 
 
148 aa  139  9.999999999999999e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5322  50S ribosomal protein L9  55.03 
 
 
148 aa  138  3e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5150  50S ribosomal protein L9  55.03 
 
 
148 aa  138  3e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000483517  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5166  50S ribosomal protein L9  55.03 
 
 
148 aa  138  3e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0461945  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5718  50S ribosomal protein L9  55.03 
 
 
148 aa  138  3e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000626689  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5579  50S ribosomal protein L9  55.03 
 
 
148 aa  138  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.17506e-22 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0789  50S ribosomal protein L9  57.72 
 
 
150 aa  138  3e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5620  50S ribosomal protein L9  55.03 
 
 
148 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000412151  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5657  50S ribosomal protein L9  55.03 
 
 
148 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000227696  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5596  50S ribosomal protein L9  55.03 
 
 
148 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000245736  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2140  50S ribosomal protein L9  52.67 
 
 
150 aa  136  1e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5339  50S ribosomal protein L9  53.69 
 
 
148 aa  134  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000103383  hitchhiker  0.00000000147927 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4009  50S ribosomal protein L9  55.7 
 
 
148 aa  130  6.999999999999999e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.015297  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2925  ribosomal protein L9  50.34 
 
 
147 aa  130  7.999999999999999e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0843322  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0015  50S ribosomal protein L9  53.02 
 
 
148 aa  124  6e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0015  50S ribosomal protein L9  53.02 
 
 
148 aa  124  6e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0923688  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3757  50S ribosomal protein L9  48.3 
 
 
148 aa  124  6e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0517  50S ribosomal protein L9  43.92 
 
 
151 aa  115  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0541  50S ribosomal protein L9  41.22 
 
 
151 aa  114  3.9999999999999997e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_482  ribosomal protein L9  40.54 
 
 
151 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4931  50S ribosomal protein L9  47.62 
 
 
148 aa  110  5e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.108353  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1814  ribosomal protein L9  40.82 
 
 
149 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2257  50S ribosomal protein L9  40.27 
 
 
148 aa  107  8.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000108464  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0132  50S ribosomal protein L9P  40.82 
 
 
150 aa  105  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.191578  normal  0.450064 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0740  ribosomal protein L9  37.84 
 
 
150 aa  104  5e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1220  50S ribosomal protein L9  42.18 
 
 
148 aa  102  2e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.592412  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0881  50S ribosomal protein L9  40.94 
 
 
148 aa  101  3e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00774862  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0081  50S ribosomal protein L9  37.41 
 
 
148 aa  100  5e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.957353  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2535  ribosomal protein L9  39.19 
 
 
148 aa  100  6e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000849852  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2006  ribosomal protein L9  40.41 
 
 
152 aa  99.8  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0851  50S ribosomal protein L9P  38.93 
 
 
149 aa  96.7  8e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1975  50S ribosomal protein L9  40.54 
 
 
149 aa  96.3  1e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3697  ribosomal protein L9  40.67 
 
 
149 aa  96.3  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2130  50S ribosomal protein L9  37.41 
 
 
149 aa  96.3  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.929246  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37780  LSU ribosomal protein L9P  38.26 
 
 
149 aa  94.4  4e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.236654  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1775  50S ribosomal protein L9  39.46 
 
 
149 aa  94.7  4e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000651865  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2911  ribosomal protein L9  41.61 
 
 
147 aa  94.4  5e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000198897  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0023  ribosomal protein L9  35.37 
 
 
174 aa  93.2  1e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.725827  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2972  50S ribosomal protein L9  37.41 
 
 
148 aa  93.2  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2650  50S ribosomal protein L9  37.41 
 
 
148 aa  93.2  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.502254  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3352  ribosomal protein L9  40.41 
 
 
151 aa  92.4  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.600621  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0448  50S ribosomal protein L9  36.54 
 
 
148 aa  91.7  3e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000315624  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0654  ribosomal protein L9  36.73 
 
 
146 aa  91.7  3e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.233351  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1359  ribosomal protein L9  37.41 
 
 
151 aa  91.3  4e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0122536  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0761  50S ribosomal protein L9  41.72 
 
 
151 aa  91.3  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000425439  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0602  ribosomal protein L9  38.1 
 
 
159 aa  90.9  5e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2212  50S ribosomal protein L9  38.97 
 
 
150 aa  91.3  5e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4519  50S ribosomal protein L9  34.9 
 
 
148 aa  90.9  5e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.986951  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0766  50S ribosomal protein L9  38.1 
 
 
147 aa  90.9  6e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1335  50S ribosomal protein L9  38.1 
 
 
147 aa  90.1  9e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.779246  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23320  ribosomal protein L9  45.33 
 
 
147 aa  89.4  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.507738  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0691  50S ribosomal protein L9  37.41 
 
 
147 aa  89.7  1e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.965634  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0830  ribosomal protein L9  36.73 
 
 
149 aa  89.4  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.211438  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7309  50S ribosomal protein L9  34.23 
 
 
148 aa  88.2  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.937449  normal  0.0304173 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2388  50S ribosomal protein L9  40.14 
 
 
147 aa  88.6  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1000  50S ribosomal protein L9  37.16 
 
 
147 aa  88.6  3e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4535  50S ribosomal protein L9  35.81 
 
 
153 aa  88.2  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.323692 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3303  ribosomal protein L9  39.6 
 
 
149 aa  87  7e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204917  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1375  50S ribosomal protein L9  37.58 
 
 
148 aa  87  8e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0636184  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0165  50S ribosomal protein L9  35.37 
 
 
148 aa  87  8e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000317895  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3666  50S ribosomal protein L9  38.93 
 
 
149 aa  86.7  9e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.006093  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1780  50S ribosomal protein L9  37.16 
 
 
150 aa  86.3  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0755  50S ribosomal protein L9  36.73 
 
 
147 aa  86.3  1e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.123004  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0025  ribosomal protein L9  31.97 
 
 
178 aa  86.3  1e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00173008  normal  0.984167 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1808  50S ribosomal protein L9  37.16 
 
 
150 aa  86.3  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.432428  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1063  ribosomal protein L9  36.73 
 
 
147 aa  86.3  1e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.342712  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5171  50S ribosomal protein L9  35.81 
 
 
150 aa  85.9  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11530  ribosomal protein L9  32.89 
 
 
191 aa  85.9  2e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0446546  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0106  50S ribosomal protein L9  34.87 
 
 
147 aa  85.5  2e-16  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4178  ribosomal protein L9  38 
 
 
151 aa  85.9  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6208  50S ribosomal protein L9  36.49 
 
 
150 aa  85.9  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1871  50S ribosomal protein L9  36.49 
 
 
150 aa  85.9  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.539407  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1894  50S ribosomal protein L9  36.49 
 
 
150 aa  85.9  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000492255  hitchhiker  0.000000062237 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2102  50S ribosomal protein L9P  35.81 
 
 
149 aa  85.1  3e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1403  50S ribosomal protein L9  35.81 
 
 
150 aa  85.5  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.318005  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0161  50S ribosomal protein L9  34.69 
 
 
148 aa  84.7  4e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000723092  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0914  50S ribosomal protein L9  40.15 
 
 
150 aa  84.3  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.334096 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0130  50S ribosomal protein L9  33.33 
 
 
149 aa  84  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0311991 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4336  50S ribosomal protein L9  34.9 
 
 
150 aa  84  6e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1422  50S ribosomal protein L9  37.41 
 
 
151 aa  83.6  9e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0660955  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31750  LSU ribosomal protein L9P  34.25 
 
 
157 aa  83.6  9e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1029  ribosomal protein L9  38.78 
 
 
148 aa  83.6  9e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0075177  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl083  50S ribosomal protein L9  34.01 
 
 
147 aa  83.2  0.000000000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000770286  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2135  ribosomal protein L9  41.48 
 
 
148 aa  83.2  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000758155  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1996  50S ribosomal protein L9  33.33 
 
 
148 aa  82.4  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2610  50S ribosomal protein L9  39.07 
 
 
147 aa  82  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.196058  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4946  ribosomal protein L9  34.44 
 
 
148 aa  82.4  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18001  50S ribosomal protein L9  37.75 
 
 
152 aa  82  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1272  50S ribosomal protein L9  36 
 
 
152 aa  81.6  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0117  50S ribosomal protein L9  36.05 
 
 
151 aa  82  0.000000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1692  50S ribosomal protein L9  35.95 
 
 
149 aa  81.6  0.000000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2827  ribosomal protein L9  37.16 
 
 
150 aa  82  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>